Christopher U. Kitalong;Tmong Udui;Terepkul Ngiraingas;Pearl Marumoto;Victor Yano
한국자원식물학회:학술대회논문집
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한국자원식물학회 2020년도 추계국제학술대회
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pp.15-15
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2020
In an internal document, CORONA-VIRUS DISEASE 2019 (COVID-19) PLAN, release developed stated that "on January 22, 2020, Palau Ministry of Health activated its emergency operations center, and since then has prepared and put in place measures in response to this global pandemic." The actions eventually led to the closure of most flights coming into Palau as a method to protect its population. The population of is at high risk with COVID19 due to the very elevated rate of NCD's, as well as the limited access to proper testing and treatment facilities. Increased use of traditional medicines in the population has reduced the co-morbidities by reducing risk factors. Furthermore, the expansion of tradtional NCD therapies, especially that of DAK reduce pressure due to obesity and diabetes therefore allowing for unimpaired immune systems to combat deadly infectious diseases such as COVID19.
담배가루이(Bemisia tabaci)는 광식성 해충으로 토마토황화잎말림바이러스(Tomato Yellow Leaf Curl Virus; TYLCV), 카사바갈색줄무늬병(Cassava Brown Streak Disease; CBSD)를 매개하는 해충이다. 담배가루이 방제를 위해 화학적 방제가 주로 시행되지만 저항성으로 인한 한계로 인해 종합적해충방제를 위한 고정정확도를 이용한 표본조사법(Fixed precision sampling plan)을 개발하였다. 표본추출은 토마토 식물이 50 cm 높이의 레일 위에 위치한 배지를 이용해 재배되고 있어 배지로부터 130 cm 이상(지상에서 180 cm 이상)을 상단, 70 cm~100 cm (지상에서 120 cm~150 cm)를 중단, 50 cm 이하(지상에서 100 cm 이하)를 하단으로 나누어 각 위치별 토마토 7엽의 잎 뒷면에서 관찰된 담배가루이 노숙 유충 마리 수를 조사하였다. 담배가루이 노숙유충은 이동성이 거의 없어 알에서 우화한 뒤 고착화하여 용과 성충 단계를 거치기 때문에 중단, 하단에 밀도가 높았다. 공간분포분석은 Taylor's power law (TPL)를 이용하여 도출된 TPL의 회귀계수를 통해 분석하였고, TPL 계수의 차이는 공분산분석(ANCOVA)하여 차이가 없어 자료를 통합(pooling)하여 계산된 새로운 TPL 계수를 이용하여 표본추출정지선과 방제의사결정법을 개발하였다. 개발된 표본추출법의 적합성을 판단하기 위해 분석에 사용하지 않은 독립된 자료를 이용하여 Resampling Validation for Sampling Plan (RVSP) 프로그램으로 평가하였다.
오이 주요재배지인 상주와 구례에서 오이에 발생하는 바이러스병을 2006년과 2007년에 조사하였다. 경상북도 상주 지역 오이의 병징 발생률은 농가 포장에 따라서 14%에서 90%이었으며 평균 발생률은 46%이었다. 전라남도 구례 지역의 경우 농가 포장에 따라서 9%에서 100%이었으며 평균 발병률은 48%이었다. 주요 발생 바이러스는 CGMMV, ZYMV, PRSV와 WMV2의 4종류였다. 이러한 바이러스는 단독감염과 복합감염 형태로 발생하였다. 2006년과 2007년의 평균 감염률을 보면 단독감염의 경우 ZYMV가 23.5%로 가장 많이 발생하고 있었으며, PRSV가 13.0%, CGMMV가 9.0%, WMV2가 2.0% 순서이었다. 복합감염의 경우에는 2종 바이러스 복합감염이 31.5%, 3종 복합감염이 7.5%, 4종 복합감염이 2.0% 발생하였다. 오이에 발생하고 있는 바이러스 감염형태는 단독감염과 2종 복합감염이 각각 47.7%와 31.5%로 총 88.7%로 대부분을 차지하였다. 오이에 발생한 바이러스의 복합감염으로 많이 발생되는 바이러스로는 ZYMV, CGMMV, PRSV, BBWV2의 순서이었다. 단독감염된 오이의 병징은 다다기 계통이나 취청 계통 오이 모두 비슷한 병징이 나타났으나, CGMMV의 경우 퇴록 반점, 엽맥 퇴록, 엽맥 쭈그러짐 등 매우 다양한 병징이 나타났다. ZYMV는 엽맥 퇴록 병징을 위주로 심한 모자이크 및 기형 병징이 나타났다. 그 이외의 PRSV, WMV-2의 병징은 CGMMV와 ZYMV에 의한 병징에 속하는 비교적 약한 병징이었다.
