• 한국미생물·생명공학회지
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• 제47권3호
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• pp.465-472
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• 2019

Candida albicans는 기회감염을 유발하는 주요한 병원성 진균 중의 하나이다. 캔디다증 치료과정에서 항진균제에 대한 내성이 흔히 발견되는데, 그 이유는 Candida가 바이오필름을 형성할 수 있기 때문이다. 이전의 연구에서 우리는 단삼(Salvia miltiorriza)의 에탄올추출물이 세포막의 투과성을 변화시키고 세포벽 합성을 저해하여 항캔디다 활성을 나타냄을 밝혔다. 본 연구에서는 10개 C. albicans 임상균주가 형성한 초기단계의 바이오필름을 대상으로 XTT 환원분석법으로 대사활성을 측정하니, $78{\mu}g/ml$ 단삼 에탄올추출물에 의해 바이오필름의 대사활성이 평균 51.3% 감소되었다. C. albicans 세포들이 폴리스티렌 표면에 부착하거나 germ tube를 형성하는 과정에서의 단삼 에탄올추출물의 영향을 현미경으로 분석하니, $39{\mu}g/ml$ 단삼 에탄올추출물에 의해 부착된 세포의 밀도는 현저하게 감소하였으나 germ tube 형성은 거의 억제하지 못했다. 단삼 에탄올추출물이 C. albicans SC5314 세포의 균사에 특이적인 유전자 발현에 미치는 영향을 qPCR로 분석한 결과, EAP1은 34.7% (p < 0.001), ALS1은 45.0% (p < 0.001), ALS3는 48.1% (p < 0.001), ECE1은 21.3% (p = 0.006) 억제하였다. 결론적으로 단삼의 에탄올추출물은 초기단계의 C. albicans 바이오필름 발달을 효율적으로 저해하며, 이는 EAP1, ALS1, ALS3 유전자의 발현억제에 따른 세포부착 억제와 관련이 있다. 더불어 단삼 에탄올추출물의 C. albicans 세포막 기능저해와 세포벽 합성억제에 의한 구조변화 또한 세포부착단계에서의 바이오필름 발달억제에 기여할 것으로 추정된다.

• 한국양봉학회지
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• 제32권3호
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• pp.155-162
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• 2017

로얄제리 생산성 우수계통 선발을 위해 국내 육성서양종꿀벌 원종 계통인 A와 C에 대한 로얄제리 생산성 및 접수율 평가를 수행하였다. 그 결과 꿀벌 계통C의 로얄제리 생산량은 $33.7{\pm}7.41g$로A 계통에 비해 높은 것으로 드러났으며, 접수율 또한 $87.8{\pm}7.5%$로 A 계통에 비해 높은 것으로 확인되었다. 이들 계통으로부터 생산된 로얄제리 trans-10-hydroxy-2-decenoic acid (10-HDA) 함량을 분석한 결과 꿀벌 계통 C는 4.28%(${\pm}0.3$)으로, A 계통에 비해 높은 것으로 나타났다. 일령에 따른 major royal jelly proteins(MRJPs) 전사체 발현량을 비교한 결과 10일령의 일벌의 경우 C 계통이 A 계통에 비해 MRJP 발현량이 큰 폭으로 증가했음을 확인 할 수 있었으며, 15일령의 일벌의 MRJP 발현량 또한 C계통이 A 계통에 비해 높은 것을 확인할 수 있었다. 이러한 결과를 통해 본 연구에서는 국내 육성 서양종꿀벌 기본종 계통 중 로얄제리 생산성이 가장 우수한 계통은 C 계통인 것으로 평가 되었으며, 향후 로얄제리 생산성 우수 계통 선발을 위한 기초 자료로 제공 될 수 있을 것이라 기대하고 있다.

• Animal Bioscience
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• 제35권10호
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• pp.1489-1498
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• 2022

