• 제목/요약/키워드: Relationship matrix

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비소세포폐암에서 Matrix Metalloproteinase(MMPs)-2, 9와 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase(TIMPs)-1, 2의 발현과 생존율과의 관계 (The Relationship Between Expression of Matrix Metalloproteinases(MMPs)-2, 9 and Tissue Inhibitors of Metalloproteinase(TIMPs)-1, 2 and Survival Time in Resected Non-Small Cell Lung Cancer)

  • 김학렬;양세훈;정은택
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제52권5호
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    • pp.453-462
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    • 2002
  • 연구배경 : MMPs는 종양 전이의 주된 장벽인 기저막과 세포외 기질을 분해하여 암세포의 침습 및 전이에 주된 역할을 하며, TIMP는 MMP에 의한 기저막 단백질 분해를 억제하는 인자로 알려져있다. MMP의 발현은 임상 병기가 진행할수록 증가하며 주위 림프절 전이와 관계가 있으며, TIMP의 발현은 주위 림파절로 전이가 일어나면 감소 또는 증가하는 것으로 알려져 있다. 대상 및 방법 : 비소세포폐암으로 진단 받고 근치적 절제술을 시행 받은 74명 환자를 대상으로 paraffin에 보관된 조직에서 면역조직화학염색법을 이용하여 MMP-2, 9, TIMP-l, 2 항체로 발현을 검색하였으며, 발현에 따른 생존율을 Kaplan-Meier, Log-rank로 검색하였다. 결 과 : MMP-2, 9의 발현은 각각 25/74례 (34%), 19/74(26%)였고, TIMP-l, 2의 발현은 각각 27/74(36%), 32/74(43%)였다. 임상 병기에 따른 MMP-2, 9 발현은 병기의 진행에 따라 유의하게 증가하였고, TIMP-2는 유의하게 감소하였다. 임상 림프절의 전이에 따른 발현은 MMP-2, 9에서만 전이의 진행에 따라 유의하게 증가하였다. MMP-2 발현에 따른 중간 생존기간은 양성군이 20개월, 음성군이 34개월로 양성군이 유의하게 낮았으며, TIMP-2은 34개월, 18개월로 양성군이 유의하게 높았다. MMP-2/TIMP-2에 따른 중간 생존기간은 음성/양성이 유의하게 높았다. 결 론 : MMP-2, 9 발현은 종양의 진행과 림프절의 전이에 관여할 것으로 사료되며, MMP-2와 TIMP-2의 발현은 역비레 관계가 있다.

골모세포유사세포의 cytoskeletal change가 세포 활성에 미치는 영향에 관한 실험적 연구 (An Experimental Study on the Effect of Cytoskeletal Changes or Osteoblastic Cell Activities)

  • 이정화;남동석
    • 대한치과교정학회지
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    • 제28권6호
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    • pp.915-926
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    • 1998
  • Cytoskeleton은 세포핵과 세포외 기질을 연결하고 있어서 기질에 가해지는 물리적 힘에 의해 cytoskeletal change가 유도되고 이에 의해 세포의 개조활성이 영향을 받는다고 생각되어 왔다. 본 연구는 골모세포 활성에 대한cytoskeletal change의 역할을 규명하기 위한 것으로서, 신생 백서로부터 조골세포양 세포를 분리, 배양하고 네가지 농도의 cytochalasin B(CB) 또는 colchicine(COL)을 3시간 처리하였다. 다시 배양액을 교환하고 24시간 동안 배양하여 prostaglandin $E_2\;(PGE_2)$, interleukin-6(IL-6), tumor necrosis factor-$\alpha$(TNF-$\alpha$) 및 matrix metalloproteinase-1 (MMP-1) 생산을 측정하고 통계적으로 비교하였으며 cytoskeletal protein actin 변화를 관찰하기위하여 면역형광염색하고 형광현미경으로 관찰하여 다음과 같은 결과를 얻었다: 1. CB 처리군에서 $PGE_2$ 생산이 증가되는 경향을 보였고 COL 처리군에서는 약물농도에 비례하여 증가하였다. 2. IL-6 생산은 CB농도 1.0 ${\mu}g/ml$일때를 제외하고 증가되었다. 3. TNF-$\alpha$도 CB 농도가 1.0 ${\mu}g/ml$ 일때를 제외하고 증가하였다. 4. MMP-1 생산은 CB 처리군에서 감소하는 경향을 보이고 COL 처리군에서는 변화되지 않았다. 5. CB처리군에서는 cytoskeletal actin stress fibers가 사라지고 세포모양이 둥글어지는 경향을 보였다. 이상의 결과로 미루어 보아 cytoskeletal rearrangement는 골모세포유사세포의 활성, 특히 $PGE_2$, IL-6, 및 TNF-$\alpha$같은 paracrine/autocrine factor의 생산과 관련있는 것으로 보인다.

