• 제목/요약/키워드: PHN

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Pseudomonas sp. strain DJ77로 부터 phenanthrene 분해 유전자군의 클로닝과 대장균에서의 발현 (Molecular Cloning of a Gene Cluster for Phenanthrene Degradation from Pseudomonas sp. Strain DJ77 and Its Expression in Escherichia coli)

  • 김영창;윤길상;신명수;김흥식;박미선;박희진
    • 미생물학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.1-7
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    • 1992
  • Pseudomonas sp. DJ77 의 chromosomal DNA로 부터 6-8kb XhoI 절편 상에 존재하는 phenanthrene 분해에 관련된 유전자군을 vector pBLUESCRIPT SK(+)에 클로닝하였다. 이렇게 얻은 재조합 plasmid인 pHENX7을 가지고 있는 JM101 균주는 3-methylcatechol을 노란색의 meta-cleavage 화합물로 전환학 수 있었다. 그러자 삽입된 절편의 방향이 반대가 되도록 제조한 pHENX7R 은 extradiol dioxygenase 활성을 나타내지 않기 때문에 전사방향을 알 수 있었다. pHENX7과 이의 유도체들을 지니는 JM101 균주에서 PhnC(24kDa), PhnD(31 kDa), PhnE(34 kDA), PhnF(15 kDa) 의 4 polypeptide 를 확인학 수 있었고 개개의 유전자의 위치와 범위를 알 수 있었다. 유전자 순서는 phnC-phnD-phnE-phnF-phnG 이었으며, phnD, phnE, phnG 는 각기 gluthione S-transferase, meta-cleavage compound hydrolase, extradiol dioxygenase, metacleavage compound dehydrogenase 의 유전자이었다.

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생분해성 Poly(L-lactic acid)/Poly($\beta$-hydroxynonanoate) 블렌드의 열적 성질 및 결정화거동 (Thermal Properties and Crystallization of Biodegradable Poly(L-lactic acid) and Poly($\beta$-hydroxynonanoate) Blend)

  • 박상혁;김영백;이두성
    • 폴리머
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    • 제24권4호
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    • pp.477-487
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    • 2000
  • Poly(L-lactic acid) (PLLA)/poly($\beta$-hydroxynonanoate) (PHN) 블렌드의 흔화도와 결정화거동을 연구하기 위해 여러 중량 흔합비의 시료를 제조하였다. DSC, XRD 및 편광현미경을 이용하여 PLLA/PHN 블렌드의 열적 성질 및 특성을 연구하였다. PLLA와 PHN은 무정형 영역에서 부분적인 상용성을 가졌으며 PLLA의 결정화도는 PHN이 첨가됨으로 인하여 증가되었다. 그리고 PHN이 첨가됨으로써 PLLA의 T$_{g}$, T$_{c}$, T$_{m}$ 의 이동이 있었다. 편광현미경 분석을 통하여 PLLA 구정의 수는 PHN이 증가할수록 증가하는 것을 알 수 있었다. 이로부터 PHN은 PLLA에 대하여 기핵제의 역할이 있음이 관찰되었다.

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Pseudomonas sp. DJ77에서 Glutathione S-transferase를 암호하는 phnC 유전자의 염기서열과 상동성 분석 (Nucleotide Sequence and Homology Analysis of phnC Gene Encoding Glutathione S-transferase from Pseudomonas sp.DJ77)

  • 우희종;신명수;김성재;정용제;정안식;박광균;김영창
    • 미생물학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.86-91
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    • 1997
  • Pseudomonas sp. DJ77로부터 클로닝된 glutathione S-transferase 유전자(phnC)의 염기서열을 결정하였다. 603bp의 open reading frame(ORF)이 존재하였고 개시코돈 앞에서 Shine-Dalgarno sequence를, 종결코돈 뒤에서는 terminator sequence를 발견하였다. phnC 유전자에서 만들어지는 phnC 단백질은 21,416 Da으로 SDS-polyacrylamide gel 전기영동 결과와 일치하였다. PhnC는 Bulkholderia cepacia LB400, Cycloclasticus oligotrophus RB1의 GST와 각각 53.7%, 49%의 높은 상동성을 나타냈다. 아미노산 서열의 상동성과 필수잔기들의 존재유무로 판단할 때 PhnC GST는 theta class GSTs와 진화적으로 유연관계가 높았지만 alpha, mu, pi, sigma class GSTs에서 구조적, 기능적으로 중요하다고 알려진 아미노산 잔기들이 PhnC GST에도 보존되어 있었다. 또한, phnC 유전자의 위치가 C. oligotrophus RB1, B. cepacia LB400 등의 GST 유전자 위치와 유사하다는 점에서 PhnC 효소는 난분해성 방향족 탄화수소의 분해에 관여하는 것으로 생각된다.

