The modern era of microbial genome analysis began in earnest in the 2000s with the generalization of metagenomics and gene sequencing techniques. Studying complex microbial community such as oral cavity and colon by a pure culture is considerably ineffective in terms of cost and time. Therefore, various techniques for genomic analysis have been developed to overcome the limitation of the culture method and to explore microbial communities existing in the natural environment at the gene level. Among these, DNA fingerprinting analysis and microarray chip have been used extensively; however, the most recent method of analysis is metagenomics. The study summarily examined the overview of metagenomics analysis techniques, as well as domestic and foreign studies on disease genomics and cluster analysis related to oral metagenome. The composition of oral bacteria also varies across different individuals, and it would become possible to analyze what change occurs in the human body depending on the activity of bacteria living in the oral cavity and what causality it has with diseases. Identification, isolation, metabolism, and presence of functional genes of microorganisms are being identified for correlation analysis based on oral microbial genome sequencing. For precise diagnosis and treatment of diseases based on microbiome, greater effort is needed for finding not only the causative microorganisms, but also indicators at gene level. Up to now, oral microbial studies have mostly involved metagenomics, but if metatranscriptomic, metaproteomic, and metabolomic approaches can be taken together for assessment of microbial genes and proteins that are expressed under specific conditions, then doing so can be more helpful for gaining comprehensive understanding.
Kim, Yeon;Park, Joo-Yeon;Park, Hyun-Joo;Kim, Mi-Kyoung;Kim, Yong-Il;Bae, Soo-Kyung;Kim, Hyung Joon;Bae, Moon-Kyoung
International Journal of Oral Biology
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제44권1호
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pp.20-26
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2019
Periodontal diseases have been associated with the development of cardiovascular diseases. Accumulating evidences have indicated that Porphyromonas gingivalis, a major periodontopathic pathogen, plays a critical role in the pathogenesis of atherosclerosis. In the present study, we demonstrated that P. gingivalis lipopolysaccharide (LPS) increases the mRNA and protein expression of matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) in rat vascular smooth muscle cells. We showed that the MMP-9 expression induced by P. gingivalis LPS is mediated by the activation of signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) in vascular smooth muscle cells. Furthermore, the inhibition of STAT3 activity reduced P. gingivalis LPS-induced migration of vascular smooth muscle cells. Overall, our findings indicate that P. gingivalis LPS stimulates the migration of vascular smooth muscle cells via STAT3-mediated MMP-9 expression.
During distraction osteogenesis, the angiogenic activity is crucial factor in the new bone formation. The aim of this study was to detect the autocrine growth activity in the cellular components of the distracted periosteum with observation of the expression of vascular endothelial growth factor (VEGF) and its receptors following the mandibular distraction osteogenesis. Unilateral mandibular distraction (0.5 mm twice per day for 10 days) was performed in six mongrel dogs. Two animals were sacrificed at 7, 14, and 28 days after completion of distraction, respectively. The distracted lingual periosteum was harvested and processed for immunohistochemical examinations. After then, we observed the expression of VEGF, Flt-1 (VEGFR-1), and Flk-1 (VEGFR-2) in the osteoblasts and immature mesenchymal cells of the distracted periosteum. At 7 days after distraction, the expression of VEGF and its receptors were significantly increased in the cellular components of the distracted periosteum. Up to 14 days following distraction, the increased expressions were maintained in the osteoblastic cells. At 28 days after distraction, the expression of VEGF and its receptors decreased, but VEGF was still expressed weak or moderate in the osteoblastic cells of distracted periosteum. The expression pattern of VEGF and its receptors shown here suggested that VEGF play an important role in the osteogenesis, and these osteoblastic cell-derived VEGF might act as autocrine growth factor during distraction osteogenesis. In the other word, the cellular components in the distracted periosteum, such as osteoblasts and immature mesenchymal cells, might have autocrine growth activity during distraction osteogenesis.
Antifibrinolytic effect of lumbrokinase in mice, in vivo, was studied. Liquid phase lumbrokinse from Lumbricus rubellus was purified by column chromatography method. Lumbrokinase was orally inserted to mice. Although oral dosage of lumbrokinase, to investigate whether lumbrokinase in mice causes antifibrinolytic effect, we have concentration of lumbrokinase varied, and detection of antifibrinolytic effect was carried out using a FDP (fibrin degradation product) test and euglobulin fibrinolytic activity test. FDP test and euglobulin fibrinolytic activity test were compared the data of PBS ingestion. control with lumbrokinase ingestion. As a result, FDP was increased in 7.8mg, 26mg lumbrokinase concentrations after 25 hours succeeding oral prescription of lumbrokinase, and decreased after 49 hours, but 7.8mg lumbrokinase ingestion more increased than 26mg. Also, FDP of PBS ingestion control and 1.3mg lumbrokinase ingestion were not been observed nothing. Euglobulin fibrinolytic activity of PBS ingestion control and 1.3mg lumbrokinase ingestion were not been observed any clear zone after 8, 25, 48 hours, and 7.8mg and 26mg were observed the most largest clear zone after 25 hours and decreased after 48 hours. However, antifibrinolytic effect of oral prescription of lumbrokinase in mice was observed. Now we need to determine an efficient amount of lumbrokinase for antifibrinolytic effect.
