Kim, Joung-Mok;Park, Hye-Yeon;Choi, Kyoung-Jae;Jung, Hoe-Il;Han, Sung-Hwan;Lee, Jae-Seong;Park, Joon-Shik;Yoon, Moon-Young
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.16
no.11
/
pp.1784-1790
/
2006
Bacillus anthracis is a causative agent of anthrax. Anthrax toxins are composed of a protective antigen (PA), lethal factor (LF), and edema factor (EF), in which the PA is a central mediator for the delivery of the two enzymatic moieties LF and EF. Therefore, the PA has been an attractive target in the prevention and vaccinization for anthrax toxin. Recently, it has been reported that the molecule consisting of multiple copies of PA-binding peptide, covalently linked to a flexible polymer backbone, blocked intoxification of anthrax toxin in an animal model. In the present study, we have screened novel diverse peptides that bind to PA with a high affinity (picomolar range) from an M13 peptide display library and characterized the binding regions of the peptides. Our works provide a basis to develop novel potent inhibitors or diagnostic probes with a diverse polyvalence.
Adhesive interaction of the platelet glycoprotien IIb-IIIa (GP IIb-IIIa) with a plasma protein, such as fibrinogen, plays an important role in thrombosis and hemostasis. The specific sequence Arg-Gly-Asp (RGD) is critical for the binding of fibrinogen to platelet. To examine and characterize the GP IIb-IIIa antagonist from natural sources, we have developed a simple enzyme-linked immunosorbant assay (ELISA) system. The GP IIb-IIIa complex was purified to homogeneity from platelet Iysates by the combination of two affinity chromatographic methods using the synthetic RGD peptide (GRGDSPK)-immobilized Sepharose and wheat germ lectin-Sepharose. The synthetic peptide GRGDSP inhibits GP IIb-IIIa binding to immobilized fibrinogen with an $IC_{50}$ of $1.5\;{\mu}M$. Venoms of three different snake species and a Korean scolopendra extract have strong antagonistic activities for the binding of human fibrinogen to the platelet GP IIb-IIIa complex. The $IC_{50}$ values of the snake venom s and scolopendra were in the range of $5.5\;{\mu}g$ to $60\;{\mu}g$. These results provide meaningful information for developing antiplatelet agents.
Tolaasin, a peptide toxin produced by Pseudomonas tolaasii, causes a serious disease on the cultivated mushrooms, known as brown blotch disease. Hemolysis using red blood cells was designed to measure the cytotoxicity of tolaasin molecules. Since tolaasin has two amine groups near the C-terminus, its membrane binding will be dependent on the ionic states of the amine groups. When the tolaasin peptide was titrated, its titration curve indicated the presence of titratable amine(s) at pH ranges from 7.0 to 9.6. When the pH-dependence of tolaasin-induced hemolysis was measured at various pHs, hemolysis was more efficient at alkaline pHs. In order to measure the membrane binding activity of tolaasin at different pHs, RBCs were incubated with tolaasin molecules for short time periods and washed out with fresh buffer. Because of the tolaasin binding during the preincubation period, fast hemolyses were observed at pH 8 or higher. These results imply that non-charged or less positively charged states of tolaasin molecules easily bind to membrane and show high hemolytic activity.
Peptidylprolyl cis-trans isomerase (PPlase) catalyzes the cis-trans isomerization of prolyl peptide and facilitates the folding of cellular proteins and peptides. PPlase consists of two distinct immunophilins, each specifically binding to the immunosupressive drug cyclosporin A (CsA) or FK506, respectively. A PPlase was isolated and partially purified from porcine spleen. The molecular weight of porcine spleen PPlase was determined to be ~14,000 on the basis of SDS-PAGE. The purified enzyme was strongly inhibited by FK506, but not by CsA. The inhibition constant and the true concentration of enzyme preparations were determined by active site titration using the tight binding inhibitor FK506: $K_{i}=18.7$ nM and $E_{t}=172$ nM. The equilibrium ratio of conformer. [cis]/[trans], of prolyl peptide substrates (N-Suc-Ala-Xaa-Pro-Phe-p-NA) in anhydrous trifluoroethanol/LiCl solvent system varied from 0.24 to 0.85 depending on the nature of Xaa. Overall. in this solvent-salt system, the populations of the cis conformer of substrates in equilibrium are higher than in an aqueous solution so that the substantial error caused by high background absorption can be reduced. The reactivities of porcine spleen PPlase are shown to be highly sensitive to changes in the structure of substrates. Thus, $k_{cat}/K_m$ value for the most reactive substrate (Xaa Leu) is $4.007+10^{6}M^{1}s^{1}$ and, is 2,636 fold higher than that for the least reactive peptide substrate tested, Xaa=Glu.
