Choi, Kyung San;Toro, Francisco del;Tenllado, Francisco;Canto, Tomas;Chung, Bong Nam
The Plant Pathology Journal
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v.33
no.2
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pp.206-211
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2017
The effect of temperature on the rate of systemic infection of potatoes (Solanum tuberosum L. cv. Chu-Baek) by Potato virus Y (PVY) was studied in growth chambers. Systemic infection of PVY was observed only within the temperature range of $16^{\circ}C$ to $32^{\circ}C$. Within this temperature range, the time required for a plant to become infected systemically decreased from 14 days at $20^{\circ}C$ to 5.7 days at $28^{\circ}C$. The estimated lower thermal threshold was $15.6^{\circ}C$ and the thermal constant was 65.6 degree days. A systemic infection model was constructed based on experimental data, using the infection rate (Lactin-2 model) and the infection distribution (three-parameter Weibull function) models, which accurately described the completion rate curves to systemic infection and the cumulative distributions obtained in the PVY-potato system, respectively. Therefore, this model was useful to predict the progress of systemic infections by PVY in potato plants, and to construct the epidemic models.
Lotus is one of the most important aquatic vegetables in China. Previously, we detected sweet potato latent virus from lotus (SPLV-lotus) and found that it has highly significant sequence diversity with SPLV-sweet potato isolates (SPLV-sp). Here, we developed serological methods for the detection of SPLV-lotus in Chinese lotus cultivation areas. Based on the high sensitivity of SPLV-lotus coat protein antiserum, rapid, sensitive and large-scale diagnosis methods of enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and dot blot in lotus planting area were developed. The established ELISA and dot blot diagnostic methods can be used to detect SPLV-lotus from samples successfully. And our results also showed that the SPLV-lotus and sweet potato isolates appeared clearly distinction in serology. Our study provides a high-throughput, sensitive, and rapid diagnostic method based on serology that can detect SPLV on lotus, which is suggested to be included in viral disease management approach due to its good detection level.
Potato cv. 'Haryeong' was bred with high solids, resistance to late blight and good culinary quality. It has been registered as new potato variety in 2005. Tuber necrosis symptoms such as severe superficial necrosis, raised surface lesions and ringed necrotic areas were found in tubers of 'Haryeong' during storage of seed potatoes in 2010. Potato virus Y (PVY) was detected from these symptomatic tubers by the analysis of RT-PCR using a primer set specific to coat protein gene of PVY. The nucleotide sequence of RT-PCR product ($PVY^{Hkr}$) was determined and compared to those of other strains, such as $PVY^{Kor}$, $PVY^N$, $PVY^{NTN}$, $PVY^O$, and $PVY^C$ registered in GeneBank. The result showed that $PVY^{Hkr}$ was exactly the same as $PVY^{Kor}$, Korean isolate reported in 2005, except two nucleotides. To verify the PVY was responsible for the tuber necrosis symptoms shown in the tubers of 'Haryeong', a bioassay was done using two viruses (PVY and Potato leafroll virus) and five potato cultivars ('Haryeong', 'Superior', 'Atlantic', 'Dejima', and 'Chubaek'). As expected, the same necrosis symptom appeared in tubers of 'Haryeong' infected with PVY only during the storage period.
The effect of mineral oil treatment in Burley 21 tobacco field on the control of potato virus Y(PVY-VN) mostly transmitted by green peach apid(Myzus persicae Sulzer) in nature was studied and the virus infection in some plants including potato, pepper, bramble, radish, etc near the tobacco fields as a virus infection source was tested by capillary tube precipitatioin test with PVY-antibody and bioassay in Xanthi-nc tobacco. The main source of PVY-VN infection in tobacco field in korea was potato(ca. 40% of test plants infected). Pepper and bramble were also infected by PVY-VN. The control level of PVY-VN infection by treatment of 0.75% liquid mineral oil with 3 % nonionic emulsifier to the plants was 84.8 % in case of the artificial transfection with a infected apterous aphid in laboratory. However, the reduction of PVY-VN disease severity in tobacco fields treated with mineral oil at late June was only 35.5%. These results suggest that mineral oil treatment is not so effective for the protection of aphid-born virus(PVY - VN) infection in tobacco fields.
Han, Shuxin;Gao, Yanling;Fan, Guoquan;Zhang, Wei;Qiu, Cailing;Zhang, Shu;Bai, Yanju;Zhang, Junhua;Spetz, Carl
The Plant Pathology Journal
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v.33
no.4
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pp.382-392
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2017
This study reports the findings of a distinct Potato virus Y (PVY) isolate found in Northeast China. One hundred and ten samples (leaves and tubers) were collected from potato plants showing mosaic symptoms around the city of Harbin in Heilongjiang province of China. The collected tubers were planted and let to grow in a greenhouse. New potato plants generated from these tubers showed similar symptoms, except for one plant. Subsequent serological analyses revealed PVY as the causing agent of the disease. A novel PVY isolate (referred to as HLJ-C-44 in this study) was isolated from this sample showing unique mild mosaic and crisped leaf margin symptoms. The complete genome of this isolate was analyzed and determined. The results showed that HLJ-C-44 is a typical PVY isolate. Phylogenetic analysis indicated that this isolate belongs to the N-Wi strain group of PVY recombinants ($PVY^{N-Wi}$) and also shared the highest overall sequence identity (nucleotide and amino acid) with other members of this strain group. However, recombination analysis of isolate HLJ-C-44 revealed a recombination pattern that differed from that of other $PVY^{N-Wi}$ isolates. Moreover, biological assays in four different potato cultivars and in Nicotiana tabacum also revealed a different phenotypic response than that of a typical $PVY^{N-Wi}$ isolate. This data, combined, suggest that HLJ-C-44 is a novel PVY recombinant with distinct biological properties.
