We isolated a novel methylotrophic bacterium from soil collected in Dongducheon Environment Affairs Agency. The isolate was identified as Methylobacterium sp. WJ4 based on phylogenetic analysis. Plackett-Burman design was employed for screening eight parameters of nitrate mineral salts (NMS) medium for cell growth of a newly isolated Methylobacterium sp. WJ4 with experimental validation. Trace element solution and vitamin stock were found to affect cell growth, which can be further optimized for increased cell growth. This is the first report of screening parameters of NMS medium which affect cell growth of strain belonging to the genus Methylobacterium using Plackett-Burman design.
The Plackett-Burman experimental design was employed to evaluate the relative importance of medium constituents of each medium for enhanced griseofulvin production by Penicillium griseofulvum MTCC 1898 and Penicillium griseofulvum MTCC 2004. It was found that the medium constituents, sucrose, $K_2HPO_4,\;NaNO_3,\;and\;FeSO_4{\cdot}7H_2O$, significantly influenced the griseofulvin production by Penicillium griseofulvum MTCC 1898. In the case of Penicillium griseofulvum MTCC 2004, lactose, glucose, and $MnSO_4{\cdot}H_2O$ significantly influenced the griseofulvin production.
This paper proposes statistically designed experiments which provide a proactive means to implement safety and environmental applications. Minimal experimental designs such as fractional factorial design, Plackett-Burman design, Box-Behnken design are economical and can be achieved tremendous savings with relatively few experiments. These experimental designs and analysis methods are illustrated with cases.
Plackett-Burman (PB) and Box-Behnken (BB) experimental designs were used to optimize fermentation variables for the biotransformation of glycyrrhizin (GL) to monoglucuronyl-glycyrrhetinic acid (MGGA). The PB design was first used to screen the important factors among the medium variables. The steepest ascent method was used to approach the optimum range for each of these factors. The BB design was finally used to analyze the response surfaces of the screened factors for further optimization. The optimized conditions for this system were 0.7 g/L $MgSO_4{\cdot}7H_2O$, 1.19 g/L GL, and cultivation for six days. The biotransformation of GL to MGGA could reach up to 35.72%, which is a good result for this kind of transformation.
Kim, Hyun;Eom, Hyun-Ju;Lee, Jun-Soo;Seo, Jin-Ho;Han, Nam-Soo
한국생물공학회:학술대회논문집
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2005.04a
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pp.68-72
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2005
Leuconostoc citreum is one of the representative strains of Leuconostoc spp. that show fast growth rates in fermented vegetables. Sequential experimental designs including the Plackett-Burman design, fractional factorial design, steepest ascent analysis, central composite design and response surface methodology were introduced tooptimize and improve the medium for Leuconostoc citreum. Fifteen medium ingredients were examined and glucose (20 g/l), yeast extract (12.5 g/l), sodium acetate trihydrate (6.12 g/l), potassium phosphate (42.55 g/l) and dibasic ammonium citrate (4.12 g/l)were chosen as the best components to give a critical and positive effect for cell-growth. The biomass was increased to 2.79 g/l (169%), compared to the 1.65 g/l in MRS medium.
Kim, Hyun;Eom, Hyun-Ju;Lee, Jun-soo;Han, Jin-soo;Han, Nam-Soo
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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v.9
no.4
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pp.278-284
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2004
Leuconostoc citreum is one of the representative strains of Leuconostoc spp. that show fast growth rates in fermented vegetables. Sequential experimental designs including the Plackett-Burman design, fractional factorial design, steepest ascent analysis, central composite design and response surface methodology were introduced to optimize and improve the medium for L. citreum. Fifteen medium ingredients were examined and glucose ($20 g/\ell$), yeast extract ($12.5g/\ell$), sodium acetate trihydrate ($6.12g/\ell$), potassium phosphate ($42.55g/\ell$), and dibasic ammonium citrate ($4.12g/\ell$), were chosen as the best components to give a critical and positive effect for cell-growth. The biomass was increased to ($2.79g/\ell$), (169%), compared to the $1.65g/\ell$ in MRS medium.
