• 제목/요약/키워드: Plant Quarantine

검색결과 636건 처리시간 0.023초

Detection of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis Assisted by Micro-Raman Spectroscopy under Laboratory Conditions

  • Perez, Moises Roberto Vallejo;Contreras, Hugo Ricardo Navarro;Herrera, Jesus A. Sosa;Avila, Jose Pablo Lara;Tobias, Hugo Magdaleno Ramirez;Martinez, Fernando Diaz-Barriga;Ramirez, Rogelio Flores;Vazquez, Angel Gabriel Rodriguez
    • The Plant Pathology Journal
    • /
    • 제34권5호
    • /
    • pp.381-392
    • /
    • 2018
  • Clavibacter michiganensis subsp. michiganesis (Cmm) is a quarantine-worthy pest in $M{\acute{e}}xico$. The implementation and validation of new technologies is necessary to reduce the time for bacterial detection in laboratory conditions and Raman spectroscopy is an ambitious technology that has all of the features needed to characterize and identify bacteria. Under controlled conditions a contagion process was induced with Cmm, the disease epidemiology was monitored. Micro-Raman spectroscopy ($532nm\;{\lambda}$ laser) technique was evaluated its performance at assisting on Cmm detection through its characteristic Raman spectrum fingerprint. Our experiment was conducted with tomato plants in a completely randomized block experimental design (13 plants ${\times}$ 4 rows). The Cmm infection was confirmed by 16S rDNA and plants showed symptoms from 48 to 72 h after inoculation, the evolution of the incidence and severity on plant population varied over time and it kept an aggregated spatial pattern. The contagion process reached 79% just 24 days after the epidemic was induced. Micro-Raman spectroscopy proved its speed, efficiency and usefulness as a non-destructive method for the preliminary detection of Cmm. Carotenoid specific bands with wavelengths at 1146 and $1510cm^{-1}$ were the distinguishable markers. Chemometric analyses showed the best performance by the implementation of PCA-LDA supervised classification algorithms applied over Raman spectrum data with 100% of performance in metrics of classifiers (sensitivity, specificity, accuracy, negative and positive predictive value) that allowed us to differentiate Cmm from other endophytic bacteria (Bacillus and Pantoea). The unsupervised KMeans algorithm showed good performance (100, 96, 98, 91 y 100%, respectively).

전자빔 조사에 따른 잿빛곰팡이병원균 방제효과와 절화 장미의 수확 후 품질 (Control of Botrytis cinerea and Postharvest Quality of Cut Roses by Electron Beam Irradiation)

  • 권송;최경자;김기선;권혜진
    • 원예과학기술지
    • /
    • 제32권4호
    • /
    • pp.507-516
    • /
    • 2014
  • 본 연구는 전자빔 조사에 따른 잿빛곰팡이병 방제효과와 절화 장미의 수확 후 품질을 알아보고자 수행하였다. 10MeV 전자가속기를 이용하여 0.1, 0.2, 0.4, 0.6, 0.8, 1, 2, 10, 20kGy로 조사했을 때 전자빔 선량이 높아짐에 따라 Botrytis cinerea 포자 발아와 균사 생장은 억제되었다. 전자빔 조사가 B. cinerea 포자 발아와 균사 생장에 미치는 영향을 비교했을 때, 포자 발아를 50% 억제하는 선량은 2.02kGy, 균사 생장을 50% 억제하는 선량은 0.89kGy였으므로 포자가 균사에 비해 전자빔에 대한 저항성이 더 높았다. 전자빔 조사후 배양온도에 따른 B. cinerea 균사 생장을 비교한 결과 잿빛곰팡이병균에 대한 전자빔 효과는 배양온도가 낮아질수록 증가하였으며, 특히 $10^{\circ}C$에서 가장 높은 균사 생장 억제효과를 보였다. 토마토 유묘를 이용하여 전자빔의 in vivo 살균활성을 검정한 결과 전자빔 선량이 높아짐에 따라 방제효과도 증가하였다. 절화 장미는 전자빔 선량이 높아짐에 따라 절화수명 및 생체중의 감소, 개화 지연 등을 보였으며, 'Decoration', 'Il se Bronze', 'Queen Bee', 'Revue'는 0.4kGy이하에서 전반적인 절화품질이 유지되었지만 'Vivian'은 0.2kGy 이하에서만 절화품질이 유지되어 장미 품종에 따라 전자빔에 대한 감수성이 다르게 나타났다.

