• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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• 제46권5호
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• pp.341-347
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• 2020

Objectives: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is one of the most common types of head and neck cancer. MicroRNAs, as new biomarkers, are recommended for diagnosis and treatment of different types of cancers. Bevacizumab, sold under the trade name Avastin, is a humanized whole monoclonal antibody that targets and blocks VEGF-A (vascular endothelial growth factor A; angiogenesis) and oncogenic signaling pathways. Materials and Methods: This study comprised 50 cases suffering from OSCC and 50 healthy participants. Peripheral blood samples were collected in glass test tubes, and RNA extraction was started immediately. Expression levels of miR-155, miR-191, and miR-494 biomarkers in the peripheral blood of OSCC-affected individuals and healthy volunteers in vivo were evaluated using real-time PCR. The influence of Avastin on the expression levels of the aforementioned biomarkers in vitro and in the HN5 cell line was also investigated. Results: Expression levels of miR-155, miR-191, and miR-494 in the peripheral blood of individuals affected by OSCC were higher than in those who were healthy. Moreover, Avastin at a concentration of 400 μM caused a decrease in the expression levels of the three biomarkers and a 1.5-fold, 3.5-fold, and 4-fold increase in apoptosis in the test samples compared to the controls in the HN5 cell line after 24, 48, and 72 hours, respectively. Conclusion: The findings of this study demonstrate that overexpression of miR-155, miR-191, and miR-494 is associated with OSCC, and Avastin is able to regulate and downregulate the expression of those biomarkers and increase apoptosis in cancerous cells in the HN5 cell line.

• Journal of Oral Medicine and Pain
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• 제34권4호
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• pp.363-369
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• 2009

미란형 구강편평태선과 재발성 아프타성 구내염은 T림프구에 의해 매개되는 염증성 면역질환이다. T림프구에 영향을 주는 다양한 조절 인자들 중 CD28, CD45, CD152, CD154, CD279등의 mRNA가 미란형 구강편평태선 및 재발성 아프타성 구내염 환자들의 비자극성 전타액내에서 어떻게 발현되는지를 살펴보고, 이것의 진단학적 가치를 평가하고자 한다. 미란형 구강편평태선으로 진단받은 환자군 18명, 재발성 아프타성 구내염으로 진단받은 환자군 12명, 정상군 8명에게서 비자극성 전타액을 10분간 채득한 후, 상피세포를 분리하여 mRNA를 추출하였다. Real time PCR을 이용하여 각 군의 T림프구 조절 인자들의 mRNA 발현 양상을 비교분석하였다. 미란형 구강편평태선의 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 정상인과 비교 결과, CD45, CD279는 높게 측정되었고, CD154는 낮게 측정되었다. 재발성 아프타성 구내염 환자들의 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 정상인과 비교 결과, CD45, CD279는 높게 발현되었고, CD28, CD154는 낮게 발현되었다. 부가적으로 미란형 구강편평태선 환자군의 타액내 CD152의 발현 양상은 재발성 아프타성 구내염 환자군보다 높게 발현되었다. 미란형 구강편평태선과 재발성 아프타성 구내염 환자들의 비자극성 전타액내 T림프구 조절인자들의 mRNA 발현 양상은 각 질환의 진단에 기여할 수 있을 것으로 사료된다.

• Journal of Periodontal and Implant Science
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• 제42권6호
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• pp.185-195
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• 2012

