• 제목/요약/키워드: Plant virus disease

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Negatively Charged Membrane을 이용한 해수 중 어류질병바이러스의 검출 (Detection of Fish Pathogenic Viruses in Seawater Using Negatively Charged Membranes)

  • 지보영;김광일;이순정;김기홍;진지웅;정현도
    • 한국수산과학회지
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    • 제46권1호
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    • pp.46-52
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    • 2013
  • After an outbreak of viral disease in an aquafarm, release of virus (es) from infected fish into environmental seawater has been suspected. In the present study, we utilized a negatively charged membrane (HA type) as an efficient method for concentration and detection of fish pathogenic viruses, specifically, megalocytivirus and viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) present in field-collected seawater samples or inoculated into seawater artificially. Positively charged viruses adsorbed onto the negatively charged membrane and were eluted with 1 mM NaOH (pH 10.5) following rinsing with 0.5 mM $H_2SO_4$ (pH 3.0). Megalocytivirus and VHSV particles isolated using anegatively charged HA membrane from seawater inoculated with each virus at a concentration of 10 viral particles/mL were of sufficient quantity to show positive results in atwo-step PCR (or RT two-step PCR); however, despite it being negatively charged, a cellulose acetate (CA) membraneshowed negative results. In quantitative PCR, the detection limits of the HA membrane for megalocytivirus and VHSV in seawater were 1.20E+00 viral particles/mL and 1.22E+01 viralparticles/mL, respectively. The calculated mean recovery yields from 1 L seawater spiked with known concentrations of megalocytivirus and VHSV particles were 28.11% and 23.00%, respectively. The concentrate of a 1-L sample of culturing seawater from the aquatank of flounder suffering from VHSV showed clear positive results in PCR when isolated with an HA, but not a CA, membrane. Thus, viral isolation using an HA membrane is a practical and reliable method for detection of fish pathogenic viruses in seawater.

한국에서의 벼 줄무늬잎마름병의 발생, 피해, 기주범위, 전염 및 방제에 관한 연구 (Studies on the Occurrence, Host Range, Transmission, and Control of Rice Stripe Disease in Korea)