울산과 나주에서 채집한 배나무 검은별무늬병균의 ergosterol 생합성 저해제 5종에 대한 감수성 저하 (Reduced Sensitivities of the Pear Scab Fungus (Venturia nashicola) Collected in Ulsan and Naju to Five Ergosterol-biosynthesis-inhibiting Fungicides)

  • 권수민;여무일;최세훈;김건웅;전경진;엄재열
    • 식물병연구
    • /
    • 제16권1호
    • /
    • pp.48-58
    • /
    • 2010
  • 우리나라의 대부분의 배 재배 농가에서는 검은별무늬병과 붉은별무늬병의 방제를 위해 저항성 발달위험이 높은 EEI를 빈번하게 사용해 왔다. 검은별무늬병이 상습적으로 발생하고 EBI를 오랫동안 사용해 온 울산과 나주에서 검은별무늬 병균을 채취 하여 difenoconazole, fluquinconazole, flusilazole, fenarimol 및 hexaconazole 의 5종 EEl에 대한 감수성을 검정했다. EBI를 함유하는 배지상에서 $EC_{50}$값이 base-line의 평균값 보다 크게 높아진 균주가 산발적으로 발견되었으므로 감수설 저하 또는 저항성 균주가 분포하는 것으로 추정되었다. 그런데 포트에 재배한 배나무 묘목에 5종의 EBI를 권장사용농도로 포트에 살포하고 3시간 동안 풍건시킨 후, 울산과 나주에서 채취한 포자를 직접 인공 접종한 결과, 울산의 5필지 중 3필지와 나주의 4필지 모두에서 채취한 균은 hexaconazole을 처리한 나무에서 무처리보다 더 높은 이병엽율을 보였으므로 그를 포장에서 채취한 균주집단에는 이 약제에 대해 고도의 저헝성을 갖는 것이 포함된 것으로 판단되었다. 또 울산의 두 과수원에서 채취한 균은 flusilazole에 대해서도 같은 반응을 보였으므로 역시 그 약제에 대해 저항성인 것으로 밝혀졌다.

광릉숲 양치식물의 분포와 생활형 (The Distribution and Life-form of Ferns in Gwangneung Forest)

  • 이강협;여경택;정승선
    • 한국자원식물학회지
    • /
    • 제19권5호
    • /
    • pp.592-597
    • /
    • 2006
  • 광릉숲 양치식물을 중심으로 한 집중적인 조사를 통하여 이 지역에 분포하는 양치식물을 정확히 밝히고자 하였다. 광릉숲에는 9과 17속 43종 3변종 총 46종류의 양치식물이 분포하고 있으며, 지역별 출현식물을 보면, 쇠뜨기, 고사리삼 등 26종류가 광릉숲 전지역에 걸쳐 분포하는 것으로 나타났으며, 꿩고비, 지리개관중 등 5종류가 소리봉 일대를 중심으로 하여 한정 분포하는 것으로 나타났다. 또, 산림동물원 계곡부를 중심으로 낚시고사리, 광릉족제비고사리 등이 분포하였고, 왕지네고사리, 참새발고사리 등은 외국수목원 일대에 국한된 분포역을 형성하고 있었다. 생활형을 보면, 휴면형(Domancy form)은 H(Hemicryptophyte)의 비율이 56.5%로 가장 높았으며, HH(Hydatophyte)가 2.2%로 가장 낮은 값을 보였다. 번식형(Propagation form)의 지하기관형(Radicoid form)은 대부분이 근경이 짧게 분지하고 가장 좁은 범위의 연결체를 갖는 $R_3$으로 39.1%이며, 근경이 옆으로 벋고 약간 넓은 범위의 연결체를 갖는 $R_2$가 2.2%이었고, 산포기관형(Disseminule form)은 모두 포자가 바람이나 물에 의해 운반되는 $D_1$이었다. 생육형(Growth form)은 t(Tussock)와 e(Erect)가 각각 67.4%와 32.6%로 나타나 광릉숲 양치식물의 대표적인 생활형은 $H-R_{3}-D_{1}-t$로 정리되었다. 광릉숲의 양치식물계수(Ptph.-Q.)는 1.28로 한반도 중부지역과 비교하였을 때 상대적으로 다소 높은 수치를 보이고 있어, 이 지역이 학술림으로서 안정적으로 보전 관리되고 있음을 알수 있다.

