• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권10호
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• pp.1331-1342
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• 2021

In this study, we evaluated the mechanism of long non-coding RNA MIR22 host gene (LncRNA MIR22HG) in osteosarcoma cells. Forty-eight paired osteosarcoma and adjacent tissues samples were collected and the bioinformatic analyses were performed. Target genes and potential binding sites of MIR22HG, microRNA (miR)-629-5p and tet methylcytosine dioxygenase 3 (TET3) were predicted by Starbase and TargetScan V7.2 and confirmed by dual-luciferase reporter assay. Cell Counting Kit-8, colony formation and flow cytometry assays were utilized to determine the viability, proliferation and apoptosis of transfected osteosarcoma cells. Pearson's analysis was introduced for the correlation analysis between MIR22HG and miR-629-5p in osteosarcoma tissue. Relative expressions of MIR22HG, miR-629-5p and TET3 were measured by quantitative real-time polymerase chain reaction or Western blot. MiR-629-5p could competitively bind with and was negatively correlated with MIR22HG, the latter of which was evidenced by the high expression of miR-629-5p and low expression of MIR22HG in osteosarcoma tissues. Overexpressed MIR22HG repressed the viability and proliferation but enhanced apoptosis of osteosarcoma cells, which was reversed by miR-629-5p upregulation. TET3 was the target gene of miR-629-5p, and the promotive effects of upregulated miR-629-5p on the viability and proliferation as well as its repressive effect on apoptosis were abrogated via overexpressed TET3. To sum up, overexpressed MIR22HG inhibits the viability and proliferation of osteosarcoma cells, which was achieved via regulation of the miR-629-5p/TET3 axis.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권4호
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• pp.610-620
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• 2021

There has been increasing interest in the head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) that is caused by high-risk human papillomavirus (HR-HPV) and has posed a significant challenge to Otolaryngologists. A rapid, sensitive, and reliable method is required for the detection of HR-HPV in clinical specimens to prevent and treat HPV-induced diseases. In this study, a multiple cross-linking spiral amplification (MCLSA) assay was developed for the visual detection of HPV-16. In the MCLSA assay, samples were incubated under optimized conditions at 62℃ for 45 min, and after mixing with the SYBR Green I (SGI) dye, the positive amplicons showed bright green fluorescence while the negative amplicons exhibited no obvious change. The specificity test revealed that the developed MCLSA technique had high specificity and could effectively distinguish all five HPV-16 strains from other pathogenic microorganisms. In terms of analytical sensitivity, the limit of detection (LoD) of MCLSA assay was approximately 5.4 × 101 copies/tube, which was 10-fold more sensitive than loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and RT-PCR. The detection results of laryngeal cancer specimens collected from 46 patients with suspected HPV infection in the Liaoning region demonstrated that the positive detection rates of MCLSA and hybridized capture 2 kit were 32.61% (15/46). The true positive rate of the MCLSA assay was higher than that of RT-PCR (100% vs. 93.33%) and LAMP (100% vs. 86.67%). Therefore, the MCLSA assay developed in the present study could be a potentially useful tool for the point-of-care (PoC) diagnosis of HR-HPV, especially in resource-limited countries.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제44권2호
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• pp.17.1-17.10
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• 2019

Objectives: Root resorption is an unexpected complication after replantation procedures. Combining anti-osteoclastic medicaments with retrograde root filling materials may avert this resorptive activity. The purpose of this study was to assess effects of a cathepsin K inhibitor with calcium silicate-based cements on osteoclastic activity. Methods: MC3T3-E1 cells were cultured for biocompatibility analyses. RAW 264.7 cells were cultured in the presence of the receptor activator of nuclear factor-kappa B and lipopolysaccharide, followed by treatment with Biodentine (BIOD) or ProRoot MTA with or without medicaments (Odanacatib [ODN], a cathepsin inhibitor and alendronate, a bisphosphonate). After drug treatment, the cell counting kit-8 assay and Alizarin red staining were performed to evaluate biocompatibility in MC3T3-E1 cells. Reverse-transcription polymerase chain reaction, tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP) staining and enzyme-linked immunosorbent assays were performed in RAW 264.7 cells to determine the expression levels of inflammatory cytokines, interleukin $(IL)-1{\beta}$, IL-6, tumor necrosis $factor-{\alpha}$ ($TNF-{\alpha}$) and prostaglandin E2 (PGE2). Data were analyzed by one-way analysis of variance and Tukey's post hoc test (p < 0.05). Results: Biocompatibility results showed that there were no significant differences among any of the groups. RAW 264.7 cells treated with BIOD and ODN showed the lowest levels of $TNF-{\alpha}$ and PGE2. Treatments with BIOD + ODN were more potent suppressors of inflammatory cytokine expression (p < 0.05). Conclusion: The cathepsin K inhibitor with calcium silicate-based cement inhibits osteoclastic activity. This may have clinical application in preventing inflammatory root resorption in replanted teeth.