The purpose of this study was to investigate the effects of fluvastatin on the pharmacokinetics of repaglinide in rats. The effect of fluvastatin on P-glycoprotein and CYP3A4 activity was evaluated. The pharmacokinetic parameters and blood glucose concentrations were also determined after oral and intravenous administration of repaglinide to rats in the presence and absence of fluvastatin. Fluvastatin inhibited CYP3A4 activity in a concentration-dependent manner with a 50% inhibition concentration($IC_{50}$) of 4.1 ${\mu}M$ and P-gp activity. Compared to the oral control group, fluvastatin significantly increased the AUC and the peak plasma level of repaglinide by 45.9% and 22.7%, respectively. Fluvastatin significantly decreased the total body clearance (TBC) of repaglinide compared to the control. Fluvastatin also significantly increased the absolute bioavailability (BA) of repaglinide by 46.1% compared to the control group. Moreover, the relative BA of repaglinide was 1.14- to 1.46-fold greater than that of the control. Compared to the i.v. control, fluvastatin significantly increased the $AUC_{0-{\infty}}$ of i.v. administered repaglinide. The blood glucose concentrations showed significant differences compared to the oral controls. Fluvastatin enhanced the oral BA of repaglinide, which may be mainly attributable to the inhibition of the CYP3A4-mediated metabolism of repaglinide in the small intestine and/or liver, to the inhibition of the P-gp efflux transporter in the small intestine and/or to the reduction of TBC of repaglinide by fluvastatin. The study has raised the awareness of potential interactions during concomitant use of repaglinide with fluvastatin. Therefore, the concurrent use of repaglinide and fluvastatin may require close monitoring for potential drug interactions.
The cytotoxic activity of Cratalariae sessiliflorae on cultured NIH 3T3 fibroblasts and human oral epithelioid carcinoma cells (KB) were evaluated by 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazoliumbromide (MTT) colorimetric method These fractions of methanol extract of Cratalariae sessiliflorae showed inhibitory effect in vitro in the milligram range against KB cell lines. In general, the antitumor activities of these fractions were does-dependent over the milligram range. The comparison of IC50 values of these fractions in tumor cell lines showed that their susceptibility to these fractions decrease in the following order: Fr. 4> Fr. 6> Fr. 10> Fr. 2> Fr. 11> Fr. 3> Fr. 8> Fr. 7> Fr. 9> Fr. 1> Fr. 5 by the MTT assay. These fractions were tested for their cytotoxic effects on NIH 3T3 fibroblasts using MTT assay. They exhibited potent cytotoxic activities in vitro in the milligram range against NIH 3T3 fibroblasts. In general, the cytotoxic activities of these fractions were does-dependent over the milligram range. The comparison of CD50 values of these fractions in NIH 313 fibroblasts shows that their susceptibility to these fractions in decrease the following order: Fr. 10> Fr. 9> Fr. 2 = Fr. 4> Fr. 8> Fr. 11> Fr. 1 = Fr. 7> Fr. 3> Fr. 5 = Fr. 6 by the MTT assay. These results suggests that fraction 5 has the most growth - inhibitory activity against KB cell lines.
Kim, Ryeo-Woon;Lee, Sook-Young;Kim, Su-Gwan;Heo, Yu-Ri;Son, Mee-Kyoung
The Journal of Advanced Prosthodontics
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제8권3호
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pp.172-180
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2016
PURPOSE. The purpose of this study was to analyze the antimicrobial, antioxidant activity and cytotoxicity of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract for assessing whether Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ can be used for the development of natural mouthwash and denture cleaning solution. MATERIALS AND METHODS. The extract was obtained from branches of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$. The solvent fractions were acquired by fractionating Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract using n-hexane, ethyl acetate, chloroform and butanol solvent. Paper disc test was used to evaluate the antimicrobial and antifungal activity of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract and solvent fractions against Streptococcus mutans and Candida albicans. The analysis of antioxidant activity was carried out through DPPH radical scavenging assay. The cytotoxicity of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract was analyzed through MTT assay using normal human oral keratinocytes. RESULTS. Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract showed antimicrobial activity against Streptococcus mutans and especially Candida albicans. The solvent fractions of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ showed strong antimicrobial activity against Streptococcus mutans and Candida albicans in n-hexane and butanol solvent fraction, respectively. Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract also showed outstanding antioxidant activity. Butanol, ethyl acetate, and chloroform solvent fraction of Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ tended to have increased antioxidant activity as the concentration increased. Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract showed high cell survival rate in cytotoxicity test. CONCLUSION. Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ extract turned out to have antimicrobial, antioxidant activity and cytophilicity. Based on these results, it is expected that Dendropanax morbifera $L{\acute{e}}veille$ is applicable as an ingredient for natural mouthwash and denture cleanser.
