• 제목/요약/키워드: Maximum-Length Sequence

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The complete chloroplast genome sequence of Korean Neolitsea sericea (Lauraceae)

  • PARK, Yoo-Jung;CHEON, Kyeong-Sik
    • 식물분류학회지
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    • 제51권3호
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    • pp.332-336
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    • 2021
  • The complete chloroplast (cp) genome sequence of Neolitsea sericea was determined by Illumina sequencing. The complete cp genome was 152,446bp in length, containing a large single-copy region of 93,796 bp and a small single-copy region of 18,506bp, which were separated by a pair of 20,072bp inverted repeats. A total of 112 unique genes were annotated, including 78 protein-coding genes (PCGs), 30 transfer RNAs, and four ribosomal RNAs. Among the PCGs, 18 genes contained one or two introns. A very low level of sequence variation between two cp genomes of N. sericea was found with seven insertions or deletions and only one single nucleotide polymorphism. An analysis using the maximum likelihood method showed that N. sericea was closely related to Actinodaphne trichocarpa.

고밀도 수직자기기록을 위한 저복잡도 잡음 예측 최대 유사도 검출 방법 (Low Complexity Noise Predictive Maximum Likelihood Detection Method for High Density Perpendicular Magnetic Recording:)

  • 김성환;이주현;이재진
    • 한국통신학회논문지
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    • 제27권6A호
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    • pp.562-567
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    • 2002
  • 잡음 예측 최대 유사도(noise predictive maximum likelihood, NPML) 검출기는 잡음 예측/백색화 과정을 비터비 검출기의 가지 메트릭 계산 과정에 삽입하여 데이터 검출의 신뢰성을 높이게 된다. 따라서 기존의 PRML 검출기에 잡음 예측기를 포함시킴으로써 그것의 실제 성능이 향상되고 복잡도가 줄어드는 이점이 있다. 본 논문에서는 선형 채널과 비선형 채널 하에서 랜덤 시퀀스와 런-길이 제한 (1,7) 시퀀스를 적용하여, 고밀도 수직 자기 기록 (1.7$\leq$K$_{p}$$\leq$3.0)에서 잡음 예측 PR-등화 신호에 의한 NP(1221)ML 검출 시스템이 보다 높은 타수의 PR(12321)ML 시스템보다 복잡도가 낮으면서 우월한 성능을 나타냄을 모의 실험을 통해 분석, 검증하였다.

Sequence Diversity in MIC6 Gene among Toxoplasma gondii Isolates from Different Hosts and Geographical Locations

  • Li, Zhong-Yuan;Song, Hui-Qun;Chen, Jia;Zhu, Xing-Quan
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제53권3호
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    • pp.341-344
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    • 2015
  • Toxoplasma gondii is an opportunistic protozoan parasite that can infect almost all warm-blooded animals including humans with a worldwide distribution. Micronemes play an important role in invasion process of T. gondii, associated with the attachment, motility, and host cell recognition. In this research, sequence diversity in microneme protein 6 (MIC6) gene among 16 T. gondii isolates from different hosts and geographical regions and 1 reference strain was examined. The results showed that the sequence of all the examined T. gondii strains was 1,050 bp in length, and their A + T content was between 45.7% and 46.1%. Sequence analysis presented 33 nucleotide mutation positions (0-1.1%), resulting in 23 amino acid substitutions (0-2.3%) aligned with T. gondii RH strain. Moreover, T. gondii strains representing the 3 classical genotypes (Type I, II, and III) were separated into different clusters based on the locus of MIC6 using phylogenetic analyses by Bayesian inference (BI), maximum parsimony (MP), and maximum likelihood (ML), but T. gondii strains belonging to ToxoDB #9 were separated into different clusters. Our results suggested that MIC6 gene is not a suitable marker for T. gondii population genetic studies.

