• 제목/요약/키워드: Northern blot analysis

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Production of transgenic cucumber expressing phytoene synthase-2A carotene desaturase gene

  • Jang, Hyun A;Utomo, Setyo Dwi;Kwon, Suk Yoon;Ha, Sun-Hwa;Xing-guo, Ye;Choi, Pil Son
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권3호
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    • pp.341-346
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    • 2016
  • The objectives of this study were to 1) evaluate the efficiency of the protocol of Agrobacterium-mediated transformation of cucumber to introduce phytoene synthase-2a carotene desaturase (PAC genes); 2) demonstrate the integration of PAC genes into the genome of putative transgenic cucumber based on growth on selection medium, PCR and Southern analysis; 3) evaluate the expression of PAC genes in transgenic cucumber based on the analysis of RT-PCR and Northern blot hybridization. Out of 5,945 cotyledonary-node explants inoculated with Agrobacterium, 65 (1.1%) explants produced 238 shoots. Integration of PAC genes into the genome of the cucumber was demonstrated based on the analysis of gDNA-PCR, 21 out of the 238 plants regenerated; while 6 plants proved positive for Southern blot hybridization. Transgene expression was demonstrated based on analysis of RT-PCR, 6 plants proved positive out of the 6 plants analyzed; while 4 plants out of 6 proved positive during Northern blot hybridization. This study successfully demonstrated the production of transgenic cucumber, integration, and expression of the PAC gene in cucumber.

Expression Patterns of Heat Shock Proteins in Primary Cultured Hepatocytes from Flounder (Paralichthys olivaceus)

  • Kim Woo Jin;Park Doo Won;Park Jung Youn;Kang Ho Sung;Kim Han Do
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제2권1호
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    • pp.85-92
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    • 1999
  • We examined the expression patterns of heat shock proteins in primary cultured hepatocytes from flounder (Paralichthys olivaceus) exposed to heat shock. The expression of hsp90, hsp70, hsp40, hsp30, and hsp27 was induced and major polypeptides were hsp70, hsp30 and hsp27. Northern blot analysis showed that expression of hsp70 was inhibited by transcriptional inhibitor actinomycin D, suggesting that expression of hsp70 gene is regulated at the transcriptional level. Prolonged exposure of cells to an elevated incubation temperature $(30^{\circ}C)$ induced the transient synthesis of hsp90, hsp70, hsp40, and hsp30 whereas maintenance of cells at a slightly higher incubation temperature $(32^{\circ}C)$ induced the continuous syntheses of these hsps. When cells were incubated at a higher temperatures $(35^{\circ}C\;or\;37^{\circ}C)$, the synthesis of hsps was almost similar to that of hsps in cells exposed to 32't except for the induction of hsp27 synthesis. These results that temperature and incubation time for optimum expression of each hsp during prolonged heat shock are different.

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Molecular Cloning of a Profilin cDNA from Bombyx mori

  • Wei, Yadong;Gui, Zhongzheng;Choi, Young Soo;Guo, Xijie;Zhang, Guozheng;Sohn, Hung Dae;Jin, Byung Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제9권1호
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    • pp.123-126
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    • 2004
  • The actin-binding protein profilin cDNA was firstly isolated from the lepidopteran insect, silkworm Bombyx mori. The B. mori profilin cDNA contains an open reading frame of 378 bp encoding 126 amino acid residues and possesses three cysteine residues. The deduced amino acid sequence of the B. mori profilin cDNA showed 80% identity to Apis mellifera profilin and 72% to Drosophila melanogaster profilin. Northern blot analysis showed that B. mori profilin is highly expressed in epidermis and less strongly in silk gland. In addition, Northern blot analysis revealed the presence of B. mori profilin transcripts in all tissues examined, suggesting that B. mori profilin gene is expressed in most, if not all, body tissues.

Expression of Murine Asb-9 During Mouse Spermatogenesis

  • Lee, Man Ryul;Kim, Soo Kyoung;Kim, Jong Soo;Rhim, Si Youn;Kim, Kye-Seong
    • Molecules and Cells
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    • 제26권6호
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    • pp.621-624
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    • 2008
  • We previously showed that Asb-4 and Asb-17 is uniquely expressed in developing male germ cells. A recent report showed that Asb-9 is specifically expressed in the kidney and testes; however, detailed expression patterns in developing germ cells have not been shown. Northern blot analysis in various tissues demonstrated that mAsb-9 was strongly expressed in the testes. Expression analysis by RT-PCR and Northern blot in developing mouse testes indicates that mAsb-9 is expressed from the fourth week after birth to adulthood, with the highest expression in round spermatids. Expression sites were further localized by in situ hybridization in the testes. Pachytene spermatocytes and spermatids expressed mAsb-9 but spermatogonia and generated spermatozoa did not. This study reveals that mAsb-9 could be a specific marker of active spermatogenesis and would be useful for studies of male germ cell development.

