Recently, many researches for plant alkaloids, one of the largest groups of natural products, are reported because of their various pharmacological activity. This study was carried out to clone putrescine N-methyltransferase (PMT) gene which is a key enzyme in diverting polyamine metabolism towards the biosynthesis of nicotine and related alkaloids from Burley tobacco. To induce expression of PMT gene in tobacco plant, the floral meristem was removed and then mRNA was purified from root. cDNA encoding PMT gene was isolated by RT PCR and cloned. Three different groups of clones were screened by PCR and restriction enzyme digestion analysis and were characterized. The data of these screening revealed that three types of PMT are present in Burley tobacco. Comparison of the nucleotide sequence of this three genes encoding putative PMT with those of other tobaccos revealed that two types of PMT are newly discovered from Nicotiana tabacum cv. Br21 tobacco and they were same as PMT2, PMT3 of N. tabacum cv. Xanthi.
Transgenic tobacco plants were selected by using the transformation of putrescine N-methyltransferase(PMT) gene, the key enzyme in diverting polyamine metabolism towards the biosynthesis of nicotine. PMT was fused in reverse orientation to the CaMV 35S promoter of the plant expression vector pBTEX(pPAB3) to produce tobacco plants of low nicotine content. To compare nicotine content, only pBTEX vector and PMT gene which was fused in forward orientation to the CaMV 35S promoter(pPAB2) were also transformed to the leaf tobacco plants(Nicotiana tabacum cv. NC82 and N. tabacum cv. Br2l). The presence of sense- and antisense-PMT gene, and pBTEX vector in the transgenic plant was confirmed by genomic PCR.
Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase (PEMT) is known to be a membrane-associated protein. However, cytosolic PEMT was detected when sufficient amounts of exogenous phospholipids were added in the incubation media. The methylation of phospholipids was measured by the incorporation of the $[^3H]-methyl$ group from S-adenosylmethionine and the methylated phospholipids were analyzed by thinlayer chromatography. The essence of the assay condition for the cytosolic enzyme was the inclusion of 200 ${\mu}g$ of each substrate, phosphatidylethanolamine (PE), phosphatidyl N-monomethylethanolamine (PME) and phosphatidyl N,N-dimethylethanolamine (PDE), in the reaction mixture of 100 ${\mu}l$. The subcellular fractionation of brain PEMT activities revealed that approximately 38.1 % for PME, 39.5% for PDE, and 22.4% for PC formation was present in the cytosolic fraction. The general properties of cytosolic PEMT were characterized and compared with those of neuronal nuclei PEMT.
To determine the regulatory mechanism of phenylethanolamine N-methyltransferase (PNMT) in the adrenal gland and in central nervous system, we observed the change of enzyme activity and mRNA level of PNMT in the adrenal gland, the brain stem, and hypothalamus of rats, which were injected with two neuroleptic agents(reserpine and haloperidol ). Reserpine depleting catecholamines in presynaptic vesicle increased PNMT activities in the adrenal gland and the brain stem to 150% of the control in time-dependent manner, but not in the hypothalamus. Haloperidol blocking dopamine receptor decreased PNMT activities in the adrenal gland and the hypothalamus, but not in the brain stem. Thus, the results indicate that catecholamines inhibit synthesis of epinephrine in the brain stem and the adrenal gland, and that dopamine stimulates synthesis of epinephrine in the hypothalamus and the adrenal gland. In addition, since the change of mRNA levels were nearly in accordance with the change of activities, the transcriptional regulation of PNMT is considered the mechanism of the regulation of epinephrine neuron.
DNA 메틸화는 유전체의 무결성의 유지 및 유전자 발현 조절과 같은 박테리아의 다양한 과정에 관여한다. Alphaproteobacteria 종에서 보존된 DNA 메틸 전이 효소인 CcrM은 S-아데노실 메티오닌을 공동 기질로 사용하여 $N^6$-아데닌 또는 $N^4$-시토신의 메틸 전이 효소 활성을 갖는다. Celeribacter marinus IMCC 12053는 해양 환경에서 분리된 알파프로테오박테리아로서 GpC 시토신의 외향고리 아민의 메틸기를 대체하여 $N^4$-메틸 시토신을 생산한다. 단일 분자 실시간 서열 분석법(SMRT)을 사용하여, C. marinus IMCC12053의 메틸화 패턴을 Gibbs Motif Sampler 프로그램을 사용하여 확인하였다. 5'-GANTC-3'의 $N^6$-메틸 아데노신과 5'-GpC-3'의 $N^4$-메틸 시토신을 확인하였다. 발현된 DNA 메틸전이 효소는 계통 발생 분석법을 사용하여 선택하여 pQE30 벡터에 클로닝 후 $dam^-/dcm^-$ 대장균을 사용하여 클로닝된 DNA 메틸라아제의 메틸화 활성을 확인하였다. 메틸화 효소를 코딩하는 게놈 DNA 및 플라스미드를 추출하고 메틸화에 민감한 제한 효소로 절단하여 메틸화 활성을 확인하였다. 염색체와 메틸라아제를 코드하는 플라스미드를 메틸화시켰을 때에 제한 효소 사이트가 보호되는 것으로 관찰되었다. 본 연구에서는 분자 생물학 및 후성유전학을 위한 새로운 유형의 GpC 메틸화 효소의 잠재적 활용을 위한 외향고리 DNA 메틸라제의 특성을 확인하였다.
