Park, Pue Hee;Kim, Mi Seon;Lee, Young Ran;Park, Pil Man;Lee, Dong Soo;Yae, Byeong Woo
Korean Journal of Breeding Science
/
v.43
no.5
/
pp.399-404
/
2011
Genetic diversity among 28 Cymbidium varieties was evaluated by using a sequence-related amplified polymorphism (SRAP) marker system. The SRAP marker which was based on the open reading frames (ORFs) regions was developed primarily for Brassica species, but has been applied to various crops. A total of 30 SRAP primer combinations were initially screened. Twenty-eight SRAP primer combinations showed high polymorphism among the 28 Cymbidium varieties, which were consisted of breeding varieties and their parents in National Institute of Horticultural & Herbal Science (NIHHS). The amplified DNA fragments were separated by denaturing acrylamide gels and detected silver staining method. One hundred ninety six polymorphic bands (7 per primer) were generated and ranged from 0.3 to 1.0 kb in size. Polymorphic fragments were scored for calculating simple matching coefficient of genetic similarity and cluster analysis with multi-variate statistical package (MVSP) 3.1. The mean genetic similarity coefficient value was 0.588. The results showed that the correlation between $F_1$ varieties and their parents was high. These studied SRAP markers will be useful tools for genotype identification, germplasm conservation, genetic relationships in Cymbidium.
Objective: This research was conducted to study the genetic diversity in several Indonesian cattle breeds using microsatellite markers to classify the Indonesian cattle breeds. Methods: A total of 229 DNA samples from of 10 cattle breeds were used in this study. The polymerase chain reaction process was conducted using 12 labeled primers. The size of allele was generated using the multiplex DNA fragment analysis. The POPGEN and CERVUS programs were used to obtain the observed number of alleles, effective number of alleles, observed heterozygosity value, expected heterozygosity value, allele frequency, genetic differentiation, the global heterozygote deficit among breeds, and the heterozygote deficit within the breed, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium, and polymorphism information content values. The MEGA program was used to generate a dendrogram that illustrates the relationship among cattle population. Bayesian clustering assignments were analyzed using STRUCTURE program. The GENETIX program was used to perform the correspondence factorial analysis (CFA). The GENALEX program was used to perform the principal coordinates analysis (PCoA) and analysis of molecular variance. The principal component analysis (PCA) was performed using adegenet package of R program. Results: A total of 862 alleles were detected in this study. The INRA23 allele 205 is a specific allele candidate for the Sumba Ongole cattle, while the allele 219 is a specific allele candidate for Ongole Grade. This study revealed a very close genetic relationship between the Ongole Grade and Sumba Ongole cattle and between the Madura and Pasundan cattle. The results from the CFA, PCoA, and PCA analysis in this study provide scientific evidence regarding the genetic relationship between Banteng and Bali cattle. According to the genetic relationship, the Pesisir cattle were classified as Bos indicus cattle. Conclusion: All identified alleles in this study were able to classify the cattle population into three clusters i.e. Bos taurus cluster (Simmental Purebred, Simmental Crossbred, and Holstein Friesian cattle); Bos indicus cluster (Sumba Ongole, Ongole Grade, Madura, Pasundan, and Pesisir cattle); and Bos javanicus cluster (Banteng and Bali cattle).
We sequenced a 522 bp fragment including the $tRNA^{Thr}$, $tRNA^{Pro}$ gene and the first half of the control region from 29 wild and cultured olive flounder specimens from Korea. Out of 522 nucleotide sites, 49 (9.4%) were variable, 23 haplotypes being found. Most haplotypes are unique in the wild population and only four were shared by cultured specimins. The nucleotide diversity and differences between wild and cultured populations were $0.025{\pm}0.013$ and $0.015{\pm}0.008$, and $12.94{\pm}6.00$ and $7.83{\pm}3.75$, respectively. Haplotype diversity was $0.98{\pm}0.02$ and $0.49{\pm}0.09$ in the wild and cultured populations, respectively. These results show that marked reductions of genetic variability in the hatchery strains were observed in the number of mitochondrial DNA haplotypes and haplotype diversity when compared to the wild populations. Furthermore, we detected significant population differentiation between both populations. The mtDNA sequencing technique used to evaluate the genetic variability of hatchery strains compared to that of the wild population is potential for genetic monitoring of olive flounder hatchery stocks.
