Objective: Genome-wide association study and two meta-analysis based on GWAS performed to explore the genetic mechanism underlying variation in pig number born alive (NBA) and total number born (TNB). Methods: Single trait GWAS and two meta-analysis (single-trait meta analysis and multi-trait meta analysis) were used in our study for NBA and TNB on 3,121 Yorkshires from 4 populations, including three different American Yorkshire populations (n = 2,247) and one British Yorkshire populations (n = 874). Results: The result of single trait GWAS showed that no significant associated single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified. Using single-trait meta analysis and multi-trait meta analysis within populations, 11 significant loci were identified associated with target traits. Spindlin 1, vascular endothelial growth factor A, forkhead box Q1, msh homeobox 1, and LHFPL tetraspan submily member 3 are five functionally plausible candidate genes for NBA and TNB. Compared to the single population GWAS, single-trait Meta analysis can improve the detection power to identify SNPs by integrating information of multiple populations. The multiple-trait analysis reduced the power to detect trait-specific loci but enhanced the power to identify the common loci across traits. Conclusion: In total, our findings identified novel genes to be validated as candidates for NBA and TNB in pigs. Also, it enabled us to enlarge population size by including multiple populations with different genetic backgrounds and increase the power of GWAS by using meta analysis.
Background: Hepatitis B virus (HBV) infection has been reported to be associated with inferior prognosis in hepatocellular and pancreatic carcinoma cases, but has not been studied with respect to non small cell lung cancer (NSCLC). The purpose of this study was to investigate the prognostic significance of HBV infection in advanced NSCLC patients. Materials and Methods: A retrospective cohort of 445 advanced NSCLC patients was recruited at our hospital from January 1, 2003 until August 30, 2014. Serum HBV markers were tested by enzyme-linked immunosorbent assay. COX proportional hazards analysis was used to evaluate associations of HBV infection with overall survival (OS). Results: Of 445 patients who were qualified for the study, 68 patients were positive for HBsAg, also considered as HBV infection. Patients in HBsAg negative group were found to have better OS (12.6 months [12.2-12.9]) than those in HBsAg positive group (11.30 months [10.8-11.9]; p=0.001). Furthermore, COX multivariate analysis identified HBV infection as an independent prognostic factor for OS (HR 0.740 [0.560, 0.978], p=0.034). Conclusions: Our study found that HBsAg-positive status was an independent prognostic factor for OS in patients with advanced NSCLC. Future prospective studies are required to confirm our findings.
Yang, Yun;Peng, Wei;Tang, Tian;Xia, Lin;Wang, Xiao-Dong;Duan, Bao-Feng;Shu, Ye
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
v.15
no.13
/
pp.5175-5180
/
2014
Objective: In this study, tumor-stage predictive abilities of miR21, miR155, miR29a and miR92a were evaluated in rectal cancer (RC). Methods: Expression of miR21, miR155, miR29a and miR92a was detected and quantitated in tumor tissue and in adjacent normal tissue from 40 patients by TaqMan MicroRNA assay. Results: Significant overexpression of miR21, miR155, miR29a and miR92a was observed in RC tissues. While high expression of miR21, miR155 and miR29a in N1-2 and C-D stages presented a potential correlation with N and Duke stages, partial correlation analysis suggested that only miR155 rather than miR21 and miR29a played a greater influencing role. Receiver operating characteristics (ROC) curve analysis showed that miR155 could discriminate N0 from N1-2 with 85.0% sensitivity and 85.0% specificity, N2 from N0-1 with 90.0% sensitivity and 96.7% specificity, and C-D stage from A-B stage with 81.0% sensitivity and 84.2% specificity. Conclusions: Increase in expression of miR155 might represent a novel predictor for RC N and Dukes staging.
