Evidence highlighting the importance of gut microbiota in biodiversity conservation is growing; however, gut bacteria in South Korean wildlife have not been well identified. Using a culture-dependent isolation method, we identified the gut bacteria from Korean aquatic wildlife: the gazami crab (Portunus trituberculatus), Korean striped bitterling (Acheilognathus yamatsutae), oily bitterling (Acheilognathus koreensis), leopard mandarin fish (Siniperca scherzeri), Korean dark chub (Zacco koreanus), diving beetle (Cybister lewisianus), spotted steed (Abbottina springeri), and Korean spotted sleeper (Odontobutis obscura interrupta). We identified 18 strains previously unrecorded in South Korea by comparing 16S rRNA gene sequences of isolates against the EzBioCloud and National Institute of Biological Resources(NIBR) databases. The isolated strains belong to the phyla Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, and Proteobacteria. We also assessed for phylogenetic relatedness, Gram-stain reaction, colony and cell morphology, and biochemical characteristics. Basic information and 16S rRNA gene sequences of the isolates were registered in NIBR, and NIBR accession numbers are provided.
생균제로서 가능성 있는 유산균의 선별을 위해 발효식품인 동치미로부터 분리된 균주들의 내산성, 내담즙성, 내췌장 액성 및 유해균 억제능을 조사하였다. 특히 분리된 균종 중에서 FF-3가 인공위액과 담즙산에 대한 높은 내성을 나타내었을 뿐만 아니라, Salmonella sp. 과 Escherichia coli에 대하여 높은 항균 활성을 나타내었다. FF-3유래 박테리오신은 그람 양성 및 음성 세균에서 넓은 항균 범위를 나타내었다 본 연구에서 최종선별된 FF-3 균주를 16s rDNA sequence 동정한 결과 Lactobacillus sp.으로 확인되어 FF-3으로 명명하였다.
Geniposide, an iridoid glucoside, has been isolated from the butanol fraction of Gardenia jasminoides Ellis (Rubiaceae). The component was found to be transformed into the blue pigments by some aerobic bacteria, suggesting that geniposide is the precursor for the formation of pigments after converting into genipin, an aglycon of geniposide, by ${\beta}-glucosidase$. Some bacteria having a ${\beta}-glucosidase$ activity did not form the pigments, which may mean that the formation of pigments can only be occurred by the reaction of any enzyme or compound in the pigment-producing bacteria.
Two species of antimicrobial agent producing bacteria and one sensitive strain were isolated from soil. Those were identified as B. subtilis, B. licheniformis, and Curtobacterium sp. by morphological, biochemical, physiological and chemotaxonomic characteristics. These were designated as B. subtilis cx1, B. licheniformis cy2 and Curtobacterium sp. cf3, respectively. Antimicrobial agent produced by B. subtilis cx1 showed high antibacterial activity against gram positive bacteria including of B. subtilis, Curtobacterium sp., L. mesenteroids, Staphy. aureus, S. faecalis and even gram negative bacteria, P. aeruginosa. Antimicrobial agent from B. licheniformis cy2 showed slightly lower antimi crobial activity than that from B. subtilis cx1. These two strains showed maximum production of antimicrobial agents at 30oC for 9~21hr cultivation. Curtobacterium sp. cf3 showed more sensitive activity than a sensitive strain of B. subtilis ATCC 6633 which was same genus or species with the B. subtilis cx1 and B. subtilis cy2, when the antimicrobial agent producing strains, B. subtilis cx1 and B. subtilis cy2, were directly applied onto these sensitive lawns.
Isolation of pollutant-degrading bacteria is important in bioaugmentation, one of the methods for biological degradation of environmental contaminants. We focused on the magnetic activated sludge (MAS) process as a culture method that efficiently concentrates degrading bacteria, and cultured activated sludge with 1,4-dioxane as a model pollutant. After 860 days of operation, MLVSS, which indicates the amount of sludge, increased from 390 mg/L to 10,000 mg/L, and the removal rate of organic matter including 1,4-dioxane, tetrahydrofuran, and glucose in the artificial wastewater reached up to 97%. Based on these results, the MAS process was successfully used to acclimate activated sludge with 1,4-dioxane. Bacterial flora analysis in the MAS showed that bacteria of the genus Pseudonocardia, already reported as 1,4-dioxane degrading bacteria, play an important role in the degradation of this pollutant. The MAS process is a suitable culture method for acclimation of environmental pollutants, and the findings indicate that it can be used as an enrichment unit for pollutant-degrading bacteria.