우리나라에서 가장 우점하는 BaYMV(Barley yellow mosaic virus)에 의한 국내 육성 맥주보리의 품종의 저항성 정도에 따룬 생육 및 수량 피해를 조사하였다. 바이러스 감염 검정에서 두산 29호는 BaYMV와 BaMMV(Barley mild mosaic virus)에 감염되어 있었으나 진양보리와 호훔보리는 BaYMV에 만 감염된 것으로 나타났다. 월동후 초장과 수확기 간징의 생육을 조사한 결과 폼종별 저항성 정도에 따라 8~29%의 신장 억제율을 보였다. 생육 후기의 간장 단축률은 9~12%로 낮아지는 결과를 보였다. 월동후 경수는 호품에서는 발병포장와 건전포장에서 차이가 없었으나, 감수성인 두산 29호와 진양에서는 10~14%감소되었다. 그러나 수확기경 수수는 BaYMV 감염에 의해 26~33%까지 감소하는 결과를 보였다. 출수기는 발병 포장에서 1~3일까지 지연되는 경향이었다. 수확후 수량구성요소의 피해정도를 조사하였다. 천립중과 l 중도 품종별 저항성 정도에 따라 피해를 받아 각각 4.0~6.6%와1.0~ 4.2% 감소되는 것으로 조사되었다. BaYMV 감염시 6.0~8.6% 정 도의 비립이 발생하였으나 건정포장에서는 2.9~3.6%로 감소되어 두배 이상 비립발생이 증가하였다. 품종간 종실 수량 피해를 조사한 결과 건전한 포장에서의 품종간 평균 수량은 약 509kg~632kg/10a으로 유의성 있는 차이를 보이지 않았다. 발병 포장에서는 품종별 저항성 정도에 따라 유의성 있는 차이를 보였다. 중저항성인 호품의 경우 약 467kg/10a, 중약과 감수성인 진양과 두산29호에서는 각각 390kg과 290kg으로 조사되어 감수성인 두 품종에서는 77~177kg/10a의 수량 감소를 보였다. BaYMV 감염에 의해 수량성은 품종의 저항성 정도에 따라 26~43%의 감소되었다.
본 연구는 국내 대추나무 바이러스 감염실태를 구명하기 위하여 시험포장 및 농가포장에서 다양한 이상증상을 나타내는 시료 61점을 채집하였다. 이후 채집한 시료는 메타전사체 분석, reverse transcription polymerase chain reac tion 진단, 염기서열 분석에 사용하였다. 그 결과 국내 대추나무에서는 2종의 DNA 바이러스, jujube associated badnavirus (JuBV), jujube mosaic-associated virus (JuMaV)와 1종의 RNA 바이러스, jujube yellow mottle-associated virus (JYMaV)를 동정하였다. 채집된 모든 시료는 3종 바이러스에 단독 또는 복합감염되어 있음을 확인하였다. 바이러스별 검출은 JuBV 100%, JYMaV 90.2%, JuMaV 8.2%로 나타났다. 3종 바이러스의 감염조합은 JuBV 단독감염 9.8%, JuBV+JYMaV 2종 복합감염 82.0%, JuBV+JYMaV+JuMaV 3종 복합감염 8.2%로 나타났다. 국내 대추나무에서 검출된 3종 바이러스의 염기서열 분석결과 중국에서 보고된 각각의 바이러스 분리주와 매우 높은 상동성을 나타내었다. 본 논문은 대추나무 바이러스 무병묘 생산을 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대되며, 국내 대추나무에서 바이러스 감염실태와 JuBV와 JuMaV에 대한 첫 보고이다.