Saponin isolated from Sapindus mukorossi Gaertn has been shown to contain a strong anti-inflammatory activity. In this study, several pharmacological properties such as acute toxicity, local irritation and hemolytic activity of Sapindus saponin and its genin component, hederagenirl, were examined. The acute toxicity of Sapindus saponin was very low. Estimated from the LD$_{50}$ values, it showed much weaker toxicity in oral administration than in intraperitoneal injection. Hederagenin gave a very high LD$_{50}$ value even in intraperitoneal injection. Sapindus saponin showed a potent local irritation after topical application, whereas hederagenin did a very weak local irritation. Sapindus saponin also gave a high hemolytic activity.
Background: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the sixth most common malignancy worldwide. Cancer development and progression require inactivation of tumor suppressor genes and activation of proto-oncogenes. The well recognized mechanism of action demonstrated for chemotherapeutic agents is induction of apoptosis via reactivation of p53. In this context, we evaluate the efficacy of IV and oral routes of our novel PH and temperature sensitive doxorubicin-methotrexate-loaded nanoparticles (DOX-MTX NP) in affecting p53 profile in an OSCC rat model. Methods: In this study, 120 male rats were divided into 8 groups of 15 animals each. The new formulated DOX-MTX NP and free doxorubicin were IV and orally given to rats with 4-nitroquinoline-1-oxide induced OSCC. Results: Results showed that both DOX and DOX-MTX-NP caused significant increase in mRNA levels of P53 compared to the untreated group (p<0.000). With both DOX and DOX-MTX NP, the IV mode was more effective than the oral (gavage) route (p<0.000). Surprisingly, in oral mode, p53 mRNA was not affected in DOX treated groups (p>0.05), Nonetheless, both IV and oral administration of MTX-DOX NP showed superior activity (~3 fold) over free DOX in reactivation of p53 in OSCC (p<0.000). The effectiveness of oral route in group treated with nanodrug accounts for the enhanced bioavailability of nanoparticulated DOX-MTX compared to free DOX. Moreover, in treated groups, tumor stage was markedly related to the amount of p53 mRNA (p<0.05). Conclusion: Both oral and IV application of our novel nanodrug possesses superior activity over free DOX-in up-regulation of p53 in a OSCC model and this increase in p53 level associated with less aggressive tumors in our study. Although, impressive results obtained with IV form of nanodrug (-21 fold increase in p53 mRNA level) but both forms of nanodrug are effective in OSCC, with less toxicity normal cells.
Essential oil은 식물로부터 추출한 휘발성의 호지방성 화합물로서 essential oil은 잠재적으로 항균, 항진균, 진경련, 항말라리아성, 곤충퇴치능력 등의 생물학적 효과를 가지고 있다. 본 연구에서는 다양한 방향식물에서 추출한 Citral, Pineole, Linalool, Eugenol, Limonene, Pinene 등으로 구성된 다섯종류의 essential oil을 사용하였으며, 여덟 군의 중요한 병원성 세균인 Streptococcus mutans(S. mutans), Staphylococcus aureus(S. aureus), Streptococcus sanguis(S. sanguis), Streptococcus anginosus(S. anginosus), Actinobacillus actinomycetemcomitans(A. actinomycetem- comitans), Streptococcus sobrinus(S. sobrinus), Staphylococcus epidermidis(S. epidermidis), Esherichia coli (E. coli)에 대한 저항성으로서 항균능력을 평가하였다. Essential oil의 항균능력은 용액희석방법을 사용하여 검사하였으며, essential oil 농도범위는 10 mg/mL, 5 mg/mL, 2.5 mg/mL, 1.25 mg/mL, 0.625 mg/mL, 0.516 mg/mL, 0.3125 mg/mL, 0.078 mg/mL, 0.039 mg/mL, 그리고 0.015 mg/mL였다. Essential oil은 용량 의존적으로 시험 균주의 성장을 효과적으로 억제하였으며, NM을 제외하고 R, LG, FR, O oil은 저농도에서 구강 병원성 미생물의 성장을 억제하였다. 또한 사용된 essential oil은 E.coli와 S. epidermidis의 성장에는 탁월한 억제효과를 보이지는 못했으나 구강 병원성 미생물에 대해서는 특별한 성장 억제효과를 나타냈다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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