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남태평양 축 라군의 초미소 식물플랑크톤 분포 특성 (Picophytoplankton Distribution in the Chuuk Lagoon South Pacific)

  • 노재훈;이미진
    • 환경생물
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    • 제24권1호
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    • pp.81-88
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    • 2006
  • 열대 남태평양에 위치한 축 라군에서 flow cytometry와 HPLC를 이용 초미소 식물플랑크톤 조사를 하였다. Synechococcus, Prochlorococcus 그리고 picoeukaryotes의 풍도와 지시색소 분포 양상을 분석하였고 추정된 탄소 생체량에서의 기여율을 조사하였다. 남세균인 Synechococcus와 Prochlorococcus는 축 라군에서 대비되는 분포 특성을 보였다. Synechococcus는 웨노섬 주변 정점에서 높은 풍도를 보인 반면, 북동수로 쪽으로 멀어지며 풍도가 감소하였다. Prochlorococcus는 이와 반대의 분포특성을 나타냈으며, picoeukaryotes는 특정적인 수역별 변화를 보이지 않았다. Prochlorococcus의 지시색소인 divinyl chlorophyll a (Chl. $\alpha2$)는 $1.2\sim180.3\;ng\;L^{-1}$의 농도 범위를 보였으며, 웨노섬 주변 정점들보다 북동수로에 접한 정점들에서 높게 나타났다. 이는 Prochlorococcus의 풍도와 유사한 분포로서, chl. a2가 생체량의 좋은 지표임을 나타냈다. 반면 zeaxanthin은 $61.4\sim135.8\;ng\;L^{-1}$의 농도 범위로 정점별 변화가 풍도변화에 비해 작은 특징을 보였는데 이는 Prochlorococcus로부터 유래된 zeaxanthin의 영향으로 판단된다. Synechococcus의 추정된 탄소 생체량은 전체 초미소 식물플랑크톤 생체량의 68%를 차지하였다. Prochlorococcus와 picoeukaryotes는 각각 17.1%와 14.9%의 생체량을 나타냈다.

Expression of Neurotrophic Factors and Their Receptors in Rat Posterior Taste Bud Cells

  • Park, Dong-Il;Chung, Ki-Myung;Cho, Young-Kyung;Kim, Kyung-Nyun
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제39권2호
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    • pp.107-114
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    • 2014
  • Taste is an important sense in survival and growth of animals. The growth and maintenance of taste buds, the receptor organs of taste sense, are under the regulation of various neurotrophic factors. But the distribution aspect of neurotrophic factors and their receptors in distinct taste cell types are not clearly known. The present research was designed to characterize mRNA expression pattern of neurotrophic factors and their receptors in distinct type of taste cells. In male 45-60 day-old Sprague-Dawley rats, epithelial tissues with and without circumvallate and folliate papillaes were dissected and homogenized, and mRNA expressions for neurotrophic factors and their receptors were determined by RT-PCR. The mRNA expressions of brain-derived neurotrophic factor (BDNF), neurotrophin-3 (NT3), receptor tyrosine kinase B (TrkB), exclusion of nerve growth factor (NGF), neurotrophin-4/5 (NT4/5), receptor tyrosine kinase A (TrkA), receptor tyrosine kinase C (TrkC), and p75NGFR were observed in some population of taste cell. In support of this result and to characterize which types of taste cells express NT3, BDNF, or TrkB, we examined mRNA expressions of NT3, BDNF, or TrkB in the $PLC{\beta}2$ (a marker of Type II cell)-and/or SNAP25 (a marker of Type III cell)-positive taste cells by a single taste cell RT-PCR and found that the ratio of positively stained cell numbers were 17.4, 6.5, 84.1, 70.3, and 1.4 % for $PLC{\beta}2$, SNAP25, NT3, BDNF, and TrkB, respectively. In addition, all of $PLC{\beta}2$-and SNAP25-positive taste cells expressed NT3 mRNA, except for one taste bud cell. The ratios of NT3 mRNA expressions were 100% and 91.7% in the SNAP25-and $PLC{\beta}2$-positive taste cells, respectively. However, two TrkB-positive taste cells co-expressed neither $PLC{\beta}2$ nor SNAP 25. The results suggest that the most of type II or type III cells express BDNF and NT3 mRNA, but the expression is shown to be less in type I taste cells.