Purpose: (-)-epigallocatechin-3-gallate (EGCG) has been reported to exert anti-inflammatory and antibacterial effects in periodontitis. However, its exact mechanism of action has yet to be determined. The present in vitro study evaluated the anti-in-flammatory effects of EGCG on human periodontal ligament fibroblasts (hPDLFs) and human periodontal ligament stem cells (hPDLSCs) affected by bacterial lipopolysaccharide (LPS) extracted from Porphyromonas gingivalis. Methods: hPDLFs and hPDLSCs were extracted from healthy young adults and were treated with EGCG and/or P. gingivalis LPS. After 1, 3, 5, and 7 days from treatment, cytotoxic and proliferative effects were evaluated using a 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay and bromodeoxyuridine assay, respectively. And then, the gene expressions of hPDLFs and hPDLSCs were observed for interleukin (IL)-$1{\beta}$, IL-6, tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$, osteoprotegerin (OPG), receptor activator of nuclear factor kappa-B ligand (RANKL), and RANKL/OPG using real-time polymerase chain reaction (PCR) at 0, 6, 24, and 48 hours after treatment. The experiments were performed with the following groups for hPDLFs and hPDLSCs; 1) No treat, 2) EGCG alone, 3) P. gingivalis LPS alone, 4) EGCG+P. gingivalis LPS. Results: The 20 ${\mu}M$ of EGCG and 20 ${\mu}g/mL$ of P. gingivalis LPS had the lowest cytotoxic effects, so those concentrations were used for further experiments. The proliferations of hPDLFs and hPDLSCs increased in all groups, though the 'EGCG alone' showed less increase. In real-time PCR, the hPDLFs and hPDLSCs of 'EGCG alone' showed similar gene expressions to those cells of 'no treat'. The gene expressions of 'P. gingivalis LPS alone' in both hPDLFs and hPDLSCs were highly increased at 6 hours for IL-$1{\beta}$, IL-6, TNF-${\alpha}$, RANKL, and RANKL/OPG, except the RANKL/OPG in hPDLSCs. However, those increased gene expressions were down-regulated in 'EGCG+P. gingivalis LPS' by the additional treatment of EGCG. Conclusions: Our results demonstrate that EGCG could exert an anti-inflammatory effect in hPDLFs and hPDLSCs against a major pathogen of periodontitis, P. gingivalis LPS.

• 한국육종학회지
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• 제42권5호
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• pp.534-539
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• 2010

사과 국내 육성 품종인 '홍로'의 형질전환 체계를 확립하고 칼슘이 강화된 '홍로' 형질전환체를 육성하기 위하여 CAX1 유전자 전환을 실시하였다. 접종에 사용되는 절편체는 기내에서 증식 배양 중인 신초의 유엽을 사용하는 경우가 생육기 수체의 유엽을 사용하는 것보다 높은 재분화율을 보여 효과적이었다. 항생제가 첨가된 재분화 선발 배지에서 재분화된 신초들을 대상으로 PCR을 실시한 결과 5개체에서 유전자 도입을 확인할 수 있었고, 이들을 Southern blot 분석한 결과 2개체에서 안정적으로 유전자가 도입되었음을 확인할 수 있었다. 또한 유전자의 정량적 발현 분석을 위해 real-time PCR을 실시한 결과 대조구에 비해 형질전환체 모두에서 CAX1 유전자의 상대적 발현량이 높게 나타났다. 형질 전환체의 칼슘 분석 결과 기내 증식 잎과 결실된 과실의 과육과 잎에서 칼슘 함량이 대조구에 비해 높게 나타났다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제32권4호
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• pp.477-484
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• 2019

Objective: We aimed to observe hair follicle (HF) development in the dorsal skin and elucidate the expression patterns of genes and proteins related to skin and HF development in Rex rabbits from birth to 8 weeks of age. Methods: Whole-skin samples were obtained from the backs of Rex rabbits at 0, 2, 4, 6, and 8 weeks of age, the morphological development of primary and secondary HFs was observed, and the gene transcript levels of insulin-like growth factor-I (IGF-I), epidermal growth factor (EGF), bone morphogenetic protein 2 (BMP2), transforming growth factor ${\beta}-1$, 2, and 3 ($TGF{\beta}-1$, $TGF{\beta}-2$, and $TGF{\beta}-3$) were examined using quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR). Additionally, Wnt family member 10b (Wnt10b) and ${\beta}$-Catenin gene and protein expression were examined by quantitative real-time PCR and western blot, respectively. Results: The results showed significant changes in the differentiation of primary and secondary HFs in Rex rabbits during their first 8 weeks of life. The IGF-I, EGF, $TGF{\beta}-2$, and $TGF{\beta}-3$ transcript levels in the rabbits were significantly lower at 2 weeks of age than at birth and gradually increased thereafter, while the BMP2 and $TGF{\beta}-1$ transcript levels at 2 weeks of age were significantly higher than those at birth and gradually decreased thereafter. ${\beta}$-Catenin gene expression was also significantly affected by age, while the Wnt10b transcript level was not. However, the Wnt10b and ${\beta}$-catenin protein expression levels were the lowest at 2 and 4 weeks of age. Conclusion: Our data showed that a series of changes in HFs in dorsal skin occurred during the first 8 weeks. Many genes, such as IGF-I, EGF, BMP2, $TGF{\beta}-1$, $TGF{\beta}-2$, $TGF{\beta}-3$, and ${\beta}$-Catenin, participated in this process, and the related proteins Wnt10b and ${\beta}$-Catenin in skin were also affected by age.

