The brain is an organ that consists of various cell types. As our knowledge of the structure and function of the brain progresses, cell type-specific research is gaining importance. Together with advances in sequencing technology and bioinformatics, cell type-specific transcriptome studies are providing important insights into brain cell function. In this review, we discuss 3 different cell type-specific transcriptome analyses i.e., Laser Capture Microdissection (LCM), Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP)/RiboTag, and single cell RNA-Seq, that are widely used in the field of neuroscience. [BMB Reports 2015; 48(7): 388-394]
Since the establishment of embryonic stem cell, pluripotency of the cells was known to allow differentiation of the cells into various cell types consisting whole body. Several protocols have been developed to induce expression of specific genes.. However, no precise protocol that will generate a single type of the cells from stem cells has been reported. In order to produce cells suitable for transplantion into brain of PD animal model, which arouse due to a progressive degeneration of dopaminergic neurons in midbrain, human embryonic stem cell (hESC, MB03) was transfected with cDNAs cording for tyrosine hydroxylase (TH). Successful transfection was confirmed by western immunoblotting. Newly transfected cell line (TH#2/MB03) was induced to differentiate by the two neurogenic factors retinoic acid (RA) and b-FGF. Exp. I) Upon differentiation using RA/ascorbic acid (AA), embryoid bodies (EB, for 4days) derived from hES cells were exposed to RA (10$^{-6}$ M)/AA (50 mM) for 4 days, and were allowed to differentiate in N2 medium for 7, 14, 21, or 28 days. Exp. II) When bFGF was used, neuronal precursor cells were selected for 8 days in N2 medium after EB formation. After selection, cells were expanded at the presence of bFGF (20 ng/ml) for another 6 days followed by a final differentiation in N2 medium for 7, 14, 21 or 28 days. By indirect immunocytochemical studies, proportion of cells expressing NF200 increased rapidly from 20% at 7 days to 70 % at 28 days in RA/AA-treated group, while those cells expressing NF160 decreased from 80% at 7 days to 10% at 28 days upon differentiation in N2 medium. However, in differentiation by RA/AA treatment system, there was a significant increase in proportion of neuron maturity (73%) at day 14 after N2 medium. TH#2/MB03 cells expressing TH are >90% when matured at the absence of either bDNF or TGF-$\alpha$. These results suggested that TH#2/MB03 cells could be differentiated in vitro into mature neurons by RA/AA.
Ko, Hyo Rim;Hwang, Inwoo;Ahn, So Yoon;Chang, Yun Sil;Park, Won Soon;Ahn, Jee-Yin
BMB Reports
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제50권3호
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pp.126-131
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2017
P48 Ebp1 is expressed in rapidly proliferating cells such as cancer cells and accelerates cell growth and survival. However, its expression pattern and role in central nervous system development have not been studied. Here, we demonstrated the spatiotemporal expression pattern of p48 Ebp1 during embryonic development and the postnatal period. During embryonic development, p48 Ebp1 was highly expressed in the brain. Expression gradually decreased after birth but was still more abundant than p42 expression after birth. Strikingly, we found that p48 Ebp1 was expressed in a cell type specific manner in neurons but not astrocytes. Moreover, p48 Ebp1 physically interacted with beta tubulin but not alpha tubulin. This fits with its accumulation in distal microtubule growth cone regions. Furthermore, in injured hippocampal slices, p48 Ebp1 introduction promoted axon regeneration. Thus, we speculate that p48 Ebp1 might contribute to microtubule dynamics acting as an MAP and promotes CNS axon regeneration.
Corticotropin releasing factor (CRF) mediates various responses to stress through CRF receptors 1 and 2. CRF receptor 2 has two forms, $2{\alpha}$ and $2{\beta}$ each of which appears to have distinct roles. Here we used dopaminergic neuron-derived MN9D cells to investigate the function of CRF receptor 2 in dopamine neurons. We found that n-butyrate, a histone deacetylase inhibitor, induced MN9D cell differentiation and increased gene expression of all CRF receptors. CRF receptor $2{\beta}$ was minimally expressed in MN9D cells; however, its expression dramatically increased during differentiation. CRF receptor $2{\beta}$ expression levels appeared to correlate with neurite outgrowth, suggesting CRF receptor $2{\beta}$ involvement in neuronal differentiation. To validate this statement, we made a CRF receptor $2{\beta}$-overexpressing $MN9D/CRFR2{\beta}$ stable cell line. This cell line showed robust neurite outgrowth and GAP43 overexpression, together with MEK and ERK activation, suggesting MN9D cell neuronal differentiation. From these results, we conclude that CRF receptor $2{\beta}$ plays an important role in MN9D cell differentiation by activating the MEK/ERK signaling pathway.
