• Title/Summary/Keyword: Polyacrylamide gel electrophoresis

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Gradient 2-D PAGE를 이용한 양수 프로테옴 분석 (Proteome Analysis of Amniotic Fluid by gradient 2-D PAGI)

  • 이은희;김재찬;변상요
    • KSBB Journal
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    • 제18권1호
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    • pp.35-38
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    • 2003
  • 양수 내에 존재하는 총 단백질을 이차원 전기영동을 이용하여 분리 분석하였고, gradient gel을 이용하여 양수 내에 소량으로 존재하는 미세 단백질까지 분리하였다. 양수 내에는 고농도로 존재하는 단백질이 있는데 이것이 serum albumin precursor임을 확인하였고, 8-18% gradient gel의 이용으로 분해능(resolution)이 향상되어 미세 단백질을 분리 분석할 수 있었다. 이차원 전기영동 후 MALDI-TOF를 이용하여 단백질을 identification하여 기존의 양수 protein database에 존재하는 단백질을 확인하였고, 존재하지 않는 새로운 단백질을 분리 분석하였다.

Streptomyces sp. 4M-2가 생산하는 생전분 분해효소의 특성 (Characteristics of Raw Starch-Digesting Enzyme from Streptomyces sp. 4M-2)

  • 최성현;김찬조;오만진;이종수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제17권2호
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    • pp.136-141
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    • 1989
  • Streptomyces sp. 4M-2의 생전분 분해효소를 황산 암모니움 염석과 이온교환 크로마토그라피 및 Gel 여과 등으로 비활성이 51.22 RSU/mg, 수율 4.5%로 정제할 수 있었다. 정제효소의 분자량은 102,000이었으며 생옥수수 전분에 대한 Km값은 44.44mg/m1 이었다 정제효소의 작용 최적온도는42$^{\circ}C$, pH는 5.5였고 $Ca^{2+}$$Ba^{2+}$의 첨가에 의해 효소활성이 증가되었다. 정제효소는 옥수수 amylose를 가장 잘 분해하고 감자전분도 비교적 잘 분해하였다. 이 효소에 의한 옥수수 생전분의 분해산물은 주로 maltose와 maltotriose였고 소량의 glucose와 oligosaccharide도 검출되었으므로 $\alpha$-amylase 계통의 효소로 추정된다.

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환상 및 선상감자 걀쪽바이로이드 RNA분자의 전기영동적 분리를 위한 효과적인 조건에 관한 연구 (Determining an Effective Electrophoretic Gel System for Separation of the Circular and Linear Potato Spindle Tuber Viroid RNA Molecules)

  • 이재열;김한집
    • 한국식물병리학회지
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    • 제3권4호
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    • pp.239-244
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    • 1987
  • 감자 걀쪽바이로이드(PSTV) RNA분자를 포함한 저분자량의 식물성 RNA분자에 대해서 0M부터 8M까지의 요소농도구배를 가진 폴리아크릴아마이드겔을 이용하여 1/40, 1/10로 희석한 완충액조건과 $17^{\circ}C,\;37^{\circ}C,\;57^{\circ}C$의 온도조건에서 전기영동을 실시하였다. 바이로이드의 RNA분자가 환상과 선상의 두가지 분자로 나뉘어지는 변성조건에서는 1/40로 희석한 TBE완충액을 포함하는 요소농도구배겔을 $57^{\circ}$에서 전기영동을 실시하는 것이 효과적이었다. 변성된 환상의 바이로이드분자에 대한 전기 영동적 이동성은 주로 요소의 농도에 따라 영향을 받는 것으로 보이는데, 이와 더불어 저 농도의 TBE완충액이 요소농도구배겔에서 환상과 선상바이로이드분자 사이에서 전기영동적 분리를 증가시켜 주었다.