• Journal of Ginseng Research
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• 제45권1호
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• pp.134-148
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• 2021

Background: Lung cancer has a high incidence worldwide, and most lung cancer-associated deaths are attributable to cancer metastasis. Although several medicinal properties of Panax ginseng Meyer have been reported, the effect of ginsenosides Rk1 and Rg5 on epithelial-mesenchymal transition (EMT) stimulated by transforming growth factor beta 1 (TGF-β1) and self-renewal in A549 cells is relatively unknown. Methods: We treated TGF-β1 or alternatively Rk1 and Rg5 in A549 cells. We used western blot analysis, real-time polymerase chain reaction (qPCR), wound healing assay, Matrigel invasion assay, and anoikis assays to determine the effect of Rk1 and Rg5 on TGF-mediated EMT in lung cancer cell. In addition, we performed tumorsphere formation assays and real-time PCR to evaluate the stem-like properties. Results: EMT is induced by TGF-β1 in A549 cells causing the development of cancer stem-like features. Expression of E-cadherin, an epithelial marker, decreased and an increase in vimentin expression was noted. Cell mobility, invasiveness, and anoikis resistance were enhanced with TGF-β1 treatment. In addition, the expression of stem cell markers, CD44, and CD133, was also increased. Treatment with Rk1 and Rg5 suppressed EMT by TGF-β1 and the development of stemness in a dose-dependent manner. Additionally, Rk1 and Rg5 markedly suppressed TGF-β1-induced metalloproteinase-2/9 (MMP2/9) activity, and activation of Smad2/3 and nuclear factor kappa B/extra-cellular signal regulated kinases (NF-kB/ERK) pathways in lung cancer cells. Conclusions: Rk1 and Rg5 regulate the EMT inducing TGF-β1 by suppressing the Smad and NF-κB/ERK pathways (non-Smad pathway).

• 한국식품과학회지
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• 제53권1호
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• pp.1-11
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• 2021