Background: Epidermal growth factor-like domain multiple 7 (EGFL7), recently identified as a secreted protein regulated by oxygen exposure, plays a critical role in promoting metastasis of hepatocellular carcinoma (HCC). Transcatheter arterial embolization (TAE) is widely used for treatment of HCC, resulting in hypoxia in tumors and surrounding liver tissues. Accordingly, we proposed the hypothesis that there could be a relationship between expression of EGFL7 and response to TAE. Materials and Methods: We established a rabbit VX2 liver tumor model using percutaneous puncture technique guided by computed tomography. TAE and sham embolization were performed and the results were confirmed by MRI 3 weeks after inoculation. We investigated the EGFL7 expression of the two groups at 6h and 3 days after intervention by means of immunohistochemistry and Western blotting. Results: Immunohistochemical staining demonstrated that the levels of EGFL7 protein significantly increased in the TAE-treated tumors compared with the control group at 6 hours (P=0.031) and 3 days (P=0.020) after intervention. Meanwhile, the relative EGFL7 protein detected in TAE group also up-regulated compared with the control group at 6 hours (P=0.020) and 3 days (P=0.024) after intervention. Conclusions: This study reveals an increase of EGFL7 expression in rabbit VX2 liver tumors after TAE. The role of EGFL7 in HCC, especially its biological behavior after TAE, needs further investigation.
Purpose: To assess efficacy of Ki67 combined with VEGF as a molecular grading model to predict outcomes with non-muscle invasive bladder cancer (NMIBC). Materials: 72 NMIBC patients who underwent transurethral resection (TUR) followed by routine intravesical instillations were retrospectively analyzed in this study. Univariate and multivariate analyses were performed to confirm the prognostic values of the Ki67 labeling index (LI) and VEGF scoring for tumor recurrence and progression. Results: The novel molecular grading model for NMIBC contained three molecular grades including mG1 (Ki67 $LI{\leq}25%$, VEGF $scoring{\leq}8$), mG2 (Ki67 LI>25%, VEGF $scoring{\leq}8$; or Ki67 $LI{\leq}25%$, VEGF scoring > 8), and mG3 (Ki67 LI > 25%, VEGF scoring > 8), which can indicate favorable, intermediate and poor prognosis, respectively. Conclusions: The described novel molecular grading model utilizing Ki67 LI and VEGF scoring is helpful to effectively and accurately predict outcomes and optimize personal therapy.
Polymorphisms in miRNA binding sites have been shown to affect miRNA binding to target genes, resulting in differential mRNA and protein expression and susceptibility to common diseases. Our purpose was to predict SNPs (single nucleotide polymorphisms) within miRNA binding sites of inflammatory genes in relation to gastric cancer. A complete list of SNPs in the 3'UTR regions of all inflammatory genes associated with gastric cancer was obtained from Pubmed. miRNA target prediction databases (MirSNP, Targetscan Human 6.2, PolymiRTS 3.0, miRNASNP 2.0, and Patrocles) were used to predict miRNA target sites. There were 99 SNPs with MAF>0.05 within the miRNA binding sites of 41 genes among 72 inflammation-related genes associated with gastric cancer. NF-${\kappa}B$ and JAK-STAT are the two most important signaling pathways. 47 SNPs of 25 genes with 95 miRNAs were predicted. CCL2 and IL1F5 were found to be the shared target genes of hsa-miRNA-624-3p. Bioinformatic methods could identify a set of SNPs within miRNA binding sites of inflammatory genes, and provide data and direction for subsequent functional verification research.
Background: The high recurrence rate after hepatic resection in hepatocellular carcinoma (HCC) is a major obstacle to improving prognosis. The objective of the present study was to explore the function of genistein, a soy-derived isoflavone, in enhancing the inhibitory effect of cisplatin on HCC cell proliferation and on tumor recurrence and metastasis in nude mice after curative hepatectomy. Methods: Proliferation of human HCC cells (HCCLM3) was detected by 3-(4, 5-dimethylthiazolyl-2)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) assay. Synergistic effects of genistein and cisplatin were evaluated with the median-effect formula. Nude mice bearing human HCC xenografts underwent tumour resection (hepatectomy) 10 days post implantation, then received intraperitoneal administration of genistein or cisplatin alone or the combination of the two drugs. 33 days after surgery, recurrent tumours and pulmonary metastasis were evaluated individually. MMP-2 level in recurrent tumours was detected by immunohistochemistry and real-time PCR; MMP-2 expression in HCCLM3 was detected by immunocytochemistry. Results: Genistein and cisplatin both suppressed the growth and proliferation of HCCLM3 cells. The two drugs exhibited synergistic effects even at relatively low concentrations. In vivo, mice in the combined genistein and cisplatin group had a smaller volume of liver recurrent tumors and fewer pulmonary metastatic foci compared with single drug treated groups. Cisplatin upregulated the expression of MMP-2 in both recurrent tumours and HCCLM3, while genistein abolished cisplatin-induced MMP-2 expression. Conclusions: Genistein reinforced the inhibitory effect of cisplatin on HCC cell proliferation and tumour recurrence and metastasis after curative hepatectomy in nude mice, possibly through mitigation of cisplatin-induced MMP-2 upregulation.
