• 제목/요약/키워드: Rhodococcus sp.

검색결과 78건 처리시간 0.029초

A Leaf-Inhabiting Endophytic Bacterium, Rhodococcus sp. KB6, Enhances Sweet Potato Resistance to Black Rot Disease Caused by Ceratocystis fimbriata

  • Hong, Chi Eun;Jeong, Haeyoung;Jo, Sung Hee;Jeong, Jae Cheol;Kwon, Suk Yoon;An, Donghwan;Park, Jeong Mee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제26권3호
    • /
    • pp.488-492
    • /
    • 2016
  • Rhodococcus species have become increasingly important owing to their ability to degrade a wide range of toxic chemicals and produce bioactive compounds. Here, we report isolation of the Rhodococcus sp. KB6, which is a new leaf-inhabiting endophytic bacterium that suppresses black rot disease in sweet potato leaves. We determined the 7.0 Mb draft genome sequence of KB6 and have predicted 19 biosynthetic gene clusters for secondary metabolites, including heterobactins, which are a new class of siderophores. Notably, we showed the first internal colonization of host plants with Rhodococcus sp. KB6 and discuss its potential as a biocontrol agent for sustainable agriculture.

생물학적 환경정화를 위한 고농도 페놀에서 생육할 수 있는 세균의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Bacteria Able to Grow with Phenol at High Concentrations for Bioremediation)

  • 박연규;손홍주
    • 환경생물
    • /
    • 제19권1호
    • /
    • pp.87-92
    • /
    • 2001
  • For the biological treatment of industrial wastewater containing high concentration of phenol, isolation and characterization of phenol - degrading bacterium were carried out. A bacterial strain P2 capable of degrading phenol was isolated from contaminated soils by enrichment culture technique and identified as the genus Rhodococcus by morphological, cultural, biochemical characteristics, and Biolog system. The optimal medium composition and cultural conditions for the growth and degradation of phenol by Rhodococcus sp. P2 were 0.1% of (NH$_4$)$_2$SO$_4$, 0.2% of KH$_2$PO$_4$, 0.25% of Na$_2$HPO$_4$ㆍ12$H_2O$, 0.2% of MgSO$_4$ㆍ7$H_2O$, and 0.008% of CaC1$_2$ㆍ2$H_2O$ along with initial pH 8.5 at 3$0^{\circ}C$. Rhodococcus sp. P2 could grow with phenol as the sole carbon source up to 1,800 ppm in batch cultures, but did not grow in medium containing above 2,000 ppm of phenol. When 800 ppm phenol was given in the optimal media, Rhodococcus sp. P2 completely degraded it within 24 h. Meanwhile, 1,800 ppm of phenol was degraded within 9 days. Rhodococcus sp. P2 could utilize toluene, n-hexane, xylene and benzene as sole carbon source .

  • PDF

Isolation and Characterization of Psychrotrophic and Halotolerant Rhodococcus sp. YHLT-2

  • Ryu Hee-Wook;Joo Yang-Hee;An Youn-Joo;Cho Kyung-Suk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제16권4호
    • /
    • pp.605-612
    • /
    • 2006
  • A psychrotrophic bacterium was isolated from oil-contaminated groundwater and identified as Rhodococcus sp. YHLT-2. Growth was observed at the temperature of 4 to $30^{\circ}C$. This strain degraded various petroleum hydrocarbons such as crude oil, diesel oil, and gasoline over the whole range of temperatures tested. The Rhodococcus sp. YHLT-2 was capable of growing even at $4^{\circ}C$, exhibiting 90% of oil biodegradation after 20 days. Degradation of crude oil occurred at low temperature in nature. This strain was also able to grow at 7% NaCl, and utilized not only short chain alkenes $(C_9\;to\;C_{12})$, but also a broad range of long chain alkenes $(C_{19}\;to\;C_{32})$ present in crude oil at $4^{\circ}C$. The Rhodococcus sp. YHLT-2 is expected to be of potential use in the in situ bioremediation of hazardous hydrocarbons under low-temperature and high-salt conditions.

Investigation of gene encoding catechol 1,2-dioxygenase from Phenol-degrading, Rhodococcus sp. EL-GT

  • 이희정;한창민;조순자;박근태;박재림;이상준
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
    • /
    • pp.549-551
    • /
    • 2001
  • 본 연구는 방향족 화합물질 중 페놀폐수에 대한 생물학적 처리를 위해 본 실험실에서 분리한 페놀분해능이 우수한 Rhodococcus sp. EL-GT를 이용하여 catechol 분해 catechol 1,2-dioxygenase 분해활성을 측정하였고, 이것이 ortho-pathway임을 확인할 수 있었다. 또한 다른 연구에서 보고되 Phodococcus rhodochrous NCIMB임을 확인할 수 있었다. 또한 다른 연구에서 보고된 Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13259 균주의 catechol 1,2 dioxygenase를 기초로한 primer를 이용하여 PCR을 수행하였으며 이 분해 유전자의 cloning실험을 수행 중이다. 이들 실험을 통하여 Rhodococcus sp. EL-GT의 페놀분해 균의 유전적 구조 및 특징을 검토하고 이를 이용하여 방향족 화합물의 분해능이 보다 우수한 균주의 개발을 시도하고자 한다.

