• 생명과학회지
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• 제20권12호
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• pp.1764-1771
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• 2010

홍화(Carthamus tinctorius L.)는 세계 여러 나라에 분포하고 있는 초본류이다. 이 종은 경제적으로 중요한데 홍화는 약용, 적색소, 노랑 색소로 이용된다. RAPD 기법으로 홍화의 26 집단 간 유연관계와 유전적 다양성을 조사하였다. 모든 집단에서 123개 밴드를 얻었으며 시발체(primer) 당 평균 9.5개 밴드를 나타내었다. 홍화의 유전적 다양도는 집단 내에 대부분 귀속되며 높은 집단 간 분화를 나타내었다. OPC18-01 밴드는 시리아 그룹에 특이 밴드였으며 다른 나라 집단에서는 발견되지 않았다. 이런 7개 특이 마크(SCAR)를 발견하였다. 비록 홍화의 분석한 개체 수가 적고 각 나라의 대표성을 의미하지 않지만 본 연구 결과 지중해의 지역(모로코, 시리아, 터키)이 인도를 제외한 다른 지역보다 변이가 높았다. 단순히 RAPD만으로 단정하기 어렵지만 홍화의 기원 센터의 후보군으로 지중해 연안으로 추정된다. 인도 역시 홍화의 2차 센터의 후보군이다. RAPD 마커는 홍화의 자연 집단을 분류하는데 효과적이었다.

• 한국약용작물학회지
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• 제11권5호
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• pp.377-384
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• 2003

본 연구는 고려인삼 재래종의 유전적 차이를 RAPD marker로 평가하였다. 재래종은 우리나라 주요 인삼재배 단지인 괴산, 금산, 남원, 포천, 양주, 연천, 영주로부터 수집한 인삼에서 10개체를 임의 선발하여 사용하였다. 9개 지역의 90개체를 대상으로 RAPD분석을 한 결과 48개의 primer 중 OPA 7, OPA 13, URP 2, URP 3, UBC 3의 5개 primer가 재현성이 있고 재래종 내 개체간에도 다형성인 band를 보였다. 재래종 집단간보다 재래종 내에서 유전적 다양성이 낮았다. 재래종 집단 간 또는 재래종 집단내의 유전적 차이가 있다는 것은 이 집단들이 헤테로라는 것을 의미한다. 이러한 결과는 우리나라에서 재배중인 고려 인삼은 유전 자원의 혼합으로 헤테로라는 것을 암시한다. 선발된 5개의 primer를 이용하여 90개체를 집괴분석한 결과 국내 재래종 인삼은 5개군으로 그리고 3개의 아군으로 구분되었다. 국내 재래종 인삼은 유전적 변이가 크므로 인삼 육종을 위한 재료로 이용될 수 있을 것이다.

• 한국응용곤충학회지
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• 제47권1호
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• pp.37-44
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• 2008

복숭아순나방(Grapholita molesta)은 사과에 주요 해충이다. 이 해충을 환경친화형 방법으로 방제하기 위해 성페로몬을 이용한 교미교란제 처리 기술이 개발되고 있다. 광범위한 영역에 대한 교미교란제의 처리는 복숭아순나방 방제에 효과적이나 이러한 광범위영역에 대한 구체적 크기를 결정하는 방법은 알려지지 않았다. 이를 결정하기 위해서는 복숭아순나방의 교미행동 범위를 결정할 수 있는 방법이 개발되어야 하며, 이를 위해 복숭아순나방의 이동을 추적할 수 있는 분자지표의 개발이 필요하게 되었다. 본 연구는 RAPD (random amplified polymorphic DNA) 기술을 이용하여 효과적인 두 개의 분자지표를 개발하였다. 상이한 지역과 시기에 따라 구분되는 야외 복숭아순나방 집단들에 대해서 이들 분자지표를 이용하여 집단 유전 분석이 실시되었다 이들 분자지표들은 특정지역에서 복숭아순나방 집단들이 시기적으로 유전적 조성에 뚜렷한 차이를 보여 주었다. 또한 서로 다른 지역의 복숭아순나방 집단들은 거리에 따라 상대적으로 차이가 증가하였지만, 계절이 진행함에 따라 그 차이가 감소하였다.