본 논문에서는 최근 10년간(2010-2019년) 바이러스에 의한 식중독 통계 및 바이러스 검출법과 제어법에 대한 자료를 정리하여 나타냈다. 국내에서 지난 10년 동안 바이러스에 의해 발생한 식중독 사고 488건 중 94.9%가 노로바이러스에 의한 것으로 확인되어 노로바이러스가 국내에서 가장 주요한 식중독 바이러스로 생각된다. 노로바이러스를 검출하는 방법으로는 PCR을 이용한 방법이 주로 보고되고 있으며 현재(2020년 12월) 식품 공전에 등록된 방법(고시 제 2010-45호)에 따라 전기 영동을 기반으로 한 one-step RT PCR 및 semi-nested PCR 방법이 널리 이용되고 있다. 또한 최근 DNA sequencing 기술이 발달됨에 따라서 검출된 바이러스의 서열을 분석하여 이미 보고된 바이러스의 서열과 비교한 논문들이 많이 보고되었다. 이 외에도 real-time PCR을 적용한 논문들도 보고되고 있으며 앞으로는 전기 영동을 실시하는 conventional PCR을 대신하여 신속하게 정량 검출이 가능한 realtime PCR의 활용이 늘어날 것으로 생각한다. 기타 바이러스의 검출에 있어서도 역시 PCR을 활용한 방법이 주로 보고되고 있으며 multiplex PCR을 활용하여 여러 종류의 바이러스를 동시에 검출하고자 하는 노력이 이루어지고 있다. 더 나아가서, 자기 면역력 분리와 퀀텀닷 분석 방법 등을 이용한 신속 검출법이 제시되고 있어 앞으로 여러 식품에 오염된 바이러스를 현장에서 신속분리 및 검출하는데 이용할 수 있을 것으로 전망된다. 한편, 노로바이러스는 실험실에서 배양하기가 어렵기 때문에 노로바이러스 제어 연구는 대체재를 이용한 방법들이 주를 이루었다. 옴 가열을 포함한 여러 종류의 열처리와 초고압, 오존, 감마선, 광펄스 등의 비가열 처리를 이용하여 노로바이러스의 저감 정도를 살펴본 연구들이 최근 보고되었다. 일반적으로 물이나 완충용액보다는 식품 샘플에서 바이러스의 저감 정도가 낮게 관찰되었는데 식품 matrix가 이러한 물리적 처리에 간섭 효과를 나타내기 때문으로 생각되며 이를 극복하기 위해서는 여러 물리적, 화학적 처리를 조합하여 처리할 필요가 있다. 기타 바이러스 제어 연구에 있어서는 열, 광펄스, 고압력 등의 물리적 처리와 더불어 살균제(sanitizer)를 적용한 논문들이 보고되고 있으며 식중독 바이러스의 저감 메커니즘에 대한 체계적인 연구가 수행되고 있는 것을 확인하였다. 여러 물리적, 화학적 처리에 대해서 식중독 바이러스가 저항성을 갖는 이유와 사멸되는 메커니즘을 정확하게 이해한다면 추후 여러 식품에서의 바이러스에 대한 안전성을 확보하는데 도움이 될 것으로 사료된다.

• 생명과학회지
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• 제33권1호
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• pp.73-81
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• 2023

본 연구에서는 어성초(Houttuynia cordata, HC) 와 야관문(Lespedeza cuneata, LC)의 열수 추출물과 메탄올 추출물의 순차적 유기용매 분획물을 제조하였다. LPS를 처리한 RAW264.7세포에서 HC와 LC의 열수 추출물과 메탄올 추출물의 유기용매 분획물의 항염증 활성을 연구하였다. 어성초와 야관문의 hexane, chloroform, ethyl acetate 분획물의 처리에 의해 농도의존적으로 nitric oxide (NO) 생산을 저해하였으며, iNOS의 발현도 감소되었다. 이전 연구에서 HC와 LC의 메탄올 추출물의 ethyl acetate 분획물의 플라보노이드 함량을 분석하였다. 분석된 플라보노이드 중 HC와 LC에 공통적으로 함유된 apigenin을 선택하여 추가실험을 진행하였다. Apigenin은 세포 생존율에 영향을 주지 않으면서 NO 생산을 저해하였으며, iNOS와 COX-2의 단백질 발현도 억제하였다. 또한, apigenin은 p38 MAPK와 JNK의 인산화를 억제함으로써 항염증 활성을 가지는 것으로 생각된다. Apigenin 처리에 의해 차별적으로 발현되는 유전자 발현을 확인하기 위하여 RNA-seq 분석을 수행하였다. 발현이 감소된 유전자 중 4개의 cytokine 유전자(IL-1α, IL-1β, IL-6, CSF2)의 발현 감소를 정량적 real-time PCR을 통해 확인하였다. 종합적으로, 본 연구결과는 어성초와 야관문은 항염증 활성을 가지고 있으며, apigenin이 두 약용 작물의 항염증 활성을 담당하는 중요한 성분 중의 하나가 될 수 있다는 것을 제시한다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제30권11호
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• pp.1529-1539
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• 2017