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Streptomyces tubercidicus에 존재하는 stu I endonuclease의 정제와 특징 (Purification and Characterization of stu I Endomuclease from Streptomyces Tubercidicus)

  • 김기태;정미영;유욱준
    • 미생물학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.180-183
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    • 1987
  • Type II제한효소 Stu I을 순수정제하고 그 효소적 특성을 연구하였다. 100g(we weight)의 Streptomyces tubercidicus(ATCC 25502)로부터 얻은 crude extranct를 ammonium sulfate fractionation한 후, DEAE-Sephadex(A-50), QAE-Sephadex(A-50) 그리고 Heparin-agarose의 순서로 column chromatography를 수행하여 1,2mg의 비특이성 nuclease가 없는 Stu I 제한효소를 얻었다. 이 시료에 포함되어 있는 다른 오염 단백질은 Sephadex G-100 column으로 gel filtration 하여 제거함으로써, 순수한 Stu I 단백질을 얻을 수 있었다. 정제된 Stu I 제한효소는 10% SDS-polyacrylamide gel electrophoresis 결과 한 개의 band로 나타났으며, 그 분자량은 34,000 $\pm$ 1,000 dalton이었다. 이 효소는 $Mg^{2+}$이온 존재하에 중성의 pH(7.0-8.0)에서 최대의 활성을 나타내었다. NaCl은 이 효소의 활성에는 필요하지 않았다.

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한국산 대추로부터 Endo-polygalacturonase 분리 및 정제 (Separation and Purification of Endo-polygalacturonase from Korean Jujube)

  • 최청;천성숙;조영제;우희섭;김태완;허영훈
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제37권4호
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    • pp.243-247
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    • 1994
  • 한국산 대추로부터 조직의 연화에 작용하는 endo-polygalacturonase를 gel filtration과 이온교환크로마토그라피에 의하여 단일 단백질로 정제할 수 있었고, 수율은 약 6% 정도였다. 정제된 이 효소는 sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis에 의하여 분자량이 약 19,000정도의 monomer로 확인되었고, 결정구조는 육각판상 모양을 나타내었다.

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Acc I endonuclease의 정제와 효소적 특성에 관한 연구 (Purification and Characterization of Acc I Endonuclease)

  • 강선철;유욱준
    • 미생물학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.13-19
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    • 1985
  • 제한효소 Acc I을 정제하고 그 효소적 특성을 연구하였다. 300g(wet weight)의 Acinetobacter calcoaceticus 로부터 얻은 crude extract를 sample로 하여 ammonium sulfate fractionation을 거쳐 Heparin-agarose, DEAE-se-phades, Affi,-gel Blue, phosphoceIIulose, hydroxylapatite의 순서로 chromatography를 수행한 결고 0 .28mg의 AccI 제한효소를 얻었다. 효소의 specific activity는 mg당 $1.1{\times}10^{s}$ unit 이었다. 정제된 Acc [제한효소는 10% SDS-polyacrylamide gel electrophoresis에서 한개의 band로 나타났으며 그 분자량은 45,000~1,000이었다. 이 효소는 $MgCl_2$ 존재하에, pH 8.0에서 11.0사이에서 최대의 활성을 보였다. NaCl은 이 효소의 활성에는 필요하지 않았으나 150mN이상에서는 급격한 효소 활성의 감소가 있었다.

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Bacillus thuringiensis subsp. israelensis 균주의 Hemolysin 성질 (Characteristics of Hemolysin from Bacillus thuringiensis subsp. israelensis)

  • 황지연;김광현
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.425-429
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    • 1987
  • B. thuringiensis subsp. israelensis 균주가 생성하는 $\delta$-endotoxin의 alkali 용해에서 생성되는 hemolysin fragment 와 extra-cellular hemolysin 의 상관관계를 조사하기 위한 기초자료로서 extra-cellular hemolysin을 분리 정제하여 그 성질을 조사하였다. 균체 배양액에 유안을 염석 및 투석시킨 후, Sephadex G-200 gel filtration 과 DEAE-cellulose column chromatography를 행하여 균체외 homely-sin을 정제하였다. 정제된 extra-cellular hemolysin 은 SDS-polyacrylamide gel 전기영동에서 47,000 dalton의 분자량을 가진 단일 단백질 band를 얻었다. 또한 정제된 hemolysin은 thiol agents에 의해 그 활성이 증가되었으나, cholesterol 및 protease 처리 또는 금속이온 즉, FeSO$_4$나 CuSO$_4$에 의해 그 활성 이 감소되었다.