• 한국동물생명공학회지
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• 제38권4호
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• pp.291-299
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• 2023

Background: Leydig cells, crucial for testosterone production, express ion channels like ANO1 that influence hormone secretion. This study investigates the expression and role of the Tandem of P domains in a weak inward rectifying K⁺ channel-related Acid-Sensitive K⁺-1 (TASK-1) channel in these cells, exploring its impact on testicular function and steroidogenesis. Methods: TASK-1 expression in Leydig cells was confirmed using immunostaining, while RT-PCR and Western Blot (WB) validated its expression in the TM3 Leydig cell line. The effect of a TASK-1 channel blocker on cell viability was assessed through live/dead staining and MTT assays. Additionally, the blocker's effect on testosterone secretion was evaluated by measuring testosterone levels. Results: Immunohistochemical analysis revealed a predominant presence of TASK-1, along with c-Kit and ANO-1, in Leydig cells adjacent to seminiferous tubules and also in Sertoli and spermatogenic cells. Expression levels of TASK-1 mRNA and protein were significantly higher in TM3 Leydig cells compared to TM4 Sertoli cells. In addition, blocking TASK-1 in TM3 cells with ML365 induced cell death but did not affect LH-induced testosterone secretion. Conclusions: These findings suggest that TASK-1 in Leydig cells is crucial for their viability and proliferation, highlighting its potential importance in testicular physiology.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제43권1호
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• pp.30-37
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• 1996

연구배경: 본 연구는 결핵의 조기검출을 위하여, PCR을 이용하는데 있어서의 중요한 문제점의 하나인 임상검체로부터 결핵균을 분리 방법을 개선하여, 교차오염의 가능성을 최소화하고 PCR에 의한 결핵균의 DNA검출을 보다 쉽고 안전하게 실시하여 대량의 검체를 처리해야하는 일상 임상검사법으로 정착시키고자 하는데 그 목적이 있다. 방법: 다양한 방법으로 DNA를 검출하여 동일한 방법으로 PCR을 수행하여 이차 PCR 산물의 전기영동 결과를 AFB도말 및 배양검사 결과와 함께 비교하여 감수성, 특이성, 양성예측도 및 음성예측도의 항목으로 비교분석하였다. 실험 1은 Proteinase K 처리후 phenol로 추출하는 방법과 Chelex 100 이온교환 수지를 이용한 InstaGene법을 100예에서 비교하였으며, 실험 2에서는 Microwave 처리후 원침 상청액을 직접 시용하는 방법과 Chelex 100 이온교환 수지를 이용한 InstaGene 법을 98예에서 비교하였다. 결과: 세 DNA 분리법으로 실시한 PCR결과에서 모두 특이성과 양성예측도가 매우 낮았다. 실험 1에서 Proteinase K 법에 의한 경우 보다 Insta Gene을 이용한 경우에 약 20% 높은 감수성과 10%~20% 높은 음성예측도를 보이고 있으며, 특이성은 2%~8% 낮고, 양성예측도는 2.5%~4% 높은 것으로 나타났다. 실험 2에서는 Microwave법과 Insta Gene을 이용한 경우에 거의 비슷한 결과를 보였다. 결론: 결핵진단시 PCR을 위한 객담검체에서의 DNA 분리시에 Microwave법과 $InstaGene^{TM}$ DNA분리 kit가 매우 효율적이며, 특히 InstaGene법이 교차오염의 가능성이 거의 없고, 처리 시간이 짧으며, 조작이 매우 간단하며 매우 경제적인 것으로 나타났다. 다만 특이성을 더욱 높일 수 있도록 연구가 추가되어야 할 것이며 일반 인구집단에서 충분한 임상검체를 대상으로 연구가 추가되면 InstaGene법의 유용성이 더욱 확실히 검증 될 것으로 사료된다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제7권1호
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• pp.59-66
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• 2010

