• 제목/요약/키워드: Real-time quantities PCR

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RNA Interference to Prevent Bombyx mori Nuclear Polyhedrosis Virus Infection in Vivo

  • Hu Zhigang;Chen Keping;Gao Lu;Yao Qin
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제12권1호
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    • pp.15-19
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    • 2006
  • RNA interference has been used as a powerful tool in preventing virus proliferation in many species. In this study, we injected the dsRNA in vitro transcripts into Bombyx mori to investigate the resistance to B. mori nuclear polyhedrosis virus (BmNPV). Through vivisectional observation and real-time quantities PCR analysis, we found that these dsRNA can prevent the BmNPV to a certain extent, and delay the viruses' proliferation.

편육과 브로콜리싹에서 Salmonella spp. 검출을 위한 배지법과 Real-time PCR 및 신속 검사키트(VIDAS(R))의 비교검증 (Evaluation of an Automated ELISA (VIDAS(R)) and Real-time PCR by Comparing with a Conventional Culture Method for the Detection of Salmonella spp. in Steamed Pork and Raw Broccoli Sprouts)

  • 현지연;황인균;곽효선;박종석;허석;최인수;박찬규;서건호
    • 한국축산식품학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.506-512
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    • 2009
  • 본 연구에서는 편육과 브로콜리 싹에 Salmonella 농도를 단계별로 접종하고 배지법, $VIDAS^{(R)}$, real-time PCR의 양성 검출률을 비교함으로써 $VIDAS^{(R)}$, real-time PCR의 Salmonella 검출력을 검증하였으며, 또한 각 식품별로 검출률에 차이가 있는가를 알아보았다. 편육과 브로콜리 싹(500 g)에 3단계 농도(<15, 15-100, 100-1000 CFU/500 g)를 접종하고 20개 샘플로 나눈 후 배지법, $VIDAS^{(R)}$ Salmonella ($VIDAS^{(R)}$ SLM), real-time PCR법을 시행하여 검출능력을 비교하였다. 편육에서 배지법, $VIDAS^{(R)}$, real-time PCR를 이용하여 Salmonella를 검출한 결과, 낮은 접종 농도(<15 CFU/500 g)에서도 Salmonella가 검출되었고 $VIDAS^{(가)}$O real-time PCR 모두 배지법과 통계학적 유의차가 나타나지 않았다. 반면에 브로콜리 싹을 이용하였을 때 낮은 접종 농도에서는 Salmonella가 검출되지 않았으며 $VIDAS^{(가)}$O real-time PCR 모두 배지법보다 더 많은 샘플을 검출하였다. 따라서 정상 세균총이 많은 야채 식품의 경우 배지법은 경쟁 세균에 의해 검출이 저해되므로 이보다 영향을 덜 받는 $VIDAS^{(R)}$법이나 real-time PCR법을 이용하여 검출하는 것이 더 효과적이라고 할 수 있겠다. 또한 이러한 신속 진단법을 이용하면 $VIDAS^{(R)}$는 3일, real-time PCR은 1일 이내에 배지법과 같거나 보다 높은 검출률로 Salmonella를 검출할 수 있는 것으로 나타났다.

Abundance of Veillonella spp. does not Reflect Salivary Nitrite Production after Nitrate Ingestion

