Kim, Sun-Shin;Oh, Jeong-Su;Lee, Bum-Ju;Kim, Tae-Kyung;Jung, Kwang-Su;Rhee, Chung-Sei;Kim, Young-Chang;Cho, Wan-Sup;Ryu, Keun-Ho
Journal of KIISE:Databases
/
v.35
no.2
/
pp.125-131
/
2008
It is very useful to predict orthologs for new genome annotation and research on genome evolution. We showed that the previous work can be extended to construct OCs(Ortholog Clusters) automatically from multiple complete-genomes. The proposed method also has the quality of production of InParanoid, which produces orthologs from just two genomes. On the other hand, in order to predict more exactly the function of a newly sequenced gene it can be an important issue to prevent unwanted inclusion of paralogs into the OCs. We have, here, investigated how well it is possible to construct a functionally purer OCs with score cut-offs. Our OCs were generated from the datasets of 20 procaryotes. The similarity with both COG(Clusters of Orthologous Group) and KO(Kegg Orthology) against our OCs has about 90% and inclines to increase with the growth of score cut-offs.
KIPS Transactions on Software and Data Engineering
/
v.2
no.4
/
pp.273-280
/
2013
This paper presents novel OCS-LBP (Oriented Center Symmetric Local Binary Patterns) based on orientation of pixel gradient and image retrieval system based on BoF (Bag-of-Feature) and random forest classifier. Feature vectors extracted from training data are clustered into code book and each feature is transformed new BoF feature using code book. BoF features are applied to random forest for training and random forest having N classes is constructed by combining several decision trees. For testing, the same OCS-LBP feature is extracted from a query image and BoF is applied to trained random forest classifier. In contrast to conventional retrieval system, query image selects similar K-nearest neighbor (K-NN) classes after random forest is performed. Then, Top K similar images are retrieved from database images that are only labeled K-NN classes. Compared with other retrieval algorithms, the proposed method shows both fast processing time and improved retrieval performance.
We have studied an optically compensated splay (OCS) mode driven by fringe electric field. The OCS configuration obtained by applying voltage to vertically aligned LCs shows a dark state when an optic axis of the OCS cell coincides with one of crossed polarizer axis. When the fringe electric field is applied, the LC director rotates in plane above whole electrode surface, giving rise to the high transmittance, the low operating voltage and wide viewing angle simultaneously.
We hypothesized that inflammation affects number and activity of osteoclasts (OCs) via enhancing autophagy. Lipopolysaccharide (LPS) induced autophagy, osteoclastogenesis, and cytoplasmic reactive oxygen species (ROS) in bone marrow-derived macrophages that were pre-stimulated with receptor activator of nuclear $factor-{\kappa}B$ ligand. An autophagy inhibitor, 3-methyladenine (3-MA) decreased LPS-induced OC formation and bone resorption, indicating that autophagy is responsible for increasing number and activity of OCs upon LPS stimulus. Knockdown of autophagy-related protein 7 attenuated the effect of LPS on OC-specific genes, supporting a role of LPS as an autophagy inducer in OC. Removal of ROS decreased LPS-induced OC formation as well as autophagy. However, 3-MA did not affect LPS-induced ROS levels, suggesting that ROS act upstream of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase in LPS-induced autophagy. Our results suggest the possible use of autophagy inhibitors targeting OCs to reduce inflammatory bone loss.
Journal of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers
/
v.17
no.5
/
pp.536-540
/
2004
A novel nematic liquid crystal (LC) cell with splay structure exhibiting wide viewing angle, fast response time and high transmittance at the same time has been developed. With rubbed homeotropic alignment in parallel directions, the device shows bend alignment in the absence of vertical electric field. However, with applied high voltage in a pulse form, the LC shows a optically compensated splay (OCS) orientation such that the mid-director is parallel to a substrate and at both surfaces the LCs are aligned vertically in parallel direction. In the device, the birefringence of the cell becomes tunable with applying voltage, i.e., the amount of light passed through the cell can be controlled by controlling the orientation of the LC. Since the OCS cell has a self-compensation structure such that the LC has a mirror symmetry along the mid-director, the device shows a wide viewing angle with only a single domain and a fast response time.
Yoo Eun Jeong;Kang Hye Kyeong;Kim Kyeong Joon;Ahn Soo Hyeon;Ahn Tae Hun;Lee Ki Hyeob;Choi Hong Joon;Kim Seung Sik
Journal of The Korean Radiological Technologist Association
/
v.27
no.2
/
pp.35-42
/
2001
Information concerning a patient visit is to be sent from the OCS(Order Communication System) to the PACS(Picture archiving and Communication System) and when the image acquisition is completed, information regarding the procedures also actually preformed
Park, Young;Lee, Kiwon;Park, Chulmin;Kwon, Sam-Young
The Transactions of The Korean Institute of Electrical Engineers
/
v.62
no.6
/
pp.886-890
/
2013
Uplift of contact wire and dynamic characteristics between pantograph and contact wire are key interaction performance of OCS (Overhead Catenary System). These two evaluation items are the approval criteria for the performance between OCS and pantograph. A telemetry system or DAQ (Data Acquisition) System based on wireless communication make it monitor a dynamic behavior which is measured directly in a 25 kv like parts. While permissible working time is too short time to install is too long. In this paper, it is described that optimization the telemetry measurement system for OCS and increasing accuracy, easy adaptation, and faster handling can be also achieved through the study.
Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
/
2006.06a
/
pp.422-423
/
2006
We have studied phase transition time and response time of optically compensated splay(OCS) cell as a function of surface pretilt angle. With decreasing surface pretilt angle, phase transition time decreases and response time becomes faster in the OCS cell. Besides, the more surface pretilt angle decreases, the easier OCS structure is obtained.
Purpose: Standard of retests were discrepant and inconsistent due to inaccuracy and lack of standardization within normal range limit of tumor marker test. To enhance the standardization of retests set standard value below normal range and the Order Communication System Quality Control (OCS QC) program was put in place. This program enables managing the results within lower limit of normal range which were used for tumor marker test in Health Center. Materials and Methods: At present the tumor marker study for AFP, CEA, CA19-9, CA125, and PSA included outpatients in Asan Medical Center from February to March, 2009. The standard value was obtained by using the percentage of CV of Inter Assay according to the normal range of each tumor test. The results were confirmed by using the OCS QC program via formatted assessment of screening test such as test items, standard value and medical department. The number of out-of-range results within plus and minus 30 percents regarding the five primary items of tumor marker test was assessed. The next step was to obtain the number of AFP, CEA, and CA125 according to the ratio of comparison between prior and post test result, 60%, 50%, and 40% within normal range, respectively. In addition, set standard value below normal range. Results: The first screening test with percentage of sample number was resulted between 30%-40% and the second one was AFP 26.1%, CEA 18.9%, CA19-9 17.3%, CA125 18.7%, and PSA 21.0% obtained screening percentage of average 20 percents. The limited value of retest was AFP less than 5.0 and more than 10.0, CEA less than 1.0 and more than 3.0, CA19-9 less than 10.0 and more than 30.0, and PSA less than 1.0 and more than 2.0 to set and the number of retest was obtained by applying to the limited value of retest to screening percentage of average 20 percents For two months, the number of retest was AFP 0, CEA 15, CA19-9 3, CA125 2, and PSA 5. Conclusions: Through using the OCS QC program in establishing the standard of retest systemically, there appeared to be reduced discrepancy among the examiners and to be expected improvement in relation to the error of results.
The purpose of this study was to investigate the effects of embryo sources such as in vivo vs. in vitro produced blastocyst, and culture systems on the membrane permeability and viability of bovine blastocyst following GMP vitrification. To produce in vivo embryos, six cows were superovulated by administration of follicle stimulation hormone (FSH) and prostaglandin $F_{2{\alpha}}$(PG $F_{2{\alpha}}$). in vitro embryos were produced by two different culture systems, oviduct co-culture (OCS) and defined culture system (HECM-6; DCS). Ovaries were picked up at a local slaughterhouse and transported to laboratory in 3$0^{\circ}C$ saline within 2 h. Ovaries were washed with same saline three times and then placed in saline on warm plate adjusted at 3$0^{\circ}C$ during aspiration. The blastocysts produced were assigned for membrane permeability and viability following GMP vitrification. The membrane permeability of blastocysts was checked in 0.5 M sucrose solution on warm plate at 35$^{\circ}C$ for 0, 2, 5 and 7 min, respectively. Then the diameters (width and length) of embryo cytoplasms were measured by a eyepiece meter, and they were converted to their volume by 4/3 $\pi$$r^3$. The blastocysts were cryopreserved by GMP vitrification method, where they were sequentially placed into vitrification solution before being loaded into GMP vessels and immersed into L$N_2$ within 20 to 25 sec. Post-thaw blastocysts were serially washed in 0.25 and 0.15 M sucrose in HM and TCM-199 for 5 min each, and then cultured in TCM 199 supplemented with 10% FCS for 24 or 48 h. The volume change of in vivo blastocyst at 0, 2, 5 and 7 min (100, 37.1, 34.3 and 31.6%) was significantly more shrunk than those of in vitro blastocysts derived from OCS (100, 59.8, 48.9, 47.9%) and DCS (100, 57.2, 47.3 and 46.9%) (P<0.05). The viability of post-thaw blastocyst derived from in vivo (93.6%) was also significantly different from those in OCS and DCS (81.9 and 83.6%; P<0.05). In the present culture system, the morphology of embryos produced in vitro was similar to that of in vivo embryos, but the quality in membrane permeability and post-thaw viability showed a big difference from their sources as in vivo or in vitro derived from OCS and DCS. The results indicated that the quality of in vivo embryos in membrane permeability and post-thaw viability was better than those of in vitro embryos derived from OCS or DCS.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.