Shin, Juyoun;Baek, Jin Yang;Chung, Doo Ryeon;Ko, Kwan Soo
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.27
no.9
/
pp.1711-1715
/
2017
In this study, we characterized the $bla_{NDM-5}$-bearing plasmid in a Klebsiella pneumoniae isolate that had lost the plasmid during serial passage. We determined the complete sequences of the plasmid pCC1410-2, which was extracted from a K. pneumoniae ST709 isolate collected at a Korean hospital from which two NDM-5-producing K. pneumoniae isolates were subsequently isolated. As a result, the pCC1410-2 plasmid had a backbone structure that was similar to those of two plasmids previously reported from the same hospital, but lacked some antibiotic resistance genes ($bla_{TEM-1}$, rmtB, mphR(A), mrx(A), and mph(A)). A 9-bp repeating unit encoding three amino acids (Gln-Gln-Pro) was inserted in TraD in pCC1410-2. Thus, the pCC1410-2 plasmid might be transferred from the previously identified carbapenem-resistant K. pneumoniae, but some delections and inversions might have occurred during the process. We compared the transfer frequency and stability of the plasmids. The relative frequency of conjugative transfer and stability in the host were significantly lower in pCC1410-2 than in previously reported $bla_{NDM-5}$-bearing plasmids in Korea. A low transfer frequency and instability in the host may cause underestimation of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in the clinical setting and in surveillance studies.
Park, Min Young;Jeon, Byeong Jun;Kang, Ji Eun;Kim, Beom Seok
The Plant Pathology Journal
/
v.36
no.6
/
pp.579-590
/
2020
Botrytis cinerea, which causes gray mold disease in more than 200 plant species, is an economically important pathogen that is mainly controlled by synthetic fungicides. Synergistic fungicide mixtures can help reduce fungicide residues in the environment and mitigate the development of fungicide-resistant strains. In this study, we screened microbial culture extracts on Botrytis cinerea to identify an antifungal synergist for tebuconazole. Among the 4,006 microbial extracts screened in this study, the culture extract from Schizophyllum commune displayed the most enhanced activity with a sub-lethal dosage of tebuconazole, and the active ingredient was identified as schizostatin. In combination with 5 ㎍/ml tebuconazole, schizostatin (1 ㎍/ml) showed disease control efficacy against gray mold on tomato leaf similar to that achieved with 20 ㎍/ml tebuconazole treatment alone. Interestingly, schizostatin showed demethylation inhibitor (DMI)-specific synergistic interactions in the crossed-paper strip assay using commercial fungicides. In a checkerboard assay with schizostatin and DMIs, the fractional inhibitory concentration values were 0.0938-0.375. To assess the molecular mechanisms underlying this synergism, the transcription levels of the ergosterol biosynthetic genes were observed in response to DMIs, schizostatin, and their mixtures. Treatment with DMIs increased the erg11 (the target gene of DMI fungicides) expression level 15.4-56.6-fold. However, treatment with a mixture of schizostatin and DMIs evidently reverted erg11 transcription levels to the pre-DMI treatment levels. These results show the potential of schizostatin as a natural antifungal synergist that can reduce the dose of DMIs applied in the field without compromising the disease control efficacy of the fungicides.
Cells of Deinococcus puniceus $DY1^T$ are Gram-positive, coccus-shaped, and crimson color-pigmented. Strain $DY1^T$ was isolated from soil irradiated with 5 kGy gamma radiation and showed resistance to UVC and gamma radiation. In this study, we report the complete genome sequence of a bacterium Deinococcus puniceus $DY1^T$ is consist of circular chromosome comprised of 2,971,983 bp, with the G + C content of 62.5%. The complete genome sequence was obtained using the PacBio RS II platform, it included 2,617 coding sequences (CDs), 2,762 genes, and 88 pseudogene.
Park, Bora;Park, Geun Ha;Gu, Dong Ryun;Ko, Wonmin;Kim, Youn-Chul;Lee, Seoung Hoon
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
/
v.29
no.1
/
pp.51-57
/
2015
Bone destruction is a pathological symptom of some chronic inflammatory diseases, such as rheumatoid arthritis and periodontitis. Inflammation-induced bone loss of these diseases results from increased number and activity of osteoclasts. Paeoniae Radix Alba has been used in korean traditional medicine to treat disease including inflammation, gynecopathy and various pain. However, these effects have not been tested on osteoclasts, the bone resorbing cells that regulate bone metabolism. Here, we investigated the effects of Paeoniae Radix Alba ethanol extract (PRAE) on receptor activator of nuclear factor-kappa B ligand (RANKL)-mediated osteoclast differentiation and formation. Osteoclast differentiation and formation were measured by tartrate resistant acidic phosphatase (TRAP) staining and TRAP solution assay. The treatment of PRAE on bone marrow derived macrophages (BMMs), which is known as osteoclast precursor cells, inhibited osteoclast differentiation and formation in a dose-dependent manner. In addition, the expression of osteoclast differentiation marker genes was suppressed by PRAE treatment. This inhibitory effect of PRAE resulted from significant repression of c-Fos expression, and subsequent reduction of NFATc1 expression which was previously reported as a master transcription factor for osteoclastogenesis in vitro and in vivo. These results demonstrate that PRAE negatively regulates osteoclast differentiation and formation and suggest that PRAE can be used as a potent preventive or therapeutic candidate for various bone diseases, such as postmenopausal osteoporosis, periodontitis and rheumatoid arthritis.
