A new species of marine Halacaridae, Copidognathus laevisetosus is recorded from Yeongdeok coast, Korea. In morphological aspects, the present new spe챠es is closely related to C. koreanus Chatterjee and Chang. Morphological similarities and dissimilarities between them are discussed. Copidognathus cerberoideus Bartsch is reported here for the first time from Korea and away from its type locality.
Sung-Eun Cho;Young-Nam Kwag;Sang-Kuk Han;Dong-Hyeon Lee;Chang Sun Kim
The Korean Journal of Mycology
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v.50
no.2
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pp.115-123
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2022
Two new records of Scleroderma species from South Korea are described here. Comprehensive taxonomic studies of Scleroderma specimens were conducted at the Korea National Arboretum. Based on morphological and molecular data (fungal barcode sequences), two new records (S. laeve and S. nastii) were confirmed. Herein, morphological descriptions, including Scanning Electron Microscope (SEM) images of basidiospore ornamentation, and a taxonomic key of Korean Scleroderma species are provided.
Sung-Eun Cho;Dong-Hyeon Lee;Eui Kyeong Kim;Keum Chul Shin;Nam Kyu Kim
The Korean Journal of Mycology
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v.51
no.3
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pp.167-177
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2023
In 2022, our investigation focused on exploring the macrofungal diversity in South Korea. Through the examination of morphological characteristics and ITS sequences of the rDNA, we successfully identified four unrecorded species (Laccaria striatula, Leotia atrovirens, Malvipezia emileia, Xerula strigosa). Detailed morphological descriptions, accompanied by photographs and molecular phylogenetic analyses were performed.
A numerical taxonomy based on the phenetic characters of 59 Korean Pterostichini species is conducted to determine the effect on the assessment of the 7 different methods combined by 3 similarity or dissimilarity coefficients, using 87 morphological multistate characters.
Proceedings of the Korean Society of Plant Pathology Conference
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2003.10a
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pp.115.1-115
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2003
Post-harvest decay, caused by Penicillium spp. is a serious problem of fruits worldwide. Morphological characteristics and molecular markers were used to characterize 22 Penicillium isolates from apples, 18 isolates from pears, 60 from oranges and 18 from grapes and 23reference isolates representing related Penicillium spp. to assess their diversity and resolve their taxonomy. Based on morphological and physiological characteristics, the isolates were grouped as identical or very similar to P. digitatum, P. italicum, P. ulaiense or very similar to P. crustosum, P. expansum, P. solitum and unidentified Penicillium spp. Based on sequence comparisons of ITS region, variable site were presented within and among the species, but there variation were not correlated with the species. Cluster analyses of AP-PCR fragment patterns using UP and L45 primer and the -tubulin gene sequence, the Penicillium species were segregated into distinct groups. Particularly. the -tubulin partial sequence data provided support for species concepts based on morphological and physiological characteristics.
Wang, Pengbin;Park, Bum Soo;Kim, Jin Ho;Kim, Joo-Hwan;Lee, Hae-Ok;Han, Myung-Soo
ALGAE
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v.29
no.2
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pp.57-73
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2014
Amphora Ehrenberg ex Kutzing sensu lato is a common and widespread benthic diatom genus with a taxonomy that has been under continual revision, particularly based on molecular analyses. Although Amphora species have been studied using modern microscopy in recent years, there has not been much progress on molecular characterization of the species, especially in Asia. In this study of Amphora, sampling was carried out from September 2009 to August 2010 in Korean coastal waters. The morphological and molecular characteristics of eight Amphora sensu lato were examined: Amphora marina, A. proteus, Halamphora costata, H. coffeaeformis, H. eunotia, H. holsatica, H. terroris, and Halamphora sp. Based on previous accounts, morphology suggested that A. marina and A. proteus belong to the subgenus Amphora Cleve, which have smooth girdle bands and rather coarse and very distinct areolae on the valve. The other species, H. coffeaeformis, H. costata, H. eunotia, H. holsatica, H. terroris, and Halamphora sp. belong to the subgenus Halamphora Cleve, which was recently elevated to generic status by Levkov 2009, have plicate girdle bands, puncta which do not form straight longitudinal lines, valves which have a narrow ventral portion and apices that are generally rostrate-capitate and recurved. In agreement with analysis based on morphological characteristics, phylogenetic analysis based on small subunit rDNA suggested that the eight Amphora sensu lato species were not a monophyletic group as the morphological classification. Also, the results of molecular work and statistical analysis on all these Amphora sensu lato combined with phylogenic analysis on our geographically representative samples give strong evidence that Halamphora Levkov is independent of Amphora Cleve. Furthermore, in this study, Amphora terroris was transferred Halamphora as Halamphora terroris (Ehrenberg) Wang comb. nov. and Amphora marina was recorded for the first time in Korea.