비트 스트림 지도를 이용한 고해상도 영상의 효율적인 지역복호화 (Efficient Local Decoding Using Bit Stream Map for High Resolution Video)

  • 박성원;원종우;이선영;김욱중;김규헌;장의선
    • 방송공학회논문지
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    • 제9권4호
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    • pp.391-401
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    • 2004
  • 본 논문은 고해상도 영상 서비스를 위하여 부분 영상의 공간임의접근(Spatial Random Access)을 효과적으로 구현하기 위하여 비트 스트림 지도 (B-map)를 이용한 부호화 방법을 제안한다. 다양한 환경에서, TV 브라운관, 모니터, PDA용 LCD와 같은 표준 디스플레이 장치들은 디지틸 시네마 또는 파노라마 영상과 같은 고해상도 영상을 위한 충분한 해상도와 프레임 크기를 지원하지 못하는 실정이다. 따라서 사용자는 다운샘플링된 저해상도의 영상이나 디스플레이의 크기에 맞춰진 부분 영상만을 볼 수밖에 없다. 제안한 B-map은 부호화 과정에서 생성된 비트 스트림에 대한 블록 단위의 배열 정보를 가지고 있으며, 복호 시 해당 영상의 비트 스트림보다 앞서 보내져 참조됨으로써 효과적인 지역 복호(Local decoding)를 가능하게 한다. B-map을 이용한 방식은 타일링을 비롯한 비교 대안들에 비해 효율적인 지역 복호화를 구현할 수 있음을 실험을 통해 확인하였다.

SCAR 마커 개발 및 이를 활용한 국내 육성 복숭아 품종 판별 (Identification of new Breeding Lines by Prunus Persica Cultivar-Specific SCAR Primers)

  • 한상은;조강희;남은영;신일섭;김정희;김현란;김대현
    • 한국육종학회지
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    • 제42권5호
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    • pp.495-501
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    • 2010
  • 복숭아의 기원은 중국으로 알려져 있으며, 저장기간이 짧아 소비자들의 선호도가 낮았다. 이런 이유로 육종가들은 저장성을 높이는 것과 향과 맛을 좋게 하는데 육종 목표를 설정했으며, 국립원예특작과학원 육종가들은 이 목표에 따라 새로운 품종('천홍', '수홍', '하홍', '유명', '백미조생', '천향', '진미', '수미', '미스홍', '유미')을 육성하였다. 국립원예특작과학원 과수과에서는 육성 품종의 보호와 특허권을 확보하기 위해 분자생물학적 마커의 개발이 필요하여, 235 세트의 Operon 프라이머를 이용하여 품종 특이적인 DNA 절편 134개를 확보했고, 염기서열 분석을 통해 SCAR 마커를 개발하였다. 개발된 마커 14 세트를 이용하여 육성 품종과 육성 품종의 모본 부본이 포함된 30품종에 대해 구분이 가능하였다. 이 결과를 토대로 국립원예특작과학원 과수과에서 육성한 품종에 대한 분자생물학적 근거로 특허권을 확보하고, 묘목시장에서 품종에 대한 정확한 근거를 제시할 것으로 기대된다.

전립선암에 대한 양성자치료에서 금마커에 의한 방사선 선량분포의 영향 (Dosimetric Influence of Implanted Gold Markers in Proton Therapy for Prostate Cancer)

  • 곽정원;신정욱;김진성;박성용;신동호;윤명근;박소아;김동욱;임영경;이세병
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제21권3호
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    • pp.291-297
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    • 2010
  • 본 연구에서는 양성자 치료에서 치료부위에 금 마커를 삽입하였을 때 양성자 빔의 선량과 그 분포에 미치는 영향을 평가하였다. 1.2 mm 직경에 3 mm 길이의 원통형 금 마커가 사용되었고 양성자 빔의 여러 위치에서 각각의 선량에 미치는 영향을 조사하였다. 3차원 moving 팬텀과 유효 반경이 0.5 mm인 정위적 방사선 치료용 다이로드 검출기를 이용하여 금마커의 방사선 선량으로의 영향을 결정하였다. Gafchromic film을 이용한 필름에 의한 선량 평가도 시행하였다. 그리고 선량-체적관계 히스토그램을 통한 분석을 위하여 GEANT4 전산 모의 도구 모음을 이용한 전산모의를 실시하였다. 마커의 움직임에 대한 영향성을 평가하기 위하여 직장 풍선을 적용하고 금 마커를 삽입한 10명의 환자에 대한 MV 영상을 이용하였다. 하나의 금 마커에 의하여 처방선량의 95% 이하가 들어간 체적은 0.15 cc로 작지만 그 체적은 치료부위 안쪽에 위치하고 평행이동에 대하여 발려져서 없어지지 않았다. 금 마커의 위치와 양성자 빔의 상태에 따라서 선량분포에 각각 다른 영향을 미치고 이는 임상치료에서 충분히 고려되어야 할 것으로 사료된다.