Genetic polymorphisms of pvdhfr and pvdhps genes of Plasmodium vivax were investigated in 83 blood samples collected from patients in the Philippines, Bangladesh, and Nepal. The SNP-haplotypes of the pvdhfr gene at the amino acid positions 13, 33, 57, 58, 61, 117, and 173, and that of the pvdhps gene at the positions 383 and 553 were analyzed by nested PCR-RFLP. Results suggest diverse polymorphic patterns of pvdhfr alone as well as the combination patterns with pvdhps mutant alleles in P. vivax isolates collected from the 3 endemic countries in Asia. All samples carried mutant combination alleles of pvdhfr and pvdhps. The most prevalent combination alleles found in samples from the Philippines and Bangladesh were triple mutant pvdhfr combined with single mutant pvdhps allele and triple mutant pvdhfr combined with double wild-type pvdhps alleles, respectively. Those collected from Nepal were quadruple mutant pvdhfr combined with double wild-type pvdhps alleles. New alternative antifolate drugs which are effective against sulfadoxine-pyrimethamine (SP)-resistant P. vivax are required.
This study aimed to develop a multiplex-touchdown PCR method to simultaneously detect 3 species of protozoan parasites, i.e., Cryptosporidium parvum, Giardia lamblia, and Cyclospora cayetanensis, the major causes of traveler's diarrhea and are resistant to standard antimicrobial treatments. The target genes included the Cryptosporidium oocyst wall protein for C. parvum, Glutamate dehydrogenase for G. lamblia, and 18S ribosomal RNA (18S rRNA) for C. cayetanensis. The sizes of the amplified fragments were 555, 188, and 400 bps, respectively. The multiplex-touchdown PCR protocol using a primer mixture simultaneously detected protozoa in human stools, and the amplified gene was detected in > $1{\times}10^3$ oocysts for C. parvum, > $1{\times}10^4$ cysts for G. lamblia, and > 1 copy of the 18S rRNA gene for C. cayetanensis. Taken together, our protocol convincingly demonstrated the ability to simultaneously detect C. parvum, G. lamblia, and C. cayetanenesis in stool samples.
Ascochyta blight caused by Ascochyta rabiei (Pass.) Lab. (Telomorph: Didymella rabiei) (Kov.) is one of the most important fungal diseases in chickpea worldwide. Knowledge about pathogen aggressiveness and identification resistance sources to different pathotypes is very useful for proper decisions in breeding programs. In this study, virulence of 32 A. rabiei isolates from different part of Iran were analyzed on seven chickpea differentials and grouped into six races based on 0-9 rating scale and susceptibility/resistant pattern of chickpea differentials. The least and most frequent races were race V and race I, respectively. Race V and VI showed highly virulence on most of differential, while race I showed least aggressiveness. Resistance pattern of 165 chickpea genotypes also were tested against six different A. rabiei races. ANOVA analysis showed high significant difference for isolate, chickpea genotypes and their interactions. Overall $chickpea{\times}isolate$ (race) interactions, 259 resistance responses (disease severity ${\leq}4$) were identified. Resistance spectra of chickpea genotypes showed more resistance rate to race I (49.70%) and race III (35.15%), while there were no resistance genotypes to race VI. Cluster analysis based on disease severity rate, grouped chickpea genotypes into four distinct clusters. Interactions between isolates or races used in this study, showed the lack of a genotype with complete resistance. Our finding for virulence pattern of A. rabiei and newly identified resistance sources could be considerably important for integration of ascochyta blight resistance genes into chickpea breeding programs and proper decision in future for germplasm conservation and diseases management.
