• 제목/요약/키워드: Marker Gene

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Skin Barrier Recovery by Protease-Activated Receptor-2 Antagonist Lobaric Acid

  • Joo, Yeon Ah;Chung, Hyunjin;Yoon, Sohyun;Park, Jong Il;Lee, Ji Eun;Myung, Cheol Hwan;Hwang, Jae Sung
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제24권5호
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    • pp.529-535
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    • 2016
  • Atopic dermatitis (AD) results from gene and environment interactions that lead to a range of immunological abnormalities and breakdown of the skin barrier. Protease-activated receptor 2 (PAR2) belongs to a family of G-protein coupled receptors and is expressed in suprabasal layers of the epidermis. PAR2 is activated by both trypsin and a specific agonist peptide, SLIGKV-$NH_2$ and is involved in both epidermal permeability barrier homeostasis and epithelial inflammation. In this study, we investigated the effect of lobaric acid on inflammation, keratinocyte differentiation, and recovery of the skin barrier in hairless mice. Lobaric acid blocked trypsin-induced and SLIGKV-$NH_2$-induced PAR2 activation resulting in decreased mobilization of intracellular $Ca^{2+}$ in HaCaT keratinocytes. Lobaric acid reduced expression of interleukin-8 induced by SLIGKV-$NH_2$ and thymus and activation regulated chemokine (TARC) induced by tumor necrosis factor-a (TNF-${\alpha}$) and IFN-${\gamma}$ in HaCaT keratinocytes. Lobaric acid also blocked SLIGKV-$NH_2$-induced activation of ERK, which is a downstream signal of PAR2 in normal human keratinocytes (NHEKs). Treatment with SLIGKV-$NH_2$ downregulated expression of involucrin, a differentiation marker protein in HaCaT keratinocytes, and upregulated expression of involucrin, transglutamase1 and filaggrin in NHEKs. However, lobaric acid antagonized the effect of SLIGKV-$NH_2$ in HaCaT keratinocytes and NHEKs. Topical application of lobaric acid accelerated barrier recovery kinetics in a SKH-1 hairless mouse model. These results suggested that lobaric acid is a PAR2 antagonist and could be a possible therapeutic agent for atopic dermatitis.

Diagnostic Value of Ceruloplasmin in the Diagnosis of Pediatric Wilson's Disease

  • Kim, Jung Ah;Kim, Hyun Jin;Cho, Jin Min;Oh, Seak Hee;Lee, Beom Hee;Kim, Gu-Hwan;Choi, Jin-Ho;Kim, Kyung Mo;Yoo, Han-Wook
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제18권3호
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    • pp.187-192
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    • 2015
  • Purpose: Measurement of serum ceruloplasmin level is the first step in screening for Wilson's disease (WD). Despite the rarity of WD in the general population, ceruloplasmin levels are routinely measured through hepatitis screening in both adults and children. Herein, we evaluated the diagnostic value of ceruloplasmin for the diagnosis of WD among children with hepatitis. Methods: We retrospectively reviewed data on serum ceruloplasmin levels measured as a serologic marker for patients with hepatitis at Asan Medical Center (Seoul, Korea) between from January 2004 to November 2013. The diagnosis of WD was confirmed by the identification of pathogenic variants in the ATP7B gene. To determine the diagnostic accuracy of ceruloplasmin, receiver operation characteristic (ROC) curves were constructed and the area under curve (AUC) were calculated. Results: Measurements of serum ceruloplasmin were performed in 2,834 children who had hepatitis. Among these, 181 (6.4%) children were diagnosed with WD. The sensitivity, specificity, and accuracy of a ceruloplasmin level of <20 mg/dL in the discrimination of WD were 93.4%, 84.2%, and 84.8%, respectively. In this study, 418 (14.7%) false-positive cases and 12 (0.4%) false-negative cases were noted. Using a ROC curve, a ceruloplasmin level of ${\leq}16.6mg/dL$ showed the highest AUC value (0.956) with a sensitivity of 91.2%, a specificity of 94.9%, and an accuracy of 94.7%. Conclusion: The measurement of serum ceruloplasmin was frequently used for the screening of WD in children, despite a low positive rate. The diagnostic value of ceruloplasmin may be strengthened by adopting a new lower cut-off level.

