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Physiological and Genetic Factors Controlling Streptomyces Regulatory Gene Expression Involved in Antibiotic Biosynthesis

  • 김응수
    • 한국미생물학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물학회 2002년도 추계학술대회
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    • pp.68-72
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    • 2002
  • While the biosynthetic gene cluster encoding the pigmented antibiotic actinorhodin is present in the two closely related bacterial species, Streptomyces lividans and Streptomyces coelicolor, it normally is expressed only in S. coelicolor---generating the deep blue colonies responsible for the S. coelicolor name. However, multiple copies of the afsR2 gene, which activates actinorhodin synthesis, result in the ability of S. lividansto also synthesize large amounts of actinorhodin. Here we report that the phenotypic property that historicially distinguishes these two Streptomycesspecies is determined conditionally by the carbon source used for culture. Whereas growth on glucose repressed actinorhodin production in S. lividans, culture on solid media containing glycerol as the sole carbon source dramatically increased the expression of afsR2 mRNA---leading to extensive actinorhodin synthesis by S. lividansand obliterating its phenotypic distinction from S. coelicolor. afsR2 transcription under these conditions was developmentally regulated, rising sharply at the time of aerial mycelium formation and coinciding temporally with the onset of actinorhodin production. Our results, which identify media-dependent parallel pathways that regulate actinorhodin synthesis in S. lividans, demonstrate carbon source control of actinorhodin production through the regulation of afsR2 mRNA synthesis. The nucleotide sequences of afsR2 revealed two putative important domains; the domain containing direct repeats in the middle and the domain homologous to sigma factor sequence in the C-terminal end. In this work, we constructed various sized afsR2-derivatives and compared the actinorhodin stimulating effects in S. lividans TK21. The experimental data indicate that the domain homologous to sigma factor sequence in the C-terminal end of afsR2 plays a critical role as an antibiotic stimulating function. In addition, we also observed that the single copy integration of afsR2 regulatory gene into S. lividans TK21 chromosome significantly activates antibiotic overproduction.

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Word Embedding 자질을 이용한 한국어 개체명 인식 및 분류 (Korean Named Entity Recognition and Classification using Word Embedding Features)

  • 최윤수;차정원
    • 정보과학회 논문지
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    • 제43권6호
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    • pp.678-685
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    • 2016
  • 한국어 개체명 인식에 다양한 연구가 있었지만, 영어 개체명 인식에 비해 자질이 부족한 문제를 가지고 있다. 본 논문에서는 한국어 개체명 인식의 자질 부족 문제를 해결하기 위해 word embedding 자질을 개체명 인식에 사용하는 방법을 제안한다. CBOW(Continuous Bag-of-Words) 모델을 이용하여 word vector를 생성하고, word vector로부터 K-means 알고리즘을 이용하여 군집 정보를 생성한다. word vector와 군집 정보를 word embedding 자질로써 CRFs(Conditional Random Fields)에 사용한다. 실험 결과 TV 도메인과 Sports 도메인, IT 도메인에서 기본 시스템보다 각각 1.17%, 0.61%, 1.19% 성능이 향상되었다. 또한 제안 방법이 다른 개체명 인식 및 분류 시스템보다 성능이 향상되는 것을 보여 그 효용성을 입증했다.

ENUM 디렉터리 서비스 설계 및 성능 평가 (Design and Performance Analysis of EU Directory Service)

