• 제목/요약/키워드: KR

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Comparative Modeling and Molecular Dynamics Simulation of Substrate Binding in Human Fatty Acid Synthase: Enoyl Reductase and β-Ketoacyl Reductase Catalytic Domains

  • John, Arun;Umashankar, Vetrivel;Krishnakumar, Subramanian;Deepa, Perinkulam Ravi
    • Genomics & Informatics
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    • 제13권1호
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    • pp.15-24
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    • 2015
  • Fatty acid synthase (FASN, EC 2.3.1.85), is a multi-enzyme dimer complex that plays a critical role in lipogenesis. This lipogenic enzyme has gained importance beyond its physiological role due to its implications in several clinical conditions-cancers, obesity, and diabetes. This has made FASN an attractive pharmacological target. Here, we have attempted to predict the theoretical models for the human enoyl reductase (ER) and ${\beta}$-ketoacyl reductase (KR) domains based on the porcine FASN crystal structure, which was the structurally closest template available at the time of this study. Comparative modeling methods were used for studying the structure-function relationships. Different validation studies revealed the predicted structures to be highly plausible. The respective substrates of ER and KR domains-namely, trans-butenoyl and ${\beta}$-ketobutyryl-were computationally docked into active sites using Glide in order to understand the probable binding mode. The molecular dynamics simulations of the apo and holo states of ER and KR showed stable backbone root mean square deviation trajectories with minimal deviation. Ramachandran plot analysis showed 96.0% of residues in the most favorable region for ER and 90.3% for the KR domain, respectively. Thus, the predicted models yielded significant insights into the substrate binding modes of the ER and KR catalytic domains and will aid in identifying novel chemical inhibitors of human FASN that target these domains.

설계차량하중 변화에 따른 교량상 장대레일 궤도의 부가축응력 (Additional Axial Stress of CWR Track on the Bridge according to the Variation of Design Vehicle Load)

  • 윤경민;전병흔;최신형;임남형
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제16권1호
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    • pp.807-813
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    • 2015
  • 교량상의 장대레일은 궤도-교량상호작용에 의해 토노반상의 장대레일에 비해 복잡한 거동을 보인다. 궤도-교량 상호작용에 영향을 미치는 요인은 온도변화와 차량하중이다. 국내 철도설계지침 KR C-08080에서는 해석 시 사용하는 물성치, 모델링 방법, 하중 및 하중 조합 방법 등에 대하여 제시하고 있다. 2014년에 KR C-08080에서 제시된 차량하중이 변경되었다. 본 연구에서는 변경된 차량하중의 영향을 평가하기 위하여 22개 교량에 대한 궤도-교량 상호작용 유한요소 해석을 수행하였다.

과학기술사적 관점에서 바라본 4 체액설(體液說)과 사상의학(四象醫學) 이론 체계의 비교 연구 (A comparative study on Humor theory and Sasang Constitutional Medicine from the viewpoint of science and technology history)

  • 백진웅
    • 대한한의학원전학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.13-22
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    • 2012
  • Objective : This study was conducted to compare Sasang Constitutional Medicine (SCM) and Four Humor Theory (FHT). Method : 1. The theoretical comparison was focused on the central pillars of both theories, i.e., the theories of Hippocrates and his successor Galenos as well as Lee Je-ma. 2. Research papers on SCM and FHT were collected as follows. First, relevant papers were searched for using several electronic databases: Pubmed (http://www.pubmed.org.), NDSL (http://www.ndsl.kr/index.do), KISS (http://kiss.ksstudy.com), and RISS (http://www.riss4u.net.). Keywords were 'Sasang', 'constitution', 'constitutional medicine', 'humor theory', 'Hippokrates', 'Galenos', and "Dongeuisusebowon".In addition, relevant papers were searched for using the websites of The Korean Society for the History of Medicine(http://medhist.kams.or.kr), The Korean society of Oriental medical classics (http://www.wonjeon.or.kr), The Society of Sasang Constitutional Medicine (http://www.esasang.or.kr/new_home/main.htm),and The Korean Association of Oriental Medical Physiology (http://www.ksomp.or.kr). As a result, a total of 32 papers were included in the final selection. Result & Conclusion : In this study, a comparison was made between FHT and SCM in terms of physiology, pathology and therapy. We showedthat the theories share similarities as well as differences. However, in a practical sense, the two should be characterized based on their differences rather than their similarities. In conclusion, the two have something in common, but overall, they are remarkably different from each other.

