A Gram-negative, motile by tuft flagella, obligately aerobic chemoorganoheterotrophic, sphere-form bacterium, designated $IMCC3135^T$, was isolated from the Antarctic surface seawater of King George Island, West Antarctica. The strain was mesophilic, neutrophilic, and requiring NaCl for growth, but neither halophilic nor halotolerant. The 16S rRNA gene sequence analysis indicated that the strain was most closely related to genera of the order Chromatiales in the class Gammaproteobacteria. The most closely related genera showed less than 90% 16S rRNA gene sequence similarity and included Thioalkalispira (89.9%), Thioalkalivibrio (88.0%-89.5%), Ectothiorhodospira (87.9%-89.3%), Chromatium (88.3%-88.9%), and Lamprocystis (87.7%-88.9%), which represent three different families of the order Chromatiales. Phylogenetic analyses showed that this Antarctic strain represented a distinct phylogenetic lineage in the order Chromatiales and could not be assigned to any of the defined families in the order. Phenotypic characteristics, including primarily non-phototrophic, non-alkaliphilic, non-halophilic, and obligately aerobic chemoheterotrophic properties, differentiated the strain from other related genera. The very low sequence similarities (<90%) and distant relationships between the strain and members of the order suggested that the strain merited classification as a novel genus within a novel family in the order Chromatiales. On the basis of these taxonomic traits, a novel genus and species is proposed, Granulosicoccus antarcticus gen. nov., sp. nov., in a new family Granulosicoccaceae fam. nov. Strain $IMCC3135^T\;(=KCCM42676^T=NBRC\;102684^T)$ is the type strain of Granulosicoccus antarcticus.
This study was conducted to evaluate desorption efficiencies accuracy and precision by $CS_2$ and thermal desorption method for polar and non-polar organic solvents collected on activated carbon(AC), activated carbon fiber(ACF), carbosieve SIII, materials tested were Methyl alcohol, n-Hexane, Benzene, Trichloroethylene, Methyl isobutyl ketone and methyl cellosolve acetate and six different concentration levels of samples were made. The results were as follows ; 1. Accuracy on kind adsorbent and desorption method was low. In case of $CS_2$ desorption solvent, Overall B and Overall CV on AC and ACF were 43% and 6.63%, respectively. In case of thermal desorption method, accuracy of thermal desorption method appeared higher than solvent desorption method by AC 18.0%, 3.54%, ACF 2.6%, 2.57%, Carbosieve SIII 13.7% and 1.97%, respectively. 2. In the concentration level III, accuracy of thermal desorption method on adsorbent was in order as follow ; ACF > Carbosieve SIII > AC in the methyl alcohol and Carbosieve SIII > ACF > AC in the rest of them all subject material and Concentration levels showed good precision at EPA recommend standard (${\leq}{\;}30%$) 3. DEs by type of organic solvent adsorbent and desorption method are as follows ; In the case that desorption solvent is $CS_2$, DE of Methyl alcohol is AC 47.5%, DE of all materials is ACF about 50%. In the case of thermal desorption method, DE of Methyl alcohol is AC 82.0%, ACF 97.4%, Carbosieve SIII 86.3%. DE of the later case is prominently improved more than one of former. In particular, Except that DE of EGMEA is ACF 88.5%, DE of the rest of it is more than 95% which is recommend standard MDHS 72. With the result of this study, in order to measure various organic solvent occurring from the working environment, in the case of thermal desorption method, we can get the accurate exposure assessment, reduce the cost, and use ACF as thermal desorption sorbent which available with easy.
We have developed a chemically-driven top-down approach using vapor phase HCl to form various GaN nanostructures and successfully demonstrated dislocation-free and strain-relaxed GaN nanostructures without etching damage formed by a selective dissociation method. Our approach overcomes many limitations encountered in previous approaches. There is no need to make a pattern, complicated process, and expensive equipment, but it produces a high-quality nanostructure over a large area at low cost. As far as we know, this is the first time that various types of high-quality GaN nanostructures, such as dot, cone, and rod, could be formed by a chemical method without the use of a mask or pattern, especially on the Ga-polar GaN. It is well known that the Ga-polar GaN is difficult to etch by the common chemical wet etching method because of the chemical stability of GaN. Our chemically driven GaN nanostructures show excellent structure and optical properties. The formed nanostructure had various facets depending on the etching conditions and showed a high crystal quality due to the removal of defects, such as dislocations. These structure properties derived excellent optical performance of the GaN nanostructure. The GaN nanostructure had increased internal and external quantum efficiency due to increased light extraction, reduced strain, and improved crystal quality. The chemically driven GaN nanostructure shows promise in applications such as efficient light-emitting diodes, field emitters, and sensors.