Objective: The objective of this study was to identify polymorphism in olfactomedin like 3 (OLFML3) gene, and association analysis with meat quality, carcass characteristics, retail meat cut, and fatty acid composition in sheep, and expression quantification of OLFML3 gene in phenotypically divergent sheep. Methods: A total of 328 rams at the age of 10 to 12 months with an average body weight of 26.13 kg were used. A novel polymorphism was identified using high-throughput sequencing in sheep and genotyping of OLFML3 polymorphism was performed using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Among 328 rams, 100 rams representing various sheep genotypes were used for association study and proc general linear model was used to analyse association between genotypes and phenotypic traits. Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) was used for the expression analysis of OLFML3 mRNA in phenotypically divergent sheep population. Results: The findings revealed a novel polymorphism in the OLFML3 gene (g.90317673 C>T). The OLFML3 gene revealed three genotypes: CC, CT, and TT. The single nucleotide polymorphism (SNP) was found to be significantly (p<0.05) associated with meat quality traits such as tenderness and cooking loss; carcass characteristics such as carcass length; retail meat cut such as pelvic fat in leg, intramuscular fat in loin and tenderloin, muscle in flank and shank; fatty acids composition such as tridecanoic acid (C13:0), palmitoleic acid (C16:1), heptadecanoic acid (C17:0), ginkgolic acid (C17:1), linolenic acid (C18:3n3), arachidic acid (C20:0), eicosenoic acid (C20:1), arachidonic acid (C20:4n6), heneicosylic acid (C21:0), and nervonic acid (C24:1). The TT genotype was associated with higher level of meat quality, carcass characteristics, retail meat cut, and some fatty acids composition. However, the mRNA expression analysis was not different among genotypes. Conclusion: The OLFML3 gene could be a potential putative candidate for selecting higher quality sheep meat, carcass characteristics, retail meat cuts, and fatty acid composition in sheep.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제56권5호
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• pp.455-468
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• 2023

본 연구에서는 잠재적인 기능성 소재로의 개발 가능성을 검증하기 위하여 미선나무 잎 추출물의 항산화능과 항염증 효능을 확인하였다. 시료의 총 폴리페놀함량, DPPH 및 ABTS 라디칼 소거능, FRAP value를 측정하여 미선나무 잎 추출물의 항산화 활성을 확인하였으며 또한 RAW264.7 세포에 미선나무 잎 추출물 처리 후 HO-1의 발현이 증가하는 것을 통해 미선나무 잎 추출물의 항산화 기전을 확인하였다. 한편, LPS로 유도된 염증 상태의 RAW264.7 세포에서 미선나무 잎 추출물은 NF-κB 활성 억제를 통한 NO 생성 억제, iNOS, COX-2 발현 억제 및 염증성 사이토카인의 발현과 생성을 억제하는 것을 확인하였다. 이러한 본 연구 결과는 향후 미선나무 잎 추출물의 기능성 소재로의 개발을 위한 기초자료 마련에 그 의의가 있다.

• 생명과학회지
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• 제23권1호
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• pp.116-124
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• 2013

본 연구의 목적은 저항성 운동 후 골격근에서 저항성 관련 유전자를 규명하는 것이다. 연구 목적을 달성하기 위하여 총 32두의 Sprague-Dawley계 수컷 흰쥐를 분양 받은 후 4주차 통제군(4 wks CON, n=8), 8주차 통제군(8 wks CON, n=8), 4주차 운동군(4 wks REG, n=8), 8주차 운동군(8 wks REG, n=8)으로 집단을 분류하였다. 저항성 운동군은 꼬리에 무게를 달고 동물용 사다리(1-m vertical, 85 degree incline)를 오르는 저항성 사다리 운동을 1회 10번, 주당 3일, 4주와 8주간 점증적으로 실시하였으며, 골격근 조직은 저항성 운동 후 장무지굴근(flexor hallucis longus; FHL)을 적출하여 분석에 이용하였다. 적출한 골격근에서 total RNA를 분류한 후, 대규모 유전자 발현분석을 위하여 Illumina RatRef-12 Expression BeadChip을 이용한 Beadarray를 시행하였으며, Beadarray 결과를 확인하기 위해 qPCR (real-time quantitative PCR)를 실시하였다. 유의성 검증은 Beadstudio software를 이용하여 실시하였으며, Beadarray 데이터 중 Detection p-value to <0.01, M-value {M= $log_2$ (condition)-$log_2$ (reference)} to >1.0, DiffScore to >20인 유전자만을 통계적으로 의미 있는 유전자로 선택하였다. 4주차 저항성 운동 후 통제집단에 비해 2배 이상 유의하게 발현이 증가한 유전자는 30개였으며, 6개의 유전자가 감소하였다. 8주차 저항성 운동 후에는 5개의 유전자가 발현이 증가하였으며, 12개의 유전자가 유의하게 감소하였다. 연구결과 다음의 유전자를 포함한 저항성 운동과 근비대와 관련 후보 유전자를 도출하였다; 1) 세포 성장 조절(IGFBP1, PLA2G2A, OKL38); 2) 근육발생(CSRP3); 3) 조직 재생과 근육 발달(MUSTN1, MYBPH); and 4) 비대 모델(CYR61, ATF3, NR4A3); and 5) 당대사(G6PC, PCK1). 이러한 연구결과는 차후 저항성 운동과 관련된 다양한 생리학적 변인을 연구하는데 있어서 기초 자료를 제공할 것으로 생각된다.