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마름병 병원균 Pseudomonas solanacearum의 병원성 상실요인에 관하여 (Determinant Involved in the Loss of Pathogenicity in Wilt - Inducing Pseudomonas solanacerum)

  • 김을제;윤경란;이영하;이청호;박지창;최광태
    • 한국연초학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.9-18
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    • 1990
  • To study the determinants which are involved in the loss of pathogenicity in wilt-inducing Pseudomoms solamcewum, several physlologica I functions were compared in a virulent P. solanacearum strain and an avirulent, spontaneously derived mutant strain. The polyacrylamide gel electrophoresis showed the distinction between two strains in the patterns and the relative intensity of proteins produced intracellularly or extracellularly. Enzyme assays showed that the level of polygalacturonase activity in the culture filtrate of the avirulent mutant was markedly reduced, while carboxymethylcellulase(rondoglucanase) activity in both strains were nearly negligible. These results suggest that the loss of pathogenicity in mutant strain is attributed in part to the reduced production of polygalacturonase. In audit ion, comparative analyses by agarose gel electrophoresis of DNA molecules isolated from both strains show that the pathogenicity genes of p. solanaceerum are not located on plasmid but are on chromosome.

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Rhizopus oryzae가 생성하는 생전분 분해효소의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Raw Starch-Digesting Enzyme from Rhizopus oryzae)

  • 김찬조;오만진;이종수
    • 한국식품과학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.288-293
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    • 1986
  • 유안염석과 column chromatography 및 gel여과 등으로 비활성이 45.2U/mg가 되는 정제된 Rhizopus oryzae의 생전분 분해효소를 16.2%의 수율로 얻었다. 정제효소는 전기영동상에서 그 순도가 인정되었고 분자량은 67000, Km값은 4.082mg/ml이었다. 정제효소는 $50^{\circ}C$, pH $4.0{\sim}5.0$에서 잘 작용하였으며 옥수수amylose가 가장 적합한 전분이었고 옥수수 생전분에 작용한 분해산물은 거의 glucose였다.

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Identification and Purification of a Normal Rat Liver Plasma Membrane Surface Protein which Disappears after Chemical Carcinogenesis

  • Kim, Min-Young;Lee, Myung-Kyu;Hahm, Kyung-Soo
    • BMB Reports
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    • 제28권6호
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    • pp.504-508
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    • 1995
  • The electrophoretic patterns of plasma membrane surface proteins of normal rat liver cells and rat hepatomas were compared in 10% non-denaturing and 7-15% gradient non-denaturing gel. Chemical carcinogens, 2-Me DAB (2-methyl-4-dimethylaminoazobenzene) and DENA (diethylnitrosamine), were used to induce hepatoma in rats. One protein which disappeared in hepatoma was identified in normal rat liver by non-denaturing gel electrophoresis. Rabbit antisera were raised against this specific protein, and the protein was purified by Sephacryl S-200 column and immunoaffinity chromatography using the purified antibody. The purified protein showed two bands of molecular weights approximately 50 $kD_{\alpha}$ and 52 $kD_{\alpha}$ by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, which reacted specifically with the antibody. However only one band was observed in non-denaturing gel and also in isoelectric focusing with a pI value of 6.6. This study showed the existence of an unique protein on the plasma membrane surface of normal rat liver cells which disappeared in rat hepatomas induced by chemical carcinogens.

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