  • 이혜원;윤미연;신용태;신성우;송관우
    • 한국정보과학회논문지:정보통신
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    • 제30권4호
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    • pp.559-571
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    • 2003
  • PSTN(Public Switched Telephone Network)과 IP Network의 연동을 제공하는 새로운 프로토콜 ENUM(tElephone Numbering Mapping)은 전 세계적으로 유일성을 가지는 전화번호를 DNS 기반의 구조에서 사용되는 F.Q.D.N.(Fully Qualified Domain Name)으로 변환함으로써 E.164 번호를 사용하여 PSTN에서 제공하는 서비스와 IP 네트워크에서 제공하는 서비스를 동시에 사용 가능케 하는 새로운 인터넷 주소체계이다. 본 논문에서는 미국과 유럽에서 활발히 진행중인 ENUM 모델 표준화 연구 및 개발에 발맞추어 ENUM 기반의 서비스를 사용할 때 ENUM resolution 성능 향상을 위한 Tier 2 네임서버 관리기법을 제시한다. ENUM 위임구조에서 Tier 2 네임서버 제공업자가 지역번호 별로 ENUM 등록 대행업 및 NAPTR RR(Naming Authority PoinTeR 리소스 레코드)을 제공함으로써 ENUM resolution의 성능이 향상됨을 증명하기 위해 ENUM 기반의 네트워크 모델링을 사용하였다. ENUM 프로토콜이 IP 네트워크 사용자와 PST리 사용자에게 유연성 및 편의성을 제공하는 반면 사용자가 ENUM을 사용할 때 지불해야할 인내력을 측정할 척도가 없는 현재 이 논문에서 제안하는 방법은 사용자의 ENUM 서비스 선택 결정에 긍정적인 영향을 미치고, ENUM Tier 2 네임서버 관리를 위한 정책에 도움이 될 것으로 기대된다.

개념간 관계의 추출과 명명을 위한 통계적 접근방법 (A Statistical Approach for Extracting and Miming Relation between Concepts)

  • 김희수;최익규;김민구
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제12B권4호
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    • pp.479-486
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    • 2005
  • 온톨로지는 차세대 시맨틱 웹을 위한 논리의 기반을 구성하기 위해 제안되었다. 이러한 온톨로지는 특정 분야에 대한 지식을 정형화된 형태로 표현함으로써 기계에 의한 지식의 이해를 가능하게 하고, 이를 사용하여 사용자의 요구에 알맞은 지능화된 서비스를 제공할 수 있게 한다. 하지만, 온톨로지의 구축과 유지는 많은 사람의 시간과 노력을 요구한다. 본 고에서는 온톨로지 구축 방법의 일환으로, 문서로부터 온톨로지를 구성하는 개념간의 관계를 정의하는 자동화된 방법을 제안한다. 본 고에서 제안된 방법은 특정 분야의 문서에 존재하는 개념을 기반으로 개념간의 연관 규칙을 형성하는 개념 쌍을 찾고, 두 개념 사이에 존재하는 내용의 군집화를 통해 두 개념간의 관계를 설명하는 패턴을 찾는다. 마지막으로 패턴간의 군집화를 사용하여 개념 사이의 일반화된 관계를 명시한다. 본 고에서는 제안된 방법을 검증하기 위한 방법으로 TREC(Text REtrieval Conference)에서 제공하는 문서집합을 사용하여 개념간의 관계를 추출, 평가하였으며, 그 결과 제안된 방법은 개념간의 관계를 설명하는 유용한 정보를 제공할 수 있음을 보여준다.

Route Optimization Scheme for Mobile Content Sources in Content Centric Networking

  • Lee, Jihoon;Rhee, Eugene
    • Journal of information and communication convergence engineering
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    • 제18권1호
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    • pp.22-27
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    • 2020
  • Content centric networking (CCN) is regarded as promising internet architecture because it can provide network efficiency in terms of bandwidth consumption by separating contents from a specific network location and decrease network congestion events. However, the application of a CCN does not widely consider the side effects of mobile devices, particularly mobile content sources. For content source mobility, a full routing update is required. Therefore, in this study, a route optimization scheme is proposed for mobile content sources in a CCN environment to provide low communication overhead, short download time, and low resource consumption. The proposed scheme establishes a direct path between content requesters and a mobile content source for the exchange of interest and data packets using interest-piggybacked data packets. Based on the inherent CCN naming characteristics, the content source does not know the name prefix of the content consumer, and thus the proposed optimized CCN scheme utilizes the content router in the home domain of the content source.