경주국립공원 내 야생 작약(Paeonia lactiflora Pall.) 집단의 유전다양성 분석 (Genetic diversity assessment of wild populations of Paeonia lactiflora Pall. in Gyeongju National Park, Korea)

  • 원효식;임창건;최선아;김미진
    • 식물분류학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.245-251
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    • 2013
  • 작약은 원예 및 전통한약으로 중요한 자연자원이다. 경주국립공원 일대에서 발견된 야생 작약 집단에 대한 보전 및 활용 방안 마련을 위해 마이크로새틀라이트 마커를 활용한 유전적 다양성 분석을 수행하였다. 경주국립공원 일대 3개 집단과 중국 연변 1개 집단 등 4개 집단을 대상으로 유전적 다양성 분석을 수행한 결과, 5개의 마이크로새틀라이트 마커로부터 61개의 대립유전자를 확인하였으며, 평균 이형접합성($H_o$)은 0.452로 나타났다. 집단 간의 유전적 분화는 $F_{ST}$=0.116로 볼 때 비교적 낮은 수준인 것으로 나타났으며, 계층적 AMOVA 분석 결과 유전적 변이가 집단 간보다는 집단 내 개체사이에 분포하는 것으로 확인되었다. 그러나 $F_{ST}$값 대신 대립유전자의 크기를 고려한 $R_{ST}$ 값을 사용한 AMOVA 분석 결과에서는 중국 집단과 국내 집단 사이에 두드러진 차이가 나타났다. 이러한 양상은 STRUCTURE 분석에서도 확인되었다. 한편, 경주국립공원 일대 3개 집단 사이에는 지속적인 유전자 흐름이 일어나고 있는 것으로 확인되었으며, 작은 집단 크기와 성숙한 개체가 적은 것으로 볼 때, 추가적인 보호 및 장기 모니터링이 필요할 것으로 판단된다.

인삼 (Panax ginseng C.A. Meyer)의 Microsatellite 마커에 대한 유전적 다형성과 특성 규명 (Genetic Polymorphism of Microsatellite Markers in Panax ginseng C.A. Meyer)

  • 박선화;현영세;정기화
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제33권3호
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    • pp.199-205
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    • 2009
  • 인삼에 대한 microsatellite 개발은 다른 분자적 마커들에 비해 늦게 이루어져, 최근에 와서야 인삼의 microsatellite 들이 보고되고 있는 실정이다. 본 연구에서는, 분리된 microsatellite들 중에서 5 개의 다형성 마커를 선별하여 국내 경작지나 시장에서 유통되는 인삼을 대상으로 유전적 다형성을 조사하고, 각 마커의 특성을 규명하였다. 유전자형 분석은 변성 PAGE와 silver staining법으로 하거나 형광표지 primer로 표지한 PCR 산물을 자동 염기서열 분석기로 분석하였다. 본 연구에서 개발한 5개의 microsatellite 마커들의 평균 대립유전자 수는 3.2 개였으며, 평균 GD는 0.367 였다. 전체적으로 볼 때, PG1419가 가장 높은 다형성을 보였으며 (PIC: 0.460, GD: 0.543), PG770은 가장 낮은 다형성을 나타내었다 (PIC: 0.070, GD: 0.078). 각 좌위들의 예상 이형접합도 (H$_{exp}$)는 0.077에서 0.541 (mean = 0.313)로 계산되었으나, 관측 이형접합도 (H$_{obs}$)는 0.040에서 0.130 (mean = 0.083)으로 훨씬 낮게 관찰되었으며, 유전자형의 분포는 Hardy-Weinberg 평형상태에서 벗어남을 보였다. 본 연구에서 개발한 인삼의 microsatellite 마커들은 인삼의 분자적 마커의 데이터베이스 확립의 기초 자료로 활용될 뿐 아니라, 인삼의 분자적 구별법 및 QTL 좌위의 염색체지도 작성에 유용하게 활용될 것이다.

