Objective: The objective of this study was to identify candidate genes that play important roles in skeletal muscle development in ducks. Methods: In this study, we investigated the transcriptional sequencing of embryonic pectoral muscles from two specialized lines: Liancheng white ducks (female) and Cherry valley ducks (male) hybrid Line A (LCA) and Line C (LCC) ducks. In addition, prediction of target genes for the differentially expressed mRNAs was conducted and the enriched gene ontology (GO) terms and Kyoto encyclopedia of genes and genomes signaling pathways were further analyzed. Finally, a protein-to-protein interaction network was analyzed by using the target genes to gain insights into their potential functional association. Results: A total of 1,428 differentially expressed genes (DEGs) with 762 being up-regulated genes and 666 being down-regulated genes in pectoral muscle of LCA and LCC ducks identified by RNA-seq (p<0.05). Meanwhile, 23 GO terms in the down-regulated genes and 75 GO terms in up-regulated genes were significantly enriched (p<0.05). Furthermore, the top 5 most enriched pathways were ECM-receptor interaction, fatty acid degradation, pyruvate degradation, PPAR signaling pathway, and glycolysis/gluconeogenesis. Finally, the candidate genes including integrin b3 (Itgb3), pyruvate kinase M1/2 (Pkm), insulin-like growth factor 1 (Igf1), glucose-6-phosphate isomerase (Gpi), GABA type A receptor-associated protein-like 1 (Gabarapl1), and thyroid hormone receptor beta (Thrb) showed the most expression difference, and then were selected to verification by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). The result of qRT-PCR was consistent with that of transcriptome sequencing. Conclusion: This study provided information of molecular mechanisms underlying the developmental differences in skeletal muscles between specialized duck lines.
Song, Ji Eun;Kim, He Min;Lee, Sang-Chul;Park, Yoon-Gghil;Byeon, Suk-Ho;Lee, Young-Mock;Lee, Joon-Soo;Kim, Heung-Dong
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.52
no.4
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pp.471-475
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2009
Purpose : Mitochondrial disorders are a clinical entity characterized by diverse symptoms and signs of involvement of various systems. Furthermore, the disorders are known to show ophthalmologic manifestations as well as neurological findings. Visually evoked potential is a sensitive measure to check the integrity of the visual pathway. In this study, we have investigated the value of visually evoked potential in mitochondrial disorders with respiratory chain defects. Methods : Nineteen patients diagnosed with mitochondrial respiratory chain complex I defect as confirmed by spectrophotometric enzyme assay in muscle samples were enrolled for this study. The patients underwent a visually evoked potential study. We classified the results into four groups and compared these with clinical ophthalmologic findings. Results : Among the 19 patients, 14 showed abnormal visually evoked potential findings. Seven patients showed abnormal clinical ophthalmologic findings. All patients with abnormal ophthalmologic findings showed abnormal visually evoked potential findings. Among the 12 patients with normal ophthalmologic findings, seven showed abnormal results in visually evoked potential. Conclusion : Visually evoked potential study could be used as an effective screening tool for mitochondrial disorders to detect ophthalmologic and neurological abnormalities.
