• 제목/요약/키워드: RSIV

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중합효소연쇄반응 (Polymerase Chain Reaction, PCR)법을 이용한 남해안 양식 해산어의 Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) 보유상황 확인 (Detection of RSIV (Red Sea Bream Iridovirus) in the Cultured Marine Fish by the Polymerase Chain Reaction)

  • 오명주;정성주;김영진
    • 한국어병학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.66-69
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    • 1999
  • 해산어의 참돔이리도바이러스 (RSIV) 감염 상황을 조사하기 위한 진단법으로 중합효소연쇄반응법(PCR)을 확립하고 1998년 여름 통영을 중심으로 대량폐사가 일어난 남해안 지역의 돌돔, 참돔 및 조피볼락을 대상으로 RSIV의 검출을 행한 결과 남해안 전역의 RSIV 감염이 확인되어졌다.

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2019년부터 2023년까지 국내에서 분리된 참돔이리도바이러스의 계통 분류 및 항원 결정기 예측 (Phylogenetic analysis and antigenic determinant prediction of red sea bream iridovirus isolated in Korea from 2019 to 2023)

  • 김국현;민준규;정현도;김광일
    • 한국어병학회지
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    • 제37권1호
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    • pp.25-36
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    • 2024
  • In this study, we analyzed the phylogenetic classification, epitope prediction, and pathogenicity of red sea bream iridovirus (RSIV) isolated from rock bream between 2019 and 2023. Phylogenetics based on genes encoding MCP and ATPase indicated that all five RSIV isolates belonged to RSIV subtype II. The deduced amino acid sequence of the MCP for the amplicons (1362 bp) obtained from RSIV isolates had a length of 453 amino acids. Among these, the amino acid sequences of the RSIV-19, 21, 22, and 23 isolates showed 100% identity, while the RSIV-20 isolate showed 99.78% identity with one residue difference at position 306. As a result of antigenicity analysis based on amino acid sequence, the antigenicity score of the RSIV-20 isolate was 0.6386 and the other RSIV isolates were 0.6365. Additionally, the prediction of their antigenic determinants resulted in a total of 17 identical antigenic plots. When each RSIV was inoculated into rock bream, no significant differences were observed with 100% cumulative mortality in all groups. This study provides data on the potential for genetic variation of RSIV isolated in the same marine area over the past five years, and the antigenicity and pathogenicity results of each isolate are expected to be useful information for selecting future vaccine strains.

남.서해안과 동중국해 자연산 어류에서 Red Sea Bream Iridovirus (RSIV)의 검출 (Detection of Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) from marine fish in the Southern Coastal Area and East China Sea)

  • 이월라;김석렬;윤현미;키타무라신이치;정성주;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.211-220
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    • 2007
  • Red sea bream iridovius (RSIV)는 우리나라와 일본의 참돔 (Pagrus major), 돌돔(Oplegnathus fasciatus) 등 주로 돔류에 질병을 유발하는 어류 병원바이러스로 알려져 왔으나, 돔류 이외에도 감수성을 나타내는 어종이 매우 다양하며 아시아를 중심으로 고수온기에 대량 폐사를 유발하는 중요한 원인체로 보고되고 있다. 본 연구는 RSIV에 대한 자연산어류에서 검출동향의 모니터링을 통해 금후 red sea bream iridoviral disease (RSIVD)에 대한 예방학적 접근의 일환으로서 자연산 어류로부터의 RSIV 검출 및 지리적 분포, 보균 어종에 대한 유전학적인 조사를 실시하였다. 조사는 2003년과, 2005년도에 동중국해역 3지점, 서해안 5지점 그리고 남해안 5지점에서 어류를 채집하여 PCR을 이용한 검출결과, 자연산 해산어류 160마리 중 39마리에서 RSIV가 검출되어 24.3%의 높은 검출율을 보였으며 특히 조사된 어류 중 상어목에서 가장 높은 검출율을 보였다. 자연산 어류에서 분리한 RSIV 분리주는 양식산어류에서 분리된 RSIV-K strain과 염기서열 분석에서 97.2%~100%, 아미노산 분석에서 94.7~100% 유사성을 나타내었으며 megalocytivirus Subgroup Ⅲ에 속함을 확인하였다.