• 한국가금학회지
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• 제41권3호
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• pp.217-225
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• 2014

텔로미어는 진핵 세포의 염색체 말단으로, 직렬 반복 DNA 염기 서열과 shelterin 단백질 복합체로 구성되어 있다. 텔로미어의 기능은 염색체를 보호하는 것으로 체세포의 텔로미어 길이는 세포 분열시 DNA 복제 결실로 인해 연령이 증가함에 따라 감소하는 경향이 있다. 그러나 유전적, 후생유전학적 및 환경적 수준에서 여러 가지 요인이 텔로미어 길이에 영향을 미친다. 따라서 본 연구에서는 닭의 텔로미어 길이의 유전력을 추정하고, 이들의 유전전이 양상을 살펴보고자 하였다. 텔로미어 길이는 백혈구를 이용하여 양적 형광접합보인법(Q-FISH)과 양적 중합효소 연쇄반응법(qRT-PCR)으로 분석하였다. 분석 결과, 텔로미어 길이의 유전력은 자손과 부모 회귀 분석에 의해 출생 시 0.9로 추정되었고, 10 주령 및 30주령 때 부 분산 분석에 의해 0.03과 0.04로 추정되었다. 부와 자손 간(r=0.348) 및 모와 자손 간(r=0.380) 텔로미어 길이는 모두 유의한 정의 상관 관계를 보였다. 따라서 닭 텔로미어의 유전 전이 양상은 부모 양쪽 모두로부터 비슷하게 자식에 영향을 미치는 것으로 판단된다. 더불어 암수 자손에 미치는 영향 또한 유사한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 부모의 텔로미어 길이의 각인이 성염색체의 유전자가 아닌 상염색체의 유전자에 의해 조절되는 것을 의미한다. 또한, 산모 연령에 따른 출생 자손의 텔로미어 길이는 차이가 없는 것으로 나타났다. 따라서 모체의 연령이 출생 자손의 텔로미어 길이에 영향을 미치지 않는데, 이는 수정란의 초기 배아 단계에서 세포적 reprogramming이 이루어지기 때문으로 사료된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권5호
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• pp.1851-1855
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• 2015

Background: There are increasing data about microRNAs (miRNA) in the literature, providing abundant evidence that they play important roles in pathogenesis and development of colorectal cancer. In this study, we aimed to investigate the miRNA expression profiles in surgically resected specimens of patients with recurrent and non-recurrent colorectal cancer. Materials and Methods: The study population included 40 patients with stage II colorectal cancer (20 patients with recurrent tumors, and 20 sex and age matched patients without recurrence), who underwent curative colectomy between 2004 and 2011 without adjuvant therapy. Expression of 16 miRNAs (miRNA-9, 21, 30d, 31, 106a, 127, 133a, 133b, 135b, 143, 145, 155, 182, 200a, 200c, 362) was verified by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) in all resected colon cancer tissue samples and in corresponding normal colonic tissues. Data analyses were carried out using SPSS 15 software. Values were statistically significantly changed in 40 cancer tissues when compared to the corresponding 40 normal colonic tissues (p<0.001). MiR-30d, miR-133a, miR-143, miR-145 and miR-362 expression was statistically significantly downregulated in 40 resected colorectal cancer tissue samples (p<0.001). When we compared subgroups, miRNA expression profiles of 20 recurrent cancer tissues were similar to all 40 cancer tissues. However in 20 non-recurrent cancer tissues, miR-133a expression was not significantly downregulated, moreover miR-133b expression was significantly upregulated (p<0.05). Conclusions: Our study revealed dysregulation of expression of ten miRNAs in Turkish colon cancer patients. These miRNAs may be used as potential biomarkers for early detection, screening and surveillance of colorectal cancer, with functional effects on tumor cell behavior.