The objectives of this study is to compare the inhibitory mechanism of sodium nitroprusside and forskolin on the phorbol ester, activator of protein kinase C (PKC), -induced contractions in rat aorta. $0.1\;{\mu}M$ phorbol dibutyrate (PDBu) induced sustained contractions and increased phosphorylations of myosin light chain (MLC) time-dependently. At 30 min, the contractions and phosphorylations of MLC by PDBu were augmented maximally and remained constant. Moreover, $^{45}Ca^{2+}$ uptake was increased 30 min after PDBu stimulation from resting values. Sodium nitroprusside which activates guanylyl cyclase followed by increasing cGMP, inhibited the PDBu-induced contractions concentration-dependently. On the other hand, forskolin which activates adenylyl cyclase followed by increasing cAMP, also inhibited the PDBu-induced contractions concentration-dependently. However, sodium nitroprusside was more potent to inhibition of the PDBu-induced contractions than forskolin. Sodium nitroprusside inhibited $^{45}Ca^{2+}$ uptake by PDBu stimulation. Forskolin also inhibited $^{45}Ca^{2+}$ uptake by PDBu stimulation. Sodium nitroprusside and forskolin inhibited the phosphorylations of MLC by PDBu, respectively. However, sodium nitroprusside was more potent to inhibition of phosphorylations of MLC by PDBu than forskolin. From these results, Sodium nitroprusside via cGMP or forskilin via cAMP may reduce myoplasmic $Ca^{2+}$ followed by suppression of phosphorylations of MLC of PKC-mediated contractions, which results in vasodilation. However, cGMP may play a role more importantly than cAMP on the regulation of protein kinase C-mediated contraction in vascular smooth muscle.
Lee, Sun Ho;Jeon, Mina;Lee, Hyun Joo;Park, Dae Young;Kim, Se Hoon;Lee, Young-Mock
Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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v.15
no.2
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pp.72-77
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2015
Purpose: Deficits of the respiratory chain are reported to be the major cause of Leigh syndrome is said to be the underlying causes. The need for biochemical diagnosis to draw more accurate diagnosis or prognosis to support treatments is rapidly increasing. This study tried to analyze the aspects of clinical characteristics and biochemical diagnosis of mitochondrial respiratory chain complex (MRC) defect in Leigh syndrome, using methods of biochemical enzyme assay. Methods: We included total number of 47 patients who satisfied the clinical criteria of Leigh syndrome and confirmed by biochemical diagnosis. All those patients went through muscle biopsy to perform biochemical enzyme assay to analyze MRC enzyme in order to find the underlying cause of Leigh syndrome. Results: MRC I defect was seen in 23 (48.9%) cases taking the first place and MRC IV defect in 15 (31.9%) following it. There were 9 (19.2%) cases of combined MRC defect. Combined cases of type I and IV were detected in 7 (14.9%) patients while type I and V in 2 (4.3%). The onset age of symptom was less than 1 year old in 28 (59.6%). The most common early symptom, observed in 23 (48.9%), was delayed development, but there were other various neurological symptoms observed as well. In regard with the disease progression, 35 (74.5%) patients showed slowly progressive course, the one that progressed continuously but slowly over 2 years of period. As for Maximum motor development, 22 (46.8%) were bed-ridden state, most of them suffering serious delayed development. Patients showed various symptoms with different organs involved, though neuromuscular involvement was most prominent. Delayed development was seen in all cases. Multifocal lesion in brain MRI study was seen in 36 (76.6 %) cases, taking a greater percentage than 11 (23.4%) cases with single lesion. In MR spectroscopy study, the characteristic lactate peak of mitochondrial disease was identified in 20 (42.6%) patients. Conclusions: Further analysis of clinical and biochemical diagnosis on more extended group of patients with Leigh syndrome will enable us to improve diagnostic precision and to understand the natural course of mitochondrial disease.
Gong, W.H.;Tang, Z.L.;Han, J.L.;Yang, S.L.;Wang, H.;Li, Y.;Li, K.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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v.21
no.11
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pp.1544-1550
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2008
The retinoids (vitamin A and its derivatives) play a critical role in vision, growth, reproduction, cell differentiation and embryonic development. Using the IMpRH panel, porcine cellular retinol binding protein genes 5 and 7 (RBP5 and RBP7) were assigned to porcine chromosomes 5 and 6, respectively. The complete coding sequences (CDS) of the RBP5 and RBP7 genes were amplified using the reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) method, and the deduced amino acid sequences of both genes were compared to human corresponding proteins. The mRNA distributions of the two genes in adult Wuzhishan pig tissues (lung, skeletal muscle, spleen, heart, stomach, large intestine, lymph node, small intestine, liver, brain, kidney and fat) were examined. A total of nine single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in two genes. Three of these SNPs were analyzed using the polymerase chain reaction-restriction-fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method in Laiwu, Wuzhishan, Guizhou, Bama, Tongcheng, Yorkshire and Landrace pig breeds. Association analysis of genotypes of these SNP loci with economic traits was done in our experimental populations. Significant associations of different genotypes of $RBP5-A/G^{63}$, $RBP5-A/G^{517}$ and $RPB5-T/C^{intron1-90}$ loci with traits including maximum carcass length (LM), minimum carcass length (LN), marbling score (MS), back fat thickness at shoulder (SBF), meat color score (MCS) and hematocrit (HCT) were detected. These SNPs may be useful as genetic markers in genetic improvement for porcine production.
