• 환경생물
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• 제24권4호
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• pp.307-313
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• 2006

2004년 9월과 11월, 2005년 1월, 5월 및 8월의 총 5회에 걸쳐 대한민국 통영연안의 1개 정점에서 표층해수를 계절별로 채취하여 해양세균 군집을 분석하였다. 선택배지에서 순수분리하여 VITEK Microbe ID system으로 동정한 배양법과 16S rRNA PCR-DGGE로 분석한 결과를 상호비교하였다. 배양법에 의한 각 계절별 해양세균 군집의 종조성은 2004년 9월은 5종, 11월은 5종, 2005년 1월은 4종, 5월은 6종 및 8월은 10종으로 조사되었고, Pseudomonas fluorescens와 Acinetobacter lwoffii는 계절과 관계없이 모두 검출되었으며, 그 외에 Pseudomonas stutzeri, Sphingomonas paucimobilis 및 Burkholderia mallei 등이 동정되었다. 16S rRNA PCR-DGGE에 의한 군집분석 결과는 2004년 9월은 10개체군, 11월은 11개체군, 2005년 1월은 6개체군, 5월은 9개체군 및 8월에는 13개체군이 조사되었고, Acinetobacter lwoffii, Burkholderia mallei, Pseudomonas fluoresence, Actinobacillus ureae, Burkholderia sp., Pseudomonas stutzeri, Roseobacter sp., Vibrio parahaemolyticus, Sphingomonas paucimobilis 및 Rugeria algocolus 등이 동정되었다. 이로부터 해양세균 군집의 분포특성을 파악하는 데는 16S rRNA PCR-DGGE가 배양법보다 더 효율적임이 판명되었다.

• 미생물학회지
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• 제30권1호
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• pp.47-52
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• 1992

본 연구에서는 토양 내에서 비선택적으로 작용하는 제초제인 phosphinothricin(PPT) 을 분해할 수 있는 세균을 분리. 동정하고 돌연변이 유도 및 세포융합의 기법을 통해 그 능력을 개량하였으며, 아울러 다른 제초제인 glyphosate 저항성 균주 (Pseudomonas cepacia) 와의 종간 세포 융함을 이용하여 두가지 제초제에 동시에 작용 할 수 있는 균주의 개발 가능성을 알아보았다. 이때, 분리된 PPT 분해균주는 Pseudomonas paucimobilis 로 동정되었고, ethylmethansulfate 를 처리하여 영양 요구성 돌연변이를 얻은뒤, 이를 종내 세포융합을 위한 균주로 사용하였다. Lysozyme 과 EDTA 를 이용하여 원형질체를 형성시켰을때, 원형질체 재생율은 P. paucimoblis 의 경우 6.5%, P. cepacia 의 경우 8.8% 로 나타났다. 세포융합의 fusogen 으로 polyethylenglycol 6,000 을 사용하여, 종내 융합을 통한 융합체 F1, F2, 종간 융합을 통한 융합체 F3, F4 를 얻었다. 종내 융합의 결과, 융합체 F1 위 경우 야생형에 비해 PPT 분해능이 약 11% 정도 향상되었으며, 종간융합을 통하여 얻은 융합체의 경우, PPT 분해능 및 glyphosate 저항성 등의 모균주 특성을 모두 지니고 있다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제25권3호
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• pp.50-57
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• 1997

The presence of slime in paper mills is practically universal. Many researches have been performed for many years to resolve the problem caused by the slime in pulp and paper mill. Many papers have been published to show the bacteria is a major cause of paper mill slime. Now that the recycling of the water has been increased and the regulations of a toxic chemical dosage have become more strengthen, the importance of the control of slime in pulp and paper mill recently has been more recognized. Therefore, to produce quality products at the lowest economic and environmental costs, a through study of the microbial ecology and the indentification of troublesome slime-forming bacteria is a quite necessary. The purpose of this paper is to indentify slime~forming bacteria isolated from the papermaking process. The samples were taken from four parts of making fine paper : machine chest, head box, wire part, white water tank. Machine chest showed the most numbers of bacteria, numbering $2.55{\times}10^7$. The different colony types were taken from the 105 dilution plate. Nine bacteria were identified u sing the Biolog system and the vitek system: 6 gram-negative bacteria, 3 gram-positive bacteria. They are Pseudomonas paucimobilis B., Staphylococcus sp., Acinetobacter calcoaceticus., Pseudomonas cepacia, Actinobaci1lus capsulatus, Acidovorax sp., Flavobacterium sp., and Staphylococcus auricularis in addition to one unidentified sp., Among them. Pseudomonas paucimobillis was found in all places where the samples were taken. And, each parts had the different predominant bacteria in it : Pseudomonas paucimobilis B. in machine chest, Acinetobactor calcoaceticus. in Wire Part and Staphylococcus sp. in head box.