최근 감자 바이러스의 발생 양상은 과거에는 PLRV의 이병율이 높았으나 현재에는 PVY의 발생이 많아지고 있는 추세인데 이는 '대서'와 '추백' 같은 감수성 품종의 재배 면적의 증가와 바이러스 이병율이 높은 재배 환경에서의 채종 때문일 것이다. 특히 2기작 감자 포장에서의 당대 감염율을 보더라도 '대서'와 '추백'의 이병율이 높아 감수성 품종으로 '수미'와 '대지'는 이병율이 비교적 낮아 저항성으로 나타났다. 또한 2기작 감자 재배지대에서 PVY에 감수성인 '추백' 품종의 안전한 씨감자 생산을 위해서 주위에 일반감자 재배가 없는 격리가 양호한 환경에서의 채종과 그렇지 못한 환경에서의 채종을 비교하여 재감염 정도를 조사하였는데 조직 배양후 2세대 걸친 노지 재배에서 바이러스 이병율이 약 3배의 차이를 보여 씨감자 생산에서 채종 환경의 중요성을 입증한 결과로 판명되었다.
Lim, Seungmo;Zhao, Fumei;Yoo, Ran Hee;Igori, Davaajargal;Lee, Su-Heon;Lim, Hyoun-Sub;Moon, Jae Sun
The Plant Pathology Journal
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제30권2호
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pp.183-187
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2014
Lettuce mosaic virus (LMV) causes disease of plants in the family Asteraceae, especially lettuce crops. LMV isolates have previously been clustered in three main groups, LMV-Yar, LMV-Greek and LMV-RoW. The first two groups, LMV-Yar and LMV-Greek, have similar characteristics such as no seed-borne transmission and non-resistance-breaking. The latter one, LMV-RoW, comprising a large percentage of the LMV isolates contains two large subgroups, LMV-Common and LMV-Most. To date, however, no Korean LMV isolate has been classified and characterized. In this study, LMV-Muju, the Korean LMV isolate, was isolated from lettuce showing pale green and mottle symptoms, and its complete genome sequence was determined. Classification method of LMV isolates based on nucleotide sequence divergence of the NIb-CP junction showed that LMV-Muju was categorized as LMV-Common. LMV-Muju was more similar to LMV-O (LMV-Common subgroup) than to LMV-E (LMV-RoW group but not LMV-Common subgroup) even in the amino acid domains of HC-Pro associated with pathogenicity, and in the CI and VPg regions related to ability to overcome resistance. Taken together, LMV-Muju belongs to the LMV-Common subgroup, and is expected to be a seed-borne, non-resistance-breaking isolate. According to our analysis, all other LMV isolates not previously assigned to a subgroup were also included in the LMV-RoW group.
Sahin-Cevik, Mehtap;Sivri, Emine Dogus;Cevik, Bayram
The Plant Pathology Journal
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제35권3호
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pp.257-273
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2019
Tomato (Solanum lycopersicum) is one of the most widely grown and economically important vegetable crops in the world. Tomato chlorosis virus (ToCV) is one of the recently emerged viruses of tomato distributed worldwide. ToCV-tomato interaction was investigated at the molecular level for determining changes in the expression of tomato genes in response to ToCV infection in this study. A cDNA library enriched with genes induced in response to ToCV infection were constructed and 240 cDNAs were sequenced from this library. The macroarray analysis of 108 cDNAs revealed that the expression of 92 non-redundant tomato genes was induced by 1.5-fold or greater in response to ToCV infection. The majority of ToCV-induced genes identified in this study were associated with a variety of cellular functions including transcription, defense and defense signaling, metabolism, energy, transport facilitation, protein synthesis and fate and cellular biogenesis. Twenty ToCV-induced genes from different functional groups were selected and induction of 19 of these genes in response to ToCV infection was validated by RT-qPCR assay. Finally, the expression of 6 selected genes was analyzed in different stages of ToCV infection from 0 to 45 dpi. While the expression of three of these genes was only induced by ToCV infection, others were induced both by ToCV infection and wounding. The result showed that ToCV induced the basic defense response and activated the defense signaling in tomato plants at different stages of the infection. Functions of these defense related genes and their potential roles in disease development and resistance to ToCV are also discussed.