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백악기 구산동응회암 내 장석의 알바이트화 작용 (Albitization of feldspar in the Cretaceous Kusandong Tuff, Korea)

  • 정종옥;손영관
    • 암석학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.195-211
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    • 2005
  • 백악기 경상분지의 대표적인 건층으로 알려진 구산동응회암은 하양층군 상부에 약 1-4m의 두께로 200km 이상 연장되어 나타나는 화쇄류 및 화쇄난류 기원의 결정질 응회암이다. 구산동응회암에 포함된 장석을 편광현미경, 전자 현미 분석기(EPMA), BSE(back-scattered electron) 이미지로 분석 및 관찰한 결과, 사장석은 대부분의 지점에서 거의 순수한 알바이트(>$97\%$ Ab) 조성을 띠며, 기질의 함량이 현격히 높은 최남단 지점에서는 부분적인 알바이트화 작용을 받았다. K-장석은 기질의 함량과 관계없이 전 지역에서 부분적인 알바이트화 작용을 받았다. 퍼사이트 조직과 체스판 쌍정, 벽개면 또는 미세절리를 따라 일어난 알바이트화 작용 그리고 기질의 함량과 알바이트화 작용의 상관관계 등은 구간동응회암이 매몰된 후 Na를 많이 함유한 외부유체에 의해 알바이트화 작용이 일어난 것으로 해석된다. 알바이트화 작용은 벽개면이나 절리면을 따라 우선적으로 시작되며 높은 기질 함량으로 인해 투수도가 낮고 외부유체의 침투가 어려운 경우 알바이트화 작용이 잘 일어나지 않는 것으로 해석된다. 또한 구간동응회암의 사장석의 현재 조성은 대부분 알바이트이나 본래 조성은 올리고클레스(oligoclase)에서 안데신(andesine)의 조성범위(Ab62.5-Ab83.3) 가졌을 것으로 해석된다.

코히어런트 다중 표적 방위 추적 알고리즘 (Coherent Multiple Target Angle-Tracking Algorithm)

  • 김진석;김현식;박명호;남기곤;황수복
    • 한국음향학회지
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    • 제24권4호
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    • pp.230-237
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    • 2005
  • 수중음향 시스템에서는 이동 표적에 대한 상태 추정 및 표적 식별 등의 목적을 위해서 표적 방위 추적은 필수적이다. 그러나 감시영역에 근접 또는 교차 표적 등이 존재하는 다수 표적 상황에서의 방위 추적은 매우 어려운 문제로 다양한 접근방법으로 연구되어 왔다. SWORD는 배열 센서 신호의 출력 공분산 행렬로부터 방위 변위를 추정하여 표적을 추적함으로써 별도의 정보 연관 과정이 필요 없는 단순한 구조의 다중 표적 방위 추적 알고리즘을 제안하였으며, RYU 등은 표적 조향 벡터 (target steering vector)와 배열 센서 공분산 행렬의 신호 고유 벡터 (signal eigenvector)가 선형결합 관계임을 이용하여 교차 표적 (cross target)에 대해서도 우수한 성능을 나타내는 효율적인 알고리즘을 제안하였다. 또한 HWANG 등은 잡음 고유 벡터 (noise eigenvector)와 표적 조향 벡터가 직교 관계임을 이용하여 RYU의 알고리즘과 동일한 성능을 유지하면서 연산량을 개선한 알고리즘을 제안하였다. 그러나 기존의 방법은 코히어런트 (coherent) 다중 표적인 경우에는 추적 성능이 저하되는 단점이 있다. 본 논문에서는 배열 센서의 공분산 행렬로부터 추정할 수 있는 신호 고유 벡터와 잡음 공분산 행렬 (noise covariance matrix)의 특성을 이용하여 코히어런트 다중 표적에 대해 추적 성능을 유지할 수 있는 다중 표적 방위 추적 알고리즘을 제안하였으며, 근접 및 교차 기동하는 표적에 대한 시뮬레이션을 통하여 비코히어런트 (incoherent)와 코히어런트 다중 표적에 대해 추적 성능이 우수함을 확인하였다.