Lim, Jae Cheong;Choi, Sang Mu;Cho, Eun Ha;Kim, Jin Joo
Journal of Radiation Industry
/
v.7
no.2_3
/
pp.191-200
/
2013
In this study, a novel bombesin (BBN) analogues, DOTA-Ala($SO_3H$)-4 aminobenzoyl-Gln-Trp-Ala-Val-Gly-His-Leu-Met-$NH_2$ (DOTA-sBBN) and DOTA-Lys(glucose)-4 aminobenzoyl-Gln-Trp-Ala-Val-Gly-His-Leu-Met-$NH_2$ (DOTA-gluBBN), were synthesized and radiolabeled, and their binding affinities were evaluated. Peptides were prepared by a solid phase synthesis method and their purities were over 98%. DOTA is the chelating agent for $^{177}Lu$-labeling, and the DOTA-conjugated peptides were radiolabeled with $^{177}Lu$ by a high radiolabeling yield (>98%). The Log P values of DOTA-sBBN and DOTA-gluBBN were -2.20 and -2.79, respectively. 50.41% of $^{177}Lu$-DOTA-sBBN and 72.97% of $^{177}Lu$-DOTA-gluBBN were left undegraded by the serum incubation at $37^{\circ}C$ for 48 hr. A competitive displacement of $^{125}I-[Tyr^4]$-BBN on the PC-3 human prostate carcinoma cells revealed that 50% inhibitory concentration ($IC_{50}$) were 1.46 nM of DOTA-sBBN and 4.67 nM of DOTA-gluBBN indicating a highly nanomolar binding affinity for GRPR. Therefore, it is concluded that $^{177}Lu$-DOTA-sBBN and $^{177}Lu$-DOTA-gluBBN can be potential candidates as a targeting modality for the Gastrin-releasing peptide receptor (GRPR)-over-expressing tumors, and further studies to evaluate their biological and pharmacological characteristics are needed.
Specific affinity binding sites for atrial natriuretic peptide (ANP) were Investigated in the pig ovarian tissues by in vitro autoradiographic techniques. In the pig ovary, the highest binding sites for 12514abeiled rANP(l~28) were localized in the granulosa cell layer of the forncles. The binding sies on theca layer of the ovarian follicles were mainly localized in the external layer, but none was observed In the Internal layer. In the corpus luteum, the binding site was not observed. The specific bindings of 200 pM of l2Sl4abelled rANP(l~28) to granulosa and theca externa layers were reversed completely by excess concentration (1 ~4) of unlabelled rANP(l~28) but not by 10 ~ of unrelated peptides, human angiotensin II and arginine vasopressin. The binding was also displaced by 1 ~ of desiGIn18, Ser19, Gly2O, leu21, Gly22I ANP(4~2g) (C- ANF) as a spedfic ligand of the ANP clearance receptor. Therefore these results indicate ~hat the biological and the clearance ANP receptors exist in the theca externa and granulosa layer of the pig ovary, and suggest that the ANP receptors may be related with the regulatory lundion of the ovarian follicular development including oocyte maturation.