Research article Black ginseng activates Akt signaling, thereby enhancing myoblast differentiation and myotube growth

  • Lee, Soo-Yeon;Go, Ga-Yeon;Vuong, Tuan Anh;Kim, Jee Won;Lee, Sullim;Jo, Ayoung;An, Jun Min;Kim, Su-Nam;Seo, Dong-Wan;Kim, Jin-Seok;Kim, Yong Kee;Kang, Jong-Sun;Lee, Sang-Jin;Bae, Gyu-Un
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제42권1호
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    • pp.116-121
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    • 2018
  • Background: Black ginseng (BG) has greatly enhanced pharmacological activities relative to white or red ginseng. However, the effect and molecular mechanism of BG on muscle growth has not yet been examined. In this study, we investigated whether BG could regulate myoblast differentiation and myotube hypertrophy. Methods: BG-treated C2C12 myoblasts were differentiated, followed by immunoblotting for myogenic regulators, immunostaining for a muscle marker, myosin heavy chain or immunoprecipitation analysis for myogenic transcription factors. Results: BG treatment of C2C12 cells resulted in the activation of Akt, thereby enhancing hetero-dimerization of MyoD and E proteins, which in turn promoted muscle-specific gene expression and myoblast differentiation. BG-treated myoblasts formed larger multinucleated myotubes with increased diameter and thickness, accompanied by enhanced Akt/mTOR/p70S6K activation. Furthermore, the BG treatment of human rhabdomyosarcoma cells restored myogenic differentiation. Conclusion: BG enhances myoblast differentiation and myotube hypertrophy by activating Akt/mTOR/p70S6k axis. Thus, our study demonstrates that BG has promising potential to treat or prevent muscle loss related to aging or other pathological conditions, such as diabetes.

Different expression levels of OsPLS1 control leaf senescence period between indica and japonica-type rice

  • Shin, Dongjin;Kim, Tae-Hun;Lee, Ji-Yun;Cho, Jun-Hyeon;Song, You-Chun;Park, Dong-Soo;Oh, Myeong-Gyu
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.98-98
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    • 2017
  • Leaf senescence is the process of aging in plants. Chlorophyll degradation during leaf senescence has the important role translocating nutrients from leaves to storage organs. The functional stay-green with slow leaf yellowing and photosynthesis activity maintenance has been considered one of strategy for increasing crop productivity. Here, we have identified two QTLs on chromosome 9 and 10 for leaf senescence with chlorophyll content of RIL population derived from a cross between Hanareum 2, early leaf senescence Indica-type variety, and Unkwang, delayed leaf senescence Japonica variety. Among these QTLs, we chose qPLS1 QTL on chromosome 9 for further study. qPLS1 was found to explain 14.4% of the total phenotypic variation with 11.2 of LOD score. Through fine-mapping approach, qPLS1 QTL locus was narrowed down to about 25kb in the marker interval between In/del-4-7-9 and In/del-5-9-4. There are 3 genes existed within 25kb of qPLS1 locus: LOC_Os09g36200, LOC_Os09g36210, and LOC_Os09g36220. Among these genes, transcript level of LOC_Os09g36200 was increased during the leaf senescence stage and the expression level of LOC_Os09g36200 in Indica was higher than in Japonica. Finally, we chose LOC_Os09g36200 as candidate gene and renamed it as OsPLS1-In and OsPLS1-Jp from Indica- and Japonica-type rice, respectively. OsPLS1-In and OsPLS1-Jp overexpressing transgenic plants showed both early leaf senescence phenotype. These results indicate that OsPLS1 functions in chlorophyll degradation and the difference of expression level of OsPLS1 cause the difference of leaf senescence between Indica and Japonica in rice.