흑연 표면에서의 Kr 기체의 물리흡착 (Physical Adsorption of Kr Gas on Graphite Surface : 2D Equation of State)

  • 안운선;손용근;류은아;이광순
    • 대한화학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.246-252
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    • 1981
  • 흑연 표면(0001)에 흡착한 Kr 분자를 2D 기체로 보고 Kr-흑연의 상호작용 에너지와 Henry 상수 $K_H$를 Fourier series expansion에 의해서 해석함수로 구하였다. 그리고 2D virial계수 $B_{2D}$$C_{2D}$를 계산하여 2D 상태방정식을 얻었으며, 이것으로 부터 구한 흡착등온곡선을 실험 결과와 비교하였다. 상호작용 에너지는 Lennard-Jones (12, 6) 퍼텐셜의 pairwise additivity로 가정하였으며, 사용한 파라미터는 ${\varepsilon}_{gs}$/k = 70 K, ${\sigma}_{gs}$ = 0.35 nm, ${\varepsilon}_{gg}$/k = 170 K 및 ${\sigma}_{gg}$ = 0.37 nm이다.

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열차제어시스템 위험원 분석을 위한 HAZOP-KR에 대한 연구 (A Study on the HAZOP-KR for Hazard Analysis of Train Control Systems)

  • 황종규;조현정;한찬희;조우식;안진;하동명
    • 한국철도학회논문집
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    • 제13권4호
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    • pp.396-403
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    • 2010
  • 열차제어시스템은 열차의 안전운행을 책임지는 바이탈한 제어장치로서 높은 안전성이 요구되고 있다. 이에 따라 유럽을 중심으로 열차제어시스템의 안전성 확보 및 평가를 위한 요구사항들이 국제 규격화되고 있다. 국내에서도 IEC와 같은 국제규격에 따라 안전성 확보를 위한 노력이 진행 중이지만 아직은 시작 단계에 불과하다. 관련된 IEC 규격에서는 위험원 분석을 HAZOP 기법을 적용하도록 권고하고 있지만, 이 기법은 화학공정 분야에서 발전된 방법으로 철도시스템에 다소 부적절한 부분이 있다. 본 논문에서는 이의 개선을 위해 열차제어시스템에 적합한 HAZOP-KR 방법을 제시하였고, 또한 실제 개발하고 있는 시스템에 적용하여 그 적용사례를 제시하였다.

AC plasma display panel의 페닝 방전가스 혼합비 변화에 따른 방전특성 연구 (A Study on the Discharge Characteristics with New Penning Gas Mixture for AC plasma display panel)

  • 박문필;이승준;이재경;황호정
    • 한국진공학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.127-134
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    • 2002
  • 본 논문은 AC PDP에서 사용하는 가스의 혼합비, 압력, 페닝 효과를 고려한 가스 조합의 최적화를 통해 낮은 방전전압으로 휘도의 증가를 얻을 수 있는 고휘도, 고효율 PDP 페닝 기체 혼합비를 찾고자 하였다. He(70%)-Ne(27%)-Xe(3%)의 3원 혼합기체와 Ne(96%)Xe(4%)의 2원 혼합기체에 페닝 효과를 극대화하기 위한 소량의 Ar, Kr을 첨가하여 각각의 첨가비에 따른 방전 개시전압, 방전 유지전압, 휘도, 발광효율 등을 측정하였다. 또한 페닝효과에 의한 방전 공간상의 전자수 증가를 확인하기 위해 셀 내의 전극 위에 쌓이는 벽전하 양을 측정하였다. 소량의 Ar(0.01%-0.03%) 또는 Kr(0.01%-0.03%)을 HE-Ne-Xe과 Ne-Xe 혼합가스에 첨가했을 때 페닝효과에 기인하여 휘도 및 발광효율이 각각 최고 10%-20% 증가하였다. 또한 페닝효과를 확인하기 위한 벽전하의 양은 10%-25% 증가를 보였다. 방전개시전압 및 최소방전유지전압은 대략 2V-3V정도 감소하였다.

액체혼합물의 활동도계수의 이론적 계산 (Theoretical Calculation of Activity Coefficients of Liquid Mixtures)

  • 문대원;전무식;이태규
    • 대한화학회지
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    • 제21권6호
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    • pp.395-403
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    • 1977
  • 액체이론(Significant Structure Theory)를 단원자 분자로부터 다원자 분자에 이르는 여러 액체혼합물에 적용하여 전 농도 범위에서 액체 혼합물의 활동도 계수를 계산했다. 단원자 분자계(Ar-Kr, Kr-Xe)와 이원자 분자계$(Ar-O_2,\;N_2-CO)$와 메탄-크립톤계의 액체혼합물의 활동도 계수는 ${\delta}E_s$ 수정 변수에 의해 좋은 결과를 얻었다. 아르곤-질소, 산소-질소, 그리고 메탄-프로판계에 대해서는 이 외에 ${\delta}$V, ${\delta}$n 수정 변수가 더 필요했다.