두경부 편평상피세포암 세포주에서 세포주기조절인자의 활성 및 이상 : 후두편평상피세포암에서 종양억제유전자 CDKN2 유전자의 발현이상 (Activation and Abnormalities of Cell Cycle Regulating Factor in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Cell Lines: Abnormal Expression of CDKN2 Gene in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma)

  • 송시연;한태희;배창훈;김용대;송계원
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제22권2호
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    • pp.166-182
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    • 2005
  • 정상인의 말초혈액 림프구 DNA를 주형으로 사용하여 DNA PCR을 시행하였다. 그 결과 5례 모두에서 예상되는 167bp 크기의 CDKN2 genomic DNA 단편이 증폭됨을 관찰할 수 있었다. 정상인의 말초혈액 림프구로부터 분리한 mRNA를 사용하여 cDNA를 합성하고 이를 주형으로 사용하여 RT-PCR와 시행하였다. 그 결과 예상되는 355bp 및 468bp의 CDKN2 및 ${\alpha}$-actin의 mRNA 전사산물이 전례에서 발현됨을 관찰할 수 있었다. 또한 CDKN2 mRNA의 RT-PCR 산물을 Sal I 제한효소로 절단하여 252bp와 103bp의 두 단편으로 나뉘어짐을 관찰하였다. 총 5례의 후두 편평상피세포암 세포주에서 CDKN2가 발현되는지를 RT-PCR로 관찰하였으며 각 세포주로부터 mRNA의 분리가 잘되었는지는 ${\alpha}$-actin의 발현을 통하여 RT-PCR로 관찰하였다. 5례의 세포주에서 모두 ${\alpha}$-actin의 발현을 관찰할 수 있었으며 이들의 mRNA를 사용하여 CDKN2 RT-PCR와 시행한 결과 총 4례(80%)의 세포주에서 CDKN2의 발현이 상실되어 있음을 알 수 있었다. CDKN2 발현의 이상이 있는 후두 편평상피세포암 세포주 및 발현이 정상인 후두 편평상피 세포암 세포주 모두에서 CDKN2 유전자의 존재를 DNA-PCR로 관찰하여 총 5례의 세포주 중 2례(40%)에서 CDKN2 유전자의 결손을 관찰할 수 있었다. 이 2례의 후두 편평상피세포암 세포주는 CDKN2의 발현이 일어나지 않은 것으로 RT-PCR의 결과와 일치하였다. 총 8례의 후두 편평상피세포암세포들에서 CDKN2의 이종접합성의 상실이 발견되는지를 DNA-PCR로 관찰하여 7례(87.5%)에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 이종접합성의 상실이 발견되었으며, 6례(75%)에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 증폭이 발견되었다. 또한 2례에서 최소한 한 개 이상의 microsatellite marker에 대한 microsatellite의 불안정이 발견되었다. 이종접합성의 상실, 증폭 또는 microsatellite의 불안정의 세 가지 모두를 보면 전례에서 한가지 이상의 CDKN2의 이상이 발견되었다. 이상의 결과로 볼 때 CDKN2가 후두암의 발생에 중요한 역할을 하고 있을 것으로 사료된다.

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Clinical characteristics and serum N-terminal pro-brain natriuretic peptide as a diagnostic marker of Kawasaki disease in infants younger than 3 months of age

  • Bae, Hyun Kyung;Lee, Do Kyung;Kwon, Jung Hyun;Kim, Hae Soon;Sohn, Sejung;Hong, Young Mi
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제57권8호
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    • pp.357-362
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    • 2014
  • Purpose: The incidence of Kawasaki disease (KD) is rare in young infants (less than 3 months of age), who present with only a few symptoms that fulfill the clinical diagnostic criteria. The diagnosis for KD can therefore be delayed, leading to a high risk of cardiac complications. We examined the clinical characteristics and measured the serum levels of N-terminal pro-brain natriuretic peptide (NT-proBNP) levels of these patients for assessing its value in the early detection of KD. Methods: We retrospectively reviewed the data of young infants diagnosed with KD from 2004 to 2012. The control group included 20 hospitalized febrile patients. Laboratory data, including NT-proBNP were obtained for each patient in both groups. Results: Incomplete KD was observed in 21/24 patients (87.5%). The mean fever duration on admission was $1.36{\pm}1.0$ days in the KD group. Common symptoms included erythema at the site of Bacille Calmette-Guerin inoculation (70.8%), skin rash (50.0%), changes of oropharyngeal mucosa (29.1%), and cervical lymphadenopathy (20.8%). The mean number of major diagnostic criteria fulfilled was $2.8{\pm}1.4$. Five KD patients (20.8%) had only one symptom matching these criteria. The incidence of coronary artery complications was 12.5%. The mean serum NT-proBNP level in the acute phase, in the KD and control groups, were $4,159{\pm}3,714pg/mL$ and $957{\pm}902pg/mL$, respectively, which decreased significantly in the convalescent phase. Conclusion: Incomplete KD was observed in 87.5% patients. Serum NT- proBNP might be a valuable biomarker for the early detection of KD in febrile infants aged <3 months.

