• 제목/요약/키워드: M13 DNA

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항산화물질을 생산하는 해양방선균 Streptomyces Sp. ACT-18의 동정 및 Electron Spin Resonance Spectrometry를 이용한 항산화활성 (Identification and Antioxidant Activity using Electron Spin Resonance Spectrometry of Antioxidant Producing Marine Actinomycetes Streptomyces sp. ACT-18)

  • 김만철;김주상;;한용재;허문수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.24-31
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    • 2010
  • 본 연구는 제주 연안 해수로부터 분리된 항산화물질을 생산하는 해양 방선균의 천연해양항산화물질에 관한 연구이다. 균주 ACT-18은 16S rDNA 염기서열, 전자현미경을 이용한 형태학적 분석, 생리학적, 생화학적 특성 및 세포 지방산분석을 통하여 동정되었다. 분리균주 ACT-18은 Gram 양성, 호기성, 비운동성 포자, 배지상에서 substrate mycelia의 색이 어두운 초록색, aerial mycelia는 노란색의 회색을 나타내였다. 세포사이즈는 약 $0.5{\sim}1.0\;{\mu}m$였다. 16S rDNA 염기서열 분석결과 Gram 양성박테리아인 Streptomyces 종들과 그룹을 형성하였다. 지방산분석결과 주요 지방산은 $C_{15:0}$ anteiso(39.33%), $C_{16:1}$ cis 9(11.96%), $C_{16:0}$ (13.08%)과 $C_{17:0}$ anteiso(10.99%)로 분석되었다. Streptomyce sp. ACT-18의 배양액 메탄올 추출물의 항산화 활성은 electron spin resonance (ESR) spectrometer에 의한 1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl (DPPH), hydroxyl, alkyl 라디컬 소거활성을 측정하여 나타내었다. 그 결과 배양액 메탄올 추출물의 DPPH 라디컬 소거활성은 0.1 mg/mL의 농도에서 46%의 라디컬 소거활성을 보였으며, Hydroxyl 라디컬 소거활성은 0.1 mg/mL에서 63%, alkyl 라디컬 소거활성은 0.1 mg/mL에서 39%의 소거 활성을 보였다.

Genetic Analysis of Three River Populations of Catla catla (HAMILTON) Using Randomly Amplified Polymorphic DNA Markers

  • Islam, M.S.;Ahmed, A.S.I.;Azam, M.S.;Alam, M.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권4호
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    • pp.453-457
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    • 2005
  • The genetic variations in three major river populations viz. the Halda, the Jamuna and the Padma of the Indian major carp, Catla catla were analyzed by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers. Four decamer primers were used for amplifying DNA of 10 individuals from each population. The proportion of polymorphic loci and the gene diversity estimates were 59.4 and 0.20 for the Halda, 37.5 and 0.14 for the Jamuna and 46.9 and 0.16 for the Padma populations respectively indicating the existence of a relatively high level of genetic variation in the Halda river population. The inter-population similarity indices, gene flow and genetic distance values indicated that the Jamuna-Padma population pair of catla was genetically closer than the Halda-Jamuna and the Halda-Padma population pairs in compliance with the geographical distances among them. The coefficient of gene differentiation ($G_{ST}$=0.13) reflects some degree of genetic differentiation among three populations of catla studied. The data suggest that the RAPD technique could be used to discriminate different river populations of catla.

Caffeine이 diethylnitrosame에 의해 유도되는 preneoplastic hepatic altered foci 형성의 promotion 단계에 미치는 효과 (The effect of caffeine on promotion step of diethylnitrosamine-initiated hepatic altered foci in a mid-term induction system)

  • 김성호;이차수
    • 대한수의학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.629-633
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    • 1992
  • Caffeine이 랫드의 간조직에서 diethylnitrosamine(200mg/kg B.W., DEN)에 의해 유도되는 preneoplastic altered foci형성의 promotion단계에 미치는 효과를 관찰한 바 다음과 같은 결과를 얻었다. Altered foci의 지표로 사용되는 glutathione S-transferase(GST-P)-positive foci의 수는 caffeine 음수 $m{\ell}$당 2mg 병행투여군($3.10{\pm}2.74$) 및 1mg병행 투여군($5.86{\pm}2.83$) 모두에서 DEN 단독투여 대조군($11.55{\pm}5.82$)에 비하여 현저히 낮게 나타났으며 면적 또한 caffeine 2mg 병행투여군($0.13{\pm}0.11$), 1mg 병행투여군($0.21{\pm}0.12$)에서 DEN 단독투여 대조군($0.76{\pm}0.33$)에 비하여 유의성있는 낮은 수치가 관찰되었다. 간 세포배양에서 unscheduled DNA synthesis(UDS)는 DEN($250{\mu}g/m{\ell}$ of medium)단독처리군에 비하여 caffeine($200{\mu}g/m{\ell}$ of medium) 처리시 약 70% 감소하였다. 이러한 결과는 caffeine이 간암발생의 promotion단계에 작용하여 억제효과를 나타냄을 암시하며 이는 DNA회복의 억제와 관계됨을 알 수 있었다.