Kim, Se-Woong;Kang, Ho-In;Sung, Ji-Hye;Roh, Sang-Ho
한국수정란이식학회지
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제25권2호
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pp.97-101
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2010
Intracytoplasmic sperm injection (ICSI) is one of the artificial fertilization methods when only a few sperm are available for insemination, and an important tool for the preservation of genetic materials of endangered animal species, especially the male is infertile. Different from other species such as mice and pigs, the conventional ICSI method which uses spiked pipette for injection (Spike-ICSI) is exhibited low success rates in cattle because the bovinesperm head membrane is hard to break during injection procedure. We chose piezo-assisted ICSI (Piezo-ICSI) for the improvement of the injection procedure including sperm head membrane rupture and efficient puncture of the plasma membrane of the oocytes. In this experiment, we compared the efficacy of the bovine ICSI embryo production between the Piezo-ICSI and Spike-ICSI. The second polar body extrusion, pronuclear formation, cleavage and blastocyst formation were evaluated after implementation of two different ICSI techniques. The Piezo-ICSI tended to show comparably higher rates of the second polar body extrusion (41.7%), the pronuclei formation (42.9%) and the two-cell cleavage (41.4%) than Spike-ICSI does (33.3%, 28.6% and 23.5%, respectively) although there is no statistic significance between two groups. In addition, the blastocysts were only obtained from the Piezo-ICSI group (10.3%). Our finding shows that the Piezo-ICSI may be used as an artificial fertilization method in cattle when in vitro fertilization is not applicable.
Bentazon의 잔류를 제거하기 위한 미나리의 생물학적 정화능력을 검정코자 $^{14}C-Bentazon$의 흡수(uptake)와 이행(translocation), 그리고 분해(metabolism) 실험을 통하여 비교 실험하였다. 잎에 처리한지 2일 후에 있어서 $^{14}C$의 21%가 처리된 잎에서 관측되었고, 66%는 잎 표면을 물로 세척한 곳에 잔류하고 있었으며, 나머지 13%는 epicuticular wax층에서 발견되었다. Bentazon을 처리한 잎으로부터 $^{14}C$의 79%가 검출되었으며, 뿌리에는 9%만이 검출되어 잎으로부터 뿌리로의 이행은 매우 적었다. 처리한 2일후에 $^{14}C$의 methanol 추출물 분석에서 잎에 처리된 제초제의 60% 이상이 모든 식물체 부위에서 분해되었다. 본 실험에서 발견된 주요 bentazon의 분해물(Metabolites)은 bentazon이나 6-hydroxy 혹은 8-hydroxy bentazon 보다 덜 이온화(Polar)된 알려지지 않은 신 물질(unknown compound)이었다.
로진과 말레산무수물로부터 rosin-maleic anhydride adduct (RMA)를 합성하고 이를 방향족디이소시아네이트와 반응시켜서 폴리아미드이미드를 합성하였다. 반응촉매로는 Sodium methoxide ($CH_3ONa$)를 사용하였고 반응용제로는 N-메틸-2-피롤리돈 (이하 NMP)을 사용하였다. NMP는 방향족디이소시아네이트와 부반응을 하기 때문에 중합체의 수율과 점성도가 낮았다. 부반응을 줄이기 위하여 NMP에 방향족용제인 크실렌, 아세토페논, 벤조니트릴 및 니트로벤젠을 공용제로 혼합, 사용하였다. 극성이 비교적 작은 공용제의 혼합시 공용제 혼합비율이 60%인 경우 약 70%정도, 극성이 비교적 큰 공용제의 혼합계에서는 혼합비율이 40%인 경우 90% 이상의 수율로서 높은 수율을 얻을 수 있었다. 중합체는 무정형이거나 약간의 결정성을 갖는 구조였으며 고극성용제에서만 용해하였다. 중합체의 점성도는 0.12-0.26dl/g의 범위였다. 열분석 결과 중합체의 초기분해온도는 $330^{\circ}C$ 이상으로서 양호한 열안정성을 나타내었다.