프로그램 가능 최대길이 CA기반 의사난수열 생성기의 설계와 분석 (Design and Analysis of Pseudorandom Number Generators Based on Programmable Maximum Length CA)

  • 최언숙;조성진;김한두;강성원
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제15권2호
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    • pp.319-326
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    • 2020
  • PRNG(Pseudorandom number generator)는 안전한 온라인 통신을 위한 암호화 키 생성에 있어서 필수적이다. PRNG에 의해 생성되는 비트 스트림은 대칭키 암호 시스템에서 빅 데이터를 효과적으로 암호화할 수 있도록 고속으로 생성되어야 하며 또한 여러 통계적 테스트를 통과할 수준의 랜덤성을 확보해야 한다. CA(Cellular Automata) 기반의 PRNG는 하드웨어로 구현이 용이하고, LFSR기반의 PRNG보다 렌덤성이 우수하다고 알려져 있다. 본 논문에서는 대칭키 암호시스템에서 효과적인 키 수열을 생성할 수 있는 PMLCA(Programmable Maximum Length CA)기반의 PRNG를 설계한다. 제안하는 PRNG는 비선형 제어 방식을 통해 비트 스트림을 생성한다. 먼저 주기가 긴 선형 수열을 생성하는 단일 여원벡터를 갖는 (m,n)-셀 PMLCA ℙ 기반의 PRNG를 설계하고 주기와 생성다항식을 분석한다. 또한 ℙ와 주기가 같으면서 비선형 수열을 생성하는 두 개의 여원벡터를 갖는 (m,n)-셀 PC-MLCA기반의 PRNG를 설계하고 비선형 수열이 출력되는 위치를 분석한다.

실내 음향 측정 및 분석 기법 연구 (Room acoustic measurement and analysis)

  • 홍승욱;전진호;이신렬
    • 한국음향학회:학술대회논문집
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    • 한국음향학회 2004년도 추계학술발표대회논문집 제23권 2호
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    • pp.557-560
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    • 2004
  • 본 논문에서는 실내음향을 측정하기 위해 사용되는 음향 측정 신호인 blank pistol, maximum length sequence, sine sweep 을 이용한 충격응답 특성을 분석한다. 각 충격응답의 실내음향 인자들을 먼저 비교 분석하고 sine sweep 속도에 따른 충격응답 특성을 분석하여 최적의 실내음향 인자를 찾기 위한 sine sweep 속도를 결정한다.

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건축음향을 위한 MLS 측정방법 (MLS for Building Acoustics Measurement)

  • Borjabad, Roberto
    • 한국소음진동공학회:학술대회논문집
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    • 한국소음진동공학회 1996년도 추계학술대회논문집; 한국과학기술회관, 8 Nov. 1996
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    • pp.386-393
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    • 1996
  • The paper describes how a Maximum Length Sequence(MLS) and correlation technique in the form of Hadamard transformation may be applied for the measurement of airborne sound reduction. It is shown that in most cases, the values obtained by the MLS technique will be equal to the expected values obtained by the classical method. However, due to the correlation process involved, the MLS method will be much less sensitive to disturbances from extraneous noise. The described method has been implemented in an RTA acoustic analyser.

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Genetic Clarification of Auricularia heimuer Strains Bred and Cultivated in Korea Using the ITS and IGS1 rDNA Region Sequences

  • Nitesh Pant;HyeongJin Noh;Won-Ho Lee;Seong Hwan Kim
    • Mycobiology
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    • 제51권2호
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    • pp.109-113
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    • 2023
  • Auricularia is one of the broadly cultivated edible mushrooms in Korea. Most of the Korean Auricularia strains used for cultivation and breeding are known as A. auricula-judae. Recently, this species has been reported to belong to a species complex. Therefore, this study was carried out to genetically clarify the bred and cultivated Korean A. auricula-judae strains. The internal transcribed spacer (ITS) and IGS1 rDNA region sequences were determined from 10 A. auricula-judae strains by PCR and sequencing. Variation in the nucleotide sequence and sequence length of the two rDNA regions were found among the seven A. auricula-judae strains. A maximum-likelihood (ML) phylogenetic tree based on the ITS sequences clearly placed all the 10 Korean A. auricula-judae strains in the A. heimuer clade of the A. auriculajudae complex. A. heimuer is diverged from A. auricula-judae. An ML phylogenetic tree based on the IGS1 sequences revealed the close relationship between Korean A. heimuer strains to Chinese A. heimuer strains. But each strain could be distinguishable by the IGS1 sequence. Furthermore, progeny strains in the seven Korean strains could be differentiated from their parental strains by the IGS1 sequence based phylogenetic tree. Our results are expected to be used to complement the distinction of domestic Auricularia cultivars.

