자연산 보리새우(Penaeus japonicus) 모하의 병리검사 결과 사상체의 mollicute와 유사한 미생물의 감염을 확인하였다. 검사에 사용된 보리새우 모하는 일본산이며, 한국으로 수입되었다. 일반 조직검사 결과 병리학적인 변화는 관찰되지 않았다. 투과전자현미경적 관찰 결과 간췌장 상피세포에서 세포내 다형태성 사상체 세균의 광범위한 감염을 발견하였다. 사상체 세균은 직경이 약 60nm이며, 길이가 300nm에서 $1{\mu}m$ 이상의 크기를 나타내었다. 이 세균의 구조는 사상체이며, 끝마디를 가진 가지로 분지 되는 특징을 보였다. 세포벽은 없으며, 원형질막으로만 둘러싸여 있었으며, 전형적인 원핵세포성 리보소음과 선형 DNA와 유사한 가닥을 가지고 있었다. 그 외 다른 세포내 기관은 관찰되지 않았다. 이러한 형태적인 특징들과 세포내 감염부위로 볼 때 이 세균은 mollicutes로 판단된다.
An oligonucleotide array was developed to detect and genotype mollicutes based on the internal transcribed spacer (ITS) sequence. The results of the assay were compared with those of a PCR-RFLP assay. The proposed oligonucleotide array containing 5 genus- and 23 species-specific probes was able to detect Mycoplasma species, including M. penetrans and M. spermatophilum, that were not detected by the PCR-RFLP assay. Therefore, the results demonstrated that the proposed oligonucleotide array was effective for the detection and discrimination of 23 species, including an acholeplasma, 21 mycoplasmas, and a ureaplasma, and showed promise as a countermeasure to ensure that biological products are safe and of good quality.
본 연구에서는 유산균과 다시마가 항비만과 장내 미생물에 미치는 영향을 조사하기 위하여 8주령의 수컷 흰쥐를 1 cage 당 3 마리씩 4반복하여 처리군 당 12마리를 사용하였으며, 대조구 기초사료에 고지방사료 처리구는 10% lard를 첨가하고, 여기에 5% 유산균($5{\times}10^8cfu$, Lactobacillus rhamnosus, Lactobacillus johnsonii, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium lactis) 첨가구, 5% 유산균과 10% 다시마를 혼합 첨가한 처리구로 구분하였다. 고지방사료 처리군에 비해 유산균 처리군과 다시마와 유산균 혼합 처리군은 체중과 일당 증체량의 감소를 나타내었다. 장내미생물을 pyrosequncing 방법으로 확인한 결과, 고지방사료 처리군에 비해 유산균 처리군과 다시마와 유산균 혼합 처리군은 Firmicutes 비율이 감소하고, Bacteroidetes의 비율이 증가하였으며, Firmicutes/Bacteroidetes (F/B) 비율은 감소하였다. 또한 이 두 처리군은 Firmicutes 문에 속하는 비만 관련 미생물 Roseburia, Mollicute, Erysipelotrichi, Oscillibacter가 감소하였고, 반면에 Bacteroidetes 문에 속하는 항비만 관련 미생물 Prevotella, Alistipes, Bacteroides는 증가하였다. 분변 내 단쇄지방산(short chain fatty acid; SCFA) 은 다시마와 유산균을 섭취한 처리군에서 butyric acid 함량이 높게 나타났다. 결론적으로, 다시마와 유산균의 혼합 처리는 항비만 효과를 나타내며 장내 미생물 변화를 유도하고 장내 대사 물질인 butyric acid의 함량을 높이는 것을 시사한다.
저자들은 이전에 711개의 원핵생물에서 COG (Clusters of Orthologous Groups of proteins)를 분석한 결과를 보고하였다. COG 데이터베이스는 2020년에 1,309개의 원핵생물 게놈들을 사용하여 대폭 업데이트되었다. 이에 COG와 원핵생물 측면에서 업데이트된 4,877개의 COG를 구성하는 3,455,853개의 단백질들에 대한 분석 결과를 보고한다. 각 원핵생물이 보유한 COG 종류의 수는 97에서 2,281개의 사이였으며, 평균은 1,430.0개이고 표준편차는 414.2개였다. 문(phylum) 수준에서 보유 COG의 평균 수는 Mollicutes가 497.86개로 최소였고, Cyanobacteria가 1,642.90개로 최대였다. 가장 높은 보유 COG 개수를 가진 상위 10개 종은 모두 Proteobacteria였으며, 하위 10개 중 9개는 시험관 내에서 배양할 수 없는 Candidatus 구성원이었다. 각 COG에 속하는 단백질의 수는 2개에서 22,048개 사이였으며, 상위 11위 COG들은 12,000개 이상의 단백질을 포함하였다. 상위 11개 중 5개는 DNA에 결합하고 유전자 발현에 관여하는 COG로, 원핵생물에서 유전자 발현 조절의 중요성을 알 수 있었다. COG 데이터 베이스는 게놈에 포함된 유전자를 식별하고 균주 개선을 위한 유전자를 선택하는 데 사용할 수 있어 많은 활용이 기대된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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