• 한국약용작물학회지
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• 제10권5호
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• pp.384-391
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• 2002

한약재 및 식품으로의 개발가능성이 높지만 현재 멸종 위험에까지 처해있는 천문동의 체계적 보호 및 보존을 위하여 수집된 유전자원의 유전 유연관계 분석을 실시한 결과는 다음과 같다. 1. 수집된 자생 천문동 23종에 대한 RAPD분석을 실시한 결과 primer 당 평균 8.5개의 PCR 밴드가 얻어졌으며 polymorphism 비율이 $42.9{\sim}91.7%$ 이었으며 평균 72.9%를 나타내어 객관적 다형 현상 분석이 가능하였다. 2. 유사도 0.82를 기준으로 23개의 천문동 수집종을 구분한 결과 6개의 group으로 분리되었는데 group I 은 전남 여수의 은적암, 경남 남해 이동, 전북 부안 위도, 전남 진도 지산과 전북 부안 하서종 이었고 Group II는 전남 영광 송이도와 전북 부안 계화. 전북 고창 아산 2, 전북 군산 개야도(적경종), 전북 고창 아산 1 그리고 일본 자생종 이었으며 group III는 전남 여수의 향일암, 충남 보령 남포, 전북 군산 선유도 1, 전북 군산 선유도 2, 전북 군산 오식도, 충남 서천 서면 자생종, Group IV는 경남 사천종과 전북 군산 선유도 2 적경종이었고 Group V는 전북 익산 금마 자생종과 중국 호남성의 적경종, Group IV는 중국종(청경종)과 군산 개야도 자생종(청경종)으로 각각 나뉘어겼다. 3. BLOTTO 사용에 의한 효율적 유연관계 분석에서는 BLOTTO를 사용할 경우 PCR 효율이 향상되어 band 획득수가 증가하고 좀더 선명한 PCR 산물의 획득이 가능하였으며 적절한 사용농도는 1% 이었다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권4호
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• pp.453-457
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• 2005

The genetic variations in three major river populations viz. the Halda, the Jamuna and the Padma of the Indian major carp, Catla catla were analyzed by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers. Four decamer primers were used for amplifying DNA of 10 individuals from each population. The proportion of polymorphic loci and the gene diversity estimates were 59.4 and 0.20 for the Halda, 37.5 and 0.14 for the Jamuna and 46.9 and 0.16 for the Padma populations respectively indicating the existence of a relatively high level of genetic variation in the Halda river population. The inter-population similarity indices, gene flow and genetic distance values indicated that the Jamuna-Padma population pair of catla was genetically closer than the Halda-Jamuna and the Halda-Padma population pairs in compliance with the geographical distances among them. The coefficient of gene differentiation ($G_{ST}$=0.13) reflects some degree of genetic differentiation among three populations of catla studied. The data suggest that the RAPD technique could be used to discriminate different river populations of catla.

• 한국작물학회지
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• 제56권1호
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• pp.35-43
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• 2011

Thirty five isolates of Trichoderma species collected from seven different locations of Bangladesh were studied for morphological characters and molecular variation. Mycelial diameters of the isolates varied from 8.28 cm to 9.00 cm. Based on colony colour, isolates were grouped into five such as dark green, green, light green, yellowish green and whitish green. Maximum isolates were green and light green. On the basis of growth habit and colony consistency, the isolates were categorized into three groups, in which most species had fast growth and were compact in appearance. PCR-based Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique employing 3 decamer primers produced 36 scorable bands of which all (100%) were polymorphic. The co-efficient of gene differentiation (Gst) was 1.0000 reflecting the existence of high level of genetic diversity among the isolates. The Unweighted Pair Group Method of Arithmetic Means (UPGMA) dendrogram constructed from Nei's (1972) genetic distance produced 2 main clusters (13 isolates in cluster 1 and 22 isolates in cluster 2). The result indicating their genetic diversity has opened new possibility of using the most efficient and more isolates of Trichoderma in the preparation of biopesticide and decomposition of municipality waste.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제14권11호
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• pp.1520-1522
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• 2001

Relationship among Tibetan cashmere goats, Inner Mongolia cashmere goats and Liaoning cashmere goats was studied using the technique of random amplified polymorphic DNA (RAPD). One primer and four primer combinations were screened. With the five primers and primer combinations, DNA fragments were amplified from the three breeds. Each breed has 28 samples. According to their RAPD fingerprint maps, the Nei's (1972) standard genetic distance was: 0.0876 between Tibetan cashmere goats and Inner Mongolia cashmere goats, 0.1601 between Tibetan cashmere goats and Liaoning cashmere goats, 0.0803 between the Inner Mongolia cashmere goats and Liaoning cashmere goats. It coincides with their geographic location. The genetic heterogeneity of Tibetan cashmere goats, Inner Mongolia cashmere goats and Liaoning cashmere goats is 0.3266, 0.2622 and 0.2475 respectively. It is also consistent with their development history.