  • 정봉조
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.181-204
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    • 1974
  • 우리나라에서의 벼 줄무늬잎마름병의 발생, 피해, 기생범위, 전염 및 방제에 관하여 1965년부터, 1974년까지 실시한 연구결과를 다음과 같이 보고한다. 1. 발생 못자리에서 줄무늬잎마름병의 피해는 $1.3-8\%$였고 포장에서는 입도중의 발병주율보다 재생도에서의 발생율이 높았으며 보통기재배보다도 조기재배에서 발병이 많았다. 또 포장에서 발병주의 분포는 대체로 휴반가까이에 많은 경향이었다. 벼 엽기별 피해에서 라병성인 일본계 벼의 경우 못자리 때인 3엽기에서 7엽기까지는 감염되면 $100\%$ 고사하였으며 9엽기에서는 $50\%$, 11엽기는 $20\%$, 13엽기 이후에는 고사주를 볼 수 없었다. 참복기간은 3-7엽기에서는 7-15일이었고 9-15엽기에서는 15-30일이었다. 저항성인 통일벼의 경우 1.5-5엽기 접종구는 비교적 발병이 많았으나 9엽기 이후부터는 현저히 떨어져 15엽기 이후는 발병을 거의 볼 수 없었다. 그리고 감염된 것은 초장이 짧고 등숙율과 임실비율이 떨어지는 경향이었다. 2. 기주범위 기주범위를 구명하기 위하여 작물과 목초 및 잡초 36종을 공시하여 아래와 같이 21종의 기주를 밝혀 내었다. 작물: 벼, 보리, 밀 , 귀리, 라이맥, 조, 옥수수, 기장, 참피 목초: 티모시, 빗살대, 이타리안라이그라스, 패래니 알라이그라스, 죤슨그라스, 슈단그라스 잡초 : 들피, 겨피, 방울피, 잠자리피, 개미피, 바랭이, 민바랭이, 좀바랭이, 방동사니대가리, 강아지풀, 비노리, 참새, 포아풀, 독새풀, 우산대바랭이, 개보리, 겨풀, 쇠풀, 조개풀, 넓은 잎 개수염은 새로운 기주로 밝혀졌다. 3. 충매전염 우리나라의 애멸구화기는 5회였으며 수원에서의 제2회성충 최성기는 6월 20일 경이고 제3회성충 최성기는 7월 30일 경이었다. 진주는 수원보다 제2회성충 최성기가 5-7일 빨랐고 진주에서는 제3회성충 최성기의 발생량이 많은 것이 달랐다. 애멸구 세대별 보독충율은 월동약충이 $10-15\%$였고 제1세대유충은 $9\%$, 제2회성충은 $17\%$, 제2세대유충은 $8\%$, 나머지 화기에서는 약 $10\%$였는데 보독충율은 남부지방보다 높은 경향이었다. 1966년부터 1970년생 사이의 애멸구 보독충율은 해에 따라 다소 차가 있었으며 화기별로는 제2회성충과 제3회성충의 보독충율이 높았다. 분리한 애멸구보독충을 재분리하여 이를 교배하였더니 차대에서는 보독충율이 $90\%$인 애멸구를 얻을 수 있었으며 애멸구충령별로는 3, 4, 5령충의 감염능력이 높았고 애멸구 무독충의 바이러스 재획득율은 평균$7.9\%$였고 여기에서 얻어진 친화성계통이라 할지라고 3회접종시험결과 계속하여 3회까지 벼에 바이러스를 매개하지 않았다. 또 애멸구보독충의 감염최적온도는 $25-30^{\circ}C$였으며, $15^{\circ}C$이하에는 감염이 일어나지 않을때도 있었다. 그리고 애멸구기생봉의 기생율은 6월부터 8월말까지 $5-48\%$였으며 7월 10일경이 $32-48\%$로서 가장 높았다.

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풋고추 수경재배에서 발생하는 tobamovirus의 특성 (Tobamoviruses of Green Peppers Growing on Hydroponic Systems)

  • 최국선;김재현;김정수;김현란
    • 식물병연구
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    • 제10권3호
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    • pp.194-197
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    • 2004
  • 풋고추 수경재배에서 tobamovirus 병의 발병률은 생육 후기 단계에서 100%였다 바이러스 종류별 감염 빈도는 PMMOY 34%, TMGMY 41.5% 및 이들 2종의 바이러스 복합감염이 24.5%로 나타났다. 다클론 항체로 제작된 DAS-ELISA에서 각각의 항체에 대하여 특이적인 반응을 보였다. 수경재배하는 풋고추에서 77개의 tobamovirus를 순수분리하여 tobamovirus의 pathotype을 구분한 결과, $P_{0}$은 61% 및 $P_{1,2}$는 39% 빈도로 분리되었다. 모든 TMGMV 분리주는 pathotype $P_{0}$에 속하였다. PMMOY에서 구분된 pathotype $P_{0}$$P_{1,2}$의 외피단백질유전자에 상응하는 cDNA를 합성하여 제한효소에 대한 분석을 실시한 결과, $P_{1,2}$는 TaqI 위치가 두 곳에 존재하였으나 $P_{0}$은 단지 한 곳에만 존재하였다.존재하였다.