전자빔 조사가 감자뿔나방의 발육과 생식에 미치는 영향 (Effect of Electron Beam Irradiation on the Development and Reproduction of Phthorimaea operculella (Lepidoptera: Gelechiidae))

  • 조선란;안현모;엄태일;경예진;이승주;김현경;구현나;김길하
    • 한국응용곤충학회지
    • /
    • 제60권2호
    • /
    • pp.255-262
    • /
    • 2021
  • 감자뿔나방은 감자에 대한 검역 해충으로 알려져 있다. 본 연구는 전자빔 조사가 감자뿔나방의 발육 및 생식, 그리고 DNA 손상에 미치는 영향을 비교하고 억제선량을 조사하였다. 전자빔을 알(0-12시간 이내), 유충(3령과 5령), 번데기(용화 1일 이내), 그리고 성충(우화 1일 이내)에 선량을 증가시키면서 조사하였다. 전자빔 150 Gy는 알의 부화와 부화된 유충의 용화를 완전히 억제하였다. 조사된 알의 부화율은 19.3%였지만, 성충 우화는 완전히 억제되었다. 3령과 5령 유충에 100 Gy를 조사하였을 때, 성충의 우화와 생식은 완전히 억제되었다. 번데기와 성충에 각각 300 Gy와 400 Gy를 조사하였을 때, F1세대의 부화율이 억제되었다. 전자빔에 대한 감자뿔나방 성충의 DNA 손상 정도를 alkaline comet assay으로 분석하였으며, 전자빔 조사가 선량 의존적으로 감자뿔나방의 DNA 손상 정도를 증가시켰다. 이러한 결과는 감자뿔나방에 대한 식물 검역 처리법으로 전자빔 150 Gy를 권장할 수 있다. 하지만, 감자뿔나방을 방제하기 위해 전자빔을 현장에 적용하기 위해서는 추가적인 연구가 필요할 것으로 사료된다.

Comparison of Culture, Conventional and Real-time PCR Methods for Listeria monocytogenes in Foods

  • Kim, Dong-Hyeon;Chon, Jung-Whan;Kim, Hyunsook;Kim, Hong-Seok;Choi, Dasom;Kim, Young-Ji;Yim, Jin-Hyeok;Moon, Jin-San;Seo, Kun-Ho
    • 한국축산식품학회지
    • /
    • 제34권5호
    • /
    • pp.665-673
    • /
    • 2014
  • We compared standard culture methods as well as conventional PCR and real-time PCR for the detection of Listeria monocytogenes (L. monocytogenes) in milk, cheese, fresh-cut vegetables, and raw beef that have different levels of background microflora. No statistical differences were observed in sensitivity between the two selective media in all foods. In total, real-time PCR assay exhibited statistically excellent detection sensitivity (p<0.05) and was less time consuming and laborious as compared with standard culture methods. Conventional culture methods showed poor performance in detecting L. monocytogenes in food with high levels of background microflora, generating numerous false negative results. While the detection of L. monocytogenes in fresh cut vegetable by culture methods was hindered only by L. innocua, various background microflora, such as L. innocua, L. welshimeri, L. grayi, and Enterococcus faecalis appeared on the two selective media as presumptive positive colonies in raw beef indicating the necessity of improvement of current selective media. It appears that real-time PCR is an effective and sensitive presumptive screening tool for L. monocytogenes in various types of foods, especially foods samples with high levels of background microflora, thus complementing standard culture methodologies.

Immunization of Mice with Recombinant Brucella abortus Organic Hydroperoxide Resistance (Ohr) Protein Protects Against a Virulent Brucella abortus 544 Infection

  • Hop, Huynh Tan;Reyes, Alisha Wehdnesday Bernardo;Simborio, Hannah Leah Tadeja;Arayan, Lauren Togonon;Min, Won Gi;Lee, Hu Jang;Lee, Jin Ju;Chang, Hong Hee;Kim, Suk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
    • /
    • 제26권1호
    • /
    • pp.190-196
    • /
    • 2016
  • In this study, the Brucella abortus ohr gene coding for an organic hydroperoxide resistance protein (Ohr) was cloned into a maltose fusion protein expression system (pMAL), inserted into Escherichia coli, and purified, and its immunogenicity was evaluated by western blot analysis using Brucella-positive mouse sera. The purified recombinant Ohr (rOhr) was treated with adjuvant and injected intraperitoneally into BALB/c mice. A protective immune response analysis revealed that rOhr induced a significant increase in both the IgG1 and IgG2a titers, and IgG2a reached a higher level than IgG1 after the second and third immunizations. Additionally, immunization with rOhr induced high production of IFN-γ as well as proinflammatory cytokines such as TNF, MCP-1, IL-12p70, and IL-6, but a lesser amount of IL-10, suggesting that rOhr predominantly elicited a cell-mediated immune response. In addition, immunization with rOhr caused a significantly higher degree of protection against a virulent B. abortus infection compared with a positive control group consisting of mice immunized with maltose-binding protein. These findings showed that B. abortus rOhr was able to induce both humoral and cell-mediated immunity in mice, which suggested that this recombinant protein could be a potential vaccine candidate for animal brucellosis.

