• 제목/요약/키워드: Promoter analysis

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콩나물에서 발견된 유전자 변형 도입 유전자의 비의도적 혼입 조사 (Detection of Genetically Modified Genes from Soybean Sprout Products)

  • 윤성철
    • 한국작물학회지
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    • 제49권3호
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    • pp.227-231
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    • 2004
  • 최근 급격히 증가되는 유전자 변형 식품의 안정성 논란과 관련하여 콩나물 및 콩나물 원료에 사용되는 국산 및 수입산 콩에 대한 유전자 변형 유전자의 정량 검사를 실시하고, 미량이나마 함유된 변형 유전자의 도입과정에 관한 연구를 실시하여 다음과 같은 결과를 얻을 수 있었다. 1.콩나물의 유전자 변형 농산물 검사는 2000년과 2001년에 원료콩 96건, 완제품 123건 등 총 219차례 실시하였다. 2. 원료콩에서는 단 한 건의 양성반응도 없었던 반면, 완제품에서는 2000년에 3건, 2001년에 8건에서 0.01-0.17%의 함량으로 CP4EPSPS 또는 35S promoter도입유전자가 검출되었으며 이는 법적 기준치인 3%보다 훨씬 낮은 비의도적 혼입이었다. 3. 외래유전자가 검출된 11건의 완제품은 국산콩으로 만든 7개 제품과 중국산 수입콩으로 만든 4개 제품이었다. 4. 이들 도입 유전자의 원료콩 및 제조과정 중 유입 경로를 확인하기 위하여 다양한 시료를 검사하였다. 샘플은 양성반응제품 원료콩 전수검사, 원료콩 표면, 저장고 바닥 및 정선기 주변, 그리고 콩나물 제품 포장 필름 표면 및 포장지 원료로 사용되는 옥수수 타분의 유전자 변형 여부를 정량검사하였다. 이들 중 두 개의 옥수수 타분 시료에서만 0.1%의 35S promoter 유전자가 검출되었다. 5. 콩나물 포장 공정 중 옥수수 타분을 사용하는 포장지에서 유래되는 변형 유전자 오염을 제시하였다. 향후, 콩나물 변형 유전자 검사시 용수, 필름 표면 등 제품주변에 존재하는 도입 유전자의 정량분석 방법 구축과 원료콩 샘플 방법 및 샘플량의 표준화가 시급히 필요하다.

돼지 유행성 설사병 바이러스의 스파이크 유전자 발현 형질전환 고구마 (Transgenic Sweetpotato (Ipomoea batatas) Expressing Spike Gene of Porcine Epidemic Diarrhea Virus)

  • 양경실;임순;권석윤;곽상수;김현수;이행순
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제32권4호
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    • pp.263-268
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    • 2005
  • Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV)는 돼지의 급성장염을 유발하여 설사 증상을 일으키는 바이러스이다. 본 연구에서는 고구마 저장뿌리 고발현 sporamin 프로모터 및 CaMV 35S promoter를 이용하여 PEDV 항원단백질을 생산하는 고구마 식물체를 개발하고자 하였다. 형질전환 벡터를 제작하기 위하여 PEDV에서 항원성이 알려진 스파이크 단백질의 일부분을 암호화하는 유전자를 PCR로 합성하였다. 고구마 [Ipomoea batatas (L.) Lam] 율미 품종의 배발생 캘러스를 재료로 하여 Agrobacterium tumefaciens을 매개로 형질전환하였다. 선발배지 (MS medium, 1 mg/L 2,4-D, 100 mg/L kanamycin, and 400 mg/L claforan)에서 배발생 캘러스를 3주 간격으로 4개월 동안 계대배양하여 카나마이신 저항성 캘러스를 선발하였다. 선발된 배발생 캘러스를 호르몬을 제거한 배지로 옮겨 체세포배를 유도하였으며 이후 shoot과 뿌리가 형성되었다. 재분화된 소식물체를 대상으로 PCR 분석으로 카나마이신 저항성 재분화 개체의 50% 이상이 도입 유전자를 가지고 있었으며 이들 식물체를 대상으로 Southern blot 분석하여 PEDV 유전자가 고구마 식물체의 게놈으로 안정적으로 도입되었음을 확인하였다. 형질전환 식물체에서 도입유전자의 발현을 RT-PCR로 분석한 결과 PEDV의 spike 유전자가 높은 수준으로 발현하였다.

Role of Human papilloma virus Infection and Altered Methylation of Specific Genes in Esophageal Cancer

  • Mohiuddin, Mohammed Khaliq;Chava, Srinivas;Upendrum, Pavani;Latha, Madhavi;Zubeda, Syeda;Kumar, Ajith;Ahuja, Yog Raj;Hasan, Qurratulain;Mohan, Vasavi
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권7호
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    • pp.4187-4193
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    • 2013
  • Background: Evaluation of Human papilloma virus (HPV) and its association with promoter methylation of candidate genes, p53 and Aurora A in esophageal cancer. Materials and Methods: One hundred forty-one esophageal tissue samples from different pathologies were evaluated for HPV infection by PCR, while the promoter methylation status of p53 and Aurora A was assessed by methylation-specific restriction based PCR assay. Statistical analyses were performed with MedCalc and MDR software. Results: Based on endoscopy and histopathology, samples were categorized: cancers (n=56), precancers (n=7), esophagitis (n=19) and normals (n=59). HPV infection was found to be less common in cancers (19.6%), whereas its prevalence was relatively high in precancers (71.4%), esophagitis (57.8%) and normals (45.7%). p53 promoter methylation did not show any significant difference between cancer and normal tissues, whereas Aurora A promoter methylation demonstrated significant association with disease (p=0.00016, OR:5.6452, 95%CI:2.18 to 14.6) when compared to normals. Aurora A methylation and HPV infection was found in a higher percentages of precancer (66.6%), esophagitis (54.5%) and normal (45.2%) when compared to cancers (14.2%). Conclusions: Aurora A promoter methylation is significantly associated with esophageal cancer, but the effect of HPV infection on this epigenetic alteration is not significant. However MDR analysis showed that the hypostatic effect of HPV was nullified when the cases had Aurora methylation and tobacco exposure. Further HPV sub-typing may give an insight into its reduced prevalence in esophageal cancer verses normal tissue. However, with the present data it is difficult to assign any significant role to HPV in the etiopathology of esophageal cancer.