• 제목/요약/키워드: Organic Solvent Recognition

검색결과 7건 처리시간 0.021초

제한효소에 대한 용매의 영향 :소수성 용매에 의한 PvuII 특이성 변화 (Solvent Effect on Restriction Endonuclease : Alteration of Specificity of Restriction Endonuclease PvuII in Hydrophobic Solution)

  • 김희정;이강민
    • KSBB Journal
    • /
    • 제9권1호
    • /
    • pp.63-71
    • /
    • 1994
  • During the last decade enzyme reaction in organic solvent has been studied to show that specificity in buffer is different from that in organic solvent. The specificity of restriction enzyme was effected by various factors such as ionic strength, salt organic solvent and temperature. In this study, restriction enzyme PvuII which is used most frequently in genetic engineering and the substrate was vector pGEM3 whose sequence was already known were used. As a result the recognition sequence site was changed in the presence of organic solvents whose Log P are -1.5∼0. Their specificities were contrast with activities were contrasted. Specificities were not changed in organic solvent easily in inactivating enzyme. We think that the enzyme recognition site was not changed randomly but by preferential order. A recombinant vector which does not contain typical cleavage site CAG↓CTG was cleaved in 20% ethanol solution. This result might show that restriction enzyme could be used to cleave at unusual sites by changing the reaction conditions.

  • PDF

인공신경망을 이용한 수정진동자 유기용매 인식시스템의 개발 (The development of AT-Cut Quartz Organic Vapor Recognizing System Using Artificial Neural Network)

  • 박수행;유민수
    • 한국산업융합학회 논문집
    • /
    • 제6권1호
    • /
    • pp.31-36
    • /
    • 2003
  • 8개의 수정진동자 위에 서로 다른 종류의 Lipid를 코팅하여서 만든 센서 배열을 가지고 유기용매를 인식할 수 있는 System을 구성한다. 유기용매 인식센서에 대한 수학적 모델을 사용하여 여러 가지 유기용매에 대한 센서의 응답으로부터 센서 표면과 유기용매 간의 물질 전달속도 패턴과 친화력 패턴을 얻어 유기용매 종류를 인식하였다. 패턴인식은 인공신경망을 이용하였으며 인공신경망의 연결 강도 수정은 Levenberg-Marquardt 알고리즘을 사용하였다. 신경망의 출력은 4개로 하였고, 디지털 신호인 0과 1의 조합으로 유기용매 종류를 구분하였다. 이 시스템을 이용하여 9개의 유기용매 Acetone, Benzene, Chloroform, Carbon-tetrachloride, Ethylacetate, Buthylacetate, Cyclohexane, Dichloromethane, 1,1,2,2,Tetrachloroethane, 2,2,4Trimethylpentane을 구분하여 인식할 수 있었다.

  • PDF

제한효소의 인식자리 변화 -BamHI 특이성에 미치는 산도와 소수성의 영향- (Alteration of Recognition Sequence by Restriction Endonuclease -Effect of pH and Hydrophobicity on BamHI-)

  • 이강민
    • KSBB Journal
    • /
    • 제11권2호
    • /
    • pp.193-200
    • /
    • 1996
  • DNA를 인식하여 절단하는 제한효소의 발견은 유전자를 연구, 조작할 수 있게 되어 분자생물학 연구에 큰 발전을 가져 왔다. 제한효소의 인식자리는 반 응용액의 산도, 유기용애의 소수성에 따라서 달라질 수 있다. 제한 효소 BamHI의 특이성 변화는 유기용 매의 소수성CLogP)과 산도에 직접적인 관계가 있다. 제한효소 BamHI의 인식자리의 특이성 변화는 산도 7.5에셔 LogP값이 -1.3~-1.35, 8.0에서 -1. 0 03~-2.5, 8.5에서 0.75~-2.5, 8.9에서 -0.32 ~­2 2.5 벙위에셔 각각 나타난다. 통일한 유기용매 혼합 물에서 산도가 알카리 일수록 낮은 유기용매 놓도에 서 특이성의 변화가 나타난다. DMSO용액에서 Bam H HI의 특이성 변화는 산도가 7.5일때 20% 농도에서 나타나지만 산도가 8.9일때는 4%에서 나타난다.