  • PDF

신균주 Rhodococcus sp. YSPW01과 YSPW02를 이용한 수중 내 고농도 Perchlorate 환원 특성 연구 (Reduction of Highly Concentrated Perchlorate in Aqueous Medium by Newly Isolated Bacterial Strains Rhodococcus sp. YSPW01 and YSPW02)

  • 이상훈;황재훈;;이대성;전병훈
    • 대한환경공학회지
    • /
    • 제36권5호
    • /
    • pp.352-358
    • /
    • 2014
  • 수중 내 함유된 고농도 perchlorate의 환원가능성을 perchlorate 환원 미생물인 신균주 Rhodococcus sp. YSPW01과 YSPW02로 검토하였다. Perchlorate 환원 미생물은 혐기소화조 슬러지에서 분리 배양하였으며, perchlorate 환원능을 검토하기 위해 전자공여체인 acetate를 사용하였다. YSPW01과 YSPW02는 perchlorate $82mg\;L^{-1}$와 acetate $550mg\;L^{-1}$에서 회분식 실험을 수행하였을 때, 반응 26시간과 9시간 후 각각 정상상태에 도달하였다. 이 때 perchlorate 환원은 8, 7시간 이내에 초기농도 $82mg\;L^{-1}$에서 검출한계 이하($10{\mu}g\;L^{-1}$)까지 제거되었다. 반응조 내에 acetate:perchlorate (w:w)비를 1:1에서 5:1로 증가한 결과, perchlorate의 제거 속도는 YSPW01과 YSPW02 모두 2.1, $3.2mg\;L^{-1}h^{-1}$에서 15, $15.5mg\;L^{-1}h^{-1}$로 약 4.5배 증가하였고, 최종 perchlorate는 검출한계 이하까지 제거되었다. 본 연구결과, Rhodococcus sp. YSPW01 및 YSPW02는 고농도 perchlorate 제거에 적합하며, 신균주를 고농도 perchlorate 제거를 위한 생물학적 처리공정에 응용가능 할 것으로 판단된다.

Natural attenuation, biostimulation 및 Rhodococcus sp. EH831을 이용한 bioaugmentation에 의한 디젤 오염 토양의 정화 (Bioremediation of Diesel-Contaminated Soils by Natural Attenuation, Biostimulation and Bioaugmentation Employing Rhodococcus sp. EH831)

  • 이은희;강연실;조경숙
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제39권1호
    • /
    • pp.86-92
    • /
    • 2011
  • 3가지 종류의 생물정화법인 natural attenuation (NA), biostimulation (BS) 및 bioaugmentation (BA) 방법을 디젤로 오염된 토양을 정화하기 위해 적용하여, 각 방법에 의한 정화효율과 미생물 활성을 계면활성제 첨가 유무(Tween 80)에 따라 비교하였다. 토양 정화 초기 단계에서는 Rhodococcus sp. EH831을 접종원으로 이용하는 BA 방법에 의한 토양 정화효율이 가장 좋았다. 3가지 생물정화방법 모두에서 계면활성제 첨가는 토양 정화효율에 영향을 미치지 않았다. 토양의 탈수소활성(DHA)과 잔류 총석유계탄화수소(TPHs) 농도는 음의 상관관계를 보였다: DHA (${\mu}g-TPF{\cdot}g$-dry $soil^{-1}\;d^{-1}$) = -0.02 ${\times}$ TPHs concentration ($mg-TPHs{\cdot}kg$-dry $soil^{-1}$) + 425.76 (2500 ${\leq}$ TPHs concentration ${\leq}$ 20000, p < 0.01).

Rhodococcus sp. EL-GT에 의한 고농도 페놀의 분해 특성 (Characterization of Biodegradation of Highly Concentrated Phenol by Rhodococcus sp. EL-GT)

  • 박근태;차미선;남귀숙;조순자;손홍주;이건;이상준
    • 한국환경과학회지
    • /
    • 제11권9호
    • /
    • pp.971-977
    • /
    • 2002
  • The isolated strain, Rhodococcus sp. EL-GT was able to degrade high phenol concentrations up to 10 mM within 24 hours in the medium consisting of 5.3 mM $KH_2PO_4$. 95 mM $Na_2HPO_4$, 18mM $NH_4NO_3$, 1 mM $MgSO_4{\cdot}7H_2O$,\;50{\mu}M CaCl_2$,\;0.5 {\mu}M FeCl_3$, initial pH 8.0, temperature $30^{\circ}C$ in rotary shaker at 200 rpm. This strain was good cell growth and phenol degradation in the alkaline pH range range, and the highest in the pH range of 7 to 9. The microorganism was able to grow at the various chlorinated phenols, benzene, toluene, and bunker-C oil. As Rhodococcus sp. EL-GT was good capable of attachment on the acryl media, it would be used as microorganism to consist of biofilm in wastewater treatment.