Park, Kyung-Hee;Lim, Jung-A;Kim, Jong-Hyun;Park, Eui-U
The Journal of the Korean Society for Microbiology
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v.34
no.5
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pp.471-478
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1999
Spirochetes were isolated from the midgut of Ixodes persulcatus ticks captured at Chungju, Korea and identified as Borrelia afzelii strains by polymerase chain reaction. To determine the pathogenicity of the B. afzelii strains isolated in Korea, the microbiological and pathological features of Lyme disease were observed in C3H/He mice after intraperitoneal inoculation of the fresh isolate of B. afzelii strain. The results are summarized as follows 1) The Borrelia were detected in the tissues of heart, spleen, kidney, urinary bladder and knee joint within 7 days after inoculation of infection by dark field microscopic examination. The isolation rate from heart, urinary bladder and joint was significantly higher than the rate from spleen, kidney, and blood samples. 2) The Borrelia was detected in heart muscle by indirect immunofluorescent antibody test. 3) Antibody to the Borrelia was detected as early as one week after inoculation. 4) The marked tropism of the Borrelia was observed in myocardial, urinary tract and joint tissue. The main pathological features are inflammation in tissues of heart, kidney, joint and urinary bladder. From these results, the Borrelia afzelii strain isolated in Korea were determined as pathogenic strain.
Journal of Physiology & Pathology in Korean Medicine
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v.32
no.1
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pp.30-34
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2018
This research was practiced to comparative investigate the distribution of sensory and motor neuron linkaged with Yangji(TE4) by using neural-tracer technology. A total 16 S-D rats were used in the present research. After anesthesia, the rats received micro-injection of $6{\mu}{\ell}$ of cholera toxin B subunit(CTB) into the relation positions of the Yangji(TE4), in the human body for observing the distribution of the linkaged sensory neurons in dorsal root ganglia(DRGs) and motor neurons in the spinal cord(C3~T4) and sympathetic ganglia. 3 days after the micro injection, the rats were anesthetized and transcardially perfused saline and 4% paraformaldehyde, followed by routine section of the DRGs, sympathetic chain ganglia(SCGs) and spinal cord. Marked neurons and nerve fibers were detected by immunohistochemical method and observed by light microscope. The marked neurons were recorded and counted. From this study the distribution of primary sensory and motor neurons linkaged with Yangji(TE4) were concluded as follows. Yangji(TE4) dominated by spinal segments of C5~T1, C6~T4, individually.
