Liquid-liquid phase separation (LLPS) of biomolecules, a newly-found phase behavior of molecules in the liquid phase, has shown to its relationship to various biological function and misfolding diseases. Extensive studies have increasingly revealed a general mechanism of LLPS and characterized the liquid droplet; ho wever, intermolecular interactions of proteins and structural states of LLPS-inducing proteins inside of the droplet remain largely unknown. Solution NMR spectroscopy has emerged as a powerful approach as it provides invaluable information on protein intermolecular interactions and structures at the atomic and residue level. We herein comprehensively address useful techniques of solution NMR including the effect of paramagnetic relaxation enhancement for the study on the LLPS and droplet based on recent studies.
[$Mn_{12}O_{12}(azo-L)_{16}(H_2O)_4$] (1), a new Mn12 single molecule magnet containing a photochromic azobenzene ligand, has been successfully synthesized by substitution of acetate ligand of Mn12 with 6-[4-{4-hexyloxyphenyl( azo)}-phenoxy]hexanoic-1-acid. The reversible photoisomerization of the azobenzene group was confirmed by UV-visible absorption spectroscopy. The temperature and field dependence of dc susceptibility and the temperature and the frequency dependence of ac susceptibility were measured for the cis and the trans isomer of 1. The magnetization value of the cis isomer in dc measurement is higher than that of the trans isomer. The cis isomer of 1 has a slower relaxation because cis-trans photoisomerization of the azobenzene group in peripheral ligands induces changes in its structure and dipole moment.
Relaxation of magnon in a very thin ferromagnetic film through spontaneous emission of photon shows an enhancement of the decay rate due to the phase coherence between the magnon and the planar component of wave vector of photon. The coupling between magnon and photon under a strong external magnetic field is considered only at the lowest order one-magnon one-photon process, which we believe the most dominant channel for the radiation from the system. Theoretical understanding related to the geometric confinement is pursued; the phase coherence due to the crystal symmetry in the film plane gives rise to superradiative emission on one hand, but the symmetry breaking along the direction perpendicular to the film renders the possibility of emission itself, providing the increased degrees of freedom for the photon.
Proceedings of the Korean Magnestics Society Conference
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2000.09a
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pp.279-286
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2000
Magnetic field dependence of magnetization reversal in Co/Pt multilayers has been quantitatively investigated. Serial samples of Co/Pt multilayers have been prepared by dc-magnetron sputtering under various Ar pressure. Magnetization reversal was monitored by magnetization viscosity measurement and direct domain observation using a magneto-optical microscope system, and the wall-motion speed and the nucleation rate R were determined using a domain reversal model based on time-resolved domain reversal patterns. Both and R were found to be exponentially dependent on the reversing applied field. From the exponential dependencies, the activation volumes of the wall motion and nucleation could be determined based on a thermally activated relaxation model, and the wall-motion activation volume was revealed to be slightly larger than the nucleation activation volume.
The Transactions of the Korean Institute of Electrical Engineers
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v.39
no.1
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pp.22-28
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1990
This paper is a study on the reduction of computation time in case of nonlinear magnetic field analysis by finite element method and Newton-Raphson method. For the purpose, the nonlinear convergence equation is computed by the conjugate gradient method which is known to be applicable to symmetric positive definite matrix equations only. As the results, we can not prove mathematically that the system Jacobian is positive definite, but when we applied this method, the diverging case did not occur. And the computation time is reduced by 25-55% and 15-45% in comparison with the case of direct and successive over-relaxation method, respectively. Therefore, we proved the utility of conjugate gradient method.
Hyperglycemia-induced hemichorea (HGHC) is a rare but characteristic hyperkinetic movement disorder involving limbs on one side of the body. In a 75-year-old woman with a left-sided HGHC, conventional brain MR imaging showed very subtle T1-hyperintensity and unique gadolinium enhancement in the basal ganglia contralateral to movements. Multi-parametric MRI was acquired using pulse sequence with quantification of relaxation times and proton density by multi-echo acquisition. Myelin map was reconstructed based on new tissue classification modeling. In this case report of multi-parametric MRI, quantitative measurement of myelin change related to HGHC in brain structures and its possible explanations are presented. This is the first study to demonstrate myelin loss related to hyperglycemic insult in multi-parametric quantitative MR imaging.
Caveolae are small plasma membrane invaginations that play many roles in signal transduction, endocytosis, mechanoprotection, lipid metabolism. The most important protein in caveolae is the integral membrane protein, caveolin, which is divided into three families such as caveolin 1, caveolin 2, and caveolin 3. Caveolin 1 and 3 are known to incorporate palmitate through linkage to three cysteine residues. Regulation of the protein palmitoylation cycle is important for the cellular processes such as intracellular localization of the target protein, membrane association, conformation, protein-protein interaction, and activity. However, the detailed aspect of individual palmitoylation has not been studied. In the present work, the role of each lipid modification at three cysteines was studied by NMR. Our results suggest that each lipid modification at the natively palmitoylation site has its own roles. For example, lipidations to C106 and C129 are play a role in structural stabilization, however, interestingly, lipid modification to C116 interrupts the structural stabilization.
Parahydrogen induced hyperpolarization (PHIP) technique is extensively studied to increase the sensitivity of the conventional NMR spectroscopy and recently try to apply this advanced technique into the revolutionary future of the MRI. The other hyperpolarization technique, which is widely utilized, is DNP (Dynamic Nuclear Polarization)-based hyperpolarization one. Despite its great advances in these fields, it contains several drawbacks to overcome: fast relaxation time, expensive equipment is needed, long build-up time is required (several hours), and batch scale material is hyperpolarized. To overcome all those limitations, one can effectively harness the hyperpolarized spin state of parahydrogen. One important step for utilizing the spin state of parahydrogen is doing well-developed experiments of ALTADENA and PASADENA. Based on those concepts, we successfully obtain the hydrogenation signals of ALTADENA and PASADENA from styrene by using benchtop NMR spectrometer. Also those signals were conceptually analyzed and confirmed with different mechanisms. To our best knowledge, those experiments using 1.4T (benchtop NMR) is the first reported one. Considering these experiments, we hope that parahydrogen-based hyperpolarization transfer studies in NMR/MRI will be broadened in Korea in the future.
Caveolin3, mainly expressed in muscle tissue types, is a structural scaffolding protein of caveolae which are microdomains of plasma membrane. To elucidate the relationship between structure and function, several studies on the structure of caveolins using NMR have been reported. Because the ionic strength can affect the electrostatic-driven association of proteins with ligand and protein structure, the effect of salt in the structural studies has to be considered. In this work, we observed that the chemical shifts of Cav3 in the LPPG detergent change depending on salt concentration. The R2 values also show salt concentration-dependent changes. Specifically, in the N-terminal region where conformational changes and various interactions occur, the R2 values decrease. Interestingly, the R2 values of residues expected to be located in the LPPG detergent are also influenced by the salt concentration. This work suggests that the concentration of NaCl can affect interpretation of NMR data from membrane proteins.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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