I construct a chaotically driven contraction system having some analogy with the information transfer mechanism in the brain system especially from CA1 cell to CA3 cell known from the empirical result. And I consider the properties of the response system on a state space according to the external input into the drive neuron by observing the fractal hierarchical structure. Then I induce the relation between the information about state transition of the chaotic time series and the spatial information on a fractal attractor to confirm the possibility of encoding of time series data to spatial information.
대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.1
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pp.202.1-202.1
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2003
Microglial cell can act for phagocytosis against abnormal particles in brain, which means that beta-amyloid produced from APP(amyloid precursor protein) can be phagocytosed by microglia when released. In contrast. when senile plaque has already been formed in brain cortex and hippocamphal region, microglia can also accelerate the AD pathogenesis due to chronic inflammatory action, which lead to neuron cell cytotoxicity. (omitted)
연구배경 : Neuron specific enolase (NSE)는 뇌조직의 신경원에서 처음 발견된 당분해 효소이며, APUD 세포 및 신경내분비계에도 존재하는 것으로 알려졌다. 소폐포폐암은 신경내분비세포 및 APUD 세포와 많은 공통점을 가지고 있다. 따라서 NSE 항체를 사용하는 면역조직화학 염색과 혈청내 NSE 농도측정은 신경내분비 분화를 하는 폐종양의 표지자로서 사용될 수 있으며 소세포폐암의 진단에 유용할 수 있다. 방법 : 소세포폐암으로 진단받은 22명과 대조군으로는 비소세포폐암환자 21명을 대상으로 하였으며 생검조직에서 NSE 항체를 이용한 면역조직화학염색을 시행하고 환자의 혈청에서 방사면역측정법으로 NSE 농도를 측정하였다. 결과: 1) NSE 항체를 이용한 면역조직화학염색 NSE 항체를 이용한 면역조직화학영색에서 소세포폐암군 환자는 18명중 9명에서 양성 반응을 보였으며, 비소세포폐암 환자중 면역조직화학염색을 시행한 16명중 5명에서 양성 반응을 보였다. 2) 방사면역 측정법에 의한 혈청 NSE농도 측정 비소세포폐암군의 혈청 NSE평균치는 $11.79{\pm}4.47\;ng/ml$이었으며 소세포폐암군의 혈청 NSE치는 개인차가 심하기는 하였으나(6.01~361.4 ng/ml) 그 평균치는 $59.30{\pm}77.88\;ng/ml$으로 두 군 사이에는 유의한 차이가 있었다. 소세포폐암환자중 limited disease군의 혈청 NSE 평균치는 $20.19{\pm}12.91\;ng/ml$이었으며, extended disease군의 혈청 NSE치는 역시 개인차가 심하기는 하였으나(17.15~361.44 ng/ml) 그 평균치는 $91.9{\pm}94.2\;ng/ml$로 두 군 사이에 유의한 차이를 보였다. 정상인에서의 혈청 NES 농도는 측정하지 않았으나 대조군인 비소세포폐암군환자 평균+2x표준편차인 20 ng/ml을 기준으로 할 때 소세포폐암환자 22명중 16명(73%)에서 증가된 소견을 보였고 이중 limited disease는 50%(5/10), extended disease는 92% (11/12)에서 증가되었으며, 비소세포암 환자중에서는 1명(1/21)만이 증가된 소견을 보였다. NSE 혈청농도와 면역조직화학염색 정도를 비교시 소세포폐암군과 비소세포폐암군 모두에서 유의한 상관관계를 보이지 않았다. 결론 : 혈청 NSE농도측정은 소세포폐암환자에서 암표지자로서 유용한 방법이 될 수 있을 것으로 사료되며 항 NSE 항체를 이용한 생검조직의 면역조직화학염색은 분화가 나빠 고식적인 현미경적 소견만으로는 소세포암과 비소세포암과의 강벌이 어려운 경우 정확한 조직유형 결정과 신경내분비 기원을 뵈이는 폐암의 진단에 도움을 줄 수 있을 것으로 사료된다.