The cerebellar hemangioblastoma (CHB) has an abundant blood supply and deep anatomical location. Complete surgical resection is generally very difficult. This study investigated the safety and effectiveness of preoperative embolization followed by surgical resection of CHB in a large cohort of patients. A database of 125 CHB patients with surgical resection in Beijing Tiantan Hospital between July 2006 and July 2012 was reviewed. Of those, 46 cases (experimental group) received preoperative embolization, 79 cases (control group) underwent surgery without embolization. Patient demographics, tumor size, duration of surgery, blood loss, blood transfusion, complications and follow-up results were collected and analyzed retrospectively. In the experimental group, the Kamofsky score (KS) was 80-100 in 40 cases (86.9%), 40-70 in 4 cases (8.7%), and below 40 in 2 cases (4.3%). Among 31 cases with follow-up, KS was 80-100 in 27 cases (87.1%), 40-70 in 2 cases (6.5%), and 0 in 2 cases (6.5%). In control group, KS was 80 -100 in 65 cases (82.2%), 40-70 in 6 cases (7.6%), 10-30 in 3 cases (3.8%), and 0 in 3 cases (3.8%). Among 53 cases with follow-up, KS was 80-100 in 44 cases (83.0%), 40-70 in 4 cases (7.5%), 10-30 in 1 case (1.9%), and 0 in 4 cases (7.5%). There were statistically significant differences between the experimental and control groups in tumor size, duration of surgery, amount of intraoperative blood loss and transfusion (p<0.01). However, complications (p=0.31) and follow-up results (p=0.76) showed no significant differences between groups. Selective preoperative embolization of those CHB patients with richer blood supply, higher hemorrhage risk, is safe and effective, and is a reliable adjuvant therapy for complete surgical resection of CHB.
In China, medicinal plants play almost the same important role in the general health service as the western medicine. In this paper, we present a brief review about the industrial development of medicinal plants in China. A nation-wide survey shows that there are 11, 118 species of medicinal plants in China. The total annual output value of natural products is about $6, 000. The output value of preparations is 3 billion US dollars. Over 100 new drugs have been developed from the medicinal plants. As the trend worldwide today that human-being favors the way of life back to nature, medicinal plants will play a very important role, and their industrial exploitation will certainly be keeping a key position for human health.
Peng, Jin Fu;Liu, Li;Guo, Cheng Xian;Liu, Shi Kun;Chen, Xiao Ping;Huang, Li Hua;Xiang, Hong;Huang, Zhi Jun;Yuan, Hong;Yang, Guo Ping
Biomolecules & Therapeutics
/
v.23
no.5
/
pp.400-406
/
2015
MicroRNAs (miRNAs) are a family of non-coding RNA that are able to adjust the expression of many proteins, including ATP-binding cassette transporter and organic cation transporter. We sought to evaluate the effect of miR-511 on the regulation of OATP1B1 expression by free fatty acids. When using free fatty acids to stimulate Chang liver cells, we found that the expression of miR-511 increased significantly while the expression of OATP1B1 decreased. We also proved that SLCO1B1 is the target gene of miR-511 with a bioinformatics analysis and using the dual luciferase reporter assay. Furthermore, the expressions of SLCO1B1 and OATP1B1 decreased if transfecting Chang liver cells with miR-511, but did not increase when transfecting the inhibitors of miR-511 into steatosis cells. Our study indicates that miR-511 may play an important role in the regulation of OATP1B1 expression by free fatty acids.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.