전형적인 모자이크 증상의 표주박(Lagenaria leucantha var. gourda)으로부터 CMV를 분리하고 Lag-CMV로 명명하였다. 표주박에서 분리한 Lag-CMV는 N. benthamiana에서 전신감염되어 전형적인 모자이크 증상을 나타내 대조로 공시한 CMV들과 유사하였다. 그러나 N. tabacum. cv. Xanthi nc에서 접종엽에 퇴록반점이 형성되는 점이 As-CMV와 유사하였으며, 접종엽에 무병징을 나타낸 Fny-CMV와 구분되었다. 또한 Fny-CMV에 감염된 오이와 쥬키니 호박은 매우 심한 모자이크 증상을 나타낸 반면, Lag-CMV와 As-CMV에 감염된 식물은 비교적 엷은 모자이크 병징이 발현되었다. 고추에서는 Fny-CMV와 As-CMV가 접종상엽에 모자이크 증상이 발현되으나, Lag-CMV는 무병징으로 감염되었다. Lag-CMV에 감염된 N. benthamiana로부터 추출한 dsRNA의 전기영동 패턴은 대조의 Fny-CMV나 As-CMV의 dsRNA와 종류 및 분자 크기에서 차이를 나타내지 않았다. Lag-CMV에 감염된 N. benthamiana로부터 추출한 total RNA를 외피단백질 유전자와 IR 및 3' 비번역영역 일부를 포함하는 약 950 bp의 cDNA합성을 위한 프라이머를 이용하여 RT-PCR을 실시한 결과 약 950 bp의 cDNA가 검출되었다. 이 cDNA를 제한효소 EcoRI, HindIII, MspI, SalI 및 XhoI으로 처리한 후 RFLP분석을 실시한 결과, Lag-CMV의 RFLP패턴은 As-CMV와 일치하였다. 한편 이 cDNA를 이용하여 염기서열을 분석한 결과, 염기서열의 유사도는 As-CMV와 99.1%, Fny-CMV와는 94.5%였으며, 외피단백질의 아미노산서열 유사도는 As-CMV는 100%, Fny-CMV와 97.3%를 나타냈다. 이와 같은 결과들로부터 표주박에서 분리한 Lag-CMV는 As-CMV와 같은 서브그룹 IB에 속하는 것으로 확인되었다.
국내에서 최근 발견된 Tomato yellow leaf curl virus(TYLCV)가 토마토에 발생하여 큰 피해가 발생하였다. TYLCV의 피해 발생 예방을 위하여 농업현장의 연구지도연구기관에서 쉽고 간편하게 사용할 수 있는 조기 정밀 유전자 진단기술 개발은 매우 중요하다. TYLCV에 대해 특이적 프라이머를 제작하고 특별한 핵산분리 기술이나 도구가 필요 없는 빠르고 정확하며 경제적인 VC/PCR 진단법을 이용한 유전자 진단법을 개발하였다. TYLCV 진단용 프라이머를 22개 제작하여 감염주 및 건전 토마토의 전체 핵산을 이용해 특이성 검정으로 PCR용으로 9점을 선발하였고, VC/PCR 진단법 용으로 9종을 선발하였다. 이러한 두 가지 진단법에 모두 특이적인 프라이머를 6종을 선발한 후 TLCV로 알려진 다른 Geminivirus와의 특이성 검정결과로 총 4종이 최종 선발하였다. 이들 중 Deng(540,541) 프라이머는 Ceminivirus를 진단할 수 있는 degenerate 프라이머로 VC/PCR진단법이 개발 되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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