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대장균에서 분리된 din (damage-inducible)과 tin (temperature-inducible) 유전자들의 특성 (Characterization of the din (damage-inducible) and tin (temperature-inducible) Genes Isolated from Escherichia coli)

  • 백경희
    • 미생물학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.392-396
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    • 1991
  • Pseudomonas sp. DJ77의 chromosomal DNA로부터 6.9kb XhoI 절편 상에 존재하는 phenanthrene 분해에 관련된 유전자군을 vector pBLUESCRIPT SK(+)에 클로닝하였다. 이렇게 얻은 재조합 plasmid인 pHENX7을 가지고 있는 JM101 균주는 3-methylcarechol을 노란색의 meta-cleavage 화합물로 전환할 수 있었다. 그러나 삽입된 절편의 방향이 반대가 되도록 제조한 pHENX7은 extradiol dioxygenase 활성을 나타내지 않기 때문에 전사방향을 알 수 있었다. pHENX7과 이의 듀도체들을 지니는 JH101균주에서 PhnC(24kDa), PhnD(31KDa), PhnE(34kDa), PhnF(KDa)의 4 polypeptide를 확인 할 수 있었고 개개의 유전자의 위치와 범위를 알 수 있었다. 유전자 순서는 phnC-phnD-phnE-phnF-phnG이었으며, phnC, phnD, phnE, phnF, phnG는 각기 glutathione S-transferase, meta-cleavage compound hydrolase extradiol dioxygenase, meta-cleavage compound dehydrogenase의 유전자이었다.

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Sphingomonas chungbukensis DJ77 균주에서 2- hydroxychromene-2-carboxylate isomerase를 암호화하는 phnS 유전자의 염기서열과 상동성 분석 (Sequence and phylogenetic analysis of the phnS gene encoding 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase in Sphingomonas chungbukensis DJ77)

  • 엄현주;강민희;김영필;김성재;김영창
    • 미생물학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.123-127
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    • 2003
  • Sphingomonas chungbuken교 DJ77은 phenanthrene을 단일 탄소원과 에너지원으로 이용하여 살아갈 수 있다. pUPXS는 phenanthrene과 naphthalene분해를 위해 필요한 2-hydroxychromene-2-carboxylate (HCCA) isomerase를 암호화하는phnS유전자를 포함한다. 본 논문에서는 phnS유전자가 포함된 3271 bp의 염기 서열을 결정하였다. 이 유전자는 ATG를 개시코돈으로 사용하며, TAA를 종결 코돈으로 사용하고 있다. 또한 개시 코돈의 5 bp앞쪽으로 GGAA라는 ribosomal binding site를 갖는다. phnS는 총 594 bP의 open reading frame을 포함하며,158개의 아미노산으로 구성되었다. phns를 구성하는 아미노산서열은 S. aromaticivorans F199의 유사서열과 87%의 유사성을 나타냈다. phns 유전자는 biphenyl dioxygenase를 구성하는 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase를 암호화하는 phnQ와 ferredoxin를 암호화 하는 phnR과 같은 operon을 이루며, 이들 유전자의 downstream에 위치하고 있다.

Pseudomonas sp. Strain DJ77에서 phnF 유전자의 구조 (Structure and Function of the phnF Gene of Pseudomonas sp. Strain DJ77)

  • 이성훈;김성재;신명수;김치경;임재윤;이기성;민경희;김영창
    • 미생물학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.92-96
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    • 1997
  • Pseudomonas sp. strain DJ77로부터 클로닝한 catechol 분해와 관련된 phnDEFG 유전자들이 존재하는 pHENX7에서 phnF 유전자의 염기서열을 밝혔다. Extradiol dioxygenase 유전자인 phnE와, 2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase를 생산하는 phnG 유전자 사이에 존재하는 유전자 phnF는 432 bps로 된 하나의 open reading frame(ORF)으로 존재하였고, 여기서 유추한 아미노산은 143개로 분자량 13,859 dalton의 polypeptide를 만들어 내고 있다. phnF 유전자는 Sphingomonas sp. strain HV3 catE 유전자 부위와 sphingomonas yanoikuyae B1의 xylE와 xylG 사이에 존재하는 ORF 부위의 염기서열과 각각 99%, 68.6%의 상동성을 가지고 있었다. 또한 PhnF 단백질의 아미노산서열은 citrobacter freundii DSM30040의 orfY 부위의 아미노산서열과 62.3%의 상동성이 있었다.

