• 한국수산과학회지
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• 제29권6호
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• pp.770-778
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• 1996

A rapid and economical method of simultaneous extraction of DNA and RNA from seaweeds has been developed by the use of lithium chloride. Lithium chloride facilitates the softening of cell walls resulting in a decrease in both compressive and tensile modulus of elasticity. The DNA was characterized by high molecular weight larger than 27 kb and a relative lack of carbohydrate and protein contamination. The DNA and RNA extracted by the method from many seaweeds were of sufficient quality to be used as a template for per amplification with a plant intergenic gene primer set, for RAPD analysis with arbitrary primers, and for differential display with arbitrary primers in the morphologically distinct regions of the matured Porphyra thallus. The cDNA polymorphism indicated that the reproductive tissue types (male, female, patch) had a relatively high degree of similarity; the vegetative tissue types (dividing, non-dividing) also showed a similar pattern with respect to each other. Holdfast tissue had very low similarity with the other tissues, but appeared most similar to vegetative non-dividing tissue type.

• 한국자원식물학회지
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• 제24권6호
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• pp.675-687
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• 2011

Mulberries have importance in the sericulture industry as food for Bombyx mori, silkworm reared for its silk. Korean Morus alba have many cultivars and, for the protection of these cultivars and for utilization in plant-breeding programs, genetic information and the diversity among cultivars are essential. This study with 14 mulberry genotypes was undertaken using RAPD and ISSR fingerprinting to discover the genetic divergences between cultivars. Polymorphism rate among the cultivars produced by RAPD primer was found to be 64.48% and 66.29% relative to ISSR primer. The genetic relationships among the cultivars were identified using a dendrogram constructed with the UPGMA clustering method. Nei's method was used to calculate the genetic dissimilarity coefficients between each pair of genotypes, and the highest dissimilarity coefficient of 0.246 was exhibited between Suwon and Hwanggum cultivars. To determine the efficiency of each primer, a polymorphic index was calculated, and the robustness of the dendrogram was checked using cophenetic correlation coefficient. The results of this study can be utilized for the improvement of mulberry varieties in plant-breeding programs.

• 한국자원식물학회지
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• 제20권6호
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• pp.511-517
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• 2007

A stable method for strain distinction using viral RNA 1 structures analyses was developed and compared with the combined RT-PCR and RAPD methods. Seven out of 61 random primers were found to be polymorphic based on RAPD analysis resulting on the differentiation of the 33 BaYMV isolates into four distinct groups according to geographical districts. The first and largest group includes 13 isolate and consists mainly of two-rowed malting barley in Haenam area. The second group had ten collections from inland in west southern. The third group had seven isolates from west southern coastal region, where mainly six-rowed naked barley is cultivated. The last fourth group included three isolates from Gyungnam region in east southern area. Conclusively, RNA 1 analysis proved to be stable and efficient method for strain distinction for Korean BaYMV isolates. Further, results of pathogenicity and RNA 1 structure analyses revealed four groups BaYMV strains and were distributed all over Korea, represented by Naju, Haenam-okcheon, Iksan and Milyang.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제15권4호
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• pp.315-324
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• 2011

본 연구는 칡소와 한우 그리고 젖소의 각 군을 통하여 RAPD-PCR방법과 RFLP방법을 응용하여 칡소에서 특이적으로 발현되는 유전자의 검출과 발현빈도에 따른 표지유전자를 분석하여 칡소 특이적인 표지인자를 탐색하고자 실시하였다. 연구결과, RAPD분석을 통하여 칡소에서 특이적으로 표현되는 유전자들을 발견할 수 있었으며, 검출 유전자의 다양성이 모색과 종간의 차이가 있음을 알 수 있었다. 특이적으로 표현된 유전자들 중 칡소에서 특이적으로 표현되는 R9B 유전자를 발견할 수 있었고, 이 유전자는 한우와 젖소의 일부 DNA 염기서열상의 차이점이 있음을 확인할 수 있었으며, 추후 칡소의 표지유전자로 적용할 수 있을 것이라 사료되었다.

• Advances in Traditional Medicine
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• 제7권1호
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• pp.26-33
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• 2007

Genetic polymorphism and molecular authentication were investigated with the commercial medicinal herb, Peony (Paeonia spp.), using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. To identify the polymorphism of the RAPD patterns among plant origins, 20 different random primers were applied to the genomic DNA extracted from Paeonia spp. plants such as Paeonia (P.) lactiflora, P. officinale and P. japonica. Ten primers out of 20 primers could be used to discriminate the plant species in the same genus and 72 out of 81 scored DNA fragments (88.9%) generated with these primers were polymorphic. Especially, four primers, such as OPA1, OPA3, OP9, and OPA13, were useful to discriminate the plant origins among the species of Peony. In the results of cluster analysis using RAPD data obtained from the 10 primers, Peony (Paeonia spp.) plants used in this study were grouped into the two distinctive clusters, genetically. Herb medicine, especially P. lactiflora, were easily identified, when species-specific primers were applied to the investigation for discriminating herb medicine currently traded in domestic herb market, Kyungdongmart. Consequently, RAPD analysis was useful method to discriminate plant origins and the commercial medicinal herbs, Paeonia spp..