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DNA marker 지문법에 의한 취나물 5종 (청옥취 , 개미취 , 참취 , 수리취 , 곰취)의 비교연구 (Comparative studies of the five edible mountain vegetables by DNA marker fingerprinting)

  • 유기억
    • 한국자원식물학회지
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    • 제9권3호
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    • pp.305-310
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    • 1996
  • 유용 취나물 5종류의 종간 유사도 및 종내 변이를 파악하기 위하여 38개체를 대상으로 PCR 방법을 이용하여 비교분석하였다. 사용된 62가지 primer 중에서 38개체 전체에서 band를 보여준 것은 10가지였고, 이를 통해 얻어진 총 band의 수는 176개로 나타났다. 종내변이는 청옥취가 31.1%에 해당하는 15개의 polymorphic band를 가져 변이가 가장 낮았으며 곰취는 61.1%로 가장 높게 나타났다. 군집분석 결과 조사된 38개체는 유사도 0.93에서 5종의 구분이 가능하였으며 38개체 각각은 유사도 0.62-0.99의 유사성을 갖는 것으로 나타났고 종내변이는 0.93이상으로 높게 나타나 변이가 적은 것으로 나타났다. 이상의 결과에서 PCR방법을 이용한 결과가 취나물 5종류를 구분하는데 유용하게 사용되었으며 군집분석 결과 종내 변이가 매우 낮은 것으로 나타났다.

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Estimation of Genetic Variation of Korean Isolates of Phytophthora capsici by Using Molecular Markers

  • Chee, Hee-Youn;Jee, Hyeong-Jin
    • Mycobiology
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    • 제29권1호
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    • pp.43-47
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    • 2001
  • Genetic diversity of 21 Korean Phytophthora capsici isolates was analyzed by using several molecular markers such as random amplified polymorphic DNA(RAPD), M-13, microsatellite and random amplified microsatellite sequences(RAMS). The overall average similarity coefficient among the isolates was 86% based on the combined data obtained by the molecular markers. No molecular markers were found to be associated with hosts or geographic regions. In addition to RAPD, analysis based on repeated sequences such as $(GTG)_5$, M-13 and RAMS could be used to assess population structure of P. capsici.

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청자갈치(Bothrocara hollandi)의 근육에 기생하는 점액포자충Myxobolus aeglefini (Myxozoa: Myxobolidae) (Myxobolus aeglefini (Myxozoa: Myxobolidae) infection in muscles of porous-head eelpout (Bothrocara hollandi))

  • 전찬혁;김정호
    • 한국어병학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.79-85
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    • 2015
  • 동해안에서 어획된 청자갈치 (Bothrocara hollandi)의 체측 근육에 유백색의 불투명한 시스트를 형성하고 있는 점액포자충이 발견되었다. 시스트를 마쇄하여 광학현미경으로 관찰해본 결과, 원형에 가까운 점액포자충의 성숙 포자가 관찰되었다. 성숙 포자의 평균 길이는 $11.9(11.0{\sim}13.5){\mu}m$, 평균 폭은 $11.6(10.7{\sim}13.6){\mu}m$, 평균 두께는 $7.8(6.9{\sim}8.8){\mu}m$이었다. 극낭의 평균 길이는 $4.4(3.2{\sim}5.3){\mu}m$이었으며, 평균 폭은 평균 $3.3(2.4{\sim}4.2){\mu}m$이었다. 감염숙주와 성숙포자의 형태학적 특징, 각 부위의 측정값으로부터 본 연구에서 발견된 점액포자충은 Myxobolus aeglefini Auerbach 1906으로 동정하였다. 또한 18S rDNA sequences를 이용한 계통분석 결과 M. albi와 M. groenlandicus와 같은 분지에 속하는 것이 확인되었으며 각각 97.7%와 96.9%의 상동성을 나타내었다.

RAPD분석을 이용한 요코가와 흡충과 미야타흡충의 분자생물학적 비교 (Different RAPD patterns between Metagonimus yokogawai and Metagonimus Miyata type)

  • 유재란;정진성;채종일
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제35권4호
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    • pp.295-298
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    • 1997
  • 요코가와흡충과 미야타흡충의 genomic DNA를 RAPD 분석을 이용하여 비교하였다. 상업적으로 구 입한 60-70%의 G+C 성분을 가진 무작위 10-mer oligonucleotide 표지자 (Kit A, Operon Technologies Inc., CalifDmia, USA) 20개 중에서 다음의 8개를 이용하여 두 홉충간에 구별이 가능한 밴드양상을 관찰할 수 있었다: OPA-02,5-TCCCGAGCTG-3; OPA-09,5-GGGTAACGCC-3; OPA-10, 5-GTGATCGCAG-3; OPA-11, 5-CAATCGCCGT-3; OPA-13, 5-CAGCACCCAC-3; OPA-17, 5-GACCGCTGT-3; OPA-19,5-CAAACGTCGG-3; OPA-20, 5-GTrCCGATCC-3. 이 연구의 결과로 미야타흡충은 요코가와흡충과 서로 다른 유전자 염기 서열을 가지고 있음이 암시 되었다.