Ras oncogene의 산물로서 대부분의 암조직이나 transformed human cell에서 거의 공통적으로 발견되는 p21 단백질은 C-terminal processing에 의해 먼저 C-terminal cysyeine에 palmition 된 후 carboxylmethylation 된다. Palmitation은 transforming activity의 요건인 세포막에 대한 친화력을 유지시키기 위한것으로 추측되며, cysteine residue의 carboxylmethylation의 의미는 아직 확실히 밝혀지고 있지 않으나 세포막에 대한 친화력을 증가 시키는 것으로 추측되고있다. 본 연구에서는 S-Farnesylcysteine Methyltransferase의 기질로서 N-acetyl-S-trans, trans-farnesyl-L-cysteine(AFC)을 합성하였으며, 본 실험실에서 계속 연구하여 온 돼지 간장으로 부터 정제한 천연 단백성 Methylation Inhibitor의 S-Farnesylcysteine Methyltransferase 활성에 대한 억제효과를 검색하였다. 천연 단백성 Methylation Inhibitor는 돼지 간조직의 soluble fraction을 열처리하여 Sephadex G-25 column chromatngraphy한 후 reverse phase HPLC로 정제하였다. 본 inhibitor는 약 10개의 아미노산으로 구성된 peptide성 천연물질로 분자량은 1,400 Da 으로서 합성한 AFC를 기질로 하였을 때, 흰쥐 뇌 조직내 S-Farnesylcysteine methyltransferase에 대한 $IC_{50}$/은 0,82 $\times$$10^{-6}$ M이었으며 또한 human cancer cell line의 S-Farnesylcysteine Methyltransferase에 대해서도 현저한 저해효과를 나타내었다.
The activity of SD-framesylcysteine O-methyltransferase was assayed by incubating the enzyrne with a synthetic in vitro substrate, [N-acetyl-S-trans, trns-famesyl-L-cysteine (AFC)], together with S-adenosyl-L-[emthyl-$_{14}$C)ester(AFCME)], was then analyzed either directly on HPLC or by converting the AFC[$methyl^{14}C$]ME to [$methyl^{14}C$] aclcohol by basehydrolysis. Employing these two analytical methods, it was established that a peptide purifed from rat liver cytosol fraction [Int. J. Biochem., 25, 1157 919930] strongly inhibited the above enzyme activity with $IC_{50}\; of\; 7.1\times 10^{-8}$ M. Also, the S-famesylcysteine O-methyltransferase from several human colon cancer cells was equally inhibited by the peptide.
Coptis chinensis 3'-hydroxy-N-methylcoclaurine 4'-O-methyltransferase (HOMT), an essential enzyme in the berberine biosynthetic pathway, catalyzes the methylation of 3'-hydroxy-N-methylcoclaurine (HMC) producing reticuline. A 3D model of HOMT was constructed by homology modeling and further subjected to docking with its ligands and molecular dynamics simulations. The 3D structure of HOMT revealed unique structural features which permitted the methylation of HMC. The methylation of HMC was proposed to proceed by deprotonation of the 4'-hydroxyl group via His257 and Asp258 of HOMT, followed by a nucleophilic attack on the SAM-methyl group resulting in reticuline. HOMT showed high substrate specificity for methylation of HMC. The study evidenced that Gly117, Thr312 and Asp258 in HOMT might be the key residues for orienting substrate for specific catalysis.
담자균류의 영지버섯으로부터 homocysteine methyltransferase를 code하는 metE 유전자를 methionine 요구성 균주인 대장균에 complementation시켜 cloning하였다. 그 결과 삽입된 DNA의 크기는 약 1.54 kb 이었고, 5개의 제한효소 부위가 존재하였다. 이 clone체의 제한지도를 작성하였고, southern blot 분석으로 metE 유전자는 영지버섯의 genome으로부터 유래하였으며, 단일 복제수로 존재함을 확인하였다.
Two new SAM-dependent methyltransferase encoding genes (fvsmt1 and fvsmt2) were identified from the genome of Flammulina velutipes. In order to make a comprehensive characterization of both genes, we performed in silico analysis of both genes and used qRT-PCR to reveal their expression patterns during the development of F. velutipes. There are 4 and 6 exons with total length of 693 and 978 bp in fvsmt2 and fvsmt1, respectively. The deduced proteins, i.e., FVSMT1 and FVSMT2 contained 325 and 230 amino acids with molecular weight 36297 and 24894 Da, respectively. Both proteins contained a SAM-dependent catalytic domain with signature motifs (I, p-I, II, and III) defining the SAM fold. SAM-dependent catalytic domain is located either in the middle or at the N-terminal of FVSMT2 and FVSMT1, respectively. Alignment and phylogenic analysis showed that FVSMT1 is a homolog to a protein-arginine omega-N-methyltransferase, while FVSMT2 is of cinnamoyl CoA O-methyltransferase type and predicted subcellular locations of these proteins are mitochondria and cytoplasm, respectively. qRT-PCR showed that fvsmt1 and fvsmt2 expression was regulated in different developmental stages. The maximum expression levels of fvsmt1 and fvsmt2 were observed in stipe elongation, while no difference was found in mycelium and pileus. These results positively demonstrate that both the methyltransferase encoding genes are involved in the stipe elongation of F. velutipes.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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