• Mass Spectrometry Letters
• /
• 제5권1호
• /
• pp.16-23
• /
• 2014

Liquid chromatography based mass spectrometry (LC-MS) is a key technology for analyzing highly complex and dynamic proteome samples. With highly accurate and sensitive LC-MS analysis of complex proteome samples, efficient data processing is another critical issue to obtain more information from LC-MS data. A typical proteomic data processing starts with protein database search engine which assigns peptide sequences to MS/MS spectra and finds proteins. Although several search engines, such as SEQUEST and MASCOT, have been widely used, there is no unique standard way to interpret MS/MS spectra of peptides. Each search engine has pros and cons depending on types of mass spectrometers and physicochemical properties of peptides. In this study, we describe a novel data process pipeline which identifies more peptides and proteins by correcting precursor ion mass numbers and unifying multi search engines results. The pipeline utilizes two open-source software, iPE-MMR for mass number correction, and iProphet to combine several search results. The integrated pipeline identified 25% more proteins in mouse epididymal adipose tissue compared with the conventional method. Also the pipeline was validated using control and colitis induced colon tissue. The results of the present study shows that the integrated pipeline can efficiently identify increased number of proteins compared to the conventional method which can be a breakthrough in identification of a potential biomarker candidate.

• 한국정보통신학회논문지
• /
• 제11권7호
• /
• pp.1318-1324
• /
• 2007

지금까지의 상품 검색 방법으로는 찾고자하는 정보를 검색할 때 주로 단어의 빈도수나 어휘 정보를 이용하는 키워드 기반의 검색이 주로 쓰이고 있었다. 키워드 기반의 검색에서는 사용자의 질의와 관련이 없는 문서들까지도 같은 결과로 나타내 주고 이로 인해 사용자는 제시된 결과를 한번 더 수동적으로 검색해야하는 부담을 않게 되었다. 이러한 문제점을 해결하기 위해 온톨로지가 대두되었다. 본 논문에서는 온톨로지를 이용한 상품 검색 시스템을 직접 구축하여 분류별 검색을 통해 얼마나 정확한 검색을 하는지 실험하였다. 실험을 위해 전국적으로 On/Off라인 할인점을 운영 중에 있는 A할인점의 상품 데이터 약 40,000여개를 데이터 베이스로 구축하였고 User Interface 개발환경은 JSP와 PowerBuilder9.0을 사용하여 검색 시스템을 개발하여 실험하였다. 그 결과 본 논문에서 제안하고 설계한 상품 도메인 온톨로지를 이용한 검색 방법이 기존의 기반의 검색 방법보다 우수한 결과를 나타내고 있음을 입증하였다.

• 한국전산유체공학회:학술대회논문집
• /
• 한국전산유체공학회 1999년도 추계 학술대회논문집
• /
• pp.127-138
• /
• 1999

본 연구에서는 2 차원 캐비티 유동에서 경계조건 부여 방법의 차이에 따른 유체유동의 이력이 최종적인 정상상태에 미치는 효과를 수치실험을 통하여 관찰하였다. 그 결과 유동의 Reynolds 수가 작은 경우는 유동장이 가지는 이력이 시간의 경과와 함께 소멸하여 하나의 정상유동 상태를 가지는데 반하여, 큰 Reynolds 수에서는 유동장 이력이 소멸하지 않고 유지됨으로 인하여 다수의 정상유동 형태가 나타남이 확인이 되었다. 엄밀한 이론적 해석은 현재 이루워지지 않았으나 유체 운동량의 증가에 따라 Navier-Stokes 방정식의 비선형성이 영향을 미치고 있다고 여겨진다.

• 한국음향학회지
• /
• 제24권2호
• /
• pp.117-126
• /
• 2005

본 연구는 대용량 데이터베이스 분석을 통한 한국어의 운을 특성 규명을 시도하였다. 남녀 화자 1명씩 각각 낭독한 650개의 뉴스기사 문장 (총 1,300 개)은 분절음 레이블링과 운율 레이블링을 한 후, 각 운율단위의 성조유형과 크기, 상위운율단위의 크기와 하위 운율단위 수간의 상관관계, 그리고 강세구의 하강곡선과 상승곡선의 기울기와 F0 값에 대한 비교분석을 수행하였다. 운율단위의 지속시간, 어절수, 음절수와 하위 운율단위의 수는 화자뿐만 아니라 운율단위 위치에 따라서 차이를 보였으며 하위 운율단위의 수는 상위 운율단위의 음절수와 지속시간과 높은 상관관계를 보였다. 강세구 내의 하강곡선의 기울기는 강세구 음절수와 반비례 관계를 보였으며 강세구 첫 성조의 유형에 따라 기울기 값에 차이가 있었다. 이 차이는 고성조로 시작한 강세구 성조의 F0 상승과 성조 간 상승 폭의 차이로 설명할 수 있었다. 강세구 경계의 하강곡선은 일정하면서 강세구 내의 하강곡선에 비해 다소 급격한 기울기를 보였다. 강세구 내의 두 상승곡선은 유사한 기지값을 보였으나 강세구 시작 상승곡선의 F0 변화량이 끝 상승곡선의 F0 변화량보다 크게 나타났다. 그리고 하나의 상승곡선이 강세구를 이루는 L Ha의 경우에는 강세구의 음절수에 반비례 관계를 보였다.