마늘 모자이크 바이러스 게놈에 대한 cDNA의 클로닝 (Molecular Coning of cDNA for Garlic Mosaic Virus Genome)

  • 최연희
    • Journal of Plant Biology
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    • 제35권3호
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    • pp.253-257
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    • 1992
  • Potyvirus group에 속하는 것으로 알려진 마늘 모자이크 바이러스 (GMV)가 식물에서 병을 유도하는 메카니즘을 이해하기 위하여, 마늘에 존재하는 GMV에 대한 cDNA clone인 clone 29-6을 분리하였다. Northern blot 분석에 의해 이 바이러스의 genome size는 약 9 kb이고, 또한 clone 29-6은 GLV genome과 유사성이 없었으며, 마늘잎으로부터 분리된 $poly(A)^{+}$ RNA와 강하게 hybridization되었다. 이러한 사실은 이 cDNA clone이 마늘에 감염하여 모자이크 병반을 유도하는 GMV에 대한 cDNA clone 중의 하나인 것으로 생각되었다. Clone 29-6을 probe으로 사용하여 마늘 바이러스의 cDNA 은행을 탐색하여 이와 중첩되는 clone을 선별하여 염기서열을 결정한 결과 이들의 염기서열이 중첩부위에서 서로 일치하지 않았는데 이는 마늘은 여러 형태의 GMV에 의해 감염되어 있음을 암시한다.

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Expression of Low Temperature Regulated Gene H28 in Solanum tuberosum L.

  • 최경화;전재흥;김현순;정영희;정혁;양덕춘
    • 한국자원식물학회지
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    • 제10권4호
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    • pp.300-304
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    • 1997
  • 저온관련 유전자인 H28 유전자를 갖고 있는 Agrobacterium MP90균주를 Desiree와 Atlantie 감자 품종의 잎절편과 공동배양한 후 약 6-8주 후에 항생제가 첨가된 선발배지에서 multiple shoots를 얻을수 있었다. 선발된 형질전환체를 대상으로 PCR 방법을 이용한 NPT II 유전자와 H28를 확인한 결과 내한성유전자가 식물체의 genome에 안정적으로 삽입되었음을 확인하였고 northern blot 확인에 의하여 내한성 유전자가 발현됨을 확인하였다.

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Agrobacterium을 이용한 내열성 유전자의 벼로의 형질전환 및 발현 (Introduction of Thermotolerant Gene into Rice Plant by Agrobacterium Mediated Transformation)

  • 이병현;이효신;원성혜;조진기
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제17권
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    • pp.39-43
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    • 1999
  • 벼에 있어서 엽록체 small heat shock protein(small HSP)의 기능을 밝히기 위하여 Agrobacterium을 이용한 형질전환법을 이용하여 벼로부터 분리한 small HSP cDNA를 도입하였다. Agrobacterium의 감염에는 벼의 미성숙 배로부터 유도한 callus를 이용하였다. 형질전환 후의 재분화율은 약 30%였다. 형질전환을 통하여 얻어진 식물체의 genomic DNA로부터 PCR 분석과 Southern blot 분석으로 엽록체 small HSP 유전자의 도입을 확인하였다. 도입 유전자의 형질전환 벼에 있어서 유전자의 발현 양상을 northern blot 분석으로 조사하였다. 그 결과 도입된 유전자는 상온에서의 발현량이 서로 다르게 나타났으며 항상적으로 발현하고 있음을 확인하였다.