국내 어류에서 분리된 Megalocytivirus의 유전형 분류 및 상관관계 분석 (Genetic relatedness of Megalocytivirus from diseased fishes in Korea)

  • 이은선;조미영;민은영;정승희;김광일
    • 한국어병학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.49-57
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    • 2019
  • 본 연구에서는 2012년부터 2018년 1월까지 국내 어류에서 참돔이리도바이러스병 (red sea bream iridoviral disease; RSIVD) 으로 확정 진단된 주요 분리주에 대하여 major capsid protein (MCP) 유전자의 염기서열을 바탕으로 Megalocytivirus의 유전적 관계를 명확히 했다. 또한, Megalocytivirus와 숙주 세포간 상호작용에 영향을 줄 수 있는 특이 유전자 2종, Vascular endothelial growth factor (VEGF) 및 Histidine triad motif인 HIT-like 단백질 (HIT)에 대한 염기서열 분석을 통해 유전적 상관관계를 고찰하였다. 국내 어류에서 분리된 39개의 megalocytiviruses는 2가지 유전형인 red sea bream iridovirus (RSIV)형과 turbot reddish body iridovirus (TRBIV)형으로 분류되었으며, RSIV형의 megalocytiviruses는 다시 유전아형인 RSIV-subgroup 1형과 2형으로 분류되었다. 그리고 VEGF 유전자 염기서열 분석 결과에서는 RSIV형의 바이러스에서 변이가 발생되었음을 확인할 수 있었으며, HIT-like 단백질 유전자는 RSIV형의 Megalocytivi rus에서만 발견되는 것을 알 수 있었다.

효모표면표출(YSD) 기법을 이용한 참돔 이리도바이러스(RSIV) 외피단백질의 발현 (Expression of the red sea bream iridovirus (RSIV) capsid protein using a yeast surface display method)

  • 서승석;박미례;황진익;이택견
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제15권8호
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    • pp.5412-5418
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    • 2014
  • 참돔 이리도바이러스(RSIV)는 이리도바이러스과에 속하며, 많은 아시아 국가에서 감염성 어류 질병을 유발하여 양식산업에 커다란 경제적 손실을 입히는 바이러스이다. 우리는 최근에 효모표면발현(yeast surface display, YSD)를 사용하여 다양한 해양바이러스를 동정하고 검출할 수 있는 새로운 실험시스템을 개발하였다. 이 연구에서 우리는 참돔 이리도 바이러스(RSIV)의 외피단백질을 효모표면 발현 기법을 이용하여 발현시켰다. 바이러스 외피단백질 유전자는 염기서열 데이터베이스에 기초하여 합성되었고, 효모발현벡터인 pCTCON2으로 서브클로닝되었다. 이 벡터는 효모 strain EBY100으로 형질전환 되었다. Flow cytometry와 Western blot analysis를 통해 RSIV 외피단백질의 발현을 확인하였다. ${\beta}$-mercaptoethanol 처리에 의해 발현된 바이러스 외피단백질을 효모 표면로부터 분리하였다. 이 연구의 결과는 YSD 시스템이 해양바이러스 외피단백질을 획득하기 위한 매우 좋은 발현시스템이라는 것을 보여준다.

Development of DNA Vaccine Against Red Sea Bream Iridovirus (RSIV)

  • PARK SO-JIN;SEO HYO-JIN;SON JEONG HWA;KIM HYOUNG-JUN;KIM YUN-IM;KIM KI-HONG;NAM YOON-KWON;KIM SUNG-KOO
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권4호
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    • pp.873-879
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    • 2005
  • Red sea bream iridovirus (RSIV) obtained from infected rock bream was propagated by Bluegill fry-2 (BF-2) cell culture. The virus titer was determined as $10^{5.5}\;TCID_{50}/ml$ on confluent BF-2 cell monolayers. The integrin binding site of ORF 055L of infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV) was selected for the construction of a primer to obtain the RSIV ORF 055L gene. The genes were amplified using RSIV gene lyzate by PCR. The homologies of the ORF 055L sequence of RSIV with ISKNV and rock bream iridovirus (RBIV) were approximately $96\%$ and $100\%$, respectively. DNA vaccine was constructed by cloning the ORF 055L of RSN into pcDNA 3.1 (+), containing a cytomegalovirus (CMV) promoter. For antibody production, pcDNA-055 DNA vaccine was injected to BALB/c mice. The production of antibodies against pcDNA-055 DNA vaccine was confirmed by the Western blot analysis. The antibodies produced by the pcDNA-055 DNA vaccine showed efficacy to neutralize the RSIV in the neutralization test in BF-2 cell culture.

수온별 Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) 인위감염에 따른 돌돔의 누적폐사 및 Heat Shock Protein (HSP) 70의 동정 (Cumulative Mortality in Striped Beakperch, Oplegnathus fasciatus Infected with Red Sea Bream Iridovirus (RSIV) at Different Water Temperature and Identification of Heat Shock Protein 70)

  • 김석렬;정병문;정성주;키타무라 신이치;김두운;김도형;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제21권1호
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    • pp.13-20
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    • 2008
  • 본 연구에서는 RSIV의 수온에 따른 병원성을 규명하기 위한 연구의 일환으로 수온별로 RSIV를 인위적으로 감염시킨 돌돔의 누적폐사를 관찰하고, 다른 온도에서 사육된 돌돔의 온도 스트레스 단백질인 HSP이 관여하는지를 확인하고자, 돌돔의 HSP 유전자의 염기서열 일부를 밝혔다. 각온도별 감염실험에서 17°C와 20°C의 경우 폐사가 발생하지 않았으나, 25°C 및 27°C 수조에서는 각각 90%와 80%의 누적 폐사율을 보였다. 돌돔에서 확인된 HSP 유전자의 일부는 넙치에서 확인된 HSP70와 97%의 homology를 나타내 돌돔의 HSP70으로 판단되었다.