• 한국환경농학회지
• /
• 제27권4호
• /
• pp.464-473
• /
• 2008

Winter migratory birds gather in paddy rice fields to feed shed rice grains. The Korean Ministry of Environment has practiced a policy program Contract on Paddy Field Management (CPFM) during winter fallow since 2002. This program starts with a contract between local governments and farmers, and the government pays a differential subsidy to farmers who finish spreading rice straw, cultivating barley, letting the whole rice plant without harvest, and submerging paddy fields for winter migratory birds. As more local governments have operated CPFM program, the total area on the contract and subsidy budget has increased yearly since 2002. This program could have its stable position as a successful policy by giving profits to farmers. With the program extended, the population of winter migratory birds has been greatly. For the evaluation of environmental performance of a policy, we analyzed this CPFM program by introducing some indicators in the form of Driving Force-State-Response Framework. The indicators were composed of 3 categorized indicators; the area of paddy land contracted under this program as 'driving force' indicator, population of birds, the number of bird species and the amount of feces as 'state' indicators, and the size of monetary support, the number of farmers or local governments participating, and public perception as 'response' indicators. The contract area of paddy field under CPFM could be a good biodiversity indicator reflecting potential performance of this policy measure in the light of its linkage to the population of winter migratory birds. And the share of CPFM land of the whole agricultural land might also be used as a useful indicator of policy evaluation for improvement of wildlife diversity. The 'state' indicators such as population of birds and the number of bird species could be matched to 'driving force' indicator, but the total CPFM area of each site could not reflect the effect of areas under different management practices. However, the amount of bird feces could reflect differences in environmental performance with management practices as 'state' indicators. The development of indicators indicating 'response' such as farmers' behavior, public perception, and policy makers' willingness is also needed to support a successful implementation and improvement of this policy measure with the development of 'performance' indicators integrating all these indicators.

• 대기
• /
• 제31권5호
• /
• pp.577-592
• /
• 2021

This study evaluates the predictability of the number of days of heat and cold damages by growth stages of rice in South Korea using the hindcast data (1986~2020) produced by Pusan National University Coupled General Circulation Model-Weather Research and Forecasting (PNU CGCM-WRF) model chain. The predictability is accessed in terms of Root Mean Square Error (RMSE), Normalized Standardized Deviations (NSD), Hit Rate (HR) and Heidke Skill Score (HSS). For the purpose, the model predictability to produce the daily maximum and minimum temperatures, which are the variables used to define heat and cold damages for rice, are evaluated first. The result shows that most of the predictions starting the initial conditions from January to May (01RUN to 05RUN) have reasonable predictability, although it varies to some extent depending on the month at which integration starts. In particular, the ensemble average of 01RUN to 05RUN with equal weighting (ENS) has more reasonable predictability (RMSE is in the range of 1.2~2.6℃ and NSD is about 1.0) than individual RUNs. Accordingly, the regional patterns and characteristics of the predicted damages for rice due to excessive high- and low-temperatures are well captured by the model chain when compared with observation, particularly in regions where the damages occur frequently, in spite that hindcasted data somewhat overestimate the damages in terms of number of occurrence days. In ENS, the HR and HSS for heat (cold) damages in rice is in the ranges of 0.44~0.84 and 0.05~0.13 (0.58~0.81 and -0.01~0.10) by growth stage. Overall, it is concluded that the PNU CGCM-WRF chain of 01RUN~05RUN and ENS has reasonable capability to predict the heat and cold damages for rice in South Korea.