Insoluble phosphate-solubilizing bacteria are routinely screened by a plate assay method using Pikovskaya agar and a modified Pikovskaya medium. A modified Pikovskaya medium to improve the clarity of the yellow-colored halo has not necessarity improved the plate assay. Colonies of phosphate-solubilizing bacteria tested could be redily selected after 48 h of incubation by green-colored colony formation on plate in which bromcresol green(BCG) was included. Among them, two bacterial strains did not produce distinct yellow halos after 48 h of incubation. We suggest that the green colony formation on plate medium containing BCG is advantageous ofr rapid isolating phosphate-solubilizing bacteria directly from soil.
Ryu Hye Myung;Kim Sang Gyo;Kim Su Won;Choi Ju Yun;Nam Jin Sik;Yoo Min
대한의생명과학회지
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제11권4호
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pp.539-543
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2005
Elevated level of serum cholesterol in humans is a risk factor correlated with the development of coronary heart disease. We have screened lactic acid bacteria from pig and human feces for the development of probiotics which have an anti-cholesterol effect. We have used special media to isolate only lactic acid bacteria and they were subjected to the experiments such as oxgal test, carbohydrate fermentation test. Results from the acid tolerance test and growth test in the presence of oxgal demonstrated that some strains would likely survive in thuman stomach, where acidity is high, and in small intestine, where bile fluid is present. In conclusion, we were able to screen lactic acid bacteria which were tolerant against bile acid and supposed to be prominent to lower the cholesterol level in human serum.
This study was carried out to select the useful bacteria which secret extracellula enzymes for enzymatic deinking agent of old newspaper. CMCase, FPase and xylanase activities of the bacteria liquid culture were measured at optimal growth conditions. Clear zone test was checked on the solid culture. The results of this study were as follow: Eight strains of 28 bacteria isolated from a paper mill soil ground were shown strong CMCase and xylanase activity with the clear zone test. The optimal pH and temperature for culture growth were 6~8 and 26~$34^{\circ}C$, respectively and optimal culture period were less than 60 hours. Based on CMCase, FPase and xylanase activity, strain No. 18, 21, 22 and 28 which were relatively higher than the other strains, were selected for further enzymatic deinking research.
Ten(10) strains of aerobic bacteria and two(2) strains of microaerobic bacteria were isolated out of soysauce which was brewed by the conventional process. The following bacteria were identified by studying their morphorogies and physiological characters. Bacillus pumillus-R-2; Bacillus subtilis var., aterimus-S-1; Bacillus licheriformis var-S-2; Bacillus subtilis-T-1; Sarcina maxima-T-2; Pediococcus acidi lactici-Z-2; Bacillus citreus var, . soyaB-Z-5. T-2 and Z-5 of the isolated bacteria were found good in growth even in the 24%-salted density, and Z-5 was more vigorous than T-2 though stinking. S-1 produced black-brown pigment from the medium containing various kinds of carbohydrate and the medium of soysauce which are available to S-1.
Blacken spoilage is one of the common problems during the cold storage of dried persimmon in Korea. We collected the spoiled dried persimmon in the refrigerator and classified them to 4 types depending on their appearances. Furthermore we isolated blacken spoilage inducing bacteria from type D of dried persimmons. Among the isolates we identified the seven blacken spoilage inducing bacteria. They are Aeromonas hydrophila DP1, Cedecea davisae DP2, Ewingella americana DP3, Flavimonas oryzihabitans DP4, Providencia rettgeri DP5, Providencia rustigianii DP6 and Serratia plymuthica DP7. Strains were identified based on their morphological, cultural and physiological properties. We also found that Ewingella americana DP3, Flavimonas oryzihabitans DP4 were the major blacken spoilage inducing bacteria during dried persimmon storage.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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