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배추의 배축절편으로부터 캘러스와 뿌리 발생을 통한 안정적 형질전환 (Stable Transformation via Callus Formation and Rhizogenesis from the Cultures of Hypocotyl Explant of Chinese Cabbage)

  • 조미애;김춘해;민성란;고석민;유장렬;최필선
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제34권2호
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    • pp.139-144
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    • 2007
  • '정상' 배추의 배축절편을 선발마커로서 paromomycin 저항 성유전자를 갖고 있는 pPTN290으로 각각 형질전환된 EHA101, LBA4404, GV3101균주와 공동배양한 후 갤러스유도배지에서 형질전환캘러스를 얻은 후, 뿌리유도배지에서 부정근을 그리고 신초유도배지에서 신초를 각각 순차적으로 유도하였다. 형질전환캘러스를 얻은 후, 뿌리유도배지에서 부정근을 그리고 신초유도배지에서 신초를 가각 순차적으로 유도하였다. 형질전환캘러스 형성은 Agrobacterium균주에 따라 차이가 있었으며, 특히 EHA101균주에 공동배양된 배축절편으로부터 최대 6.1%까지 얻어졌다. 또한 각각의 형질전환캘러스 클론으로부터 형질전환 부정근과 신초 발생은 EHA101균주에서 60.7%와 38.2%, LBA4404에서 8.3%와 0%, GV3101에서 20.5%와 85.7%까지 각각 얻을 수 있었다. 형질전환식물체는 특별한 형태적 이상 없이 온실에서 정상적으로 자라 $T_{2}$종자를 얻을 수 있었다. GUS방법으로 7개의 후대 유식물체를 분석한 결과 gus유전자가 안정적으로 발현하고 있음을 확인하였고, 배추 genome에 single 또는 multiple copy로 전달되고 있음을 추측할 수 있었다.

Effects of Trichostatin A on In vitro Development of Porcine Embryos Derived from Somatic Cell Nuclear Transfer

  • Jeong, Yeon Ik;Park, Chi Hun;Kim, Huen Suk;Jeong, Yeon Woo;Lee, Jong Yun;Park, Sun Woo;Lee, Se Yeong;Hyun, Sang Hwan;Kim, Yeun Wook;Shin, Taeyoung;Hwang, Woo Suk
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권12호
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    • pp.1680-1688
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    • 2013
  • Many different approaches have been developed to improve the efficiency of animal cloning by somatic cell nuclear transfer (SCNT), one of which is to modify histone acetylation levels using histone deacetylase inhibitors (HDACi) such as trichostatin A (TSA). In the present study, we examined the effect of TSA on in vitro development of porcine embryos derived from SCNT. We found that TSA treatment (50 nM) for 24 h following oocyte activation improved blastocyst formation rates (to 22.0%) compared with 8.9% in the non-treatment group and total cell number of the blastocysts for determining embryo quality also increased significantly ($88.9{\rightarrow}114.4$). Changes in histone acetylation levels as a result of TSA treatment were examined using indirect immunofluorescence and confocal microscopy scanning. Results showed that the histone acetylation level in TSA-treated embryos was higher than that in controls at both acetylated histone H3 lysine 9 (AcH3K9) and acetylated histone H4 lysine 12 (AcH4K12). Next, we compared the expression patterns of seven genes (OCT4, ID1; the pluripotent genes, H19, NNAT, PEG1; the imprinting genes, cytokeratin 8 and 18; the trophoblast marker genes). The SCNT blastocysts both with and without TSA treatment showed lower levels of OCT4, ID1, cytokeratin 8 and 18 than those of the in vivo blastocysts. In the case of the imprinting genes H19 and NNAT, except PEG1, the SCNT blastocysts both with and without TSA treatment showed higher levels than those of the in vivo blastocysts. Although the gene expression patterns between cloned blastocysts and their in vivo counterparts were different regardless of TSA treatment, it appears that several genes in NT blastocysts after TSA treatment showed a slight tendency toward expression patterns of in vivo blastocysts. Our results suggest that TSA treatment may improve preimplantation porcine embryo development following SCNT.