Khan, Minhaj Ahmad;Hamid, Rifat;Ahmad, Mahboob;Abdin, M.Z.;Javed, Saleem
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.20
no.11
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pp.1597-1602
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2010
Chitinase is one of the most important mycolytic enzymes with industrial significance. This enzyme is produced by a number of organisms including bacteria. In this study, we describe the optimization of media components with increased production of chitinase for the selected bacteria, Stenotrophomonas maltophilia, isolated from soil. Different components of the defined media responsible for influencing chitinase secretion by the bacterial isolate were screened using Plackett-Burman experimental design and were further optimized by Box-Behnken factorial design of response surface methodology in liquid culture. Maximum chitinase production was predicted in medium containing 4.94 g/l chitin, 5.56 g/l maltose, 0.62 g/l yeast extract, 1.33 g/l $KH_2PO_4$, and 0.65 g/l $MgSO_4{\cdot}7H_2O$ using response surface plots and the point prediction tool of the DESIGN EXPERT 7.1.6 (Stat-Ease, USA) software.
A locally isolated thermophile, Geobacillus sp. SAB-40, producing thermostable extracellular amylase constitutively and an induced intracellular ${\beta}$-galactosidase was characterized and identified based on 16S rRNA sequencing. A phylogenetic analysis then revealed its closeness to Geobacillus stearothermophilus. To evaluate the effect of the culture conditions on the coproduction of both enzymes by G stearothermophilus SAB-40, a Plackett-Burman fractional factorial design was applied to determine the impact of twenty variables. Among the tested variables, $CaCI_2$, the incubation time, $MgSO_4{\cdot}7H_2O$, and tryptone were found to be the most significant for encouraging amylase production. Lactose was found to promote ${\beta}$-galactosidase production, whereas starch had a significantly negative effect on lactase production. Based on a statistical analysis, a preoptimized medium attained the maximum production of amylase and ${\beta}$-galactosidase at 23.29 U/ml/ min and 12,958 U/mg biomass, respectively, which was 3-and 2-fold higher than the yield of amylase and lactase obtained with the basal medium, respectively.
The effect of alginate coating in combination with an anti-browning agent on increasing the post-cutting shelf life and improving the quality of minimally processed apple cubes was studied during storage at room temperature for 5 days. A simple coating technique involving the chemical cross-linkage of alginate by calcium was used. Statistical-based experimental designs were applied to improve the quality of the alginate-coated apple cubes (ACAC). Plackett-Burman design was first used to determine the main factors influencing the preservation of the original weight, color, and texture of ACAC. Among these variables, alginate concentration ($X_1$), dipping time ($X_2$), and dipping temperature ($X_3$) significantly influenced the ACAC weight and color (confidence levels above 90%). Subsequently, the effects of the 3 main factors were further investigated by a central composite design. The polynomial models developed by response surface methodology were adequate to describe the relationships between the studied factors and the responses. Overall optimization conducted by superimposing the curves of the responses enabled the determination of an optimal range of the independent variables in which the five responses were simultaneously optimized. The point chosen as representative of this optimal area corresponded to $X_1=2.98%$, $X_2=0.85\;min$, and $X_3=55^{\circ}C$ and under these conditions the model predicted weight loss=0.522%, relative hardness=1.517, ${\Delta}E=1.423$, browning inhibition=93.403%, and ${\Delta}L=0.158$.
In this paper, two statistical methods were applied to optimize medium components to improve the production of the milk-clotting enzyme by Bacillus amyloliquefaciens D4. First, wheat bran juice, skim milk powder, and $Na_2HPO_4$ were shown to have significant effects on D4 enzyme production using the Plackett-Burman experimental design. Subsequently, an optimal medium was obtained using the Box-Behnken method, which consisted of 3.31 g/l of skim milk powder, 5.0 g/l of sucrose, 0.1 g/l of $FeSO_4{\cdot}7H_2O$, 0.1 g/l of $MgSO_4{\cdot}7H_2O$, 0.1 g/l of $MnSO_4{\cdot}2H_2O$, 0.1 g/l of $ZnSO_4{\cdot}7H_2O$, 1.52 g/l of $Na_2HPO_4$, and 172.45 g/l of wheat bran juice. With this optimal medium, the milk-clotting enzyme production was remarkably enhanced. The milk-clotting enzyme activity reached 3,326.7 SU/ml after incubation of 48 h, which was 1.76-fold higher than that of the basic medium, showing that the Plackett-Burman design and Box-Behnken response surface method are effective to optimize medium components, and B. amyloliquefaciens D4 possessed a high rennet-producing capacity in the optimal medium.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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