• 제목/요약/키워드: N.$D_L$

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Structural dynamics insights into the M306L, M306V, and D1024N mutations in Mycobacterium tuberculosis inducing resistance to ethambutol

  • Yustinus Maladan;Dodi Safari;Arli Aditya Parikesit
    • Genomics & Informatics
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    • 제21권3호
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    • pp.32.1-32.11
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    • 2023
  • Resistance to anti-tuberculosis drugs, especially ethambutol (EMB), has been widely reported worldwide. EMB resistance is caused by mutations in the embB gene, which encodes the arabinosyl transferase enzyme. This study aimed to detect mutations in the embB gene of Mycobacterium tuberculosis from Papua and to evaluate their impact on the effectiveness of EMB. We analyzed 20 samples of M. tuberculosis culture that had undergone whole-genome sequencing, of which 19 samples were of sufficient quality for further bioinformatics analysis. Mutation analysis was performed using TBProfiler, which identified M306L, M306V, D1024N, and E378A mutations. In sample TB035, the M306L mutation was present along with E378A. The binding affinity of EMB to arabinosyl transferase was calculated using AutoDock Vina. The molecular docking results revealed that all mutants demonstrated an increased binding affinity to EMB compared to the native protein (-0.948 kcal/mol). The presence of the M306L mutation, when coexisting with E378A, resulted in a slight increase in binding affinity compared to the M306L mutation alone. The molecular dynamics simulation results indicated that the M306L, M306L + E378A, M306V, and E378A mutants decreased protein stability. Conversely, the D1024N mutant exhibited stability comparable to the native protein. In conclusion, this study suggests that the M306L, M306L + E378A, M306V, and E378A mutations may contribute to EMB resistance, while the D1024N mutation may be consistent with continued susceptibility to EMB.

동적 변화 환경에서 다중 임무점 방문을 위한 최적 경로 계획 알고리즘 (Optimal Path Planning Algorithm for Visiting Multiple Mission Points in Dynamic Environments)

  • 이호형;장우혁;장환철
    • 한국항공우주학회지
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    • 제47권5호
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    • pp.379-387
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    • 2019
  • 다중 임무점 방문을 위한 경로 계획의 복잡도는 단일 구간 경로 계획을 위한 복잡도보다 크게 더 높다. n개의 다중 임무점을 방문하는 경로 계획을 위해서는 $n^2+n$번의 단일 구간 경로 계획이 필요하다. 본 논문에서는 동적 변화 환경에서 다중 임무점을 방문하기 위한 최적의 경로 계획 알고리즘인 Multiple Mission $D^*$ Lite($MMD^*L$) 알고리즘을 제안하였다. $MMD^*L$은 앞서 수행된 단일 구간 경로 계획 정보를 재사용함으로써 복잡도를 감소시킨다. 시뮬레이션 결과를 통해 경로의 최적성은 양보하지 않으면서도 복잡도가 급격하게 감소하였음을 확인하였다.

Determining the Required Vitamin D Level for Bone Health Based on Bone Turnover Markers

  • Ismail, Tuan Salwani Tuan;Muda, Bayani Che;Rosdi, Roznie Aida Mohd;Zainuddin, Azalina;Isa, Salbiah;Mustapaha, Zulkarnain
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제49권4호
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    • pp.337-344
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    • 2017
  • To date, no clear threshold that has been established for defining an adequate store of vitamin D for bone health. Therefore, this study aims to determine the required level of vitamin D to maintain a healthy skeleton based on bone remodelling process among healthy adult population. This was a cross sectional study, involving a healthy adult population in Kota Bharu, Malaysia, aged 18~50 years. We measured serum 25(OH)D (vitamin D), serum parathyroid hormone (PTH), serum C-terminal telopeptide of type 1 collagen (CTX), and Procollagen 1 Intact N-Terminal (P1NP) in 120 healthy adults selected via multi stage sampling (64 males, 56 females) from 6 subdistricts in Kota Bharu. The mean level of 25(OH)D was 23.50 (${\pm}8.74$) nmol/L. There was a significant difference of the vitamin D level between genders ($26.81{\pm}8.3nmol/L$ vs $19.72{\pm}7.68nmol/L$ in males and females respectively) (p value<0.001). More than 50% of female subjects had 25(OH)D less than 20 nmol/L, while only 20.3% of male subjects had 25(OH)D below 20 nmol/L. Based on the LOESS plot, the bone turnover markers showed a plateauing result, at the 25(OH)D level of 35 nmol/L for CTX and 20 nmol/L for P1NP. Contrastingly, PTH showed a step rise in the 25(OH)D level of 20 nmol/L. Based on the LOESS plot for CTX, P1NP and PTH versus 25(OH)D, level of vitamin D between 20 to 35 nmol/L is recommended to maintain healthy skeleton.