Park, Kee-Choon;Seo, Young-Jin;Kim, Chan-Yong;Kim, Jong-Su;Yi, Young-Keun;Seo, Ji-Ae
Korean Journal of Environmental Agriculture
/
v.27
no.3
/
pp.260-266
/
2008
The aim of present work was to assess the response of soil microbial activity and diversity to green manures under the organically managed grape-greenhouse in early spring. Hairy vetch, milk vetch, and red clover were seeded in fall, and enzymatic activities by dehydrogenase and fluorescein diacetate (FDA) hydrolase, and microbial diversities by Biolog $EcoPlate^{TM}$ and phospholipid fatty acid (PLFA) were characterized for soils sampled in early spring. Dehydrogenase activity and FDA hydrolytic activity did not differentiate the green manures but the average well color development of Biolog EcoPlate was higher in soils covered with red clover than control soil. Soil microbial functional diversity by Biolog EcoPlate differentiated the soils covered with hairy vetch and milk vetch, and Shannon diversity index by Biolog EcoPlate was higher in soils covered with hairy vetch than control soil. Principal component analysis of PLFA differentiated the soils covered with milk vetch from control soil.
Lee, Jee Eun;Lee, Sang-Rae;Youn, Seok-Hyun;Chung, Sang Ok;Lee, Jin Ae;Chung, Ik Kyo
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
/
v.17
no.3
/
pp.160-180
/
2012
We have studied the eukaryotic plankton species diversity to compare the community structure of fresh and brackish waters in the lower reaches of the Nakdong River using metagenomic methods. We constructed 18S rDNA clone libraries of total DNAs extracted from environmental water samples collected at Mulgeum (MG100929, fresh) and Eulsukdo bridge (ES, brackish). Through the steps of colony PCR, PCR-RFLP, sequencing and similarity analysis, we discovered the diverse species composition of eukaryotic plankton. Total 338 clones (170 at MG100929 and 168 at ES) were analyzed, and then we found 74 phylotypes (49 for MG100929 and 25 for ES). From the phylogenetic analysis, we confirmed various eukaryotic plankton of broad range of taxonomic groups, including Stramenopiles, Cryptophyta, Viridiplantae, Alveolata, Rhizaria, Metazoa, and Fungi. We also found several unreported species in Korea and candidates of new taxonomic entities at levels higher than genus. Especially, the cryptic species diversity including unreported phylotypes of Pirsonia (Stramenopiles) and Perkinsea (Alveolata) suggests that the molecular monitoring method can produce new informative biological data in monitoring the changes in the Nakdong River Mouth ecosystem.
Journal of the Korean Society of Environmental Restoration Technology
/
v.14
no.1
/
pp.23-33
/
2011
Habitats loss and fragmentation are major threats to biodiversity. There are various kinds of environmental assessment have been developed for various problems to solve. Yet, there are no well-developed methods for quantifying and predicting about biodiversity. To achieve a sustainable conservation for biodiversity, the structural diversity of forest must be assessed by proper indexes. This study aim to quantitatively assess the diversity of forest structure as habitats and results of the verification by bird survey for objective presentation of evidence. As a result of literature review, some indexes were selected as potential prediction tools for biodiversity; area of patch, area of core regions, shape of patch and average age of stand. The assessment results were estimated by monitoring of birds for accuracy verification and the results were almost in agreement with each others. But, 1 and 2 level of forests were showed ambiguous results. Certainly, this study was limited in some valuation indexes on landscape scale. Further studies should be considered that different environmental factors such as land use, disturbances by human and vegetation index. Also, we expect that the additional monitoring of birds should give rise to the result which is improved assessment results.