동과 분획물이 3T3-L1 지방세포 분화 억제에 미치는 영향 (Effects of Fractions from Benincasa hispida on Inhibition of Adipogenesis in 3T3-L1 Preadipocytes)

  • 유양희;전우진
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제41권7호
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    • pp.895-900
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    • 2012
  • 본 연구에서 동과 물추출물의 계통분획을 통해 획득된 세가지 분획물인 핵산 분획(BHHH), 클로로포름 분획(BHHC), 에틸아세테이트 분획(BHHE)들을 3T3-L1 분화과정 중에 처리한 후, Oil Red O 염색법에 의한 lipid accumulation, 지방구내 triglyceride 함량을 평가하고, free glycerol release 함량과 adipogenesis와 관련된 transcription factor들의 발현 함량을 비교하여 동과 물추출물 중 anti-adipogenesis 활성 분획물을 밝히고, 이 분획물의 작용 메커니즘을 규명하고자 하였다. 50 ${\mu}g/mL$ 농도의 BHHC와 BHHE의 처리는 분화된 지방세포 내 지질 축척을 11%와 13%로 낮추었다. 지방세포 내 중성지방(TG)의 함량은 동일 농도의 각 분획물에서 21%와 16%로 낮게 나타났다. TG 함량의 감소와 지방구내 지질 축적의 감소, 즉 anti-adipogenesis 메커니즘을 밝히기 위해 free glycerol 분비량을 평가하였다. 동일 농도의 BHHC와 BHHE에서 각각 13%와 17% 감소되어 나타났다. BHHC와 BHHE는 세포가 분화하는 동안 $PPAR{\gamma}$, C/$EBP{\alpha}$, leptin의 mRNA 발현을 억제하는 것으로 나타났다. 특히 BHHE의 경우 각 transcriptional factor들의 발현을 45%, 67%, 35%로 현저히 억제시키는 우수한 anti-adipogenetic 소재로 나타났다. 이에 BHHE는 항비만 기능성 소재로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

줄댕강나무 (Abelia tyaihyoni) 집단의 유전다양성 및 공간구조 (Genetic Diversity and Spatial Structure in Populations of Abelia tyaihyoni)

  • 정지희;김규식;이철호;김진수
    • 한국산림과학회지
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    • 제96권6호
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    • pp.667-675
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    • 2007
  • I-SSR 표지자를 이용하여 영월지역의 줄댕강나무 2개 집단의 유전적 다양성과 공간구조가 조사되었다. 줄댕강나무는 분포가 제한되어있고 집단크기가 작음에도 불구하고 개체 수준에서 추정된 유전변이는 다른 관목류와 유사한 수준으로 판단되었다.(S.I.=0.336, h=0.217). Genet 수준에서 조사된 유전다양성 역시 개체 수준의 값과 큰 차이가 없었다(S.l.=0.339, h=0.219). 전체 유전변이의 약 18.7%가 집단 간 차이로 나타나, 다른 관목류에 비해 다소 높거나 비슷한 수준이었다. $N_G/N$ 값과 Simpson's index로 추정된 유전자형 다양성 역시 다른 관목류에 비해 높았다($N_G/N=0.729$. $D_G=0.988$). 한 genet의 최대직경은 5.5 m로 비교적 작게 나타났다. 높은 수준의 유전자 및 유전자형 다양성과 genet의 작은 직경 크기는, 무성번식이 줄댕강나무 집단의 유전적 구성에 차지하는 비중이 그렇게 크지 않음을 보여주었다. 개체 및 genet 수준에서 큰 차이 없이, 약 12-18 m 거리 내에 분포하는 개체 간에 자기상관성이 인정되었다. 줄댕강나무 집단의 현지외 보전을 위한 표본 추출 시, 연속 분포하는 집단에서는 최소 18m 이상의 간격을 두는 것이 좋고, 소규모 단편으로 분리되어 분포하는 경우 최대한 많은 단편으로부터 표본을 채취하는 것이 효율적일 것으로 판단되었다.