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들잔디 체세포 배발생 세포로의 DNA 전입을 위한 Electroporation 조건 구명 (Electroporation Conditions for DNA Transfer into Somatic Embryogenic Cells of Zoysia japonica)

  • 박건환;안병준
    • 식물조직배양학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.13-19
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    • 1998
  • Electroporation을 이용한 형질전환 연구에서 원형질체 대신 체세포 배발생 세포를 이용하여도 DNA가 도입될 수 있음을 이미 보고한 바 있다. 본 연구는 배발생 세포 내로 DNA를 도입하기 위한 electroporation의 최적 조건, 즉 전압과 capacitance 수준, promoter 종류, DNA 농도, 저온처리효과 등을 구명하며, 처리에 따른 DNA의 전입 현상을 이해하고 전기충격후의 생장과 분화 정도를 조사하고자 수행되었다. 들잔디 미숙배를 2,4-D가 2 mg/L 함유된 MS배지에서 배양하여 배발생 캘러스를 유도하였고, 동일 조성의 액체배지에 진탕배양하여 조직 electroporation에 적합한 현탁배양 세포괴를 증식할 수 있었다. 100-400 V의 전압과 10-1980 $\mu\textrm{F}$의 capacitance 수준에서 세포괴를 35S-gusA 조성을 갖는 운반체 DNA와 함께 electroporation 하였을 때, 전반적으로 DNA가 도입되었음을 표지유전자 gusA의 transient 발현을 통하여 확인하였으며, 200-300 V 전압과 330-800 $\mu\textrm{F}$ capacitance 수준이 보다 효과적인 경향을 보였다. 처리시 온도는 큰 영향을 미치지 않았으며, 6 $\mu\textrm{g}$/mL 이상의 DNA 농도에서는 GUS 발현이 양호하였다. 배발생 캘러스 세포주들은 모두 DNA가 도입 되었으나 비 배발생 캘러스 세포주는 11개중 하나에서만 도입이 확인되었다. Electroporation시 전기충격후 20, 40시간 후에 DNA를 첨가하여도 gusA가 발현됨에 따라 전기충격이 세포막의 침투성을 장시간 변화시킴으로써 DNA가 전이될 수 있는 것임을 확인할 수 있었다. GusA의 promoter로 CaMV 35S외에 Actl과 Ubil의 활성을 비교한 바, 35S에 비해 각각 7배, 5배의 활성을 나타내었다. Electroporation 처리후 세포괴의 배양실험에서 100-400 V의 전압과 10-l980 $\mu\textrm{F}$ capacitance의 전 처리 범위에서 캘러스의 지속적인 생장과 함께 식물체 재분화가 일어났다.

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Pleurotus eryngii 로부터 항암물질의 분리 (Antitumor Sterol Isolated from the Fruiting Body of Pleurotus eryngii)

  • 이영훈;박기훈;이병원;조용운;최영주;갈상완
    • 생명과학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.282-288
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    • 2006
  • 새송이버섯으로부터 활성추적법으로 항암활성이 있는 물질인 에르고스테롤 프록사이드를 분리하였다. 이 스테롤의 구조는 분광법과 NMR법으로 확인하였으며 분자식은 $C_{28}H_{44}O_3$이었다. 폐암과 난소암에 $IC_{50}$값은 각각 $7{\mu}M$$14{\mu}M$이었다. DNA단편화 실험에서 이 화합물은 암세포의 chromosimal DNA 를 사닥다리모양으로 분해하였고, 세포 분열주기의 억제실험에서 G1단계를 억제함을 관찰하였다.

Expression Profiles of Immune-related Genes in Fluoxetine-treated Human Mononuclear Cells by cDNA Microarray

  • Lee, Hee-Jae;Jin, Sheng-Yu;Hong, Mee-Suk;Li, Guang-Zhe;Kim, Jong-Woo;Kim, Beom-Sik;Chung, Joo-Ho
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제7권5호
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    • pp.279-282
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    • 2003
  • To investigate the effect of fluoxetine, one of selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs), on the immune system, human peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were treated with fluoxetine $(10^{-7}\;M)$ for 24 h, and immune-related genes were analyzed by cDNA microarray. Expression of the immunerelated genes such as CD107b (LAMP-2), CD47 receptor (thrombospondin receptor), CD5 antigen-like (scavenger receptor cysteine rich family), copine III (CPNE3), interleukin (IL)-18 (interferon-gammainducing factor), integrin alpha 4 (CD49d), integrin alpha L subunit (CD11a), IL-3 receptor alpha subunit, L apoferritin, and small inducible cytokine subfamily A (Cys-Cys) member 13 (SCYA13) was induced by fluoxetine. This result suggests that fluoxetine may affect the immune system, and provides fundamental data for the involvement of SSRIs on immunoregulation.