  • PDF

생물공학에서 이온성 액체의 응용 (Application of Ionic Liquids in Biotechnology)

  • 이상목;장우진;구윤모
    • KSBB Journal
    • /
    • 제20권3호
    • /
    • pp.183-191
    • /
    • 2005
  • 현재 석유화학 및 화학분야에서 이온성 액체를 이용한 많은 연구가 이뤄지고 있다. 휘발성 유기용매의 대체 물질로서 각광을 받고 있는 이온성 액체는 최대 250억불 이상의 시장을 형성할 것으로 기대된다 위에서 말한 바와 같이 생물공학 분야에서도 이온성 액체를 이용한 연구가 시작되어 용매로 사용하는 방법, 분리매개체로서 사용하는 방법 등 다양하게 이용되고 있다. 이러한 이온성 액체는 효소의 활성, 안정성을 증대시킬 뿐 아니라, 분리 과정도 손쉽게 실현할 수 있다. 또한 환경적 측면과, 경제적인 측면을 고려하여 청정용매로 널리 사용 할 수 있을 것이다. 앞에서 말한 바와 같이 생물공학에서 이온성 액체의 응용 가능성은 무한하다 볼 수 있다. 또한, 나노공학과 생물공학을 접목하는 분야에서도 널리 이온성 액체가 쓰일 수 있을 것이다. 유럽과 미국에서는 주로 청정용매로서의 응용에 대한 연구를, 일본에서는 주로 이온 전도성 재료로서의 응용에 대한 연구를 활발히 하고 있다. 이러한 전 세계적인 연구의 활성화에 비하여 국내 상황은 대학 및 연구소에서 산발적으로 연구가 진행되고 있는 수준이다. 이에 국내에서도 이에 대한 관심과 더불어 정부 및 기업체, 대학 및 연구소에 의한 컨소시엄을 형성하여 보다 체계적인 연구지원이 이뤄져야 할 것이다.

Versatilities of Calix[4]pyrrole Based Anion Receptors

  • Lee, Chang-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
    • /
    • 제32권3호
    • /
    • pp.768-778
    • /
    • 2011
  • Calixpyrroles and related macrocycles are non-planer synthetic anion receptors that have attracted considerable attentions in recent years. Although the synthesis of calix[4]pyrrole (known as meso-octamethylporphyrinogen) was reported more than 100 years ago, the anion binding properties were first discovered in 1996. The simple calix[4]pyrroles can be synthesized in single step in high yield by condensation of pyrrole with acetone. The compounds showed preferential binding for halide anions including fluoride, phosphate, carboxylate, and chloride in organic media. Efforts to improve the anion affinity of calix[4]pyrrole and to enhance its selectivity have led to the synthesis of a variety of new calixpyrrole derivatives. Among the various modifications, introduction of straps on one side of the calix[4]pyrroles are the most effective. Incorporation of aromatic rings other than pyrroles also exhibited interesting binding behaviour. Introduction of signalling units as part of the strapping element enable to detect the anions on chromogenic or fluorogenic fashion. Finding of the anion transport properties across the membrane and cytotoxic effects of the calix[4]pyrroles open new window for calixpyrrole-related research. The polymer-incorporated systems have also been employed as anion complexants in solvent-solvent extraction. These old, yet easy-to-make macrocycles have well advanced more recently with the discovery of the ion-pair complexation properties. In this review, the synthetic developments and anion binding properties of calixpyrroles for the last decades will be discussed and will cover the advances in calixpyrrole chemistry.