• Plant Resources
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• 제5권1호
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• pp.59-69
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• 2002

Twenty-three plants of Japanese apricot (Prunus mume) were collected from several sites around Mountains JIRI in Korea. Japanese apricots having the different morphological features were evenly distributed in the groups made from the cluster analysis, indicating no geographic distributions but artificial vegetations in Korea. Japanese apricots were, as based on the PCR-RAPD techniques, clustered into the three groups; a group (prototype) having the five white petals with the five red sepals, a group (green type) having the five white petals with the five green sepals, and a group (hybrid type) having the more than five red petals with various colored sepals. The prototype apricots showed higher toxicities than other type apricot against bacteria and production of less compounds in TLC plates. The polypetal types of Japanes apricot were related to those of p. armebiaca in the characteristics of seed (the ruggedness), but also to be closed to those of p. armebiaca in PCR-RAPD analysis. The cluster analysis of the twenty three apricots and its related species calculated from the two primers were shown to distinguish relationships of cultivars within species, or of individual plants within cultivars, but also to display the two overlapping bands resulted from PCR-RAPD technique.

• 한국수산과학회지
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• 제36권6호
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• pp.654-660
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• 2003

To evaluate the biological diversity of fish pathogenic streptococci, 35 strains isolated from diseased olive flounder (Paralichtys olivaceus), were analyzed using a random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique with the oligonucleotide commercial primer 6 (Amersham Biosciences). Api 20 Strep test, drug resistance and artificial infection were carried out for further characterization of the isolates. RAPD fingerprints showed similar pattern in 25 strains (about $71.4\%$ of 35 isolates) and these strains were designed as RA group 1. Similarities greater than $44\%$ were obtained when the Dice coefficient was applied among the isolates of RA 1. On the other hand, the reference Streptococcus iniae showed a similar RAPD profile to the isolates with similarity levels of $40-93.3\%.$ Rh I was suggested to be the dominant group isolated from olive flounder suffering from streptococcosis. However, the isolates of Rh 1 group were not classified into the same species by the Api 20 Strep identification system. There was no peculiarity in drug resistance patterns of Rh I group isolates against 7 antibacterial agents. However, only 3 of 25 isolates $(0.12\%)$ showed oxytetracycline (OTC) resistance and OTC might be a useful chemotherapeutic agent in controlling the streptococcosis by strains of RA I group in olive flounder. Fish injected intraperitoneally with $10^5$ CFU of an isolate of Rh I and RA III group showed $60\%\;and\;50\%$ accumulative mortality for 20 days, respectively ($20\%$ in control or Rh II). However luther comparative studies about differences in virulence between isolates are needed.

• 한국양식학회지
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• 제17권4호
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• pp.251-257
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• 2004

상업적 가치가 높고 양식 가능성이 있는 백합과 5종을 대상으로 RAPD방법을 이용한 개체간의 유전적 유연관계를 조사하였다. DNA 추출은 protein K-phenol방법을 사용하여 각 종의 후폐각근에서 추출하였다. RAPD-PCR결과 15개의 primer들이 증폭되었고, 그들로부터 각각 1-3개의 band를 볼 수 있었다. 백합과 5종간 유전적 유사도는 살조개와 바지락간에는 0.84, 개조개와 백합간에는 0.87로 각각의 두 종간에는 놓은 유사도를 보였고, 가무락조개는 살조개와 바지락간에 0.78의 유사도를 보였으며, 개조개와 백합, 살조개, 바지락, 가무락조개간에는 0.46의 비교적 낮은 유전적 유사도를 보였다. RAPD 방법으로 종내개체 유전변이를 파악하기는 힘들어도, 양식이나 자원증식을 위한 패류의 우수형질 선택에 있어 기본 정보를 제공 할 수는 있을 것이다. 또한, 살조개 대량종묘생산의 방법은 유전적 유사도가 가장 가까운 바지락을 중심으로 이루어져야 할 것으로 사료된다.