타원편광 분석기에서 정렬오차와 사분파장판의 지연오차로 인한 뮬러 매트릭스 오차 분석 (Comparison of Misalignment and Retardation Errors of Dual Rotating Quarter-Wave Plates in Muller-Matrix Ellipsometry)

  • 정해두;김덕현
    • 한국광학회지
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    • 제25권5호
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    • pp.262-272
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    • 2014
  • 두 개의 회전하는 사분파장판을 가진 타원편광분석기에서 광학계가 오차를 포함하지 않는 경우와 5가지의 체계적 오차(두 개의 사분파장판의 정렬오차와 지연오차, 검광판의 정렬오차)를 포함하는 경우에 측정신호를 핏팅하여 구한 퓨리어 계수와 뮬러매트릭스와의 관계를 분석하였다. 5가지 체계적 오차를 포함하는 경우 전산모사를 이용해 비교 분석한 결과 사분파장판의 지연 오차가 정렬오차보다 뮬러매트릭스 대각선 요소에 야기하는 오차가 더 크다는 것을 찾아내었다. 각속도의 회전비를 1:5로 선택시 첫 번째 사분파장판의 초기 정렬오차와 두 번째 사분 파장판의 초기 정렬오차가 뮬러 매트릭스에 야기하는 오차가 같다는 것을 전모사를 통해 찾아 내었다. 5가지 체계적인 오차를 전산모사를 통해 분석한 결과 검광판의 정렬오차(${\epsilon}_5$)가 야기하는 뮬러 매트릭스 오차와 사분파장판의 정렬오차(${\epsilon}_3$, ${\epsilon}_4$)가 야기하는 뮬러 매트릭스 오차를 비교하면 대각선 요소($m_{22}$$m_{33}$)의 상대 오차는 0.18%이며 비 대각선요소($m_{23}$$m_{32}$)는 2배 차이가 남을 찾아내었다. 이 결과들을 활용하여 측정대상 물질의 보다 정확한 뮬러매트릭스를 얻을 수 있다.

Matrix Metalloproteinases(MMPs) 및 Vascular Endothelial Growth Factor(VEGF)의 발현을 통한 구강 설암의 침윤 기전 연구 (Correlations of Oral Tongue Cancer Invasion with Matrix Metalloproteinases(MMPs) and Vascular Endothelial Growth Factor(VEGF) Expression)

  • 김세헌;조남훈;임재열;김지훈;김정홍;장정현;최은창
    • 대한두경부종양학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.3-9
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    • 2005
  • Purpose: In oral tongue cancer, the degree of tumor invasion has a significant effect on the prognosis. We hypothesized that the destruction of extracelluar matrix and neovascularization are related to tumor infiltration mechanism. By studying the the tissues of early stage oral tongue cancer patients, we are intend to clarify the invasion related factors in oral tongue cancer. Material and Methods: To demonstrate the invasion process in early T-stage oral tongue cancer, the expressions of extracellular matrix destruction related molecules(MMP2, MMP9) and neovascularization related molecule(VEGF) were observed by immunohistochemical study. Also, immunohistochemical staining of CD31 was done for quantification of neovascularization. With the experiment showed above, we analyzed relationship between expression of each substances and tumor invasion depth, tumor free survival rates and cervical lymph node metastasis rate in early T-stage oral tongue cancer. Results: The expression rates of MMP2, MMP9, VEGF in 38 early oral cancer patients were 52.6%, 78.9% 52.6%, respectively. Significant correlation was found between the VEGF expression and microvessel density showed by CD31 immunohistochemical staining(p<0.001). VEGF expressions were significantly related with tumor invasion depth(p=0.002). The tumor free survival rate of those patients with VEGF-positive tumors was significantly poorer than in those with VEGF-negative tumors(p=0.019). Conclusion: This results indicate that VEGF is a useful marker for predicting the tumor invasion in patients with early tongue cancer and could be used as a beneficial factors in defining operative field and prognosis.

지렁이 꼬리 재생시 발현되는 피브리노겐 분해효소의 활성과 특성에 관한 연구 (Expression and Characterization of Fibrinolytic Enzyme Activity During Earthworm Tail Regeneration)

  • 탁은식;조성진;김재영;이규석;박순철
    • 한국토양동물학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.101-106
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    • 1999
  • 지렁이 꼬리재생 초기에 발현되는 피브리노겐 분해효소의 활성은 세포외기질의 재구성에 연관되어 있을 것으로 생각된다. 본 연구에서는 지렁이의 꼬리 재생 중에 발현된 피브리노겐 분해효소의 활성과 특성을 밝히고자 하였다. 지렁이의 꼬리 재생 중에 발현되는 피브리노겐 분해효소는 최소 7개이며 그 분자량은 각각 58, 45, 32, 27, 23, 19 그리고 12kDa로 측정되었다. 피브리노겐 분해효소의 활성은 절단 후 1일부터 효소의 활성이 나타나서 7일까지 거의 유사한 정도의 활성이 유지되었으며, 7일 이후부터는 이 효소들의 활성이 급격히 감소하여 14일에는 그 활성이 대조군 수준으로 회복되었다. 지렁이 꼬리 재생 중 발현된 모든 피브리노겐 분해효소는 PMSF와 aprotinin를 처리하였을 때 효소들의 활성이 억제되었다. 또한 Ca$^{2+}$의 제거는 이효소의 활성에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 이러한 결과를 통하여 지렁이 꼬리재생시 발현되는 피브리노겐 분해효소는 serine계 단백질 분해효소임을 알 수 있었다.

