• Title/Summary/Keyword: S-201

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A report on 38 unrecorded bacterial species in Korea in the class Gammaproteobacteria

  • Weerawongwiwat, Veeraya;Kim, Myung Kyum;Joh, Kiseong;Kim, Seung-Bum;Seong, Chi-Nam;Yi, Hana;Yoon, Jung-Hoon;Kim, Wonyong
    • Journal of Species Research
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    • 제10권3호
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    • pp.201-216
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    • 2021
  • During an investigation of indigenous prokaryotic species in the Republic of Korea, a total of 38 bacterial strains belonging to the class Gammaproteobacteria were isolated from diverse environments. Samples were collected from soil, seawater, sand, sedimentary soil, rabbit feces, rat intestines, marine wetland, and tidal flats. The strains were identified to the species level using the high 16S rRNA gene sequences and showed high similarity (>98.7%) with the closest bacterial species and formed a robust clade in the neighbor-joining phylogenetic tree; it was determined that each strain belonged to independent, predefined bacteria species within the class Gammaproteobacteria. The 38 strains of Gammaproteobacteria analyzed in this study have not been reported in the Republic of Korea. Therefore, this study describes 20 genera of 13 families in 8 orders: Aeromonadales, Alteromonadales, Cellvibrionales, Enterobacterales, Lysobacterales, Oceanospirillales, Pseudomonadales, and Vibrionales. For each species, we describe Gram reaction, strain ID, isolation source, colony and cell morphology, cultural, physiological, and basic biochemical characteristics.

Conditions to avoid synchronization effects in lateral vibration of footbridges

  • Andrade, Alexandre R.;Pimentel, Roberto L.;Silva, Simplicio A. da;Souto, Cicero da R.
    • Structural Monitoring and Maintenance
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    • 제9권2호
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    • pp.201-220
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    • 2022
  • Lateral vibrations of footbridges may induce synchronization between pedestrians and structure itself, resulting in amplification of such vibrations, a phenomenon identified by lock-in. However, investigations about accelerations and frequencies of the structural movement that are related to the occurrence of synchronization are still incipient. The aim of this paper is to investigate conditions that could lead to avoidance of synchronization among pedestrians themselves and footbridge, expressed in terms of peak acceleration. The focus is on the low acceleration range, employed in some guidelines as a criterion to avoid synchronization. An experimental campaign was carried out, employing a prototype footbridge that was set into oscillatory motion through a pneumatic exciter controlled by a fuzzy system, with controlled frequency and amplitude. Test subjects were then asked to cross the oscillating structure, and accelerations were simultaneously recorded at the structure and at the subject's waist. Pattern and phase differences between these signals were analysed. The results showed that test subjects tended to keep their walking patterns without synchronization induced by the vibration of the structure, for structural peak acceleration values up to 0.18 m/s2, when frequencies of oscillation were around 0.8 to 0.9 Hz. On the other hand, for frequencies of oscillation below 0.7 Hz, structural peak accelerations up to 0.30 m/s2 did not induce synchronization.

Tl-201 심근관류 SPECT 검사에서 광대역 재구성(Wide Beam Reconstruction: WBR) 방법과 여과 후 역투영법에 따른 영상의 질 및 정량적 지표 값 비교 (The Comparison of Image Quality and Quantitative Indices by Wide Beam Reconstruction Method and Filtered Back Projection Method in Tl-201 Myocardial Perfusion SPECT)

  • 윤순상;남기표;심동오;김동석
    • 핵의학기술
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    • 제14권2호
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    • pp.122-127
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    • 2010
  • 광대역 재구성 기법(Wide Beam Reconstruction : WBR)은 잡음을 감소시켜 신호 대 잡음 비를 증가시키고, 또 광속 확산 함수 효과(Beam spread function effect)를 저하시킴으로써 기존의 여과 후 역투영법(Filtered Back Projection : FBP)와 비교하였을 때 영상의 질은 동등하고 영상획득 시간을 줄일 수 있는 장점이 있다고 보고 있다. 본 연구는 UltraSPECT(Haifa,Israel)사 광대역 재구성 기법 인 Xpress3.$cardiac^{TM}$를 이용하여 기존의 FBP기법에 대한 WBR기법의 유용성을 알아보고자 한다. 1. Phantom 실험 : Anthropomorphic torso phantom을 사용하여 심근과 연부조직 그리고 폐 영역에$^{201}Tl$을 각각 74 kBq(2 ${\mu}Ci$)/cc, 11.1 kBq (0.3 ${\mu}Ci$)/cc, 2.59 kBq (0.07 ${\mu}Ci$)/cc의 비율로 투여하여 검사 시 실제 환자의 count와 유사하게 phantom을 제작하였다. 영상획득은 게이트법 적용 없이 Tl-201 심근관류 SPECT를 시행하였다. FBP로 재구성 한 영상은 투사영상 당 50초로 영상을 획득하였고, WBR으로 재구성 한 영상은 시간을 1/4로 단축하여 투사영상 당 13초로 영상을 획득하였다. 두 가지 기법으로 재구성한 영상을 Xeleris ver. 2.0551을 이용하여 반치폭(Full Width at Half Maximum : FWHM)과 평균 영상 대조도를 비교하였다. 2. 환자 정량분석 값 비교 : 2010년 1월 ~ 4월까지 본원에서 Tl-201 심근관류 SPECT 시행한30명의 환자를 대상으로 분석하였다. 먼저 아데노신 부하 후 stress 촬영 시 투사영상당 50초로 약 15분 동안 영상을 획득한 후 곧바로 투사영상당 13초로 약 4분 동안 영상을 다시 획득하였다. 또 rest 촬영시에도 동일하게 획득하였다. 투사영상 당 50초로 획득한 데이터는 FBP기법으로, 투사영상 당 13초로 획득한 데이터는 WBR기법으로 재구성하여 SSS, SDS, SRS, EDV, ESV, EF 값을 산출하여 비교 하였다. Phantom 실험 후 분해능 측정 결과, WBR기법으로 재구성한 경우 FBP기법에 비하여 FWHM은 29.46% 향상되었다(WBR data: 5.47 mm, FBP data: 7.07 mm). 또 평균 영상 대조도 증가하는 것으로 나타났다(WBR data: 0.90, FBP data: 0.56). 반면 환자 데이터를 분석한 결과, SSS, SDS, SRS, EDV, ESV, EF 등 정량분석 값들은 상호간에 유의한 차이를 보였다(p<0.01). 상관계수는 SSS, SDS, SRS에서 각각 0.18, 0.34, 0.08로 통계적으로 유의한 차이를 보였지만 EDV, ESV, EF에서는 각각 0.88, 0.89, 0.71로 좋은 상관관계를 보였다. Phantom 실험 결과 WBR기법은 FBP에 비해 분해능이 향상된 결과를 보였고, 평균 영상 대조도 역시 증가하는 것으로 나타났다. 환자 데이터를 분석하였을 때, WBR기법과 FBP기법 간의 정량분석 값들은 유의한 차이를 보였고, 상관계수 또한 SSS, SRS, SDS에서 유의한 차이가 보였으나, EDV, ESV, EF값에서는 높은 상관관계를 나타났다. 본 연구를 통하여 phantom 실험에서는 영상 획득 시간의 단축 및 영상의 질 향상을 확인할 수 있었다. 단, 환자 데이터에 대한 정량분석에서는 기존의 FBP기법에 비하여 많은 차이가 있어 임상에 적용 시 이에 대한 고려 및 추가적인 연구가 필요할 것이라고 사료된다.