Young Ho Kim;Eun Kyung Park;Soon Yong Chae;Sang Seock Kim;Kyung-Hee Paek;Hye Sun Cho
Journal of the Korean Society of Tobacco Science
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v.20
no.1
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pp.50-56
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1998
The complementary DNA (cDNA) of potato virus Y- vein necrosis strain (PVY-VN) replicase gene (Nlb) was transformed into tobacco (Nicotiana tabacum cv. Burley 21) plants. Out of 25 putative transformants regenerated, 3 were resistant to PVY-VN, one highly resistant plant with no symptom until seed harvest time and the other two with mild chlorotic spot symptoms at late stages after infection. No symptom was observed in the highly resistant plant, while mild vein necrotic symptoms were developed on suckers of the moderately resistant plants after seed harvest time, In the first generation (T1) via self fertilization, resistance to susceptibility frequency in transgenic plants from the highly resistant transformant was about 3 : 1, while it was lowered much (about 1:2 and 1:19) in T1 of the moderately resistant transformants. In the second generation (T2) of the highly resistant plant, resistance frequencies were similar to T1, but resistance levels varied greatly and appeared to be decreased. Key words : potato virus Y, viral replicate gene, transgenic tobacco plants, resistance.
Kim, Jaedeok;Yang, Jung wook;Kwak, Hae-Ryun;Kim, Mi-Kyeong;Seo, Jang-Kyun;Chung, Mi-Nam;Lee, Hyeong-un;Lee, Kyeong-Bo;Nam, Sang Sik;Kim, Chang-Seok;Lee, Gwan-Seok;Kim, Jeong-Soo;Lee, Sukchan;Choi, Hong-Soo
The Plant Pathology Journal
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v.33
no.5
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pp.467-477
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2017
A nationwide survey was performed to investigate the current incidence of viral diseases in Korean sweet potatoes for germplasm and growing fields from 2011 to 2014. A total of 83.8% of the germplasm in Korea was infected with viruses in 2011. Commercial cultivars that were used to supply growing fields were infected at a rate of 62.1% in 2012. Among surveyed viruses, the incidence of five Potyvirus species that infect sweet potato decreased between 2012 and 2013, and then increased again in 2014. Representatively, the incidence of Sweet potato feathery mottle virus (SPFMV) was 87.0% in 2012, 20.7% in 2013 and then increased to 35.3% in 2014. Unlike RNA viruses, DNA viruses were shown to decrease continuously. The incidence of Sweet potato leaf curl virus (SPLCV) was 5.5% in 2003, 59.5% in 2011, and 47.4% in 2012. It then decreased continuously year by year to 33.2% in 2013, and then 25.6% in 2014. While the infection rate of each virus species showed a tendency to decline, the virus infection status was more variable in 2013 and 2014. Nevertheless, the high rate of single infections and mixed infection combinations were more variable than the survey results from 2012. As shown in the results from 2013, the most prevalent virus infection was a single infection at 27.6%, with the highest rate of infection belonging to sweet potato symptomless virus-1 (SPSMV-1) (12.9%). Compared to 2013, infection combinations were more varied in 2014, with a total of 122 kinds of mixed infection.
Proceedings of the Korean Society of Plant Pathology Conference
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2003.10a
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pp.14-14
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2003
Potato virus X (PVX), the type member of Potexvirus genus, is a flexuous rod-shaped virus containing a single-stranded (+) RNA. Infection by PVX produces genomic plus- and minus-strand RNAs and two major subgenomic RNAs (sgRNAs). To understand the mechanism for PVX replication, we are studying the cis- and/or trans-acting elements required for RNA replication. Previous studies have shown that the conserved sequences located upstream of two major sgRNAs, as well as elements in the 5' non-translated region (NTR) affect accumulation of genomic and sg RNAs. Complementarity between sequences at the 5' NTR and those located upstream of two major sgRNAs and the binding of host protein(s) to the 5' NTR have shown to be important for PVX RNA replication. The 5 NTR of PVX contains single-stranded AC-rich sequence and stem-loop structure. The potential role(s) of these cis-elements on virus replication, assembly, and their interaction with viral and host protein(s) during virus infection will be discussed based on the data obtained by in vitro binding, in vitro assembly, gel shift mobility assay, host gene expression profiling using various mutants at these regions.
The complete nucleotide sequences of a Korean isolate of Potato virus X(PVX-Kr) has been determined. Full-length cDNA of PVX-Kr has been directly amplified by long template reverse transcription and polymerase chain reaction(RT-PCR) using virus specific 5'-end primer and 3'-end primer, and then constructed in a plasmid vector. Consecutive subclones of a full-length cDNA clone were constructed to identify whole genome sequence of the virus. Total nucleotide sequences of genome of PVX-Kr were 6,435 excluding one adenine at poly A tail, and genome organization was identical with that of typical PVX species. Comparison of whole genome sequence of PVX-Kr with those of European and South American isolates showed 95.4-96.8% and 77.4-77.9%, in nucleotide similarity, respectively. Sequenced PVX-Kr in this study and twelve isolates already reported could be divided into two subgroups in phylogeny based on their complete nucleotide sequences. Phylogenetic tree analysis demonstrated that PVX-Kr was clustered with European and Asian isolates(Taiwan, os, bs, Kr, S, X3, UK3, ROTH1, Tula) in the same subgroup and South American isolates(CP, CP2, CP4, HB) were clustered in the other subgroup.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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