Sin, Seong-Cheol;Sin, Gi-Hyeon;Park, Jong-Geun;Lee, Jun-Je;Baek, Myeong-Gi;Heo, Yeon-Beom;Chae, Ji-Seon;Jeong, Gu-Yong;Jeong, Ui-Ryong
Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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2005.10a
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pp.119-122
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2005
본 연구는 한우 근내 지방 축적 기작을 구명하고 고급육과 저급육에서 차등 발현되는 유전자를 발굴 동정하여 한우 육질 진단을 위한 분자 표지 마커로 활용하기 위해 GeneFishing PCR 기법을 이용하여 한우 육질등급에 따른 등심조직에서 차등적으로 발현되는 유전자를 분석하였다. 한우 육질 등급($1^+$ 등급 vs 3 등급)간에 총 10개의 차등 발현 유전자가 확인되었고 이 가운데 고급육 한우 등심에서 발현량이 높은 유전자가 4개 그리고 저급육 등심에서 발현량이 높은 유전자 6개가 각각 검출되었다. 발현량 차이 유전자를 cloning하여 염기서열을 분석하고 상동성 검색을 실시한 결과 고급육에서 발현량이 높은 DEG는 주로 EST(expressed sequence tag) 유전자들로 밝혀졌고 저급육에서 발현량이 높은 DEG는 malate dehydrogenase 2(MDH2), myosin heavy chain 2a, triosephosphate isomerase 1(TPI 1), actin, alpha 1, skeletal muscle(ACTA1 ) 유전자들로 동정 되었다. 본 연구를 통해 한우 육질간 차등 발현되는 유전자들은 한우 육질 및 등급판정을 위한 표지인자(marker)로 활용할 수 있어 유전자 마커를 이용한 고급육 생산 한우의 육질 조기진단이 가능할 것이다.
The Journal of Korean Academy of Orthopedic Manual Physical Therapy
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v.7
no.2
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pp.23-39
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2001
Dysfunction of the anterior and dorsal muscles of the trunk have been studied in relation to low back pain of many years. Many muscles of the trunk are capable of contributing to the stabilization and protection of the lumbar spine, recent evidence has suggested that transversus abdominis may be critically involved and has been the focus of rehabilitation. The delay in onset of contraction of trunk muscles associated with movement of the upper or lower limb in patients with low back pain indicates a significant deficit in the automatic motor command for control of disturbance to the spine. The function of transversus abdominis has been largely ignored in the evaluation of spinal stabilization and protection. The most essential stabilizing muscles for the lumbar column are the transversus abdominis and the multifidus. Sling exercise therapy(SET) concept consists of a system of diagnosis and treatment. The system of diagnosis involves testing the muscle's tolerance through progressive loading in open and close kinetic chains. The SET system contains elements such as relaxation, increasing the range of movement, traction, training the stabilizing musculature, sensorimotor exercises, training in open and close kinetic chains, dynamic training of the mobilizing musculature, cardiovasc+ular exercises, group exercise, personal exercise at home. Sensorimotor training is an essential element of the SET concept. The emphasis is on closed kinetic chain exercises on an unstable surface, thereby achieving optimum stimulation of the sensorimotor apparatus.
The polyherbal drug Gyeongshingangjeehwan 18 (GGEx18) from Rheum palmatum L. (Polygonaceae), Laminaria japonica Aresch (Laminariaceae), and Ephedra sinica Stapf (Ephedraceae) has traditionally been used as an antiobesity drug in Korean local clinics. This study investigates the effects of GGEx18 on pancreatic fibroinflammation in high-fat diet (HFD)-fed obese C57BL/6J mice and the molecular mechanism involved in this process. After HFD-fed obese C57BL/6J mice were treated with GGEx18 (125, 250, and 500 mg/kg) for 12 weeks, variables and determinants of obesity, pancreatic inflammation, and fibrosis were measured using histology, immunohistochemistry, and real-time polymerase chain reaction. Administration of GGEx18 at 500 mg/kg/day to obese mice decreased body weight gain, mesenteric adipose tissue mass, and adipocyte size. GGEx18 treatment not only reduced mast cells and CD68-immunoreactive cells, but also decreased collagen levels and ${\alpha}$-smooth muscle actin-positive cells in the pancreas of HFD-fed mice. Concomitantly, GGEx18 decreased the expression of genes for inflammation (i.e., CD68 and tumor necrosis factor ${\alpha}$) and fibrosis (i.e., collagen ${\alpha}1$ and transforming growth factor ${\beta}$) in the pancreas of obese mice. These results suggest that GGEx18 may inhibit visceral obesity and related pancreatic fibroinflammation in HFD-fed obese mice.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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