Yong Ho Shin;Min Ju Choi;Hyun Su Kang;Yong Chull Jeun
식물병연구
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제29권1호
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pp.39-44
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2023
To diagnose lily fasciation, lily bulbs showing fasciation were collected from several greenhouses in Jeju Island, South Korea. Bacteria were isolated from the lily bulbs and amplified with both primers for fasA in plasmid and for putative glycosyltransferase epsH gene in chromosome of Rhodococcus fascians. Three bacterial isolates were detected with the P450 primer set and identified as R. fascians by NCBI blast analysis. Twelve bacterial isolates were identified as R. fascians using RS02785 primer set, including the three bacterial isolates identified as the same pathogen using the P450 primer set. Pathogenicity of these bacterial strains identified as R. fascians was demonstrated. Apparent symptoms were observed on wounded lily leaves after inoculation with each bacterial suspension whereas no symptom was found on lily leaves treated with H2O. Furthermore, bacteria re-isolated from wounded sites were identified as R. fascians. Based on the results, these two sets of primers are recommended for quarantine of R. fascians.
본 실험에 사용된 균주는 유류로 오염된 지역의 토양시료로부터 직접 분리한 Rhodococcus fascians로 이전 연구에서 항공유의 분해에 효과가 있는 것으로 밝혀진 균주이다. 디젤유가 항공유보다 R. fascians의 생장에 영향을 주는 것으로 나타났다. 해수중의 디젤 분해를 위해서는 2%이상의 접종량이 효과적이며 접종량이 증가할 경우 잔류량이 더 감소하였으나 큰 차이는 없었다. 해수중의 디젤이 5%이상에서는 디젤유의 독성에 의해 R. fascians의 생장이 저해를 받아 디젤 잔류량이 높게 나타났다. R. fascians는 pH 8에서 가장 높은 디젤 분해속도를 보였으며 비교적 넓은 pH 범위에서 디젤 분해도가 유지되는 것으로 나타났다. R. fascians의 최적 성장온도 보다 높은 $32^{\circ}C$에서는 디젤의 분해에 온도증가에 따른 자연분해의 영향이 큰 것으로 나타났다. R. fascians의 해수중 디젤유 분해의 최적온도는 $27^{\circ}C$로 최적 생장온도에서 분해가 활발히 이루어지는 것을 알 수 있었다.
Contamination of soils, groundwater, air and marine environment with hazardous and toxic chemicals is major side effect by the industrialization. Bioremediation, the application of microorganism or microbial processes to degrade environmental contaminant, is one of the new environmental technologies. Because of low water solubility and volatility of diesel, bioremediation is more efficient than physical and chemical methods. The purpose of this study is biodegradation of diesel in sand by using Rhodococcus fascians, a microorganism isolated from petroleum contaminated soil. This study was performed in the column containing sand obtained from sea sides. Changes in biodegradability of diesel with various flow rates, inoculum sizes, diesel concentrations, and pH were investigated in sand column. The optimal condition for biodegradation of diesel by R. fascians in sand column system was initial pH 8 and air flow rate of 30 mL/min. Higher diesel degradation was achieved at larger inoculum size and the diesel degradation by R. fascians was not inhibited by diesel concentration up to 5%.
유류 오염 토양으로부터 항공유 JP-8을 분해하는 능력이 우수한 균주를 분리하여 16S rDNA 염기서열 분석한 결과 Rhodococcus fascians로 확인되었다. 분리된 R. fascians를 MSM 배지에 JP-8을 탄소원으로 배양하여 그 성장특성과 JP-8 분해 특성을 고찰하였다. 분리된 R. fascians는 2% JP-8을 포함하는 배지에서 5일 이내에 JP-8 대부분을 분해하였다. 16% JP-8을 포함하는 배지에서는 10일 동안 배양액 내 JP-8의 농도를 초기 농도의 14%까지 낮출 수 있었다. $17^{\circ}C$ 부터 $32^{\circ}C$ 까지 JP-8의 분해에 미치는 영향을 살펴본 결과 5일 후에는 모든 시료에서 JP-8의 대부분이 제거되었으며 온도가 낮을수록 R. fascians에 의하여 분해되는 JP-8의 양이 많은 것으로 나타났다. 배지의 초기 pH는 pH5에서 초기 분해속도가 비교적 낮았으나 pH8 까지 모두 5일만에 JP-8의 대부분이 제거되었다.
본 실험에 사용된 균주는 유류에서 오염된 지역의 토양 시료로부터 직접 분리 하였는데, 이를 액체 배지에서의 성능 시험을 통해 효과를 확인 후 토양 column에 적용하였다. 토양 column에서의 JP-8 분해는 통기에 의한 자연적인 분해와 미생물에 의해 분해되는 것으로 나뉠 수 있다. 토양 내에 접종된 Rhodococcus fascians이 통기를 시키지 않을 경우에도 토양중의 JP-8의 농도가 감소하여 R. fascians의 JP-8 분해가 통기에 상관없이 이루어지는 것을 알 수 있었다. 통기를 시킬 경우 R. fascians를 접종한 경우에 토양중의 JP-8의 70%가 분해되었다. 토양에서 R. fascians의 생장에 작용할 수 있는 질소원을 첨가한 경우 JP-8의 분해율이 75%로 증가하였다. R. fascians에 의한 JP-8의 분해는 세포의 생장과 밀접하게 관련이 있어서 JP-8의 분해율 향상을 위해서는 R. fascians의 증가가 중요함을 알 수 있었다.
An extracellular limonoate dehydrogenase was purified 10-fold from a cell-free extract of Rhodococcus fascians by ammonium sulfate precipitation, dialysis, and ultrafiltration. This purified dehydrogenase catalyzed the conversion of limonoate to 17-dehydrolimonoate. The enzyme showed optimum activity at pH 8.0 and $40^{\circ}C$, with $K_m$ value of 0.9$\muM$, and requires Zn ions and sulfhydryl groups for catalytic action. The enzyme activity was inhibited by $Hg^{2+}\;and\;NaN_3$ ions. The degradation of limonin (66%) in Kinnow mandarin juice was successfully demonstrated with partially purified limonoate dehydrogenase. With scale-up preparation of limonoate dehydrogenase, a successful debittering operation of fruit juices appears feasible.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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