The Research on the concept and characteristics of the Personal Community Service

  • Ahn, Joong-Ho;Chae, Min-Kyun;Yang, Ji-Youn
    • 한국전자거래학회:학술대회논문집
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    • 한국전자거래학회 2005년도 e-Biz World Conference 2005
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    • pp.180-185
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    • 2005
  • This is the research on the new services which are called Korean blog, personal media, etc and which showed large increase in usage rate in 2004. In spite of this increase there has been no effort to conceptualize these services. So, we researched whether these new services constituted an independent domain, in what aspects they were different with other established services, how could we conceptualize them with an appropriate name, what were characteristics of them. We used Interview and Delphi method with the participation of professionals in charge of planning and operating these services in 4 major service providers.

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제조 데이타베이스 설계에서의 뷰 통합 방안 (A methodology for view integration in manufacturing database design)

  • 신기태;박남규;박진우
    • 경영과학
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    • 제11권3호
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    • pp.87-102
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    • 1994
  • Conceptual database design is an important activity because the performance of a DBMS heavily depends on the proper design of the database, and view integration is one of the most important phases of conceptual database design. During this phase, the individual views designed by separate user groups are integrated into a global view for the entire system. After the view integration, a database schema must be validated before it becomes a stable product of the design. In this paper, a methodology for view integration an validation is suggested. The individual views are modeled by entity-relationship model. The entities are integrated according to their name and domain information. After that, the relationships are merged by their constraints. We also present a methodology for checking redundant relationships which has an algorithmic description.

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클라이언트 기반 분산 웹캐싱 시스템 (A Client-based distributed web caching system)

  • 박종호;유성구;정길도
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2006년도 하계종합학술대회
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    • pp.829-830
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    • 2006
  • A distributed web caching system can transmit information to a user quickly and stably, avoiding a congested internet network by storing and later supplying requested content to a cache that is distributed and shared like a proxy server. This paper proposes a client-based distributed web caching system that assigns an object and controls the load using a user's direct connection to shared caches, without the aid of additional domain name system (DNS) requests. The proposed system simplifies information transmission by reducing both DNS queries and delay time.

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X.509기반 PKI의 영역간 상호인증 프로토콜에 관한 연구 (A Study of Cross Certification between Realms in Public Key Infrastructure based on X.509)

  • 신광철
    • 한국컴퓨터산업학회논문지
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    • 제2권6호
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    • pp.845-852
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    • 2001
  • 인터넷의 전자상거래, 응용서비스가 보편화되고 중요문서나 주문정보 등 개인정보가 네트워크상에서 교환되면서 송ㆍ수신자의 적법성과 정보의 무결성을 위해 허락된 사용자만이 자원에 접근할 수 있는 절차가 필요하다. 서버자원에 접근하는 사용자를 통제하고 클라이언트들을 식별하기 위해서는 인증서비스를 통해서 가능하다. 특히 분산환경에서는 공개키 암호시스템을 기반으로 구현되어야 여러 사용자들에게 동시에 편리성과 안전성을 보장할 수 있다. 본 논문에서는 PKI기반의 X.509와 DNS를 연관하여 디렉토리 인증을 통한 영역간 서비스를 제공하는 메커니즘을 설계하였다.

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RFID 시스뎀에서 ID 변환 기술 연구 (A Study of ID resolution technologies in REID System)

  • 이창열
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제7권6호
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    • pp.1224-1230
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    • 2006
  • RFID 태그에 기록되는 ID의 구조는 해당 규격에 따라 이진수나 문자 형태로 기록되며, 이들 자료가 RF 리더로 읽힌 다음 의미 있는 ID로 변경된다. 이 ID는 인터넷 서비스를 위하여 FQDN 형태로 변경이 필요하며, 이후 URN에서 제시하는 변환 과정을 통하여 해당 ID의 서비스 루트를 찾아가서 궁극적으로 원하는 자료를 얻게 된다. 본 연구에서는 이러한 여러 변환 단계에서 필요한 기술적 사항과 이에 따라 특정 ID 체계를 RFID로 표현하여 서비스할 경우 필요한 과정과 고려 사항에 대한 연구를 진행하였다. 샘플 ID로써 ISBN을 RFID 시스템에 적용하였다.

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