• 생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.115-120
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• 2004

민자주방망이버섯은 우수한 식용버섯으로 세계적으로 분포하고 있는 종이다. 민자주방망이버섯과 5가지 송이과버섯 종들의 유전적인 변이와 분류학적 관계를 RAPD에 의해 분석 하였다. RAPD에 15가지 random primer를 사용하였다. 버섯들의 유전적 거리는 UPCMA를 사용하여 측정하였고 계통유전학적 유연관계는 neighnor-joining (NJ) 방법을 사용하여 분석하였다. PCR에 의하여 증폭된 RAPD 절편들은 100bp에서 1600 bp이었다. Nei-Li의 유전적 거리는 228개의 DNA밴드를 사용하여 계산하였고 이를 바탕으로 계통유전학적 계통수를 만들었다. 민자주방망이버섯, 자주방망이버섯 아재비, 가랑잎애기버섯, 밀버섯, 만가닥버섯, 졸각버섯의 유전적 변이 는 각각 0∼21.3%, 21.2∼28.0%, 15.4∼23.0%, 14.0∼21.8%, 16,5∼34.6%, 12.4∼27.4%이였다. CI (Consistency index), RI (Retention index), HI (Homoplasy inedx)의 값은 각각 0.5217, 0.5769, 0.5156이었다. 또한 NJ tree로 두 그룹을 만들 수 있었다. 유전적 거리는 민자주방망이버섯과 자주방망이버섯아재비보다 민자주방망이버섯과 밀버섯이 더 가까웠다.

• 한국약용작물학회지
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• 제19권3호
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• pp.162-169
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• 2011

The rhizomes and herbal medicines originating from Acorus gramineus, A. calamus, A. tatarinowii, and A. gramineus var. pusilus, show significant similarity, and the correct identification of species is very difficult. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) were used to develop a reliable method for identification of these four species. Several distinct SCAR markers were developed from species-specific RAPD amplicons for each species. Furthermore, a useful molecular marker was established for multiplex-PCR, in order to the four species could be distinguished concurrently. These markers allow efficient and rapid identification of closely-related Acorus species and will be useful for standardization of herbal medicines.

• 한국응용곤충학회지
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• 제36권3호
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• pp.206-214
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• 1997

본 연구에서는 현재 농가에서 일대잡종으로 보급되고 있는 장려누에품종 원종 잠 113 등 20계통에 대해서 RAPD-PRC방법을 이용하여 누에 품봉간 유전적 유연관계를 분석, 검토하였다. 그 결과 공시한 26개의 primer중 24개의 primer에서 다형화 밴드패턴의 마커가 확인되어, 이들 마커를 UPGMA법에 의해 분석하였다. 그 결과, 유전적 유연계수 0.60을 기준으로 하였을 때 2개의 group으로 나눌 수 있었는데 제1group에는 잠113, 잠119, 잠120, 잠123, 잠125와 잠127로서 중국종계잠 120을 제외하고는 모두 일본종계 품종이 포함되어 있었으며, 제 2group은 잠114, 잠121, 잠122, 잠124, 잠126, 잠128, 잠129, 잠130, 잠131, 잠132, 잠133, 잠134, 잠 301과 잠 302로서 일본종계 5품종 중국종계 9품종이 포함되었다. 또한, 잠 114와 잠 120 및 잠114와 잠 127은 유전거리가 다른 품종에 비해서 가장 낮게 분석되었으며, 잠 129와 잠 131은 유전적 유연계수가 1.0으로 두 품종간에는 유전적 유사도가 아주 높았다.

• 생명과학회지
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• 제20권1호
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• pp.119-123
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• 2010

본 연구는 차조기 유전자원의 유전적 특성 분석을 위해 차조기 유전자원의 유전적 변이를 DNA 수준에서 비교하고, 이들의 유전적 근연성 및 변이정도를 규명하여 유전 및 육종의 기초자료를 제공하기 위하여 수행한 연구의 결과로서, RAPD를 이용하여 국내에서 수집한 차조기 유전자원의 DNA polymorphism을 관찰한 결과 80개의 primer 중에서 22개의 변별력 있는 primer가 선발되었고 이들 22개의 primer는 총 224개의 band가 나타났으며, 이중에서 polymorphic band는 127개 이었다. UPGMA에 의한 유사도 계수는 0.72~0.94 이었고, 유사도계수 matrix를 이용한 유연관계의 분석 결과 차조기 유전자원 22계통은 하나의 큰 그룹과 하나의 작은 그룹을 형성하였다. 그리고 NTSYS에 의한 유연관계 분석의 결과와 생육특성인 개화기, 성숙기, 경장, 분지수, 마디수와 화방군장 및 삭수와의 밀접한 관련성은 확인하지 못하였다.

• 한국양식학회지
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• 제17권4호
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• pp.251-257
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• 2004

상업적 가치가 높고 양식 가능성이 있는 백합과 5종을 대상으로 RAPD방법을 이용한 개체간의 유전적 유연관계를 조사하였다. DNA 추출은 protein K-phenol방법을 사용하여 각 종의 후폐각근에서 추출하였다. RAPD-PCR결과 15개의 primer들이 증폭되었고, 그들로부터 각각 1-3개의 band를 볼 수 있었다. 백합과 5종간 유전적 유사도는 살조개와 바지락간에는 0.84, 개조개와 백합간에는 0.87로 각각의 두 종간에는 놓은 유사도를 보였고, 가무락조개는 살조개와 바지락간에 0.78의 유사도를 보였으며, 개조개와 백합, 살조개, 바지락, 가무락조개간에는 0.46의 비교적 낮은 유전적 유사도를 보였다. RAPD 방법으로 종내개체 유전변이를 파악하기는 힘들어도, 양식이나 자원증식을 위한 패류의 우수형질 선택에 있어 기본 정보를 제공 할 수는 있을 것이다. 또한, 살조개 대량종묘생산의 방법은 유전적 유사도가 가장 가까운 바지락을 중심으로 이루어져야 할 것으로 사료된다.