• 한국경제지리학회지
• /
• 제22권4호
• /
• pp.422-437
• /
• 2019

국제 이주에 대한 폭넓은 논의가 이루어진 데 반해 이주자가 출발지로 되돌아가는 귀환 이주에 대한 연구는 비교적 많지 않다. 이는 귀환 이주를 자본 축적 이후의 성공적 귀환이나 적응 실패로 인해 돌아가는 현상으로 비교적 단순하게 인식해왔기 때문이다. 조선족이 국내로 대거 이주해온 지 이십여 년을 넘기면서 귀화하는 사람뿐만 아니라 귀환하는 이도 어렵지 않게 볼 수 있다. 본 연구는 옌볜으로 귀환하여 자영업에 진출한 조선족을 대상으로 귀환 이주가 어떠한 전략적 선택 속에서 이루어졌는지 살펴본다. 최근의 옌볜 상업 경관은 귀환 조선족의 자영업 진출로 적지 않은 변화가 나타나고 있다. 특기할만한 점은 귀환 조선족에게 있어 한국 체류는 단순히 사업 자금을 마련하기 위한 것만은 아니었다는 것이다. 한국 경험과 네트워크는 옌볜에서 자본 축적의 새로운 기회를 찾고 넓히는 데 기여하고 있다. 이는 세계체제론 관점에서 옌볜 조선족 자영업자의 귀환이 주는 세계체제 간극을 활용한 자본축적 전략으로 해석될 수 있다.

• Korean Chemical Engineering Research
• /
• 제59권1호
• /
• pp.94-99
• /
• 2021

2단 Rushton turbine 날개를 장착한 접시바닥형 교반조 내의 유동 상태가 어떤 회전수에서 변화하는 현상을 찾아냈다. 층류 영역에서는 회전수를 변화시켜도 안정적인 도넛 링이 형성되어 혼합 패턴에 특이한 변동은 관찰되지 않았다. 전이영역에서의 평바닥형 교반조에서는 회전수에 변화를 주어도 두꺼운 2개의 미혼합 도넛 링에 변화가 없는 반면, 접시바닥형 교반조에서는 회전수가 450 rpm이 되면 두꺼운 2개의 미혼합 도넛 링이 아주 얇은 3개의 도넛 링으로 바뀌어 혼합이 개선되었다. 접시바닷형 교반조에서는 Re=138~178의 영역에서 링 모양의 미혼합 영역이 3곳에서 나타났고 그 크기도 컸지만, 평바닥형 교반조에서는 Re=116~176에서 링모양의 미혼합 영역은 2곳에서 나타났으며 그 크기도 작았다. 이러한 현상이 관찰되는 조건은 전이영역으로, 방해판을 부착하였을 때가 방해판이 없을 때와 비교하여 동력수가 커지기 시작하는 영역임을 알 수 있었다. 또한 교반 레이놀즈수가 300을 넘어 유동 상태에 약간의 난류가 섞이게 되면, 이 같은 흐름 양상의 단절이 해소되어 완전히 혼합되었다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제16권12호
• /
• pp.5081-5084
• /
• 2015

Background: Breast cancer is a malignant tumor that starts from cells of the breast and is seen mainly in women. It's the most common cancer in women worldwide and is a major threat to health. The purpose of this study was to fit a Cox proportional hazards model for prediction and determination of years of survival in Iranian patients. Materials and Methods: A total of 366 patients with breast cancer in the Cancer Research Center were included in the study. A Cox proportional hazard model was used with variables such as tumor grade, number of removed positive lymph nodes, human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) expression and several other variables. Kaplan-Meier curves were plotted and multi-years of survival were evaluated. Results: The mean age of patients was 48.1 years. Consumption of fatty foods (p=0.033), recurrence (p<0.001), tumor grade (p=0.046) and age (p=0.017) were significant variables. The overall 1- year, 3-year and 5-year survival rates were found to be 93%, 75% and 52%. Conclusions: Use of covariates and the Cox proportional hazard model are effective in predicting the survival of individuals and this model distinguished 4 effective factors in the survival of patients.

• 한국응용과학기술학회지
• /
• 제21권2호
• /
• pp.182-189
• /
• 2004

On contraction of the muscles, marked changes in X-ray reflections are observed, suggesting that conformational changes of contractile molecules and the movement of myosin heads during muscle contraction. Time slice requires tension peak after the onset of stimulation and the height of tension peak depends on the number of twitch cycle. The muscles were stimulated by five successive stimuli at an interval of 80 ms started while the tension was still being exerted by the muscles. The intensity of $I_{11}$, $I_{10}$, $143{\AA}$ and $215{\AA}$ reflection measured with 5ms time resolution and is recorded in isometric tension. The peak height of $I_{11}$ and $143{\AA}$ intensity is changed after the onset of a stimulation $I_i$, and the length of twitch is shortened by successive twitches in the case of stimulation $T_i$. On the other hand, the peak height of In and $215{\AA}$ intensity starts to decrease at the 1st twitch and remains constant at low peak height without appreciable recovery during the contraction term. In the case of successive twitch stimulation, the myosin heads of muscle are once moved from their resting position and never returned to their initial position.