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웅성불임기술을 이용한 쇠파리 구제에 관한 연구 (4) 방사선 조사가 쇠파리에 미치는 영향 (Study on Stable Fly Eradication by Sterile-male Technique (4) Effects of X-ray Irradiation on the Stable Fly)

  • 정규회;유준;권신한
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.163-166
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    • 1975
  • 쇠파리의 난과 3-5일령 및 7-9일령 용에 X-선을 조사시켜 부화율, 우화율을 조사하였으며 또한 3-5일 영용에 X-선을 조사시켜 우화된 성충의 불임유기선량에 대한 실험결과를 다음과 같이 얻었다. 1. 란부화율은 약 300R 조사시 $50\%$이었으며 3-5일영 및 7-9일영 번데기에 대한 사충율의 회귀직선은 Y=2.665x+2.301, Y=4.36x_0,18이고 중앙치사선량$(LD_{50})$은 11.5KR과 12.6KR이었다. 2. 3KR 조사웅충과 정상자충에서 산란된 란은 약 $98\%$가 미부화되었다. 그러나 2.KR 조사자충과 정상웅충 사이에서 산란된 란은 $100\%$가 부화되지 않았다. 3. 불임유기선량은 자충이나 웅충과 같이 4KR이면 완전할 것으로 보며 $(LD_{50})$선량을 고려할 때 충분히 이용가능할 것으로 본다.

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The Effects of Panax ginseng on TCDD-induced Testicular Atrophy in Guinea Pigs

  • Kim, Wun-Jae;Hwang, Seok-Yeon;Lee, Hyung-Lae;Song, Geun-Song;Kim, Si-Kwan
    • 고려인삼학회:학술대회논문집
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    • 고려인삼학회 1998년도 Advances in Ginseng Research - Proceedings of the 7th International Symposium on Ginseng -
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    • pp.300-311
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    • 1998
  • 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD), one of the most notorious toxic environmental pollutants, induces various toxic effects in many organs including testes and is regarded as an endocrine disruptor. Korean ginseng, on the other hand, has been well known for its preventive effects on lox- ins, diabetes melltus and hyperlipidemia. We investigated, histopathologically, the effect of Korean Red ginseng water extract (KR-WE) on guinea pig testes damaged by TCDD. Ninety guinea pigs were divided into 6 groups: normal control (NC) group received vehicle and saline; TCDD,1191kg b.w., was administered intraperitoneally to the single dose TCDD-treated (77) group; 100 mghg b.w.16 and 200mg1kg b.w./d KR-WE were injected intraperitoneally to the preventive groups (PIOO and P2OO, respectively) for 28 days from 1 week before TCDD injection, and to the therapeutic groups (CIOO and C2OO, respectively) for 14 days since 1 week after TCDD administration. Increment of body weight was retarded to a larger extent by TCDD. Moreover, body weight of the 77 group decreased significantly 7 days after TCDD exposure, while that of preventive groups kept increasing. Decrease in body weight was not observed in KR-WE-treated groups. Weight decrease in testes caused by TCDD was remarkably protected by KR-WE. Testicles in 77 group displayed decreased tubular size and maturation arrest at the primary or secondary spermatocyte stage. On the other hand, maturation arrest in germ cells by TCDD was improved in KR-WE treated groups. Almost complete protection of the testes was observed in PIOO and P2OO groups. In addition, the therapeutic effect was noticed in C 100 and C2OO groups. These results provided strong evidence that Korean Red ginseng might be a useful agent for the prevention and treatment of testicular damage induced by environmental pollutants.

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확률론적 파괴역학 기법을 이용한 압력관의 파손확률 평가 (Failure Probability Evaluation of Pressure Tube using the Probabilistic Fracture Mechanics)

  • 손종동;오동준
    • 한국안전학회지
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    • 제22권4호
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    • pp.7-12
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    • 2007
  • In order to evaluate the integrity of Zr-2.5Nb pressure tubes, probabilistic fracture mechanics(PFM) approach was employed. Failure assessment diagram(FAD), plastic collapses, and critical crack lengths(CCL) were used for evaluating the failure probability as failure criteria. The Kr-FAD as failure assessment diagram was used because fracture of pressure tubes occurred in brittle manner due to hydrogen embrittlement of material by deuterium fluence. The probabilistic integrity evaluation observed AECL procedures and used fracture toughness parameters of EPRI and recently announced theory. In conclusion, the probabilistic approach using the Kr-FAD made it possible to determine major failure criterion in the pressure tube integrity evaluation.