Objective: The objective of this study was to compare the DNA methylation profile in the longissimus dorsi muscle between Small Tailed Han and Dorper${\times}$Small Tailed Han crossbred sheep which were known to exhibit significant difference in meat-production. Methods: Six samples (three in each group) were subjected to the methylated DNA immunoprecipitation sequencing (MeDIP-seq) and subsequent bioinformatics analyses to detect differentially methylated regions (DMRs) between the two groups. Results: 23.08 Gb clean data from six samples were generated and 808 DMRs were identified in gene body or their neighboring up/downstream regions. Compared with Small Tailed Han sheep, we observed a tendency toward a global loss of DNA methylation in these DMRs in the crossbred group. Gene ontology enrichment analysis found several gene sets which were hypomethylated in gene-body region, including nucleoside binding, motor activity, phospholipid binding and cell junction. Numerous genes were found to be differentially methylated between the two groups with several genes significantly differentially methylated, including transforming growth factor beta 3 (TGFB3), acyl-CoA synthetase long chain family member 1 (ACSL1), ryanodine receptor 1 (RYR1), acyl-CoA oxidase 2 (ACOX2), peroxisome proliferator activated receptor-gamma2 (PPARG2), netrin 1 (NTN1), ras and rab interactor 2 (RIN2), microtubule associated protein RP/EB family member 1 (MAPRE1), ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2 (ADAMTS2), myomesin 1 (MYOM1), zinc finger, DHHC type containing 13 (ZDHHC13), and SH3 and PX domains 2B (SH3PXD2B). The real-time quantitative polymerase chain reaction validation showed that the 12 genes are differentially expressed between the two groups. Conclusion: In the current study, a tendency to a global loss of DNA methylation in these DMRs in the crossbred group was found. Twelve genes, TGFB3, ACSL1, RYR1, ACOX2, PPARG2, NTN1, RIN2, MAPRE1, ADAMTS2, MYOM1, ZDHHC13, and SH3PXD2B, were found to be differentially methylated between the two groups by gene ontology enrichment analysis. There are differences in the expression of 12 genes, of which ACSL1, RIN2, and ADAMTS2 have a negative correlation with methylation levels and the data suggest that DNA methylation levels in DMRs of the 3 genes may have an influence on the expression. These results will serve as a valuable resource for DNA methylation investigations on screening candidate genes which might be related to meat production in sheep.

• 대한소아신경학회지
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• 제23권2호
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• pp.45-50
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• 2015

목적: X-ALD는 Xq28에 위치한 ABCD1 유전자의 돌연변이로 긴사슬지방산이 신경 조직과 부신에 축적되어 일어나는 퇴행 뇌질환이며, 소아기 대뇌형의 경우 빠르고 심한 임상 경과를 보인다. 이 과정에서 산화스트레스도 조직 손상에 영향을 주는 것으로 알려져 있다. 골수이식이나 로렌조 기름 등이 치료 방법으로 이용되나 치료의 위험성과 효과에서 한계를 보이는 실정이다. 이에 저자들은 X-ALD 환자에게 채취한 섬유모세포를 이용하여, X-ALD의 치료 가능성을 알아보기 위하여 VPA의 효과를 연구해보고자 하였다. 방법: X-ALD 환자의 피부에서 채취한 섬유모세포와 정상인의 피부에서 채취한 섬유모세포를 배양하였다. 배양된 섬유모세포에 VPA를 처리한 후 RNA발현 정도를 통해 ABCD2 발현을 확인하고 유동세포계측법으로 활성산소종을 측정하였다. 결과: VPA을 처리한 후 정상과 X-ALD 섬유모세포 모두에서 ABCD2의 mRNA 발현이 증가하였다. 특히 X-ALD 섬유모세포에서 ABCD2 유전자 mRNA 발현이 2.22배로 정상의 1.76배보다 더 증가하였다. 유동세포계측법으로 활성산소종을 확인한 결과 대조군에서 13.7, VPA를 처리한 군에서는 각각 0.25 mM에서 8.67, 0.5 mM에서 9.37, 1 mM에서 5.83을 나타내었다. 결론: X-ALD 환자에서 VPA의 항산화능을 이용하여 신경손상을 막을 수 있는 가능성이 있을 것으로 보이며, 이를 실제 환자에 적용하는 연구가 필요할 것이다.