아플라톡신 오염 및 저감화 방안 (Contamination and Detoxification of Aflatoxins)

  • 조소연;강인호;심영훈;양동혁;오세욱;이병희;현성예;장승엽;정춘식;이용수;김영식;강신정
    • 생약학회지
    • /
    • 제38권3호통권150호
    • /
    • pp.205-216
    • /
    • 2007
  • South Korea is the representative consumption country of herbal medicines and most of herbal medicines circulating in Korea have been importing from the developing countries of Southeast Asia such as China, Vietnam, Indonesia and so forth. Domestic hygiene and safety are continuously proposed because herbal medicines which are circulating have the possibility could remain contaminants or residues. Physicochemical contaminants such as heavy metals, persistent organic pollutants, radionucleosides, microbial toxins, biological contaminants such as microorganisms and animals, agrochemical residues such as pesticides, substances used for fumigation, antiviral agents, and solvent residues are classified as major contaminants and residues in herbal medicines from 2005 September WHO.$^{1)}$ Currently our administration have established a permission standard and the inspection criteria against the heavy metal, the residual pesticides and a residual sulfur dioxide. Furthermore our administration is continuously monitoring and conducting researches for the policies and their scientific ground against herbal medicines. But the appearances or discoveries of the harmful new species due to environmental and industrial developments are becoming social problems. Therefore it may be necessary to continuously consider and investigate regarding hereupon. Recently, the contamination of the mycotoxins against foods such as cereals, nuts and the powdered red pepper have developed and started became problematic issue, and possibility of contamination against the herbal medicine is proposed. And since populations who are using the herbal medicines very limited to several nations, recognition and researches about contamination of mycotoxins in herbal medicines are very insufficient. Therefore it will be need to more focus on the international regulation of quality control and safety for herbal medicines. Now on, we are going to introduce the importance, occurrence, characteristic properties, World-wide research trends and detoxification of aflatoxins, which is known as the most potent mutagen, carcinogen and teratogen mycotoxins.

Streptomyces Peucetius에서의 ${\varepsilon}$-rhodomycinone 추출 및 이종균주에서의 rhodomycin D 생산 연구 (NDP-sugar production and glycosylation of ${\varepsilon}$-rhodomycinone in Streptomyces venezuelae)

  • 박성희;차민호;김은정;윤여준;송재경;이희찬;류광경;김병기
    • KSBB Journal
    • /
    • 제23권1호
    • /
    • pp.44-47
    • /
    • 2008
  • Streptomyces peucetius가 생산하는 anthracycline 계열의 doxorubicin은 치료목적으로 사용되는 중요한 항암제 중 하나이다. Doxorubicin은 rhodomycin D에서부터 몇 단계의 생합성 과정을 더 거쳐 생산되는데, 생물학적 활성을 갖기 위해서는 deoxy-sugar의 전이가 반드시 일어나야 한다. 본 논문에서는 이종균주인 Streptomyces venezuelae에 11개의 유전자를 형질 전환하여 TDP-L-daunosamine를 생산하고 이것을 ${\varepsilon}$-rhodomycinone에 전이하여 rhodomycin D를 생산하는 연구를 수행하였다. S. peucetius 유래의 7개 유전자 dnmU, T, J, V, Z, Q, S.를 당 합성 및 전이를 위해 plasmid 형태로 전이하였으며, S. venezuelae의 desIII, IV와 doxorubicin 내성 유전자인 drrA, B는 chromosomal DNA에 삽입하였다. Aglycone 기질인 ${\varepsilon}$-rhodomycinone을 확보하기 위하여 6L의 고체 배지에 S. peucetius를 배양하여 유기용매로 추출하고 preparative HPLC로 분리 정제하였다. 결과적으로 이종균주인 S. venezuelae에서 ${\varepsilon}$-rhodomycinone에 당 전이가 일어난 생산물을 확인함으로써 deoxy-sugar의 생합성 및 전이에 필요한 최소한의 유전적 정보를 확인할 수 있었다. 또한, 유사서열 단백질 모델링을 통하여, 최초로 당 전이 반응에 필수적인 도움효소 DnrQ의 구조를 예측하였다.