• 대한의용생체공학회:의공학회지
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• 제43권2호
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• pp.94-101
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• 2022

Recent advancement of micro/nano technology enables the development of diverse micro/nano particle-based delivery systems. Due to the multi-functionality and engineerability, particle-based delivery system are expected to be a promising method for delivery to the target cell. Since the particle-based delivery system should be delivered to the various kinds of target cell, including the cardiovascular system, cancer cell etc., it is frequently decorated with multiple kinds of targeting molecule(s) to induce specific interaction to the target cell. The surface decorated molecules interact with the cell surface expressed molecule(s) to specifically form a firm adhesion. Thus, in this study, the probability of adhesion is estimated to predict the possibility to form a firm adhesion for the multi-ligand decorated particle-based delivery system.

• Molecules and Cells
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• 제27권6호
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• pp.629-634
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• 2009

G protein-coupled receptors (GPCRs) are part of multi-protein networks called 'receptosomes'. These GPCR interacting proteins (GIPs) in the receptosomes control the targeting, trafficking and signaling of GPCRs. PDZ domain proteins constitute the largest protein family among the GIPs, and the predominant function of the PDZ domain proteins is to assemble signaling pathway components into close proximity by recognition of the last four C-terminal amino acids of GPCRs. We present here a machine learning based approach for the identification of GPCR-binding PDZ domain proteins. In order to characterize the network of interactions between amino acid residues that contribute to the stability of the PDZ domain-ligand complex and to encode the complex into a feature vector, amino acid contact matrices and physicochemical distance matrix were constructed and adopted. This novel machine learning based method displayed high performance for the identification of PDZ domain-ligand interactions and allowed the identification of novel GPCR-PDZ domain protein interactions.

• Radiation Oncology Journal
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• 제22권2호
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• pp.77-90
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• 2004

종양 발생 과정에 관여되고 있는 분자 생물학적 기전을 직접 공격해 보자고 하는 치료 방침은 암 치료에 있어서 아주 유망한 치료방법의 하나로 인정되고 있다. Epidermal growth factor receptor (EGFR) 수용체에 여러 ligands가 결합하게 되면 발암 단계에서부터 암의 진행 과정과 전이 과정 그리고 방사선에 대한 저항성과 관련된 여러 가지중요한 신호전달체계를 활성화시킨다. 특히 진행된 두경부 암 환자들에서 EGFR이 과발현 된 경우에는 매우 불량한 예후를 나타내고 있기 때문에 이러한 signaling pathway의 selective targeting을 위한 많은 임상 시도가 이루어지고 있다. 현재까지 알려진 표적치료 항암제로는 크게 EGFR에 대한 monoclonal antibody와 tyrosin kinase Inhibitors로 대별될 수 있는데 이와 같은 약제들은 여러 xenograft에서 고무적인 실험 결과들이 입증되어 곧 바로 임상 현장에서 적용되고 있다. 그러나 기대와는 달리 EGFR Inhibitor 단독으로 치료한 초기 임상연구 결과들을 보면 극히 소수의 환자에서만 미미한 효과를 나타내고 있고, 방사선 치료와의 병용치료에서도 괄목할만한 항암 효과를 보여주지 않고 있다. 그럼에도 불구하고 많은 실험적 데이터로부터 여러 가지 생물학적 이점이 밝혀져 있고 또 미래 지향적인 치료법의 하나로 각광을 받고 있기 때문에 현재 많은 연구자들은 어떤 환자 군에서 이러한 표적 치료가 도움이 될 것이며, 방사선 치료 또는 항암 치료와는 어떤 방식으로 조합할 것인지, 또 그 순서는 어떻게 할 것이며, 또 환자 선정에 있어 reliable marker는 무엇인지, 어떻게 체내에서 신호 전달체계의 효과적인 차단을 확인할 수 있겠는지, 또한 multiple targ리ed therapy가 필 요하도록 하는 targeted agent에 대 한 Intrinsic 또는 acquired resistance의 기전은 무엇인지 등등, 현재 당면하고 있는 많은 문제점을 규명하고자 노력하고 있다. 특히 EGFR-signaling pathway를 표적으로 하는 표적 지향적 방사선 치료를 위한 translation research의 적절한 모델이 되고 있는 두경부 암 환자에서 이러한 제반 문제점을 해결하기 위해서는 더 많은 임상 연구와 함께 well-Integrated laboratory clinical research program이 필요할 것으로 생각된다 또한 EGFR antagonist 외에도 anglogenlc pathway나 cell-cycle pathway를 표적으로 하는 새로운 약제들이 계속 개발되고 있고 이에 관한 연구가 활발히 진행 중이다. 따라서 이 고찰에서는 두경부 암 환자에서 이러한 약제들을 방사선 치료와 병용하였을 때의 임상 연구 결과들을 재검토해 보고 부가적으로 EGFR blockade에 따르는 내성 문제 그리고 방사선 치료를 병용하면서 여러 표적을 동시에 차단시키는 multiple-targeted therapy의 개발 현황을 간략히 소개하고자 한다