Development of a Single-nucleotide Polymorphism Marker for the Sw-5b Gene Conferring Disease Resistance to Tomato spotted wilt virus in Tomato

  • Lee, Hyung Jin;Kim, Boyoung;Bae, Chungyun;Kang, Won-Hee;Kang, Byoung-Cheorl;Yeam, Inhwa;Oh, Chang-Sik
    • 원예과학기술지
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    • 제33권5호
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    • pp.730-736
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    • 2015
  • Tomato spotted wilt virus (TSWV) causes one of the most destructive viral diseases that threatens global tomato production. Sw-5b was reported as the resistance gene effective against TSWV. The objective of this research was to develop a single-nucleotide polymorphism (SNP) marker to distinguish tomato cultivars resistant to TSWV from susceptible cultivars for marker-assisted breeding. First, we determined genotypes for TSWV resistance in 32 commercial tomato cultivars using the previously reported Sw-5b gene-based marker. Then, DNA sequences of Sw-5b alleles in tomato cultivars showing resistant or susceptible genotypes were analyzed; a single SNP was found to distinguish tomato cultivars resistant to TSWV from susceptible cultivars. Based on the confirmed SNP, a SNP primer pair was designed. Using this new SNP sequence and high-resolution melting analysis, the same 32 tomato cultivars were screened. The results were perfectly correlated with those from screening with the Sw-5b gene-based marker. These results indicate that the SNP maker developed in this study will be useful for better tracking of resistance to TSWV in tomato breeding.

Update on Distribution and Genetic Variability of Plum pox virus Strains in Bulgaria

  • Kamenova, Ivanka;Borisova, Anelija
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제35권3호
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    • pp.243-256
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    • 2019
  • Field surveys for Plum pox virus (PPV) infection were conducted in stone fruit orchards all over Bulgaria. In total, 1168 out of 3020 leaf samples from cultivated Prunus spp. and wildly growing P. cerasifera trees reacted positive for PPV in DASI-ELISA with the universal monoclonal antibody (MAb) 5B. Further ELISA analyses showed that 987 and 127 isolates belonged to PPV-M and PPV-D serotypes, respectively. The plum and P. cerasifera showed 82.0% and 50.5% levels of infection, respectively followed by the peach (40.0%) and the apricot (32.0%). Five hundred fifty one PPV isolates were further typed by IC-RT-PCR with PPV-Rec, -M and -D-specific primers, targeting (Cter)NIb-(Nter) CP genome region, as 125 isolates were sequenced. The results revealed the presence of PPV-Rec, PPV-M and PPV-D and mixed infections of these strains. PPV-Rec was the most prevalent strain (49.0%), followed by PPV-M (40.1%), while PPV-D was the less spread strain (8.2%). PPV-Rec was the most common strain in plums, including the eight "old-aged" trees from the region of the first Sharka discovery. PPV-M was the most prevalent strain in peach and apricot. Phylogenetic analyses on (Cter)NIb-(Nter)CP of the isolates were performed. PPV-Rec isolates formed a homogeneous group, while PPV-M isolates split into PPV-Ma and PPV-Mb subgroups. Five separated clades were formed by the analyzed PPV-D isolates. Nucleotide sequences of the partial CP coding region of the analyzed isolates revealed a slightly higher intra-strain genetic variability in PPV-Rec and PPV-M isolates, while that of PPV-D strain isolates was higher from the reported for these strains.

마(Dioscorea opposita)에 발생한 Japanese yam mosaic virus 진단 및 염기서열 분석 (Diagnosis and Sequence Analysis of Japanese yam mosaic virus from Yam (Dioscorea opposita))

  • 이중환;손창기;권중배;남효훈;김영태;김미경;이수헌
    • 식물병연구
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    • 제22권4호
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    • pp.289-292
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    • 2016
  • JYMV에 감염된 마는 잎과 엽맥에 부정형의 황화증상을 나타내었고, 마 주산단지인 경북 안동지역에서 조사한 결과 33.6%-40.8%의 감염률을 나타냈다. 마에 발생하는 JYMV 분리주 BRI 게놈의 polyprotein을 코딩하는 영역에 대한 염기서열을 결정하고 이를 JYMV isolate BRI로 명명하고 GenBank에 KU309315로 유전자 등록을 하였으며, 외피단백질 영역에 대한 유연관계 분석에서 대부분의 일본이나 중국과 분리주와는 다른 유연관계를 보이는데 이것은 분화 과정 중에 나타나는 변이주 가능성이 제시되나 추후 광범위한 조사를 통한 정밀한 분석이 필요하다.