화재감지 센서 작동시간 및 열방출률에 대한 실험연구 (A Experimental Study on the Heat Release Rate to activate Fire Detection Sensor)

  • 홍성호
    • 전기학회논문지
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    • 제61권9호
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    • pp.1358-1361
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    • 2012
  • This paper presents a study on the analysis for activation time and threshold value of heat detection sensor using HRR(Heat Release Rate). And it is represented to quantity of heat to activate heat detection sensor. The experiment is conducted to measure activation time and HRR of fire detection sensor burning alcohol and n-heptane. In order to burn the alcohol and n-heptane using $43.5cm(L){\times}43.5cm(W){\times}5cm(D)$ and $33cm(L){\times}33cm(L){\times}5cm(D)$ steel pan and the quantity of alcohol and n-heptane are 2.5 L and 650 g, respectively. The results show that peak HRR are in case of alcohol 66.13 kW and in case of n-heptane 151.64 kW, respectively. Total heat releases of heat detection sensor are in case of alcohol approximately 20.7 MJ and in case of n-heptane approximately 18 MJ, respectively.

Decimation에 의해 생성된 p-진 m-시퀀스 군의 상호 상관 값의 분포 (Cross-Correlation Distribution of a p-ary m-Sequence Family Constructed by Decimation)

  • 서은영;김영식;노종선;신동준
    • 한국통신학회논문지
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    • 제33권9C호
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    • pp.669-675
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    • 2008
  • 홀수인 소수 p와 n=4k, 그리고 $d=((p^2k+1)/2)^2$에 대해서, 주기가 $p^n-1$인 p-진 m-수열 s(t)에 대해서 $(p^{2k}+1)/2$개의 서로 다른 decimated 수열들 s(dt+1), $0{\leq}l<(p^{2k}+1)/2$가 존재한다. 이 논문에서는 s(t)와 s(dt+l), $0{\leq}l<(p^{2k}+1)/2$ 사이의 상호상관 값이 $\{-1,-1{\pm}\sqrt{p^n},-1+2\sqrt{p^n}\}$과 같음을 보이고, 상호 상관 값의 분포를 유도하였다.

N-아실-α-아미노숙신이미드와 N-아실-α-아미노글루탈이미드의 합성 (Synthesis of N-acyl-α-aminosuccinimides and N-acyl-α-aminoglutarimides)