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네트워크 분석과 시각화를 통한 트위터 팔로우십 분석 (Twitter Following Relationship Analysis through Network Analysis and Visualization)

  • 송등주;이창수;박찬권;신기태
    • 한국전자거래학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.131-145
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    • 2020
  • 전 세계적으로 SNS(social network service) 사용자와 사용 시간이 매년 증가하고 있으며, SNS의 영향력 또한 점점 커져가고 있다. 이에 따라 SNS는 일상적인 의사결정에서부터 기업의 경영활동에 이르기까지 광범위하게 영향을 미치고 있다. 따라서 SNS를 적절히 분석하는 것은 매우 의미 있는 작업이 될 수 있는데, 이에 많은 연구들이 SNS에서의 다양한 활동과 관계를 들여다보려는 많은 노력들을 하고 있다. 본 연구에서는 대표적인 SNS 서비스 가운데 하나인 트위터를 이용해서 SNS 팔로잉 관계를 분석하고자 한다. 즉, 기존의 SNS 분석과는 달리 두 개 계정이 공통으로 팔로잉하는 계정들을 추출하고 시각화 함으로써 해당 계정들의 관심사를 분석하고자 한다. 이를 위해서 마이크로소프트 액셀 매크로를 사용해 공통 팔로잉 계정을 추출하였으며, 인접행렬를 이용해 추출된 계정들 간의 관계를 정의하였다. 또한 팔로잉 관계 분석을 용이하게 하기 위해 방향 그래프를 이용해 시각화 하였으며, 이 같은 시각화에는 R 프로그래밍을 사용하였다.

Accurate Estimation of Effective Population Size in the Korean Dairy Cattle Based on Linkage Disequilibrium Corrected by Genomic Relationship Matrix

  • Shin, Dong-Hyun;Cho, Kwang-Hyun;Park, Kyoung-Do;Lee, Hyun-Jeong;Kim, Heebal
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권12호
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    • pp.1672-1679
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    • 2013
  • Linkage disequilibrium between markers or genetic variants underlying interesting traits affects many genomic methodologies. In many genomic methodologies, the effective population size ($N_e$) is important to assess the genetic diversity of animal populations. In this study, dairy cattle were genotyped using the Illumina BoviveHD Genotyping BeadChips for over 777,000 SNPs located across all autosomes, mitochondria and sex chromosomes, and 70,000 autosomal SNPs were selected randomly for the final analysis. We characterized more accurate linkage disequilibrium in a sample of 96 dairy cattle producing milk in Korea. Estimated linkage disequilibrium was relatively high between closely linked markers (>0.6 at 10 kb) and decreased with increasing distance. Using formulae that related the expected linkage disequilibrium to $N_e$, and assuming a constant actual population size, $N_e$ was estimated to be approximately 122 in this population. Historical $N_e$, calculated assuming linear population growth, was suggestive of a rapid increase $N_e$ over the past 10 generations, and increased slowly thereafter. Additionally, we corrected the genomic relationship structure per chromosome in calculating $r^2$ and estimated $N_e$. The observed $N_e$ based on $r^2$ corrected by genomics relationship structure can be rationalized using current knowledge of the history of the dairy cattle breeds producing milk in Korea.

컴포넌트 의존정보 명세화와 의존 관리자의 구현 (The specification of component dependence information and implementation of dependence manager)

  • 최상균;송영재
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제12D권3호
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    • pp.385-394
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    • 2005
  • 컴포넌트 기반 소프트웨어 개발(Component-based software Development) 환경에서 컴포넌트간의 의존관계 정보를 제공하는 것은 컴포넌트를 합성하는 개발자에게 중요한 일이다. 그러나 컴포넌트의 의존관계 정보가 충분하게 제공되지 않고 있다. 따라서 개발자는 원시 컴포넌트의 의존관계를 모르고 컴포넌트를 합성하는 경우가 발생한다. 본 논문에서는, 위와 같은 단점을 보완하기 위하여, 컴포넌트 사이의 의존정보를 XML로 정의하여 관리하고, 개발자에게 원시 컴포넌트 의존관계 정보를 제공하여, 무결성 있고 영속성 있는 정보 시스템 개발을 위한 컴포넌트 의존정보를 제공하는 의존 관리자의 설계와 구현을 하였다. 의존 관리자에서 생성된 컴포넌트는 재사용성 측정 메트릭의 측정값이 $89\%$에서 $95\%$가 신뢰구간 안에 포함되어 있음을 보이고 있다.