ACLSV(Apple chlorotic leafspot virus) 감염이 사과 '홍로' 품종의 과실품질에 미치는 영향 (Influence of ACLSV-infection on Fruit Quality of 'Hongro' Apples)

  • 김현란;김정수;황정환;이신호;최국선;최용문
    • 식물병연구
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    • 제10권2호
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    • pp.145-149
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    • 2004
  • 사과 '홍로' 품종은 품질이 우수하여 재배면적이 증가되고 있는 중요한 품종으로 최근 일부 농가에서 과실 크기가 작아지면서 과육이 딱딱해지고 과즙이 거의 없어지는 소과증상이 발생되고 있어 재배현장에서 문제가 제기되고 있다. '홍로' 품종의 소과증상은 주요 재배지역에서 조사한 결과 조사농가당 홍로품종 재배주수의 평균 12%정도 발생되고 있었으며 ELISA에 의한 바이러스 진단 결과 소과 발생나무에서 고농도의 ACLSV가 100% 검출되었다. 즙액 접종한 C. quinoa에서 ACLSV가 분리되었으며, 접목 접종한 목본지표식물에서도 잎 상편생장 및 줄기괴사 병징을 나타내어 접목전염성이 확인되었다. 소과증상의 원인 구명을 위해 열처리와 생장점배양으로 육성된 바이러스 무독주에 인위적으로 ACLSV 등 바이러스를 접목접종 한 다음 결실된 과실의 특성을 조사한 결과 ACLSV 접종주에서 소과증상이 발생되는 것을 확인할 수 있었다. 결론적으로, 소과증상을 일으키는 주된 요인이 ACLSV 감염에 의한 것으로 판단되며 국내 육성종인 '홍로' 품종은 ACLSV에 대한 감수성 품종으로 분류될 수 있을 것으로 판단된다.

고추에 엽맥퇴록병을 일으키는 오이 모자이크 바이러스(CMV-VCH)의 특징 (Characteristics of Cucumber mosaic virus-VCH Causing Vein Chlorosis on Red Pepper in Korea)

  • 조점덕;이신호;김정수;최국선;김현란;정봉남;류기현
    • 식물병연구
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    • 제12권3호
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    • pp.226-230
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    • 2006
  • 노지 포장에서 채집한 고추 잎에 바이러스 병징을 나타내는 총 62개 시료 중 32개(52%)시료가 CMV에 감염되었다. CMV에 감염된 32개체 중 22개(68.8%) 시료는 엽맥퇴록 및 엽맥괴저 병징을 나타냈으며 모두 CMV(CMV-VCH)에 단독감염되어 있었다. 생물검정결과 Nicotiana glutinosa에서 접종엽에 엽맥퇴록, 상엽에 엽맥녹대, 엽맥괴저, 순괴저에 이르는 심한 병징을 보였고, N. benthamiana와 N. tabacum cv. 'Ky-57'에서 접종엽에 무병징, 상엽에 엽맥녹대, 기형 및 물집 병징을 일으켰다. 고추 시판품종인 '부강', '마니따' 그리고 '꽈리풋고추' 모두 엽맥퇴록 병징이 나타났으며 후기에는 기형이 되었다. RT-PCR 유전자 진단결과 엽맥퇴록 병징의 시료는 모두 CMV에 감염되었으며, CMV-VCH 바이러스 입자는 약 30 nm의 구형 이었다. 자외선 흡광도는 260nm에서 최고, 242nm에서 최저였으며 핵산과 단백질 비율은 1.71이었다. CMV-VCH의 핵 단백질은 단일 단백질이며 분자량은 24.5kDa 이었다.