반추위에서 분리한 곰팡이의 Conjugated Linoleic Acid 생산과 ITS-1 영역의 염기서열 해석 (Isolation and Identification of Rumen Fungus and Its Produced Conjugated Linoleic Acid)

  • 남인식
    • 미생물학회지
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    • 제43권2호
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    • pp.111-115
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    • 2007
  • 반추위에서 분리한 곰팡이(IS-13)의 conjugated linoleic acid 생산 과정을 조사하고conjugated linoleic acid를 생산하는 곰팡이를 동정하기 위하여 본 연구를 실시하였다. IS-13 곰팡이가 함유된 배양액에 linoleic acid를 첨가한 결과 linoleic acid는 배양 12시간 이내에 conjugated linoleic acid와 trans-11 vaccenic acid로 biohydrogenation되었다. IS-13 곰팡이의 동정은 internal transcribed spacer 1 영역(ITS1)을 sequence하여 GenBank 유래의 관련 23속(종)의 반추위 곰팡이와 비교하였다. IS-13 곰팡이의 ITS1의 length는 218 bp인 것으로 확인되었으며, 염기서열 분석 결과 Orpinomyces species와 98% 일치하여 반추위내 Orpinomyces species는 conjugated linoleic acid 생산에 깊이 관여하는 것으로 확인되었다. 연구결과 본 균주는 Orpinomyces 속에 속하는 균으로 동정되었다.

고밀도 DVD시스템을 위한 저 복잡도 검출 기법 (Low-Complexity Detection Techniques for High-Density DVD Systems)

  • 조한규;우중재;주만식;강창언;홍대식
    • 한국통신학회논문지
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    • 제27권10A호
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    • pp.1000-1010
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    • 2002
  • Partial response maximum likelihood (PRML)과 fixed-delay tree search with decision feedback (FDTS/DF)은 기록 재생 시스템에서 준최적 성능을 보이는 정보열 검출 기법 (sequence detection)으로 알려져 있다. 그러나, 정보열 검출 기법 고유의 metric 연산은 심각한 하드웨어 복잡도를 유발한다. 본 논문은 정보열 검출 기법의 복잡도 문제를 극복하기 위한 대안을 제시한다. 제안된 저 복잡도 기법들은 검출 과정에서 덧셈 및 곱셈의 수를 최소화하여 고속 프로세스 및 저 복잡도 하드웨어 구현에 적합하다. 결정 궤환 드화 깁버 (decision feedback equalization; DFE)을 결합하여 ${\tau}$=2 FDTS/DF와 동일한 성능을 보이며, 기록 밀도 S>5.6에서 PR(1111)ML의 성능을 능가함이 모의 실험을 통해 보여진다.

분산값이 서로 다른 파이버들을 이용한 광펄스의 압축과 기본솔리톤 생성 (Comression of optical pulse and generation of fundamental soliton byusing fibers which have different dispersion values)

  • 윤수영;안규철;송윤원;최병하
    • 한국통신학회논문지
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    • 제21권11호
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    • pp.3012-3023
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    • 1996
  • In this paper, we analyze the compression of optical soliton which is obtained by proceeding the optical pulse in FSDD(Fiber with Slowly Decreasing Dispersion) using both NSE(Nonlinear Schrodinger Equation) and GNSE(General Nonlinear Schrodinger Equation) and compare the results. We replace the FSDD with a sequence of fibers having different dispersion values and pompre the results with those obtained in FSDD. It is found that the same results in peak value and FWHM(Full width Half Maximum) can be obtained by replacing FSDD with a sequence of fibers having proper length. We vary the shape of initial pulse which is the input of FSDD and suggest the condition to obtain higher compression rate.

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