Silk sericin protein was hydrolyzed by seven proteolytic enzymes in order to examine the effectiveness of the hydrolysates in binding calcium. The amino acid nitrogen content of hydrolysates from Flavourzyme was higher than that for other enzymes, and its calcium binding capacity showed a dose-dependent increase. We examined the effects of calcium binding peptide from sericin hydolysates on the bioavailability of Ca-deficient rats. Three-week-old male rats were fed an Ca-deficient diet for three weeks. Rats were divided into four groups (DD: non-treated group on calcium deficient diet; DD+MC: milk-calcium treated group; DD+OC: organic calcium made using sericin hydolysates; and DD+IC: inorganic calcium ($CaCl_2$). After oral administration of calcium supplements for one week, the calcium content of the serum and liver were significantly higher in DD+OC ($101.7{\mu}g$/mL and $49.3{\mu}g$/mL) and DD+MC ($83.6{\mu}g$/mL and $42.8{\mu}g$/mL) than DD ($86.3{\mu}g$/mL and $43.4{\mu}g$/mL). The alkaline phosphatase (ALP) content in the treated groups was significantly lower than DD, but no significant difference among groups was shown. Aspartate aminotransferase (AST) levels did not show any significant difference between groups. Alanine aminotransferase (ALT) levels were significantly reduced compared to the DD group. In conclusion, binding calcium to peptides from sericin hydrolysates seems to improve its bioavailability, and to hasten the cure of calcium deficiency in experimental rats.
Acyl-CoA binding proteins (ACBP) are small highly-conserved cytosolic proteins that bind long-chain acyl-CoAs. A cDNA encoding ACBP was identified from cDNA library constructed from hairy root poly $A^{+}$ RNA in expressed sequence tags (EST) analysis. The cDNA clone was 453 bp long and carried an open reading frame of 264 bp (10 kDa). The ginseng ACBP amino acid sequence was compared with other reported plant ACBPs using the CLUSTALW. Ginseng ACBP is 89%, 81%, 80%, and 73% identical with ACBP from castor bean, lilly, Digitalis and Arabidopsis, respectively. However, ginseng ACBP is 5 amino acids smaller than Arabidopsis and rape seed ACBPs. Also there is no any known signal peptide sequence in ginseng ACBP.
The purpose of this research was to investigate the potential use of cheese whey protein (CWP), a cheese by-product. The physiological activity of calcium-binding peptides in CWP may be used as a food additive that prevents bone disorders. This research also examined the characteristics of calcium-binding peptides. After the CWP was heat treated, it was hydrolyzed by trypsin. Then calcium-binding peptides were separated and purified by ion-exchange chromatography and reverse phase HPLC, respectively. To examine the characteristics of the purified calcium-binding peptides, amino acid composition and amino acid sequence were analyzed. Calcium-binding peptides with a small molecular weight of about 1.4 to 3.4 kDa were identified in the fraction that was flowed out from 0.25 M NaCl step gradient by ion-exchange chromatography of tryptic hydrolysates. The results of the amino acid analysis revealed that glutamic acid in a calcium-binding site took up most part of the amino acids including a quantity of proline, leucine and lysine. The amino acid sequence of calcium-binding peptides showed Phe-Leu-Asp-Asp-Asp-Leu-Thr-Asp and Ile-Leu-Asp-Lys from $\alpha$-LA and Ile-Pro-Ala-Val-Phe-Lys and Val-Tyr-Val-Glu-Glu-Leu-Lys from ${\beta}$-LG.
Papiliocin, isolated from the swallowtail butterfly (Papilio xuthus), is an antimicrobial peptide with high selectivity against gram-negative bacteria. We previously showed that the N-terminal helix of papiliocin (PapN) plays a key role in the antibacterial and anti-inflammatory activity of papiliocin. In this study, we measured the selectivity of PapN against multidrug-resistant gram-negative bacteria, as well as its anti-inflammatory activity. Interactions between Trp2 of PapN and lipopolysaccharide (LPS), which is a major component of the outer membrane of gram-negative bacteria, were studied using the Trp fluorescence blue shift and quenching in LPS micelles. Furthermore, using circular dichroism, we investigated the interactions between PapN and LPS, showing that LPS plays critical roles in peptide folding. Our results demonstrated that Trp2 in PapN was buried deep in the negatively charged LPS, and Trp2 induced the ${\alpha}$-helical structure of PapN. Importantly, docking studies determined that predominant electrostatic interactions of positively charged arginine residues in PapN with phosphate head groups of LPS were key factors for binding. Similarly, hydrophobic interactions by aromatic residues of PapN with fatty acid chains in LPS were also significant for binding. These results may facilitate the development of peptide antibiotics with anti-inflammatory activity.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.