  • 정대일;김문주;송현애;김윤영;이용균;박유미;최순규;한정태;박민수
    • 생명과학회지
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    • 제14권1호
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    • pp.91-97
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    • 2004
  • 앞선 연구의 구조적 특성을 근거로 하여, 한 분자내에 MES 유발경련에 작용하는 cyclicimide의 구조를 포함하면, 그들의 구조가 경련 유발 수용체들에 상호 보완적으로 작용, MES및 PTZ유발 경련에 모두 작용할 수 있는 적용 범위가 넓은 항경련성 화합물이 될 수 있을 것으로 생각하여 N-acyl-$\alpha$-aminosuccinimide 1과 N-acyl-$\alpha$-aminoglutar- imide 2 유도체를 합성하였다. 먼저 (R)-2-benzyloxy carbonylamino-succinic acid 3을 출발 물질로 하여 N-acyl-a-aminosuccinimide 1 유도체인 (R)-Benzoic acid 4-benzyloxycarbonyl-amino-2-oxo-pyrrolidin-l-yl ester 6a, (R)4-nitro-benzoic acid 4-benzyloxycarbon-ylamino-2-oxo-pyrrolidin-1-yl ester 6b, (R)-4-nitro-benzoic acid 4-benzyloxycarbonylamino-2-oxo-pyrrolidin-1-yl ester 6c, 그리고 (R)-propionic acid 4-benzyloxycarbonylamino-2-oxo-pyrrolidin-1-yl ester 64를 합성하였다 또한 (R)-3-car-bobenzyloxy-aminoglutarrnic acid 7를 출발물질로 하여 N-acyl-$\alpha$-aminoglutarimide 2유도체인 (R)-(3-Benzyloxycarbonyl-amino-2,6-dioxo-piperidin-1-yloxy)-acetic acid methyl ester 10a, (R)-(3-benzyloxyarbonylamino-2,6-dioxo-piperidin-1-yloxy)-acetic acid ethyl ester l0b, 그리고 (R)-2-(3-benzylox-ycarbonylanino-2,6-dioxo-piperidin-1-yloxy)-propionic acid methyl ester l0c를 합성하였다. 합성된 화합물 6a, 6b, 6c, 6d, 10a, lOb, l0c에 대한 활성평가는 각 단계별 MES test와 PTZ test의 항경련 활성 시험 방법을 가지고 실험할 예정이다.

Reactivity of RhCp* Complexes Containing Labile Ligands toward Potential Linking Ligands Containing Terminal Thiophene or Furan Rings:Preparation and Structures of [Cp*Rh(L1)Cl2], [Cp*Rh(η2-NO3)(L1)](OTf),and {[Rh(L2)] · (OTf)}[L1 = 1,2-Bis((thiophen-2-yl)methylene)hydrazine); L2 = 1,2-Bis((furan-2-yl)methylene)hydrazine]

  • Lee, Kyung-Eun;Lee, Soon-W.
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권12호
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    • pp.3600-3604
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    • 2010
  • Rhodium(III)-$Cp^*$ complexes containing labile ligands, $[Cp^*RhCl_2]_2$, [$Cp^*Rh({\eta}^2-NO_3)$(OTf)], and $[Cp^*Rh(OH_2)_3](OTf)_2$, reacted with potential linking ligands [$L^1$ = (2-thiophene)-CH=N-N=CH-(2-thiophene); $L^2$ = (2-furan)-CH=N-N=CH-(2-furan)] to give two molecular compounds, [$Cp^*Rh(L^1)Cl_2$] (1) and [$Cp^*Rh({\eta}^2-NO_3)(L^1)$]$(OTf){\cdot}CH_2Cl_2$ ($2{\cdot}CH_2Cl_2$), and one 1-dimensioanl coordination polymer, $\{[Rh(L^2)]{\cdot}(OTf)}_{\infty}$ (3). Whereas one imine nitrogen atom within the ligand is coordinated to the Rh metal in compounds 1 and 2, both nitrogen atoms are bound to two neighboring Rh metals in compound 3 to lead to a 1-D chain polymer.

술패랭이꽃(Dianthus superbus)의 엽육원형질체로부터 식물체 재분화 (Plant Regeneration from Mesophyll Protoplasts of Dianthus superbus)

  • Lee, Eun-Ae;Kim, Joon-Chul;Kim, Won-Bae
    • 식물조직배양학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.41-46
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    • 1995
  • 술패랭이꽃의 엽육원형질체를 2.0mg/L NAA, 0.5 mg/L BAP 및 9%의 mannitol이 포함된 MSPI 9M 액체배지에서 배양하였다. 27$^{\circ}C$, 암조건에서 배양 3-4주일 후 활발한 분열과정을 거쳐 원형질체로부터 colony가 형성되었으며 이들colony는 연속광 (21.5 $\mu$Eㆍ $m^{-2}$ ㆍse $c^{-1}$)하에서 배양 2주일 후 직경 약 3 mm의 녹색 microcallus로 생장하였다. 녹색 microcallus는 2.0 mg/L 2,4-D가 첨가된 고체배지에서 배양30일 후 배발생 캘러스를 형성하였으며 이들 배발생 캘러스는 0.1 mg/L 2,4-D, 2.0 mg/L kinetin 및 2.0 g/L casein hydrolysate가 포함된 $N_{6-}$2 배지에서 캘러스당 10-15개의 multiple shoot의 분화가 이루어졌다. 재분화된 shoot는 2.0mg/L NAA가 포함된 MS 배지에서 뿌리가 유도되었으며 이들을 pot로 이식하여 재분화 개체를 획득할 수 있었다.