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벼도열병균에서의 methionine sulfoxide reductase B 유전자의 분자적 특성 (Identification and Molecular Characterization of Methionine Sulfoxide Reductase B Gene in Rice Blast Fungus, Magnaporthe oryzae)

  • 김정환;김진수;정미연;최우봉
    • 생명과학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.343-348
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    • 2009
  • 벼도열병균은 벼의 주요 병해인 벼도열병의 원인균이다. 식물병원균의 침입 시 식물체로부터 발생하는 ROS는 식물의 방어기작으로 중요하며, 특히 아미노산의 하나인 methionine은 ROS에 의해 산화되어 methionine sulfoxide로 변화될 수 있다. 식물병원균은 식물체로 부터의 ROS에 의한 산화반응을 회피하기 위해 methionine sulfoxide reductase B (MSRB)와 같은 항산화 효소를 가지는데 본 연구에서는 벼도열병균에서의 MSRB 유전자를 동정하고 분자적 특성을 살펴보았다. MSRB 유전자는 벼도열병균의 게놈 상에 단일 유전자로 존재하며 과산화수소 처리에 의해 유전자발현이 다소 증가하는 경향을 보였다. 이러한 결과로 MSRB 유전자는 벼도열병균의 항산화 기작에 관여할 가능성이 높다고 판단된다.

다양한 식물병원성 곰팡이에 항진균 활성을 갖는 길항미생물의 탐색 (Screening of Antagonistic Bacteria having Antifungal Activity against Various Phytopathogens)

  • 양희종;정수지;정성엽;정도연
    • 한국균학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.333-340
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    • 2014
  • 미생물을 이용한 생물학적 방제제의 개발을 위해 연작피해가 없는 순창군 토양으로부터 다양한 미생물 201종을 분리하였고, 이들의 생물학적 활성을 조사하였다. 201종의 분리 세균 중에서 다양한 식물병원성 곰팡이에 대하여 항균활성이 우수한 5종을 선별하였다. 5종의 분리주에 대하여 siderophore를 생산하며 cellulase, protease, amylase와 같은 곰팡이 세포벽 분해효소를 생산하는 능력이 가장 우수한 SCS3 균주를 최종 선별하였다. 최종 선별한 균주 SCS3의 형태학적, 생리학적 및 생화학적 특성을 조사하였고, 16S rRNA 염기서열의 분석에 의해 B. subtilis SCS3으로 명명하였으며, 염기서열 분석에 기반하여 계통수를 작성하였다. 이상의 결과로부터 B. subtilis SCS3은 식물병원성 곰팡이의 방제를 위한 생물학적 방제제로 유용하게 이용될 수 있을 것으로 생각한다.

Design of Kalman Filter to Estimate Heart Rate Variability from PPG Signal for Mobile Healthcare

  • Lee, Ju-Won
    • Journal of information and communication convergence engineering
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    • 제8권2호
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    • pp.201-204
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    • 2010
  • In the mobile healthcare system, a very important vital sign in analyzing the status of user health is the HRV (heart rate variability). The used signals for measuring the HRV are electrocardiograph and PPG (photoplethysmograph). In extracting the HRV from the PPG signal, an important issue is that extract the exactly HRV from PPG signal distorted from the user's movements. This study suggested a design method of the Kalman filter to solve the problem, and evaluated the performances of a proposed method by PPG signals containing motion artifacts. In the results of experiments that compared with a variable step size adaptive filter proposed in recently, the proposed method showed better performance than an adaptive filter.