순천만 갈대의 근권으로부터 분리한 BTEX 분해세균 Microbacterium sp. EMB-1과 Rhodococcus sp. EMB-2의 생리학적 특성 분석 (Physiological Characterization of BTEX Degrading Bacteria Microbacterium sp. EMB-1 and Rhodococ-cus sp. EMB-2 Isolated from Reed Rhizosphere of Sunchon Bay)

  • 강성미;오계헌;강형일
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제33권3호
    • /
    • pp.169-177
    • /
    • 2005
  • 본 연구는 어업이나 농업 등의 인간활동에 의하여 상당한 영향을 받고 있는 순천만 갈대의 근권에서 이루어지는 정화작용에 있어 미생물의 역할을 조사하는 것에 중점을 두었다. 일반적으로 만은 환경 스트레스로 인한 갑작스런 충격을 감소시키는 완충지역으로서의 역할을 하는 것으로 알려져 있다. 갈대근권에서 이루어지는 정화기능에 있어 미생물의 역할을 밝히기 위한 첫 번째 노력의 일환으로 벤젠, 톨루엔, 또는 자일렌이 단일 탄소 및 에너지원으로 첨가된 농화배양법을 사용하여 BTEX를 분해할 수 있는 두 종류의 그람양성 세균을 순수분리하였다. 다양한 온도조건의 BTEX배지에서 이들 세균을 배양하는 동안 BTEX의 분해율 및 성장률을 주기적으로 조사한 결과 $37^{\circ}C$에서 가장 빠른 기질 분해율을 보였고 $42^{\circ}C$의 고온에서도 두 균 모두 잘 성장하는 것으로 나타났다. 본 연구에서 시험한 수은, 카드뮴, 납, 바륨, 철 대부분의 중금속에 강한 내성뿐만 아니라 ampicillin을 비롯한 시험한 5종류의 항생제 모두에 강한 내성을 나타냈다. 16S rRNA 유전자 서열과 다양한 표현형 및 형태학적 특성을 기초로 한 동정의 결과 BTEX를 분해할 수 있는 두 균주는 $95{\%}$상의 신뢰도로 Microbacterium sp.와 Rhodococcus sp.로 나타났고, 각 균주는 Microbacterium sp. EMB-1과 Rhodococcus sp. EMB-2로 명명하였다. 이러한 결과는 주요한 염습지 식물중의 하나인 갈대의 근권에서 살아가는 이들 균주들이 BTEX와 같은 석유로 오염된 근권 환경의 정화작용에 중요한 역할을 할 수 있음을 제시해주었다.

페놀폐수 처리를 위한 Rhodococcus sp. EL-GT와 활성슬러지를 이용한 호기성 생물막 반응기의 미생물 군집 동태 (Dynamics of Microbial Community of Aerobic Biofilm Reactor using Rhodococcus sp. EL-GT and Activated Sludge for Phenol Wastewater Treatment)

  • 박근태;원성내;손홍주;남귀숙;이재동;이상준
    • 한국환경과학회지
    • /
    • 제10권3호
    • /
    • pp.239-245
    • /
    • 2001
  • This research was performed to investigate the dynamics of microbial community by RBC (Rotating Biological Contactor) using Rhodococcus sp. EL-GT and activated sludge. Cell counts revealed by DAPI were compared with culturable bacterial counts from nutrient agar. Colony counts on nutrient agar gave values 20~25% and 1~15% of cell counts (DAPI). The cell counts for the dynamics of bacterial community were determined by combination of in situ hybridization with fluorescently-labelled oligonyucleotide probes and epifluorescence microscopy. Around 90~80% of total cells visualized DAPI were also detected by the bacteria probe EUB 338. For both reactors proteobacteria belonging to the gamma subclass were dominant in the first stage (1 and 2 stage) and proteobacteria belonging to the gamma subclass were dominant in the last stage (3 and 4 stage).

  • PDF

Cyclohexanol 이용성 세균의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Cyclohexanol-utilizing Bacteria)

  • 김태강;이인구
    • 한국미생물·생명공학회지
    • /
    • 제27권2호
    • /
    • pp.107-112
    • /
    • 1999
  • A bacterium, which can utilize cyclohexanol as a sole source of carbon and energy, was isolated from sludge in sewage of Ulsan Industrial Complex for Petrochemicals, Korea and identified as Rhodococcus sp. TK6. The growth conditions of the bacteria were investigated in cyclohexanol containing media. The bacteria utilized cyclohexanol, cyclohexanone, cyclohexane-1,2=diol, cyclopentanol, cyclopentanone, and $\varepsilon$-caprolactone but not cyclohexane, cyclohexane-1,2-dione, and cyclooctanone. The bacteria were able to utilize alcohols such as ethanol, 1-propanol, 1-butanol, 1-pentanol, 1-hexanol, 2-methyl-1-propanol, 3-methyl-1-butanol, 2-propanol, and 2-butanol as well as cyclohexanol, organic acids such as adipate, propionate, butyrate, valerate, n-caproate, and 6-hydroxycaproate, and aromatic compounds such as phenol, salicylate, p-hydroxbenzoate, and benzoate as a sole source of carbon and energy. Cyclohexanone as a degradation product of cyclohexanol by Rhodococcus sp. TK6 was determined with gas chromatography.

  • PDF