Lim, Mi Young;Jana, Sonali;Sivanesan, Iyyakkannu;Park, Hyun Rho;Hwang, Ji Hyun;Park, Young Hoon;Jeong, Byoung Ryong
Horticultural Science & Technology
/
v.31
no.3
/
pp.322-327
/
2013
The genetic diversity and phylogenetic relationships of eleven herbaceous peonies grown in Korea were analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD). Twenty-four decamer RAPD primers were used in a comparative analysis of these Korean peony species. Of the 142 total RAPD fragments amplified, 124 (87.3%) were found to be polymorphic. The remaining 18 fragments were found to be monomorphic (12.7%) shared by individuals of all 11 peony species. Cluster analysis based on the presence or absence of bands was performed by Jaccard's similarity coefficient, based on Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Averages. Genetic similarity range was 0.39 to 0.90 with a mean of 0.64. This study offered a rapid and reliable method for the estimation of variability among different peony species which could be utilized by the breeders for further improvement of the local peony species. Also, the results propose that the RAPD marker technique is a useful tool for evaluation of genetic diversity and relationship amongst different peony species.
Six parent and their 12 gamma ray-induced somatic flower colour mutants of garden rose were characterized to discriminate the mutants from their respective parents and understanding the genetic diversity using Random amplification of polymorphic DNA (RAPD) markers. Out of 20 primers screened, 14 primers yielded completely identical fragments patterns. The other 7 primers gave highly polymorphic banding patterns among the radiomutants. All the cultivars were identified by using only 7 primers. Moreover, individual mutants were also distinguished by unique RAPD marker bands. Based on the presence or absence of the 48 polymorphic bands, the genetic variations within and among the 18 cultivars were measured. Genetic distance between all 18 cultivars varied from 0.40 to 0.91, as revealed by Jaccard's coefficient matrix. A dendrogram was constructed based on the similarity matrix using the Neighbor Joining Tree method showed three main clusters. The present RAPD analysis can be used not only for estimating genetic diversity present in gamma ray-induced mutants but also for correct identification of mutant/new varieties for their legal protection under plant variety rights.
Programmers use multiple languages to reuse legacy code best suited to their problems. However, it is quite challenging to develop error-free multilingual programs because new types of bugs occur since misunderstanding about language interfaces such as Java Native Interface (JNI) and Python/C. There is a considerable amount of research to overcome multilingual program bugs and errors but these researches have less consideration about substantiality of programming languages, language interfaces, and bugs to evaluate their analyses and tools. In this paper, we have identified and establish substantiality of multilingual programming research with empirical study about diversity and interoperability of programming languages in Ubuntu software ecosystem based on real-world statistical data.
Journal of the Korean Operations Research and Management Science Society
/
v.41
no.4
/
pp.75-93
/
2016
This study aims at analyzing the relationship between team characteristic and innovation performance. The mediating effect of creative climate on the team characteristic and innovation performance is also measured. Based upon literature review, individual creative characteristics, team diversity, team cohesion, task characteristics are presented as antecedents of team characteristic. Creative climate affects the creative behavior and innovative performance. Creative climate is measured as the Team Climate Inventory (TCI) proposed by Anderson & West (1998) including goal, participative-autonomy and innovative-support. Data were collected from 186 survey responses (54 Teams) out of total 462 (69 teams) from the R&D department of a major ICT firm in Korea. Empirical results show the diversity, cohesion, job characteristic, individual creative characteristic have a positive effect on the creative climate and innovation performance. The participative-autonomy climate factor appears to mediate the relationship between team characteristic (diversity, cohesion, job and individual characteristics) and innovation performance. However, the mediating effects of goals and innovative-support factors were not significant statistically. It was confirmed that the organization can contribute to improve the team innovation performance by facilitating a autonomy and participative climate as well as fostering the team characteristic.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.