Fluorescent nucleic acids were prepared utilizing the polymerase extension (PEX) reaction to incorporate fluorescent molecules. 2'-Deoxyuridine triphosphate (dUTP) derivatives possessing pyrene molecules as fluorophores were synthesized using the aqueous-phase Sonogashira coupling between 5-Iodo-dUTP and acetylene-linked pyrene molecules. The incorporation of the pyrene (Py)-labeled deoxyuridine triphosphates (PyU) into DNA by polymerase was evaluated by polyacrylamide gel electrophoresis, demonstrating that the PyU can work as a good substrate for the PEX reaction. The fluorescent properties of the functionalized DNA prepared by the PEX reaction were characterized by steady-state fluorescence measurements. The Py-conjugated DNA showed typical emission spectra of the pyrene, and the DNA with two pyrene molecules connected to each other by a diethylene glycol linker exhibited a broadened emission attributed to the electronic interaction between the Py molecules.
In recent years, the study of self-assembly peptide used in drug delivery system has been attracted great interest from scientists. In the category are self-assembly peptides in the structure either with one hydrophobic surface and another hydrophilic or a hydrophobic head and a hydrophilic tail. Here, we focus on a novel designed peptide EYK with double amphiphilic surfaces, investigating on the capability of peptide as a carrier for hydrophobic compound model pyrene. The fluorescence data presented the dynamic process of the transfer, showing that the pyrene was in the crystalline form in peptide solution, and molecularly migrated from its peptide encapsulations into the membrane bilayers when the peptide-pyrene suspension was mixed with liposome vesicles. The results indicated that the peptide EYK could stabilize hydrophobic pyrene in aqueous solution and delivered it into EPC liposome as a potential carrier.
In this study, pyrene based chemosensor was synthesized by two step reaction. The chemosensor showed that high selectivity toward fluoride in DMSO. The fluorescence intensity was drastically increased by binding between chemosensor and fluoride ion. Absorption and fluorescence spectra were obtained by UV-Vis spectrometer and fluorescence spectrophotometer. The binding ratio between chemosensor and fluoride ion was also investigated by job's plot method and Benesi-Hildebrand plot. The HOMO/LUMO energy levels and electron distribution were calculated and simulated by Material studio 6.0 Package.
Various pyrene derivatives were synthesized and systematically examined in micelles. Synthesized mono and bispyrene derivatives were tested in micelles so that they displayed a strong excimer band and the excimer band was quenched in the presence of TNT and RDX. In the optimized condition, the binding constant for TNT of a simple dipyrene derivative 4 was increased up to $1.0{\times}10^6M^{-1}$ in cetyl trimethylammonium bromide (CTAB) micelles, which allowed for the detection of 2 ppb of TNT and 334 ppb of RDX by fluorescence titrations.
본 연구에서는 낙엽과 토양에서 추출한 용존 자연유기물질(DOM)을 대상으로 생분해 과정 중 변화하는 분광특성과 pyrene 결합 반응성을 조사하였다. 유기물질 특성 변화 분석을 위해 용존 유기탄소(DOC), 용존 자연유기물질 내 방향족 탄소성분을 나타내는 고유흡광도(Specific UV absorbance: SUVA), synchronous 형광 스펙트럼과 유기탄소결합계수(pyrene organic carbon-normalized binding coefficient: K$_{oc}$) 분석을 실시하였다. 3주간의 배양기간 동안 낙엽 추출 DOM과 토양 DOM의 DOC는 각각 61%, 51% 감소하였다. 배양 전과 후의 분광특성을 비교해 보면 단백질/아미노산 계 형광특징(PLF)은 점차 감소된 반면 SUVA, 펄빅산계 형광 특징(FLF)과 휴믹산 계 형광 특징(HLF)은 점차 증가하였다. 이러한 자연유기물질의 분광특성 변화는 생분해 과정을 통해 휴믹화가 진행되며 자연유기물질 내 비방향족 생분해성 탄소성분이 단단한 구조의 방향족 탄소구조로 변화됨을 시사한다. SUVA 값과 유기오염물질과의 결합정도를 나타내는 K$_{oc}$ 값 사이에서는 시료의 종류와 상관없이 1차 상관관계(r = 0.97)를 보여 주어 생분해가 진행되는 동안 방향족 탄소구조 분포가 자연유기물질의 소수성 오염물질과의 결합 정도에 큰 영향을 미침을 보여주었다. 또한 형광특징 중 FLF와 HLF가 K$_{oc}$ 값과 높은 상관관계를 보였으며 자연유기물질의 기원에 따라 다른 상관관계식을 보여주었다. 본 연구를 통해 생분해가 진행되는 동안 자연유기물질 성분변화 및 소수성 유기오염물질의 거동 예측에 자연유기물질의 분광특성이 좋은 모니터링 지표로 사용될 수 있음을 보여 주었다.