목 적: QF-PCR법은 흔한 염색체 이수성에 대한 빠른 산전 진단을 가능하게 하는데, 낮은 가격, 빠른 속도, 그리고 자동화가 가능하여 한꺼번에 많은 검체에 대해 적용할 수 있다는 장점들이 있다. 하지만 아직까지 국내에서 QF-PCR법은 산전 염색체 이수성 선별검사로 주로 사용되는 방법이 아니다. 본 연구에서는 한국인에서 빠른 산전 진단을 목적으로 시행하는 짧은 염기서열 반복(short tandem repeats, STR) 표지자를 이용한 QF-PCR법의 수행능을 검증하고자 한다. 대상 및 방법: 2007년에서 2009년까지 산전 염색체 이수성 선별을 목적으로 의뢰된 847개의 양수 검체에 대해 QF-PCR법을 시행하였는데 13번, 18번, 21번, X, Y염색체에 위치한 총 20개의 STR 표지자로 구성된 Elucigene kit (Gen-Probe, Abingdon, UK)를 사용하였다. 총 847개의 양수 검체에 대한QF-PCR 결과는 염색체 검사 결과와 비교하였고, STR 표지자의 정보력을 평가하기 위해서 각 표지자에 대해 이형접합체 지수(heterozygosity index)를 구하였다. 결 과: 총 847개 양수 검체에 대한 QF-PCR 검사 결과 19개(2.2%, 19/847)에서 13, 18, 21번 염색체와 X, Y염색체의 수적 이상이 관찰되었는데 염색체 검사에서도 동일한 결과를 보여100% 양성 예측율을 나타냈다. 하지만 염색체 검사 결과 7개(0.8%, 7/847) 검체에서 5개의 균형전좌와 2개의 불균형 염색체 이상이 관찰되었으나 QF-PCR에서는 진단되지 않았다. STR 표지자의 평균 이형접합체 지수(he-terozygosity index)는 0.76으로 서양인에서 보고된 0.8에 비해 다소 낮았다. 본 연구에서 D13S634표지자의 미세수준의 중복(submicroscopic duplication)이 1.4% (12/847)에서 관찰되었는데 이는 한국인에서 특징적인 소견으로 생각된다. 결 론: 본 기관에서는 산전 염색체 이수성 선별을 위한 QF-PCR법을 검증하였으며 효율적이고 신뢰할 수 있는 방법임이 입증되었다. 하지만 QF-PCR결과를 해석하기 위한 지침을 만들기 위해서 검사실마다 독립적으로 각각의 STR표지자에 대한 검증이 필요하며, 또한 QF-PCR법을 통상적인 염색체 검사 업무흐름에 통합하는 것이 필요하다고 사료된다.

• Molecules and Cells
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• 제38권11호
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• pp.991-997
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• 2015

Tristetraprolin (TTP) is an AU-rich elements (AREs)-binding protein, which regulates the decay of ARE-scontaining mRNAs such as proto-oncogenes, anti-apoptotic genes and immune regulatory genes. Despite the low expression of TTP in various human cancers, the mechanism involving suppressed expression of TTP is not fully understood. Here, we demonstrate that Resveratrol (3,5,4'-trihydroxystilbene, Res), a naturally occurring compound, induces glioma cell apoptosis through activation of tristetraprolin (TTP). Res increased TTP expression in U87MG human glioma cells. Res-induced TTP destabilized the urokinase plasminogen activator and urokinase plasminogen activator receptor mRNAs by binding to the ARE regions containing the 3' untranslated regions of their mRNAs. Furthermore, TTP induced by Res suppressed cell growth and induced apoptosis in the human glioma cells. Because of its regulation of TTP expression, these findings suggest that the bioactive dietary compound Res can be used as a novel anti-cancer agent for the treatment of human malignant gliomas.

• Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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• 제47권1호
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• pp.54-60
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• 2020