Identification of New Microsatellite DNAs in the Chromosomal DNA of the Korean Cattle (Hanwoo)

  • Kim, J.W.;Hong, J.M.;Lee, Y.S.;Chae, S.H.;Choi, C.B.;Choi, I.H.;Yeo, J.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권10호
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    • pp.1329-1333
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    • 2004
  • To isolate the microsatellites from the chromosomal DNA of the Korean cattle (Hanwoo) and to use those for the genetic selection, four bacteriophage genomic libraries containing the chromosomal DNA of six Hanwoo steers showing the differences in meat quality and quantity were used. Screening of the genomic libraries using $^{32}P-radiolabeled 5'-({CA})_{12}-3$nucleotide as a probe, resulted in isolation of about 3,000 positive candidate bacteriophage clones that contain $(CA)_n$-type dinucleotide microsatellites. After confirming the presence of microsatellite in each positive candidate clone by Southern blot analysis, the DNA fragments that include microsatellite and flanking sequences possessing less than 2 kb in size, were subcloned into plasmid vector. Results from the analysis of microsatellite length polymorphism, using twenty-two PCR primers designed from flanking region of each microsatellite DNA, demonstrated that 208 and 210 alleles of HW-YU-MS#3 were closely related to the economic traits such as marbling score, daily gain, backfat thickness and M. longissimus dorsi area in Hanwoo. Interestingly, HW-YU-MS#3 microsatellite was localized in bovine chromosome 17 on which QTLs related to regulation of the body fat content and muscle ypertrophy locus are previously known to exist. Taken together, the results from the present study suggest the possible use of the two alleles as a DNA marker related to economic trait to select the Hanwoo in the future.

Efficacy of New 6-Phytase from Buttiauxella spp. on Growth Performance and Nutrient Retention in Broiler Chickens Fed Corn Soybean Meal-based Diets

  • Kiarie, E.;Woyengo, T.;Nyachoti, C.M.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제28권10호
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    • pp.1479-1487
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    • 2015
  • A total of 420 day-old male Ross chicks were weighed at d 1 of life and assigned to test diets to assess the efficacy of a new Buttiauxella spp. phytase expressed in Trichoderma reesei. Diets were: positive control (PC) adequate in nutrients and negative control (NC) diet (40% and 17% less available phosphorous (P) and calcium (Ca), respectively) supplemented with 6 levels of phytase 0, 250, 500, 750, 1,000, and 2,000 phytase units (FTU)/kg of diet. All diets had titanium dioxide as digestibility marker and each diet was allocated to ten cages (6 birds/cage). Diets were fed for 3 wk to measure growth performance, apparent retention (AR) on d 17 to 21 and bone ash and ileal digestibility (AID) on d 22. Growth performance and nutrient utilization was lower (p<0.05) for NC vs PC birds. Phytase response in NC birds was linear (p<0.05) with 2,000 FTU showing the greatest improvement on body weight gain (20%), feed conversion (7.4%), tibia ash (18%), AR of Ca (38%), AR of P (51%) and apparent metabolizable energy corrected for nitrogen (5.1%) relative to NC. Furthermore, phytase at ${\geq}750FTU$ resulted in AID of total AA commensurate to that of PC fed birds and at ${\geq}1,000FTU$ improved (p<0.05) AR of P, dry matter, and N beyond that of the lower doses of phytase and PC diet. In conclusion, the result from this study showed that in addition to increased P and Ca utilization, the new Buttiauxella phytase enhanced growth performance and utilization of other nutrients in broiler chickens in a dose-dependent manner.

반송(Pinus densiflora for. multicaulis)의 몇 가지 동위효소(同位酵素)의 유전변이(遺傳變異) (Genetic Variation of Several Isoenzymes in Pinus densiflora for. multicaulis)

  • 황재우;이석우
    • 한국산림과학회지
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    • 제85권3호
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    • pp.409-415
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    • 1996
  • 반송의 유전변이를 조사하기 위해 전국에서 선발한 31개체에 대한 배유조직을 이용하여 4개 동위효소에 대한 전기영동을 실시하였으며, 분석된 결과를 소나무와 비교하였다. 분석 결과 최소 7개의 유전자좌(GDH-A, GOT-B, GOT-C, IDH-A, LAP-A, LAP-B)가 다형성을 나타냈으며, 이들 유전자좌에서 관측된 대립유전자 수는 2-4개였다. 본 연구에서 조사된 유전자좌에서는 소나무와 반송을 구별할 수 있는 표식인자(標識因子)를 발견할 수 없었으며, 각 유전자좌별 대립유전자 빈도 분포 역시 소나무와 반송이 거의 동일하였다. 반송의 99% 수준에서의 다형적 유전자좌의 비율, 유전자좌당 대립유전자수, 이형접합율의 관측치와 기대치는 각각 85.7, 2.3개, 0.165와 0.186%로 소나무에 비해서 유전변이는 적은 것으로 나타났다.

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