A new fluorescent derivatizing reagent was developed to be used in HPLC for the trace determination of primary and secondary amines. This new reagent, 1-(N,N-dimethylamino)pyrene-6-sulfonyl chloride, was synthesized by the chlorination of sodium 1-(N,N-dimethylamino)pyrene-6-sulfonate which was obtained from 1-(N,N-dimethylamino)pyrene after sulfonation. Ephedrine and norephedrine were derivatized quantitatively by this reagent. The optimum conditions for the derivatization such as pH, reagent concentration, reaction time and reaction temperature ware examined. The structures of derivatives were identified by IR, $^{1}$H-NMR and MS methods. The fluorescence properties and the stability of the derivatives were examined. The derivatives were separated on silica column with an isocratic elution using the mixture of n-hexane and ethylacetate and monitored by fluorescene detector. Linear calibration curves were obtained and detection limits in a 10 $\mu$l injection volume were 5 picomole for ephedrine and norephedrine.
In this study, we presented a newly synthesized pyrene-naphthalene diimide(NDI)-pyrene triad. The optical and structural properties were examined using various characterization techniques. A donor-acceptor-donor triad molecule exhibited a strong charge transfer, though there existed neither intramolecular nor intermolecular hydrogen bonding sites, due to the formation of preferential complementary complex between pyrene and NDI. Powder XRD measurement revealed a sharp and distinctive X-ray patterns, indicating the presence of microcrystalline-like structure. POM images showed anisotropic fingerprint texture similar to that of cholesteric phase, and SEM images showed numerous columnar structures with length of 1 to $10{\mu}m$. Above observation clearly demonstrated that ${\pi}$-complementary NDI-pyrene interactions in the traid was strong enough to form columnar aggregates in the long range.
Thermosensitive block copolymers of ethylene oxide and N-isopropylacrylamide (NIPAM) were synthesized. A five armed star shape oligo(ethylene oxide) initiator with a cyclotriphosphazene core was prepared and used for the atom transfer radical polymerization (ATRP) of NIPAM. The lower critical solution temperatures (LCSTs) of the copolymers were 36 to 46 ${^{\circ}C}$, higher than that of PNIPAM (32 ${^{\circ}C}$), depending on their molecular weights. The copolymers were soluble in water below the LCSTs but formed micelles above the LCSTs. The thermosensitive micellization behaviors of the polymers were investigated by fluorescence spectroscopy. With increasing the temperature of an aqueous solution of P2 and pyrene above the LCST, the peak of 333 nm red-shifted to appear around 339 nm and its intensity increased significantly, indicating the micelle formation. The transfer of pyrene into the micelles was also confirmed by a confocal laser scanning microscope. The fluorescence image obtained from P2 in an aqueous pyrene solution exhibited a green emission resulting from the pyrene transferred into the micelles. Salt effects on the solubility of the copolymers in an aqueous solution were investigated. The LCST of P2 decreased sharply as the concentration of sodium chloride increased, while decreased slowly with potassium chloride.
정제된 Aldrich 휴믹산(PAHA)과 한외 여과된 다양한 크기의 PAHA 성분들(PAHA UF fractions)을 이용하여 여러 고리 방향족 탄화수소(PAH)와의 결합 메커니즘을 조사하였다. 유기탄소 결합계수($K_oc$)는 전통적인 Stern-Volmer 형광 소광법과 변형 형광 소광법 두 가지를 이용하여 구하였다. 구해진 Pyrene $K_oc$ 값은 PAHA 농도와 자유 용존 pyrene 농도에 의존하였다. 이러한 비선형 흡착결합 양상은 두 물질간의 흡착성 고유상호작용이 존재한다는 것을 암시하였다. 상대적으로 분자크기가 작은 naphthalene은 중간 크기의 PAHA UF fractions과의 결합에서 높은 $KK_oc$ 값을 보여준 반면 분자 크기의 큰 PAH,즉 pyrene의 경우에는 PAHA UF fractions 크기가 크면 클수록 더 결합이 잘 되었다. 이러한 두 PAH 물질간의 불일치한 크기별 결합양상은 현재까지 제시된 고유 결합 메커니즘들 중의 하나 인 크기별 배제(size exclusion) 효과로 잘 설명되었다. 다양한 pH 조건하에서의 PAH $K_oc$ 실험에서는 일반적으로 pH가 낮아질수록 휴믹산의 산성작용기가 중화되고 그에 따라 휴믹산내의 소수성 영역이 커짐으로 인해 pyrene과 휴믹산과의 결합정도는 커졌다. 그러나 큰 사이즈의 PAHA UF fraction(>100K Da)을 사용한 실험에서는 낮은 pH가 아닌 특정 pH 범위에서 또 하나의 높은 pyrene $KK_oc$ 값을 보여줌으로서 크기별 배제 효과가 존재함을 뚜렷이 보여주었다. 이러한 크기별 배제 효과는 휴믹산의 홀(hole)구조가 PAH 크기에 적합하게 구성되어 있는 조건(휴믹성분 크기 혹은 pH)에서만 작용하는 것으로 보인다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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