• ALGAE
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• 제35권3호
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• pp.225-236
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• 2020

Gymnodinium smaydae is a newly described mixotrophic dinoflagellate that feeds on only Heterocapsa spp. and Scrippsiella acuminata among 19 tested algal prey. It is one of the fastest growing dinoflagellates when feeding, but does not grow well without prey. To investigate its spatial-temporal distributions in Korean waters, we quantified its abundance in water samples that were seasonally collected from 28 stations along the Korean Peninsula from April 2015 to October 2018, using quantitative real-time polymerase chain reactions. This dinoflagellate had a wide distribution, as reflected by the detection of G. smaydae cells at 23 of the sampling stations. However, this distribution had a strong seasonality; it was detected at 21 stations in the summer and only one station in winter. The abundance of G. smaydae was significantly and positively correlated with chlorophyll a concentration as well as with water temperature. However, there were no significant correlations between the abundance of G. smaydae and salinity, concentrations of nutrients, or dissolved oxygen concentration. During the study period, G. smaydae was present when water temperatures were 7.6-28.0℃, salinities were 9.6-34.1, concentrations of NO₃ were not detectable-106.0 μM, and concentrations of PO₄ were not detectable-3.4 μM. The highest abundance of G. smaydae was 18.5 cells mL^-1 in the coastal waters of Jinhae in July 2017 when the chlorophyll a concentration was 127 mg m^-3 and water temperature was 23.8℃. Therefore, the spatial-temporal distribution of G. smaydae in Korean coastal waters may be affected by chlorophyll a concentration and water temperature.

• Molecules and Cells
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• 제43권5호
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• pp.438-447
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• 2020

The aim of this study was to explore the role of IL-6-miR-210 in the regulation of Tregs function and atrial fibrosis in atrial fibrillation (AF). The levels of interleukin (IL)-6 and IL-10 in AF patients were detected by using ELISA. Proportions of Treg cells were detected by fluorescence activated cell sorting analysis in AF patients. The expression of Foxp3, α-SMA, collagen I and collagen III were determined by western blot. The atrial mechanocytes were authenticated by vimentin immunostaining. The expression of miR-210 was performed by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). TargetScan was used to predict potential targets of miR-210. The cardiomyocyte transverse sections in AF model group were observed by H&E staining. The myocardial filaments were observed by masson staining. The level of IL-6 was highly increased while the level of IL-10 (Tregs) was significantly decreased in AF patients as compared to normal control subjects, and IL-6 suppressed Tregs function and promoted the expression of α-SMA, collagen I and collagen III. Furthermore, miR-210 regulated Tregs function by targeting Foxp3, and IL-6 promoted expression of miR-210 via regulating hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α). IL-6-miR-210 suppresses regulatory T cell function and promotes atrial fibrosis by targeting Foxp3.

• ALGAE
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• 제33권1호
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• pp.21-35
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• 2018

The phototrophic dinoflagellate genus Scrippsiella is known to have a worldwide distribution. Here, we report for the first time, the occurrence of Scrippsiella lachrymosa in Korean waters. Unlike the other stains of S. lachrymosa whose cultures had been established from cysts in the sediments, the clonal culture of the Korean strain of S. lachrymosa was established from motile cells. When the sulcal plates of S. lachrymosa, which have not been fully described to date, were carefully examined using scanning electron microscopy, the Korean strain of S. lachrymosa clearly exhibited the anterior sulcal plate (s.a.), right sulcal plate (s.d.), left sulcal plate (s.s.), median sulcal plate (s.m.), and posterior sulcal plate (s.p.). When properly aligned, the large subunit (LSU) rDNA sequence of the Korean strain of S. lachrymosa was ca. 1% different from those of two Norwegian strains of S. lachrymosa, the only strains for which LSU sequences have been reported. The internal transcribed spacer (ITS) rDNA sequence of the Korean strain of S. lachrymosa was also ca. 1% different from those of the Scottish and Chinese strains and 3% different from those of the Canadian, German, Greek, and Portuguese strains. Thus, the Korean S. lachrymosa strain has unique LSU and ITS sequences. The abundances of S. lachrymosa in the waters of 28 stations, located in the East, West, and South Sea of Korea, were quantified in four seasons from January 2016 to October 2017, using quantitative real-time polymerase chain reaction method and newly designed specific primer-probe sets. Its abundances were >$0.1cells\;mL^{-1}$ at eight stations in January and March 2016 and March 2017, and its highest abundance in Korean waters was $26cells\;mL^{-1}$. Thus, S. lachrymosa has a nationwide distribution in Korean waters as motile cells.