Experimental transmission of red sea bream iridovirus (RSIV) between rock bream (Oplegnathus fasciatus) and rockfish (Sebastes schlegelii)

  • Min, Joon Gyu;Jeong, Ye Jin;Jeong, Min A;Kim, Jae-Ok;Hwang, Jee Youn;Kwon, Mun-Gyeong;Kim, Kwang Il
    • 한국어병학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.1-7
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    • 2021
  • Red sea bream iridovirus (RSIV), belonging to the genus Megalocytivirus, is the predominant cause of mortality in marine fishes in Korea, including rock bream (Oplegnathus fasciatus). Rockfish (Sebastes schlegelii) are the host fish for RSIV, exhibiting no clinical signs or mortality. Cohabitation challenges, which mimicked natural transmission conditions, were performed to evaluate viral transmission between rock bream and rockfish, and to determine the pathogenicity and viral loads. In cohabitation challenge, artificially RSIV-infected rock bream were the viral donor, and healthy rockfish were the recipient. The results showed that although the donor rock bream had 95-100 % cumulative mortality (>108 viral genome copies/mg of spleen 7-14 days after viral infection), the recipient rockfish did not die, even when the viral genome copies in the spleen were >105 copies/mg. These results indicated asymptomatic infections. Notably, in a reverse-cohabitation challenge (artificially RSIV-infected rockfish as the viral donor and healthy rock bream as the recipient), RSIV horizontally infected from subclinical rockfish to rock bream (107 viral genome copies/mg of spleen 21 days after cohabitation) with 10-20% cumulative mortality. These results suggest that an asymptomatic, infected rockfish can naturally transmit the RSIV without being sacrificed.

Evaluation of a novel TaqMan probe-based real-time polymerase chain reaction (PCR) assay for detection and quantitation of red sea bream iridovirus

  • Kim, Guk Hyun;Kim, Min Jae;Choi, Hee Ju;Koo, Min Ji;Kim, Min Jeong;Min, Joon Gyu;Kim, Kwang Il
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제24권11호
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    • pp.351-359
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    • 2021
  • The red sea bream iridovirus (RSIV) belonging to genus Megalocytivirus is responsible for red sea bream iridoviral disease (RSIVD) in marine and freshwater fishes. Although several diagnostic assays for RSIV have been developed, diagnostic sensitivity (DSe) and specificity (DSp) of real-time polymerase chain reaction (PCR) assays are not yet evaluated. In this study, we developed a TaqMan probe-based real-time PCR method and evaluated its DSe and DSp. To detect RSIV, the probe and primers were designed based on consensus sequences of the major capsid protein (MCP) genes from megalocytiviruses including RSIV, infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV), and turbot reddish body iridovirus (TRBIV). The probe and primers were shown to be specific for RSIV, ISKNV, and TRBIV-types megalocytiviruses. A 95% limit of detection (LOD95%) was determined to be 5.3 viral genome copies/µL of plasmid DNA containing the MCP gene from RSIV. The DSe and DSp of the developed real-time PCR assay for field samples (n = 112) were compared with those of conventional PCR assays and found to be 100% and 95.2%, respectively. The quantitative results for SYBR Green and TaqMan probe-based real-time PCR were not significantly different. The TaqMan probe-based real-time PCR assay for RSIV may be used as an appropriate diagnostic tool for qualitative and quantitative analysis.

양식산 Tubot, Scophthalmus maximus 감염원으로 확인된 Iridovirus의 분자생물학적 연구 (Molecular Characterization of Iridovirus in Cultured Turbot, Scophthazmus maximus)

  • 김기홍;김위식;김춘섭;김영진;키타무라신이치;정성주;정태성;오명주
    • 한국양식학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.24-29
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    • 2004
  • 2003년 6월과 7월, 고창에서 사육중인 turbot이 약 90% 누적폐사되었고, 주 증상은 안구돌출, 비장 비대 그리고 장내 내용물이 없는 것으로 관찰되었다. 병리조직학적 검사에서 RSIV와 유사한 이형비대세포가 모든 장기에서 관찰되어 RSIV검출을 위한 primer로 PCR을 실시하였다. 그 결과 PCR에서 특이밴드가 모든 조직에서 검출되어졌고, 염기서열 분석 결과 기존에 보고된 strain과 88%이상의 유사성을 나타내는 것으로 확인 되어져서 터봇의 페사 원인으로 이리도바이러스감염이 관여됨을 확인할 수 있었다.