토마토반점위조바이러스에 대한 재배 및 야생형 고추 수집종의 병징과 저항성 조사 (Symptom and Resistance of Cultivated and Wild Capsicum Accessions to Tomato Spotted Wilt Virus)

  • 한정헌;이원필;이준대;김미경;최홍수;윤재복
    • 식물병연구
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    • 제17권1호
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    • pp.59-65
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    • 2011
  • 토마토반점위조바이러스(Tomato spotted wilt virus, TSWV)에 대한 고추 유전자원 및 시판품종 등 100점의 병징 유형과 저항성 반응을 조사하였다. 병징 유형과 TSWV 감염률은 접종 후 9, 12, 14, 45일에 각각 육안으로 조사하였으며, 접종 14일에는 효소면역항체법을 이용하여 실험에 사용한 모든 개체의 비 접종 상엽에서 바이러스 감염 유무를 검정하였다. 감염된 대다수의 개체에서 잎 말림 증상이 가장 빈번하게 관찰되었으며, 국내 상용 $F_1$ 품종과 재래종고추에서는 황화 증상이, 야생형 수집종에서 줄기괴사 증상이 특이적으로 관찰되었다. TSWV의 전형적인 병징으로 알려진 원형반점은 조사한 일부 계통에서 관찰되었고, 계통 내 개체간 바이러스 병징 발현 정도는 상이하였다. 상용 F1 4품종(Kpc-35, -36, -57, -62)과 야생형 고추 8계통(PBI-11, C00105, PBC076, PBC280, PBC426, PBC495, PBC537, PI201238)은 유묘기에 기계적 접종했을 때 TSWV에 대해 고도의 저항성을 보였다.

GM 격리포장 내 고추에서 분리한 Cucumber mosaic virus 분리주들의 외피단백질 유전자 비교 (Comparative Analysis of Coat Protein Gene of Isolates of Cucumber mosaic virus Isolated from Pepper Plants in Two GMO Environmental Risk Assessment Fields)

  • 홍진성;박호섭;류기현;최장경
    • 식물병연구
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    • 제15권3호
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    • pp.165-169
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    • 2009
  • 남양주와 안성의 GM 고추 격리포장에서 모자이크 병징이 뚜렷한 이병주들로부터 바이러스를 채집하여 그 특성을 조사하였다. CMV RNA3의 외피단백질 유전자를 포함하는 3' 말단 부분에 대한 특이 프라이머를 이용하여 RT-PCR을 실시한 결과, 예상되었던 약 950 bp의 밴드가 확인되었다. 이 PCR 산물을 이용하여 클로닝을 실시하였으며 분석된 외피단백질유전자 염기서열을 토대로 기존에 알려진 Fny-CMV 외피단백질유전자 염기서열과 비교하였다. 남양주와 안성에서 채집된 각 분리주들은 Fny-CMV 염기서열과의 상동성에 있어 특별한 차이를 보이지 않았지만 염기서열을 이용한 계통발생분석에서는 두 지역간 CMV가 확연히 다른 그룹으로 나타났다. 한편, 분리된 각 CMV의 외피단백질유전자 염기서열을 통해 확인된 아미노산서열과 Fny-CMV의 외피단백질 아미노산 서열을 비교한 결과, 남양주에서 분리된 CMV가 96.8%에서 97.3%의 유사성을 보인 반면, 안성의 고추포장에서 분리된 CMV는 95.9%에서 96.8%의 유사성을 보였다. 특히 남양주에서 분리된 CMV와 Fny-CMV 모두 88번째 잔기에서 Lysine(K)을 포함하지만 안성에서 분리된 CMV는 Arginine(R)을 포함하였으며, 91번째 잔기에서 전자는 Leucine(L)을 포함하지만 후자는 Valine(V)을 포함하는 것이 확인되었다. 이 같은 결과를 종합해볼 때, 남양주와 안성의 고추에서 각각 분리된 CMV는 서로 다른 지역적 특색을 나타내는 것으로 확인되었다.