Objective: Oxidative stress plays a key role in the pathogenesis of male infertility. But, the adverse effects of oxidative biomarkers on sperm quality remain unclear. This study aimed to investigate the levels of nitric oxide (NO), 8-hydroxydesoxyguanosine (8-OHdG), and total antioxidant capacity (TAC) oxidative biomarkers in seminal plasma and their relationship with sperm parameters. Methods: A total of 77 volunteers participated in the study, including fertile (n = 40) and infertile men (n = 37). NO, 8-OHdG, and TAC levels were measured using the ferric reducing ability of plasma, Griess reagent method and an enzyme-linked immunosorbent assay kit, respectively. Results: The mean values of sperm parameters in the infertile group were significantly lower than those in the fertile group (p< 0.001). The mean 8-OHdG in the seminal plasma of infertile men was significantly higher (p= 0.013) than those of controls, while the mean TAC was significantly lower (p= 0.046). There was no significant difference in NO level between the two groups. The elevated seminal 8-OHdG levels were negatively correlated with semen volume, total sperm counts and morphology (p< 0.001, p= 0.001 and p= 0.052, respectively). NO levels were negatively correlated with semen volume, total sperm counts and morphology (p= 0.014, p= 0.020 and p= 0.060, respectively). Positive correlations between TAC and both sperm count and morphology (p= 0.043 and p= 0.025, respectively) were also found. Conclusion: These results suggested that increased levels of NO and 8-OHdG in seminal plasma could have a negative effect on sperm function by inducing damage to the sperm DNA hence their fertility potentials. Therefore, these biomarkers can be useful in the diagnosis and treatment of male infertility.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제8권2호
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• pp.113-118
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• 2011

목적: Corticotropin-releasing hormone receptor type 1(CRHR1)은 자간전증과 같은 비정상적인 태반의 기능을 가지는 산모에서 감소되어 나타나며, 그것의 발현이나 기능은 유전적으로 영향을 받는다. 이번 연구의 목표는 한국인에서 CRHR1 유전자 다형성인 c.33+8199C>T과 자간전증 사이의 연관성을 조사하는 것이었다. 대상 및 방법: CRHR1 유전자 다형성은 SNapShot kit와 ABI Prism3100 Genetic analyzer를 이용하여 203명의 자간전증 임산부와 211명의 정상 임산부에서 측정되었고, 유전자 다형성과 자간전증 위험도 사이의 연관성을 분석하였다. 결과: CRHR1 유전자 다형성의 유전자형과 대립유전자 빈도는 자간전증 임산부와 정상 임산부 사이에 다르지 않았다. 자간전증 발생 위험도는 분석된 유전자 다형성의 드문 대립 형질(C)을 지닌 이종접합 유전자형(TC)이나 동형접합 유전자형(CC)을 수반하는 그룹에서 증가되지 않았다. CRHR1 유전자의 동형접합 유전자형(CC)을 수반하는 그룹에서 중증 자간전증과 조기 자간전증과 같은 자간전증의 합병증 발병 위험에도 차이가 없었다. 결론: 이 연구는CRHR1 유전자 다형성인 c.33+8199C>T가 한국인 임신부의 자간전증 발생과 연관이 없음을 나타낸다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제18권12호
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• pp.521-528
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• 2017

과도한 음주는 치매 및 알츠하이머 병과 같은 여러 신경계 질환을 일으키는 주요원인 중 하나로 알려져 있으며 이를 해결하기 위한 많은 노력인 진행 중이다. 또한, 홍삼은 신경 세포의 생존, 세포 자멸사의 억제 및 신경 세포의 신경 재생을 향상시키는 것으로 알려져 있다. 본 연구의 목적은 Rg3 풍부 고려홍삼 추출액(KRG)이 알코올 유발성 신경독성으로 인하여 일어나는 PC12 세포의 세포 사멸을 억제 할 수 있는지, 그리고 KRG가 caspase 매개 경로와 관련된 몇 가지 인자들을 어떻게 조절하는지 확인하는 것이다. 그 방법으로, 우리는 PC12 세포에서의 세포 생존율과 세포 사멸율은 EZ-Cytox 세포 생존율 측정 kit와 유세포 분석기로 측정하였고, 세포 자멸 관련 단백질(Bcl-2, Bax, caspase-3)의 발현 정도를 Western blot기법으로 측정하였으며, 측정된 결과의 유의성을 ANOVA 분석법으로 확인하였다. 그 결과, KRG는 Bcl-2의 발현을 증가시키고, Bid와 Bax 및 caspase-3 발현을 저해하였고, 이를 통해 알코올로 유도된 PC12 세포의 세포 사멸을 억제하였다. 이러한 결과를 통해, KRG에 의해 유도된 Bcl-2 발현의 증가와 Bid 및 Bax 발현의 하향 조절이 caspase-3 발현을 하향 조절하고, 결국 미토콘드리아 세포 사멸 경로를 억제한다는 것을 결론내릴 수 있었다. 본 연구는 향 후, KRG가 신경 보호제 후보로서 개발할 가치가 있음을 제시하였다.