  • Mitsui, Takahiro;Ishikawa, Taichi;Harasawa, Ryo;Sasaki, Minoru
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.447-454
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    • 2020
  • Veillonella spp. have been reported to be the most prevalent nitrate-reducing bacterial species in the oral cavity. The purpose of this study was to examine the relationship between the abundance of Veillonella spp. and nitrite production after nitrate ingestion. Bacterial samples were obtained from the tongue surfaces of 50 university students. The predominant Veillonella spp., V. atypica, V. dispar, and V. rogosae were identified and enumerated using real-time polymerase chain reaction (qPCR). Salivary nitrate and nitrite were measured before and 30, 60, and 90 min after ingestion of 100 ml of beetroot juice. Increased nitrite concentrations were observed in all participants, with a mean increase of 0.61 (0.42-1.10) mM expressed as the median (interquartile range). Veillonella atypica was detected in 40 subjects (80%), V. dispar in 48 (96%), and V. rogosae in 48 (96%), at quantities ranging from 1.3 × 102 to 2.8 × 107 CFU/ml per subject. The strengths of the correlations of the log colony forming unit (CFU) values of V. atypica, V. dispar, V. rogosae, and the log CFU value of the three species together with the increase in nitrite levels were 0.091, 0.114, -0.228, and 0.060, respectively, none of which were significant (p > 0.05). Our results indicate that the abundance of Veillonella spp. is not related to salivary nitrite production after nitrate ingestion.

mRNA Expression and Clinical Significance of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 in Postoperative Patients with Non-Small Cell Lung Cancer

  • Han, Yi;Wang, Xiao-Bin;Xiao, Ning;Liu, Zhi-Dong
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권5호
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    • pp.2987-2990
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    • 2013
  • Background: To explore mRNA expression and clinical significance of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 genes in tumor tissue of postoperative patients with non-small cell lung cancer (NSCLC). Materials and Methods: Sixty NSCLC patients undergoing radical operation in our hospital from Nov., 2011 to Jun., 2012 were selected. Plasmid standards of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 were established and standard curves were prepared by SYBR fluorescent real-time quantitative PCR analysis. Samples from tumor centers were taken to detect mRNA expression of ERCC1, BRCA1, RRM1, TYMS and TUBB3 genes in cancerous tissue during operation. The total mRNA expression quantities were compared according to different clinical characteristics. Results: The total expression quantities of 5 genotypes from high to low were ERCC1>RRM1>TUBB3>TYMS>BRCA1 in turn. By pairwise comparisons, other differences showed statistical significance (p<0.05 or p<0.01) except for TYMS and TUBB3 (p>0.05); the low expression rates from high to low were ERCC1>TYMS>TUBB3>TUBB3>RRM1>BRCA1 in turn. The expression quantities of BRCA1, RRM1 and TYMS in males, smokers and patients without adenocarcinoma were all significantly higher than that in females, non-smokers and patients with adenocarcinoma, and significant differences were present (p<0.05 or p<0.01). In terms of pathological staging, the expression quantities of BRCA1, RRM1 and TYMS in phases IIa~IIb and IIIa~IIIb had a tendency to be greater than in phases I and IV. Conclusions: Resistance to chemotherapy and sensitivity to targeted therapy differ among patients with NSCLC. Differences in gene expression in different individuals were also revealed. Only according to personalized detection results can individualized therapeutic regimens be worked out, which is a new direction for oncotherapy.

배추에서 항암물질 phenylethylisothiocyanate의 다량 합성을 위한 myrosinase와 glutathione S-transferase 유전자 분리 및 이를 이용한 형질전환체 육성 (Isolation of Myrosinase and Glutathione S-transferase Genes and Transformation of These Genes to Develop Phenylethylisothiocyanate Enriching Chinese Cabbage)