Cui, Yanji;Park, Jee-Yun;Wu, Jinji;Lee, Ji Hyung;Yang, Yoon-Sil;Kang, Moon-Seok;Jung, Sung-Cherl;Park, Joo Min;Yoo, Eun-Sook;Kim, Seong-Ho;Ahn Jo, Sangmee;Suk, Kyoungho;Eun, Su-Yong
The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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제19권3호
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pp.219-228
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2015
Excessive microglial activation and subsequent neuroinflammation lead to synaptic loss and dysfunction as well as neuronal cell death, which are involved in the pathogenesis and progression of several neurodegenerative diseases. Thus, the regulation of microglial activation has been evaluated as effective therapeutic strategies. Although dieckol (DEK), one of the phlorotannins isolated from marine brown alga Ecklonia cava, has been previously reported to inhibit microglial activation, the molecular mechanism is still unclear. Therefore, we investigated here molecular mechanism of DEK via extracellular signal-regulated kinase (ERK), Akt and nicotinamide adenine dinuclelotide phosphate (NADPH) oxidase-mediated pathways. In addition, the neuroprotective mechanism of DEK was investigated in microglia-mediated neurotoxicity models such as neuron-microglia co-culture and microglial conditioned media system. Our results demonstrated that treatment of anti-oxidant DEK potently suppressed phosphorylation of ERK in lipopolysaccharide (LPS, $1{\mu}g/ml$)-stimulated BV-2 microglia. In addition, DEK markedly attenuated Akt phosphorylation and increased expression of $gp91^{phox}$, which is the catalytic component of NADPH oxidase complex responsible for microglial reactive oxygen species (ROS) generation. Finally, DEK significantly attenuated neuronal cell death that is induced by treatment of microglial conditioned media containing neurotoxic secretary molecules. These neuroprotective effects of DEK were also confirmed in a neuron-microglia co-culture system using enhanced green fluorescent protein (EGFP)-transfected B35 neuroblastoma cell line. Taken together, these results suggest that DEK suppresses excessive microglial activation and microglia-mediated neuronal cell death via downregulation of ERK, Akt and NADPH oxidase-mediated pathways.
In the past a few decades, various kinds of cells have been examined in laboratories all over the world, and their interesting results have been expressed through various methods in journal publications. For a representative example, the increment or reduction of cell numbers during a bio-related experimental process has been demonstrated using the hazard ratio in survival analysis or in the form of a graph. In addition, the condition of cells such as their normality or abnormality would be indicated by the images of the cell nuclei or membranes treated with proper fluorescent labeling. However, the above methods seem to not be quantitative but rather qualitative assessments, which might be difficult to provide people with the eidetic understanding through parameters or numerical data. With adequate suggestions on any indices enabling the explanation for cell conditions, some analyses may be underestimated due to the lack of objectiveness caused by merely linguistic evaluation for the cell conditions, not numerally scientific interpretation. Therefore, in this study, we would suggest some indices enabling quantitative analysis on the cellular conditions.
The mature human braun contains over 10 billion nerve cells (neurons), whose functions are directly related to the acquisition, transfer, processing, analysis, and utilization of all the information. There are also billions of glial cells, which serve primarily to support and to maintain the integrity of the neuron network and to synthesize an essential fatty strucfure, myelin. In the human brain DNA content therefore cell number rises rapidly until birth and then more slowly until $5{\sim}6$ months of age, when it reaches a maximum. While glial cells may be replaced, the more important nerve cell neurons can never be replaced once they are formed. Humans are born with their full complement of neurons and every neuron is as old as each individual. Thus prenatal malnutrition can seriously affect a person's entire life by severely inhibiting the production of neurons before birth.It has been demonstrated that in humans severe malnutrition during the fetal period and in infancy is associated with intellectual impairment. Severely malnourished children have brains smaller than average size and have been found to have $15{\sim}20%$ fewer brain cells than wellnourished childen. There is growing body of literature pointing to malnutrition as a cause of abnormal behavior as evidence that suggests these abnormalities may produce chromosomal damage that may persist forever. Although cognitive development in children is affected by multiple environmental factors, nutrition certainly deaerves more attention than it has received.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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