Neosiphonia japonica is a rhodomelacean red alga that occurs in Korea, Japan, China, far-east Russia, northwest America, and New Zealand. Although it is distinguished by a bush-like habit having four pericental cells with cortication and numerous branches on axes, the taxonomy of N. japonica is still problematic. To investigate the taxonomy and phylogeny of the species, we analyzed rbcL and phycoerythrin (cpeA/B) genes from 19 samples of N. japonica and putative relatives. Phylogenetic trees from both genes show that N. japonica from Korea, Japan, New Zealand, and USA is clearly separated from N. decumbens, N. harlandii, and N. flavimarina from the Pacific Ocean. Instead, N. harveyi from the Atlantic Ocean was more related to N. flavimarina than to N. japonica. This result supports morphological and distributional differences between N. japonica and N. harveyi. However, the close relationship between these species suggests that they might have a recent most common ancestor. This is the second report to use the cpeA/B gene for evaluating species diversity in the Rhodophytes.
The taxonomy of the Isodon excisus complex has been ambiguous and problematic because the morphological characters, especially characters related to the leaf distinguishing subgroups of the complex in the original descriptions, are variable. To elucidate the taxonomic structure of the I. excisus complex in Korea, 34 characters were measured from 70 OTUs representing different locations and analyzed by principal component analysis (PCA). The analysis showed that principle component axis 1, 2, 3 (PC1, PC2, PC3) represents 52.0% of the total variance and characters showing high loading values for PC1 were leaf shape, density of non-glandular hairs on the lower surface of the leaf, and characters related to the teeth of the leaf. The length of apical tooth and the angle between two widest points of the leaf were highly correlated to PC2 and PC3, respectively. Three-dimensional scatter plotting of OTUs for PC1, PC2, and PC3 axis showed that the areas of previously recognized three subgroups of I. excisus completely overlapped. Our result supported that just one taxon, I. excisus var. excisus, should be recognized in the complex at the variety level.
LIU Hua;MOON Eun-Kyung;YU Hak-Sun;JEONG Hae-Jin;HONG Yeon-Chul;KONG Hyun-Hee;CHUNG Dong-Il
Parasites, Hosts and Diseases
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v.43
no.1
s.133
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pp.7-13
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2005
The taxonomy of Acanthamoeba spp., an amphizoic amoeba which causes granulomatous amoebic encephalitis and chronic amoebic keratitis, has been revised many times. The taxonomic validity of some species has yet to be assessed. In this paper, we analyzed the morphological characteristics, nuclear 18s rDNA and mitochondrial 16s rDNA sequences and the Mt DNA RFLP of the type strains of four Acanthamoeba species, which had been previously designated as A. divionensis, A. parasidionensis, A. mauritaniensis, and A. rhysodes. The four isolates revealed characteristic group II morphology. They exhibited 18S rDNA sequence differences of $0.2-1.1\%$ with each other, but more than $2\%$ difference from the other compared reference strains. Four isolates formed a different clade from that of A. castellanii Castellani and the other strains in morphological group lion the phylogenetic tree. In light of these results, A. paradivionensis, A. divionensis, and A. mauritaniensis should be regarded as synonyms for A. rhysodes.
Comparison of morphological characters and development of eggs and larvae of two bitterlings, Acheilognathus limbata and A. signifer from Korea were observed and discussed taxonomically. A. signifer differs from A. limbata by the color pattern of dorsal and anal fin ray of male, egg form and the length of ovipositor of female. Although two species are overlapping each other in some morphometric characters, there is a great difference between the two in the multivariate analysis of 15 morphological characters of five comparative populations. These results indicate that A. limbata and A. signifer are two independent allopatric sibling species in Korea.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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