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Earlier treatment improves the chances of complete relief from postherpetic neuralgia

  • Kang, Dong Hee;Kim, Su Young;Kim, Hyuck Goo;Park, Jung Hyun;Kim, Tae Kyun;Kim, Kyung Hoon
    • The Korean Journal of Pain
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    • 제30권3호
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    • pp.214-219
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    • 2017
  • Background: As herpes zoster progresses via postherpetic neuralgia (PHN) to well-established PHN, it presents its recalcitrant nature to the treatment. At this point, the well-established PHN is fixed as a non-treatable, but manageable chronic painful neuropathic disorder. This study evaluated the incidence of complete relief from PHN according to PHN duration at their first visit, and the other factors influencing it. Methods: A retrospective chart review was performed on patients with PHN at a university-based pain clinic over 7 years. The responders were defined as patients who had complete relief from pain after 1 year of active treatment. Age, sex, PHN duration at their first visit, dermatomal distribution, and underlying disorders were compared in the responder and non-responder groups. Responders were also compared according to these factors. Results: Among 117 PHN patients (M/F = 48/69), 35 patients (29.9%) had complete relief from PHN. Mean ages were $64.3{\pm}10.6$ and $66.9{\pm}10.7$ years, numbers of male to female patients were 11/24 and 37/45, and mean durations of PHN at their first visit were $8.5{\pm}6.3$ and $15.3{\pm}10.7$ months in the responder and non- responder groups, respectively. In addition, PHN patients who visited the clinic before 9 months showed a better result. Dermatomal distribution and underlying disorders did not show significant differences. Conclusions: Almost 30% of PHN patients received complete relief. Those who sought treatment in a pain clinic before 9 months received a better result.

Survey on the Treatment of Postherpetic Neuralgia in Korea: Multicenter Study of 1,414 Patients

  • Nahm, Francis Sahngun;Kim, Sang Hun;Kim, Hong Soon;Shin, Jin Woo;Yoo, Sie Hyeon;Yoon, Myung Ha;Lee, Doo Ik;Lee, Youn Woo;Lee, Jun Hak;Jeon, Young Hoon;Jo, Dae Hyun
    • The Korean Journal of Pain
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    • 제26권1호
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    • pp.21-26
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    • 2013
  • Background: Postherpetic neuralgia (PHN) is a serious complication resulting from herpes zoster infections, and it can impair the quality of life. In order to relieve pain from PHN, various treatments, including pharmacological and interventional methods have been used. However, little information on the recommendations for the interventional treatment of PHN, along with a lack of nation-wide surveys on the current status of PHN treatment exists. This multicenter study is the first survey on the treatment status of PHN in Korea. Methods: Retrospective chart reviews were conducted on the entire patients who visited the pain clinics of 11 teaching hospitals from January to December of 2011. Co-morbid disease, affected site of PHN, routes to pain clinic visits, parenteral/topical medications for treatment, drugs used for nerve block, types and frequency of nerve blocks were investigated. Results: A total of 1,414 patients' medical records were reviewed. The most commonly affected site was the thoracic area. The anticonvulsants and interlaminar epidural blocks were the most frequently used pharmacological and interventional methods for PHN treatment. For the interval of epidural block, intervals of 5 or more-weeks were the most popular. The proportion of PHN patients who get information from the mass media or the internet was only 0.8%.The incidence of suspected zoster sine herpete was only 0.1%. Conclusions: The treatment methods for PHN vary among hospitals. The establishment of treatment recommendation for PHN treatment is necessary. In addition, public relations activities are required in order to inform the patients of PHN treatments by pain clinicians.

Pseudomonas sp. Strain DJ77에서 Rieske-Type의 Ferredoxin을 암호화하는 phnR 유전자의 구조

  • 김성재;박용춘;김치경;임재윤;이기성;민경희;김영창
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.367-373
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    • 1997
  • One of the three components of the phenanthrene dioxygenase which is required for conversion of phenanthrene to cis-phenanthrene dihydrodiol, Rieske-type ferredoxin encoded by phnR has been cloned and sequenced from Pseudomonas sp. strain DJ77. The gene phnR is positioned at the downstream of phnQ encoding 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase. The PhnR ferredoxin contains 108 amino acids with a Mr of 11,355. The deduced amino acid sequence of the PhnR ferredoxin is 35-79% identical to those of homologous ferredoxins encoded by various genes.

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Pseudomonas sp. strain DJ77 균주에서 extradiol dioxygenase 를 암호화하고 있는 phnE 유전자의 염기배열

  • 김영창;신명수;윤길상;박영순;김욱현
    • 미생물학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.8-14
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    • 1992
  • Pseudomonas sp. DJ77로부터 extradiol dioxygenase 유전자(phnE)를 클로닝하고 염기배열을 결정하였다. 921 bp의 open reading frame (ORF) 이 존재하였고 개시코돈 앞에서 Shine-Dalgarno sequence를 발견하였다. phnE 유전자에서 만들어지는 PhnE 단백질은 분자량이 34,449 Da 인데 SDS-polycrylamide gel 전기영동에 의해 측정된 분자량과 일치하였다. PhnE는 NahH, XylE, DmpB 등과 아미노산 배열의 상동성의 약 50% 였다. DJ77에는 bphC와 같은 3형의 extradiol dioxygenase 유전자는 발견할 수 없었다. DJ77 과 JM101(pPE17)은 catechol, 3-methylcatechol, 4-methylcatechol, 2, 3-dihydroxybiphenyl 등의 기질을 meta-cleavage 하여 노란색 화합물을 생성할 수 있었다.

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