• 대한환경공학회지
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• 제32권7호
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• pp.699-705
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• 2010

3가지 재질의 생물활성탄 부착 박테리아들을 부리 동정한 결과 총 9종류의 부착 박테리아가 동정되었다. Pseudomonas 속이 차지하는 비율이 평균 56.5%로 나타나 가장 높은 우점비율을 나타내었고, 다음으로 Pasteurella속 18.9%, Chryseomonas 속 4.0%, Agrobacterium속 3.5%, Aeromonas속 2.0% 순으로 검출되었다. 순수 분리된 9종의 박테리아들의 성장곡선을 조사한 결과 24~96시간 내에 최대의 생체량을 나타내어 geosmin을 유기탄소원으로 활용하는 능력이 뛰어난 것으로 조사되었다. $4^{\circ}C$와 $25^{\circ}C$의 운전조건에서 geosmin에 대한 생분해능을 조사한 결과 Pseudomonas vesicularis, Pseudomonas fluorescens, Agrobacterium radiobacter 및 Stenotrophomonas maltophilia 등이 뛰어난 생분해율을 나타낸 반면 Chryseomonas luteola, Spingomonas paucimobilis, Spirillum spp. 등은 비교적 낮은 geosmin 생분해능을 나타내었다. Geosmin의 생분해능은 수온이 $4^{\circ}C$일 경우 생분해율 속도상수가 $0.00006{\sim}0.00020\;hr^{-1}$의 범위에서 $25^{\circ}C$에서는 $0.0043{\sim}0.0046\;hr^{-1}$의 범위로 나타나 수온 상승에 따라 큰 폭으로 증가하였으며, 또한 투입된 geosmin의 농도가 10~10,000 ng/L로 증가할수록 생분해율 속도상수도 $0.0003{\sim}0.0882\;hr{-1}$로 증가하였다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제30권3호
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• pp.26-33
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• 2002

The seven strains, Pseudomonas paucimobilis, Pseudomonas cepacia, Staphylococcus auricularis, Staphylococcus saprophyticus, Acidovorax spp., Acinetobacter calcoaceticus, and Actinobacillus capsulatus were tested with three slimicides. Most of the tested bacteria were inhibited with slimicide K (an isothiazolin based compound), even at its low concentration, except for Actinobacillus capsulatus and Staphylococcus auricularis. Both slimicides B (an organic bromine based compound) and S (aldehydes) also couldn't prevent these two strains even at their highest concentration. Five different sizes of plasmid DNA were isolated from Actinobacillus capsulatus. Staphylococcus auricularis, a gram-positive bacteria, showed the slimy substances around its cell distinctively. The results suggest that two strains, Actinobacillus capsulatus, Staphylococcus auricularis, have presumably developed a resistance to the slimicide, by plasmid DNA or slimy substance. Our findings also suggest that not only gram-negative bacteria, but also gram-positive bacteria should not be neglected

• 디지털융복합연구
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• 제15권6호
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• pp.339-344
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• 2017

본 연구에서는, 생화학 및 기술학 융합 연구의 일환으로, 병원내 환경으로부터 미생물이 추출되고 생화학적 분석으로 통하여 동정되었다. 미생물은 평택 소재 평원 중환자실에서 수집되었다 (2014년 11월 28일부터 2014년 11월 30일). 생화학장비인 VITEK2를 이용하여 11개의 미생물, Micrococcus luteus (or M. lylae), Granulicatella adiacens (M. luteus or M. lylae), Staphylococcus caprae, Sphingomonas paucimobilis, Kocuria kristinae, G elegans, Aerococcus viridans (or Staphylococcus arlettae), Methylobacterium spp., Dermacoccus nishinomiyaensis (or Kytococcus sedentarius), Kocuria kristinae (or M. luteus, M. lylae), Pseudomonas oryzihabitans이 동정되었다. 이후 이산화염소가스를 배출하는 팜이톡이라고 하는 플라스틱 막대와 함께 두고 측정해본 결과, 약 99.9% 이상의 매우 강한 미생물 성장억제가 분석되었다. 팜이톡과 함께 배양된 미생물 플레이트에는 어떠한 세균 집락도 발견되지 않았다. 종합해볼 때, 이산화염소가스를 배출하는 팜이톡은 병원내 감염을 유발하는 미생물에 대한 매우 강한 성장 억제효과를 가지는 것으로 확인되었다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제13권7호
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• pp.3267-3274
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• 2012