This study explores the 6-month lead prediction skill of stratospheric temperature and circulations in the Global Seasonal forecasting model version 5 (GloSea5) hindcast experiment over the period of 1996~2009. Both the tropical and extratropical circulations are considered by analyzing the Quasi-Biennial Oscillation (QBO) and Northern Hemisphere Polar Vortex (NHPV). Their prediction skills are quantitatively evaluated by computing the Anomaly Correlation Coefficient (ACC) and Mean Squared Skill Score (MSSS), and compared with those of El Nino-Southern Oscillation (ENSO) and Arctic Oscillation (AO). Stratospheric temperature is generally better predicted than tropospheric temperature. Such improved prediction skill, however, rapidly disappears in a month, and a reliable prediction skill is observed only in the tropics, indicating a higher prediction skill in the tropics than in the extratropics. Consistent with this finding, QBO is well predicted more than 6 months in advance. Its prediction skill is significant in all seasons although a relatively low prediction skill appears in the spring when QBO phase transition often takes place. This seasonality is qualitatively similar to the spring barrier of ENSO prediction skill. In contrast, NHPV exhibits no prediction skill beyond one month as in AO prediction skill. In terms of MSSS, both QBO and NHPV are better predicted than their counterparts in the troposphere, i.e., ENSO and AO, indicating that the GloSea5 has a higher prediction skill in the stratosphere than in the troposphere.
본 논문에서는 극지미생물의 저온 활성 protease 생산에 관한 연구를 수행하였다. 먼저 protease를 생산하는 극지미생물인 PAMC 25641, 25614, 25719, 25617을 16s rDNA 염기서열 분석을 이용하여 동정하였다. 그 후, 다양한 온도($5^{\circ}C$, $10^{\circ}C$, $15^{\circ}C$, $20^{\circ}C$)에서의 성장률 및 protease activity, specific activity를 확인하였다. 각 미생물의 온도별 성장률은 대체로 비슷한 경향을 보였으나 25617은 $20^{\circ}C$에서 급격한 성장률 증가를 확인할 수 있었다. 또한, specific activity는 25641이 5, 15, $20^{\circ}C$에서 가장 높은 specific activity를 갖는 것을 확인하였다.
Kim, Byeollee;Han, So-Ra;Lamichhane, Janardan;Park, Hyun;Oh, Tae-Jin
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제29권7호
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pp.1144-1154
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2019
There have been several studies regarding lichen-associated bacteria obtained from diverse environments. Our screening process identified 49 bacterial species in two lichens from the Himalayas: 17 species of Actinobacteria, 19 species of Firmicutes, and 13 species of Proteobacteria. We discovered five types of strong antimicrobial agent-producing bacteria. Although some strains exhibited weak antimicrobial activity, NP088, NP131, NP132, NP134, and NP160 exhibited strong antimicrobial activity against all multidrug-resistant strains. Polyketide synthase (PKS) fingerprinting revealed results for 69 of 148 strains; these had similar genes, such as fatty acid-related PKS, adenylation domain genes, PfaA, and PksD. Although the association between antimicrobial activity and the PKS fingerprinting results is poorly resolved, NP160 had six types of PKS fingerprinting genes, as well as strong antimicrobial activity. Therefore, we sequenced the draft genome of strain NP160, and predicted its secondary metabolism using antiSMASH version 4.2. NP160 had 46 clusters and was predicted to produce similar secondary metabolites with similarities of 5-100%. Although NP160 had 100% similarity with the alkylresorcinol biosynthetic gene cluster, our results showed low similarity with existing members of this biosynthetic gene cluster, and most have not yet been revealed. In conclusion, we expect that lichen-associated bacteria from the Himalayas can produce new secondary metabolites, and we found several secondary metabolite-related biosynthetic gene clusters to support this hypothesis.
Lee Joo-Hee;Kim Kimoon;Kim Jong-Hyun;Kim Jong-Jean
Bulletin of the Korean Chemical Society
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제13권3호
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pp.268-274
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1992
An attempt to improve the second harmonic generation (SHG) efficiency of MAP (methyl (2,4-dinitrophenyl)aminopropanoate) by modifying the substituents on the amino group of MAP is described. Several MAP analogues have been prepared using optically active amino acids alanine, phenylalanine and serine, and their SHG efficiencies measured. None of the MAP analogues exhibited SHG efficiencies as high as that of MAP. X-ray crystal structures of three MAP analogues have been determined. In the crystal structures of two of them, which were the derivatives of phenylalanine, two crystallographically-independent molecules existing in the asymmetric unit are aligned almost antiparallel. These structures are consistent with the very low SHG efficiencies of these compounds. On the other hand, the crystal structure of a serine derivative reveals substantial alignment of the dinitroaniline chromophore along the polar axis. However, the angle of 86.2° between the molecular charge tranfer axis and the polar axis of the crystal is still far away from the optimum value of 54.74° for the phase-matchable SHG. The structure is consistent with the SHG efficiency of this compound which is much higher than those of the phenylalanine derivatives but still lower than that of MAP. This study demonstrates the importance of the orientation of molecules in the crystal lattice in determining secod-order nonlinear optical properties of crystalline materials.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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