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Cloning and Expression Analysis of a Novel Mouse Zinc Finger Protein Gene Znf313 Abundantly Expressed in Testis

  • Li, Na;Sun, Huaqin;Wu, Qiaqing;Tao, Dachang;Zhang, Sizhong;Ma, Yongxin
    • BMB Reports
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    • 제40권2호
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    • pp.270-276
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    • 2007
  • We have cloned a novel mouse zinc finger protein gene Znf313 by rapid amplification of cDNA ends (RACE) according to the homologue of human ZNF313 gene. The cDNA is 2,163 base pairs (bp) in length and encodes a 229 amino acids (aa) protein with a $C_3HC_4$ ring finger domain and three $C_2H_2$ domains. 89% and 93% nucleotide (nt) and aa sequence identity is observed with its human homologue. Revealed by Northern blot and RT-PCR, full mRNA consists of 2.16 kb and widely expresses in tissues as a single transcript, most abundantly in heart, liver, kidney and testis. The expression of Znf313 in testis is detected in all development stages. Western blot analysis also reveals that Znf313 is expressed in the tissues. Immunohistochemical staining and subcellular localization demonstrate that Znf313 is expressed both in the cytoplasm and nucleus whereas predominantly localized in the nucleus. Present data suggests that Znf313 gene might play a fundamental role in gene transcription and regulation in organism and relates to spermatogenesis.

안개초(Gypsophila paniculata L.)로부터 dihydroflavonol 4-reductase 유전자의 분리 및 분석 (Molecular cloning, sequences analysis and in vitro expression of the dihydroflavonol 4-reductase gene from Gypsophila paniculata L.)

  • 민병환;정동춘
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제37권1호
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    • pp.89-95
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    • 2010
  • Dihydroflavonol 4-reductase(DFR)는 flavonoid 생합성 경로의 가장 중심부에 작용하는 효소로 2R,3R-trans-dihydroflavonols로부터 leucoanthocyanidins 으로의 변환을 촉매한다. 본 연구에서는 색소유전자의 전이를 통하여 새로운 색소발현체계를 가진 품종을 육종하기 위한 기초연구로 안개초 (Gypsophila paniculata L.)의 꽃봉오리로부터 cDNAlibrary를 합성하였고 카네이션의 DFR 유전자를 probe로 사용하여 anthocyanin 합성경로의 중요 효소의 하나인 DFR 유전자를 분리하였다. 염기서열분석을 수행하여 분리유전자의 크기가 1279 bp이며 이 중 coding region은 1063 bp임을 확인하였다. 이미 밝혀진 다른 식물체의 DFR 유전자와 서로 염기서열의 일치성을 비교해 본 결과 Cheddar pink, 카네이션, 양배추, 개나리, 페튜니아, cup flower, 장미, 과꽃 및 거베라에서 각각 62% 이상을 나타내었다. 분리유전자의 발현을 확인하기 위하여 Northern blot 분석 및 인위적으로 기내에서의 transcription과 translation을 수행하였고, 분리한 유전자의 효소활성을 측정해 본 결과 leucopelargonidin의 작은 peak를 확인하였다. Southern blot 분석 결과 안개초의 DFR 유전자는 다른 대부분의 식물체와 유사하게 한 개가 존재함을 확인하였다.

F9 Teratocarcinoma Stem Cell의 분화에 따른 라미닌의 발현 (Expression of Laminin During the Differentiation of F9 Teratocarcinoma Stem Cell)

  • 이호영;허규정;김규원
    • 한국동물학회지
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    • 제33권4호
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    • pp.446-453
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    • 1990
  • 본 실험은 레티노익산에 의해 F9 Teratocarcinoma Stem Cell의 분화를 유도하고 이분화과정에서 세포형태의 변화와 라미닌유전자의 발현을 조사 하였다. 분화되지 않은 F9 Stem Cell은 지속적으로 증식을 하며 세포간의 간격을 구분하기 어령루 뿐만 아니라 불규칙적인 모양을 하고 있으나,레티노익산과 dibutyryl cyclic AMP처리후의 분화된 F9세포는 둥글고 평평한 모양을 나타내며 세포성장은 중지되었다. Northern blot분석에 의하여 레티노익산과 cyclic AMP처리 후의 F9세포내에서 라미닌 유전자의 발현은 현저하게 증가하였다. 즉, 라미닌 B1유전자 발현은 분화과정 동안 최소한 30배, 라미닌 B2 유전자의 발현은 약 20배 증가하였다. 또한 라미닌 항체를 이용한 면역형광 분석결과는 Northern 분석결과와 일치하게 분화 후에 라미닌 단백질 합성이 크게 증가되었으며, 생성된 라미닌 단백질은 거의 세포표면에 분포된 것으로 나타났다. 이러한 결과로부터, 레티노익산에 의해 F9 Stem Cell의 분화가 유도되며 이 분화과정에서의 형태적인 변화와 진행은 라미닌의 생성과 밀접한 관련이 있다고 추측된다.

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