  • 박지현;이수진;김보령;우은택;이지선;한은향;이윤형;박영두
    • 원예과학기술지
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    • 제29권6호
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    • pp.623-632
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    • 2011
  • 본 연구는 배추에서 항암물질 PEITC의 함량을 높이기 위하여 PEITC 대사과정에서 관련 유전자인 myrosinase (MYR)와 Glutathione S-transferase(GST) 유전자를 분리하고 Agrobacterium tumefacien 형질전환 방법을 통하여 유전자 발현을 조절하였다. 분리된 MYR과 GST의 cDNA는 각각 1647bp와 624bp임을 확인하였고 pET system으로 단백질의 발현을 확인하였다. 형질전환을 위해서 MYR-과발현 벡터와 GST-발현억제 벡터를 제작하였으며 이를 이용하여 배추에 형질전환한 후 PCR 검정을 통해 MYR-과발현 벡터로 형질전환된 개체(IMS) 13개체를 GST-발현억제 벡터로 형질전환된 개체(IGA) 5개체를 선발하였다. 선발된 $T_0$ 개체는 $T_1$ 세대로 진전시켰으며 $T_1$ 형질전환 계통의 서던분석 결과 배추 genome내로 1-4 copy의 T-DNA가 삽입된 것을 확인하였다. 유전자 발현양을 real-time RT PCR로 조사한 결과 IMS는 발현량이 1.03-4.25배 증가하였고 IGA는 26.42-42.22배 감소하였다. IMS와 IGA의 각 계통에서 PEITC의 농도를 GC-MS 방법을 이용하여 확인한 결과 IMS는 PEITC 함량이 형질전환이 되지 않은 대조군에 비해 최대 4.86배까지 증가한 계통을 확인하였고 IGA는 최대 3.89배까지 증가된 계통을 확인하였다. 최종적으로 본 연구를 통하여 항암물질 PEITC량의 증가를 보인 형질전환계통 IMS 1, 3, 5, 12, 15 및 IGA 1, 2, 4를 선발하였다.

산화적 스트레스에 대한 여주 (Momordica charantia) 추출물의 항산화 효과 및 세포사멸 억제 기전을 통한 신경세포보호효과 (Neuroprotective effects of Momordica charantia extract against hydrogen peroxide-induced cytotoxicity in human neuroblastoma SK-N-MC cells)

  • 김꽃별;이선아;허재혁;김정희
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제50권5호
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    • pp.415-425
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    • 2017
  • 건 여주로부터 얻은 70%에탄올 추출물의 항산화 효과를 측정하고, $H_2O_2$에 의해 유도된 산화적 스트레스에 대한 신경세포 보호효과를 알아보기 위해 human neuroblastoma cell인 SK-N-MC세포를 이용하여 실험을 수행하였다. 여주 추출물의 총 폴리페놀과 플라보노이드 함량은 각각 28.51 mg gallic acid/extract g과 3.95 mg catechin/extract g 이었고, 추출물의 DPPH 라디칼 소거능 ($IC_{50}$)은 $506.95{\mu}g/ml$ 이었다. 여주추출물을 신경세포에 전 처리한 후 $H_2O_2$을 처리하여 산화적 스트레스를 유도했을 때, 여주추출물에 의해 세포생존율은 증가되었고 세포내 ROS는 감소되는 것을 확인하였다. 그리고 세포내 항산화 방어시스템인 항산화효소 (SOD-1,2와 GPx-1)의 mRNA 발현이 여주추출물 처리에 의해 control 수준으로 회복되거나 control 보다 증가되는 결과를 보였으며, ROS 의존적 세포사멸과 연관 있는 것으로 알려진 MAPK pathway 중 p38과 JNK의 인산화를 여주추출물이 억제하였다. 또한 cleaved caspase-3와 cleaved PARP의 발현도 여주추출물의 처리에 의해 감소되었다. 본 연구 결과에서 70% 에탄올 여주추출물은 항산화효능이 우수하여 ROS를 직접적으로 제거할 뿐 아니라 세포내 ROS 축적을 억제시키는 효과를 보여주었다. 그리고 신경세포 내 항산화효소들의 발현 증가 기전과 p38, JNK의 인산화 억제 및 cleaved caspase-3, cleaved PARP의 발현 억제를 통한 세포사멸 억제 기전을 통해 산화적 스트레스로부터 신경세포를 보호하는 효과가 있음을 제시하고 있다. 따라서 여주추출물은 산화적 스트레스에 의한 알츠하이머병이나 파킨슨병 등과 같은 신경변성질환 (neurodegenerative disease)에 대한 예방 및 치료제의 소재로써 이용가치가 충분한 것으로 사료된다.