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Column-Switching System을 이용한 우유속의 D-아미노산의 미량정량 (Micro-Determination of D-Amino Acids in Milk by using Column Switching System)

  • 이선행;김경희;이영철;김상태
    • 대한화학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.257-265
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    • 1995
  • 시중에 시판되고 있는 우유를 전처리하여 이 우유에 포함된 유리 아미노산을 dansyl-chloride로 유도체화시켜 C-18 컬럼을 이용한 역상 LC법으로 분리한 다음 표준물 첨가법으로 정량했다. 미량의 D-아미노산의 분리에서는 LC의 Column-Switching System을 이용하였으며 비키랄 컬럼을 통과한 단실 D/L-아미노산에 $Cu(N-benzyl-L-proline)_2$를 이동상에 첨가한 키랄 분리를 수행하여 L-아미노산에서 D-아미노산을 분리 정량했다. 이 방법은 우유시료 중에 존재하는 16가지 아미노산의 정량이 가능하며 이중에 12가지의 D-아미노산이 column switching 방법을 통한 키랄 분리로 정량이 가능하다. 우유 100 mL에 총 유리 아미노선이 41.00 mg 포함되어 있음을 확인했으며, D-아미노산은 D-glutamic acid가 2.05%, D-alanine 2.93%만이 포함되어 있음을 확인했다.

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연속순환 생물막 공정을 이용한 돈사 폐수 처리 (Swine Wastewater Treatment Using Continuos Circulation Biofilm Process)

  • 고병대;라창식
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제49권2호
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    • pp.279-286
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    • 2007
  • 반응물을 연속적으로 내부 순환시키는 생물막 연속회분식모래여과 공정을 고안하고 외부 탄소원이 전혀 사용되지 않는 조건하에서의 돈사폐수 처리특성을 평가하였다. 수직형과 경사형 모래여과조에서의 NOx-N 부하량에 따른 탈질율은 각각 19%와 3.8%로 수직형에서 5배 정도 높은 효율을 보임에 따라 수직형태의 모래여과조를 생물막 연속회분식 공정과 연계하여 운전하였다. 처리공정을 HRT 15일, 내부순환율 105L/hr.m3, 평균 암모니아성 질소 부하량 54g/m3.d 조건에서 운전하였을 때 STOC, NH4- N, TN의 처리효율은 각각 75%, 97%, 85%이었다. 생물막 연속회분식 반응조와 모래여과조간의 내부순환으로 TN의 제거효율이 약 14%증진되는 것으로 나타났으며 얻어진 질소제거효율 증진은 주로 모래여과조에서의 탈질에 의한 것으로 밝혀졌다. 또한 용해성 인의 경우 내부순환이 수행되지 않았을 시에는 유출수내 농도가 오히려 증가하였으나 내부순환시에는 약 57% 정도가 제거되는 것으로 나타남에 따라 반응물의 내부순환이 용해성 인의 제거효율 증진에도 기여함을 알 수 있었다. 시스템에서의 질소제거 양상을 분석해본 결과 최종 유출수내의 NH4-N은 부하량 60g/m3.d 수준에서 약 20mg/L 이하로 비교적 일정하였고 부하량이 100g/m3.d. 이상의 수준으로 상승함에도 80% 이상의 질소 제거효율을 보였다. 그러나 부하량 100g/m3.d 수준 이상에서부터 처리효율이 감소하는 것으로 나타나 외부탄소원이 전혀 사용되지 않는 운전조건에서의 질소의 적정 부하량은 약 100g/m3.d 정도인 것으로 판단되었다.