Development and characterization of 15 microsatellite loci from Lycorma delicatula (Hemiptera: Fulgoridae)

  • Kim, Hyo-Joong;Kim, Min-Young;Kwon, Deok-Ho;Park, Sang-Wook;Lee, Ye-Rim;Jang, Hyo-Young;Lee, Seung-Hwan;Lee, Si-Hyeock;Huang, Junhao;Hong, Ki-Jeong;Jang, Yi-Kweon
    • Animal cells and systems
    • /
    • 제15권4호
    • /
    • pp.295-300
    • /
    • 2011
  • Lycorma delicatula (White 1845), which has been recently introduced into Korea, is a notorious pest on grapes. This invasive insect has rapidly spread throughout central and southern Korea. To date, we have no behavioral or population genetics information, such as invasion routes and subsequent dispersal rates in Korea, to help understand and control populations of L. delicatula. Here, we have developed 15 novel microsatellite loci for L. delicatula. The isolated loci were polymorphic, with 2 to 19 alleles in 42 individuals from a single population in Korea. The analyses revealed that all 42 individuals had different multilocus genotypes with heterozygosity ranging from 0.214 to 0.866. Eleven of the 15 loci did not deviate significantly from Hardy-Weinberg equilibrium. The isolated markers will facilitate population genetic studies of L. delicatula.

한국 너구리(Nyctereutes procyonoides)의 심장사상충감염에 대한 유병률 (Prevalence of Dirofillaria immitis in Raccoon Dogs (Nyctereutes procyonoides) in Korea)

  • 남효승;김종택;양동근;현창백
    • 한국임상수의학회지
    • /
    • 제30권6호
    • /
    • pp.453-455
    • /
    • 2013
  • 심장사상충 감염은 개에서 심부전과 폐질환을 유발하는 치명적인 질환이다. 이러한 심장사상충 감염은 너구리들을 포함한 야생육식동물에서도 발생을 한다. 최근 연구를 통해, 야생 너구리 집단에서 상대적으로 높게 발생하는 유병률을 확인할 수 있다. 그러므로, 본 논문은 한국의 야생너구리에서 발생하는 D. immitis 의 유병률과 감염된 너구리의 회복률에 대한 평가를 하기 위해 고안되었다. 한국 너구리의 D. immitis 에 대한 전체의 유병률은 17.8%이었다. 수컷 너구리의 유병률은 21.8%이었고, 암컷 너구리의 유병률은 12.8% 이었다. 심장사상충 항원 검사에서 양성이 나온 17마리의 너구리들에게 마이크로필라리아는 관찰되지 않았다. 본 논문의 결론은 한국의 D. immitis 의 유병률이 일본에 비해 2배이상 높은 것으로 확인되었다. 또한, 고양이와 마찬가지로 너구리들도 마이크로필라리아혈증이 드문 것으로 나타났다.

코로나바이러스감염증-19와 일부 가축전염병 방역소독제품의 함유성분 및 유해물질 조사 (Investigation of Ingredients and Hazardous Substances in Disinfectants Used against COVID-19 and Some Livestock Diseases)

  • 김동현;임미영;이기영
    • 한국환경보건학회지
    • /
    • 제46권4호
    • /
    • pp.470-479
    • /
    • 2020
  • Objectives: The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic has caused the death of 740,000 people around the world as of August 12, 2020. Foot-and-Mouth Disease, Avian Influenza, and African Swine Fever are serious livestock diseases. Government agencies in Korea have provided ingredient information and usage instructions for disinfectants used to counter those infectious diseases. The purpose of this study was to provide information on the chemical ingredients in disinfectant products used against COVID-19 and certain livestock diseases. Methods: We collected information from the Korean government. The Central Disaster Management Headquarters and Central Disease Control Headquarters provided information on disinfectant products used against COVID-19. The Animal and Plant Quarantine Agency of Korea provided information on efficacy-certified disinfectant products for use against selected livestock diseases. Health hazard and environmental hazard information on the ingredients in the disinfectants was collected from the Korea Occupational Safety & Health Agency's Material Safety Data Sheets, and toxicity value information was collected from United States Environmental Protection Agency's CompTox Chemicals Dashboard. Results: There were 76 COVID-19 disinfectant products in use, and the most common ingredients were benzalkonium chloride (51%), alkylbenzyl dimethyl ammonium (30%), and ethanol (3%). There were 216 livestock disease disinfectant products comprised of 89 acidic, 88 oxidic, 30 aldehydic, three alkaline, and six other products. Among the 49 active ingredients used in the disinfectants that were investigated, health and environmental hazard information was provided for many of them, but only 20 chemicals had official toxicological information. Conclusion: Since the disinfectants included numerous chemicals, an understanding of their chemical characteristics could be critical to prevent unintended human or environmental exposure.