Mycobacterial cell walls comprise thick and diverse lipids and glycolipids that act as a permeability barrier to antibiotics or other chemical agents. The use of OH radicals from a non-thermal plasma jet (NTPJ) for the inactivation of mycobacteria in aqueous solution was adopted as a novel approach. Addition of water vapor in a nitrogen plasma jet generated OH radicals, which converted to hydrogen peroxide ($H_2O_2$) that inactivated non-pathogenic Mycobacterium smegmatis and pathogenic Mycobacterium tuberculosis H37Rv. A stable plasma plume was obtained from a nitrogen plasma jet with 1.91 W of power, killing Escherichia coli and mycobacteria effectively, whereas addition of catalase decreased the effects of the former. Mycobacteria were more resistant than E. coli to NTPJ treatment. Plasma treatment enhanced intracellular ROS production and upregulation of genes related to ROS stress responses (thiolrelated oxidoreductases, such as SseA and DoxX, and ferric uptake regulator furA). Morphological changes of M. smegmatis and M. tuberculosis H37Rv were observed after 5 min treatment with $N_2+H_2O$ plasma, but not of pre-incubated sample with catalase. This finding indicates that the bactericidal efficacy of NTPJ is related to the toxicity of OH and $H_2O_2$ radicals in cells. Therefore, our study suggests that NTPJ treatment may effectively control pulmonary infections caused by M. tuberculosis and nontuberculous mycobacteria (NTM) such as M. avium or M. abscessus in water.
Kwon, Hye Jin;Lee, Min Ho;Kim, Hyun Woo;Yang, Ji Yeong;Woo, Hyun Jun;Park, Min;Moon, Cheol;Kim, Sa-Hyun;Kim, Jong-Bae
Biomedical Science Letters
/
v.26
no.4
/
pp.288-295
/
2020
Infection of Helicobacter pylori on gastric mucosa is associated with various gastric diseases. According to the WHO, H. pylori causes gastric cancer and has been classified as a class I carcinogen. Riboflavin is an essential vitamin which presents in a wide variety of foods. Previous studies have shown that riboflavin/UVA was effective against the growth inhibition of Staphylococcus aureus, S. epidermidis and multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa and had the potential for antimicrobial properties. Thus, we hypothesized that riboflavin has a potential role in the growth inhibition of H. pylori. To demonstrate inhibitory concentration of riboflavin against H. pylori, we performed agar and broth dilution methods. As a result, we found that riboflavin inhibited the growth of H. pylori. The MIC was 1 mM in agar and broth dilution test. Furthermore, to explain the inhibitory mechanism, we investigated whether riboflavin has an influence on the replication-associated molecules of the bacteria using RT-PCR to detect mRNA expression level in H. pylori. Riboflavin treatment of H. pylori led to down-regulation of polA and dnaB mRNA expression levels in a dose dependent manner. After then, we also confirmed whether riboflavin has cytotoxicity to human cells. We used AGS, a gastric cancer cell line, and treated with riboflavin did not show statistically significant decrease of cell viability. Thus, these results indicate that riboflavin can suppress the replication machinery of H. pylori. Taken together, these findings demonstrate that riboflavin inhibits growth of H. pylori by inhibiting replication of the bacteria.
Objective: The aim of this study was to compare the effects of different doses of Geumnyeonyijin-tang (GNYJT) water extracts with those of metformin (250 mg/kg) in mild diabetic-obese mice. Methods and Results: The 48 mice were divided into 1 normal pellet diet (NFD) group and 5 high-fat diet (HFD) groups. At the end of 12 weeks of oral administration of metformin (250 mg/kg) or GNYJT water extracts (400, 200, or100 mg/kg), the effects were evaluated. The HFD control mice showed noticeable increases in body weight, adipose tissue density, fat pad weight of the periovarian and abdominal wall, and insulin, blood glucose, and HbA1c levels, with decreases in serum HDL levels. Increases in the periovarian and dorsal abdominal fat pad, regions of steatohepatitis, adipocyte hypertrophy, and hepatocyte hypertrophy were also discovered. The HFD group showed a decline in glucose levels and elevation of hepatic gluconeogenesis, suggesting an HFD-induced AMPK downregulation related to glucose dysregulation, as well as lipid metabolism related to obese insulin-resistant type II diabetes, dyslipidemia, and oxidative stress related diabetic hepatopathy (non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD). Conclusion: Assessment of the key parameters for inhibition of diabetes and related complications in HFD-fed diabetic-obese mice demonstrated that GNYJT water extracts have favorable ameliorating effects. The effect of GNYJT was manifested through the stimulation of AMPK upregulation of related hepatic glucose enzyme activities and expression of lipid metabolism-related genes. Therefore, appropriate oral dosages of GNYJT could be promising as a new preventive candidate for controlling diabetes and related complications. Further screening of biologically active compounds, elucidation of detailed mechanisms, and more animal studies are warranted.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.