371 균주의 해양박테리아를 광양만에서 분리하였다. 우점종은 Pseudomonas aeruginosa, Aeromonas hydrophila, P. fluorescens, P. paucimobilis, Chryseomonas luteola, P. vescularis 등이었다. 영양염과 유기물을 제거할 수 있는 해양박테리아를 탐색하기 위하여 암모니아성 질소(100 mg/L), 질산성 질소(100 mg/L) 및 인(10 mg/L)이 각각 포함된 10 mL의 marine broth 2216 (DIFCO)에 해양박테리아를 접종(1.0%, v/v)하고 12시간 배양하였다. 스크리닝 테스트 결과 25% 이상 $COD_{Cr}$을 제거하는 해양박테리아는 16종, 15% 이상의 암모니아 질소를 제거하는 해양박테리아는 9종, 60% 이상의 질산 질소를 제거하는 해양박테리아는 11종 그리고 90% 이상의 인을 제거하는 해양박테리아는 13종이 분리되었다. Aeromonas hydrophila, Chryseomonas indologenes, Pseudomonas diminuta, Vibrio parahaemolyticus 균주가 유기물 및 영양염류 제거실험을 위해 선정되었다. 회분식 시험을 위해 4종의 해양박테리아를 $COD_{Cr}$ 250 mg/L, $NH_3-N$ 40 mg/L, ${NO_3}^{-}-N$ 40 mg/L, ${PO_4}^{3-}-P$ 10 mg/L이 각각 첨가되어 있는 변형 marine broth에 접종하고, 10시간 배양하면서 제거효율을 측정하였다.

• 환경생물
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• 제25권3호
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• pp.273-278
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• 2007

[ $2003{\sim}2007$ ]년 통영 바다목장 해역 5개 정점을 대상으로 표층수와 저층수의 종속영양세균의 개체수를 측정하고, 종속영양세균 군집의 종조성 및 우점종을 분석하였다. 종속영양세균은 겨울이나 봄 및 가을에 비하여 해수의 온도가 높은 여름에 더 많이 검출되었으며, 정점별 변화는 특별한 변화 경향이 없었다. 2003년 10월 및 2004년 9월에는 태풍과 집중호우의 영향으로 표층수와 저층수의 개체수가 큰 차이를 나타내지 않거나 저층수의 개체수가 표층수보다 오히려 더 많은 경우도 있었다. 통영 바다목장 해역의 종속영양세균 개체수는 해를 거듭할수록 감소하는 추세를 나타내었다. 종속영양세균 군집의 종조성은 Pseudomonas fluorescens TY1, Pseudomonas stutzeri TY2, Acinetobacter lwoffii TY3, Sphingomonas paucimobilis TY4, Burkholderia mallei TY5, Pasteurella haemolytica TY6, Pasteurella multocida TY7, Comamonas acidovorans TY8, Actinobacillus ureae TY9 및 Chryseobacterium indologenes TY10으로 조사되었고, P. fluorescens TY1과 A lowffii TY3이 우점종으로 분석되었다.

• 환경생물
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• 제22권1호
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• pp.75-82
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• 2004

2000년부터 2002년까지 통영 바다목장 해역 5개 정점표층수와 저층수에서 종속영양세균의 개체수를 평판계수법으로 측정하여 종속영양세균군집의 계절별 변동추이를 비교 분석하고, 우점종을 선별하여 동정하였다. 7월과 8월의 하절기에 채수한 해수에는 봄 혹은 가을 및 겨울에 채수한 해수에 비하여 모든 정점에서 훨씬 더 많은 종속영양세균이 검출되었다. 저층수에 비하여 표층수에서 종속영양세균의 수가 더 많았으나 동절기(2001년 12월과 2002년 2월)에는 해수 온도가 낮으며 해수의 대류가 느려짐에 따라 부유물질이 저층에 축적되는 관계로 저층수의 종속영양세균의 수가 표층수의 경우 보다 오히려 더 많이 검출되었다 해수 내 종속영양세균의 수와 태풍의 빈도는 뚜렷한 상관관계를 보이지 않아 태풍의 빈도 이외에 태풍의 진로와 강도 및 태풍을 수반하는 집중 호우와 해수의 온도 변화가 종속영양세균의 수에 영향을 미치는 것으로 판단되었다. 통영 바다목장 해역의 종속영양세균의 우점종은 Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas stutzeri, Acinetobucter lwoffii 및 Sphingomonas paucimobilis로 동정되었다.

• BMB Reports
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• 제32권4호
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• pp.399-404
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• 1999

2,3-Dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (2,3-DHBD), which catalyzes the ring meta-cleavage of 2,3-dihydroxybiphenyl, is encoded by the phnQ gene of biphenyl- and phenanthrene-degrading Pseudomonas sp. strain DJ77. We determined the nucleotide sequence of a DNA fragment of 1497 base pairs which included the phnQ gene. The fragment lncluded an open reading frame of 903 base pairs to accommodate the enzyme. The predicted amino acid sequence of the enzyme subunit consisted of 300 residues. In front of the gene, a sequence resembling an E. coli promoter was identified, which led to constitutive expression of the cloned gene in E. coli. The deduced amino acid sequence of the PhnQ enzyme exhibited 85.6% identity with that of the corresponding enzyme in Sphingomonas yanoikuyae Q1 (formerly S. paucimobilis Q1) and 22.1% identity with that of catechol 1,2,3-dioxygenase from the same DJ77 strain. PhnQ showed broader substrate preference than previously-cloned PhnE, catechol 2,3-dioxygenase. Ten amino acid residues, considered to be important for the role of extradiol dioxygenases, were conserved.