Detergent-degrading bacteria isolated from the Han River downstream running through the center of Seoul area were identified. Samples were monthly taken from the surface waters at four designated sites from October, 1980 to August, 1981. Isolated strains were characteristically Gram-negative bacteria in all, and they were classified within 18 genera, 43 spceies. The dominant strains of detergent -degrading bacteria were within geneus Pseudomonas. On the regional distribution of detergent-degrading bacteria, Euterobacteriaceae and genus Aeromonas were suddenly increased at the Third Bridge of site 2 and the First Bridge of site 3, and others were almost the same regardless of sites.
Isolation and identification of mesophilic and psychrotrophic bacteria distributed in Korean refrigerated beef were attempted. Total isolated colonies were 192, and identified as 5 genera and 10 species. Among them, mesophilic bacteria were Enterobacter aerogenes, E. agglomerans, Serratia liquefaciens, Proteus mirabilis, and "psychrotrophic" bacteria were Pseudomons fluorescens, P. putida, P. pickettii, P. mendocina, P. stutzeri, Alcaligenes faecalis. Dominant species was Serratia liquefaciens as mesophiles, and Pseudomonas putida as psychrotroph.chrotroph.
철저한 혐기적 방법으로 배양분리한 결과 편성 혐기성세균의 분리율이 높아졌고, 검체당 평균 3.3주가 분리되었다. 혈액배지인 NATB배지와 BA배지에서 비혈액배지인 NAT배지와 GAM배지에서 보다 세균 분리효과가 우수했다. NATB배지에는 혐기성 그람 양성 구균에 좋은 분리효과를 나타내었고, 그람 음성 간균은 15주 분리되었다. 이 중 Bacteroides가 12주로서 가장 많이 존재하는 균종이었다.
In eukaryotic cells, various proteins are anchored to the plasma membrane through glycosylphosphatidylinositol (GPI). To study the biosynthetic pathways and modifications of GPI, various mutant cells have been isolated from the cells of Chinese hamster ovaries (CHO) supplemented with several exogenous genes involved in GPI biosynthesis using aerolysin, a toxin secreted from gram-negative bacterium Aeromonas hydrophila. Alpha toxin from Gram-positive bacterium Clostridium septicum is homologous to large lobes (LL) of aerolysin, binds GPI-anchored proteins and possesses a cell-destroying mechanism similar to aerolysin. Here, to determine whether alpha toxins can be used as an isolation tool of GPI-mutants, like aerolysin, CHO cells stably transfected with several exogenous genes involved in GPI biosynthesis were chemically mutagenized and cultured in a medium containing alpha toxins. We isolated six mutants highly resistant to alpha toxins and deficient in GPI biosynthesis. By genetic complementation, we determined that one mutant cell was defective of the second subunit of dolichol phosphate mannose synthase (DPM2) and other five cells were of a putative catalytic subunit of inositol acyltransferase (PIG-W). Therefore, C. septicum alpha toxins are a useful screening probe for the isolation of various GPI-mutant cells.
Yeo, Han-Cheol;Jang, Jin-Young;Park, Hyeong-Jun;Min, Byung-Tae;Yoo, Min
Quantitative Bio-Science
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제37권2호
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pp.125-132
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2018
In this study, noble strains of lactic acid bacteria were isolated and identified by genetic analysis of 16s rRNA. Also, pH-dependent growth curve, cholesterol assimilation ability and sugar production efficiency were measured. Lactic acid bacteria were identified to inhabit in the milks from various animals. Results of sequence analysis showed that there were differences in 16S rRNA sequence among strains and part of gene deletion was also recognized. Growth rates were varied, too, depending on the pH of the medium. Lactobacillus rhamnosus LOCK908 isolated from cow milk showed the highest growth rate and high cholesterol assimilation ability. Results of sugar fermentation tests were relatively consistent with the sequencing results. So, we propose newly isolated Lactobacillus rhamnosus LOCK908 as useful candidate for a starter of fermented beverage and probiotics. Results of this study will contribute to the isolation and identification of noble Lactic acid bacteria and to the public health.
Bacterial decarboxylation of amino acids in food leads to the production of biogenic amines, which can cause reactions in human that include headaches, nausea, palpitations, chills, and severe respiratory distress. The amine putrescine is an especially effective inhibitor of metabolizing enzymes and amplifies histamine intoxication and tyramine poisoning. Using an L-ornithine decarboxylating medium, we isolated 14 putrescine-producing bacteria from sand lance, Ammodytes personatus, sauces. The isolates were identified, using an API kit and 16S rRNA analysis, as Lysinibacillus fusiformis (1 strain), Lysinibacillus xylanilyticus (6 strains), Lysinibacillus macroides (1 strain), Lysinibacillus sphaericus (3 strains), Bacillus fusiformis (1 strain), Paenibacillus favisporus (1 strain), and Staphylococcus caprae (1 strain). These strains produced between 1.66 to 236.97 μg/mL of putrescine after 48 h incubation. Lysinibacillus spp. were the dominant putrescine-producing bacteria in sand lance sauces, which produced 236.97 μg/mL of putrescine from a culture broth containing 0.5% L-ornithine. This is the first report on the isolation and identification of putrescine-producing bacteria from sand lance sauces.
For the treatment of Korean food-wastes, three mesophilic and one thermophilic bacteria were isolated from soil and fermented fertilizers. The thermophilic Streptomyces sp. strain WF021 produced two enzymes which were a protease and a lipase at 55$^{\circ}C$. The mesophilic Bacillus sp. strain WF024 produced four enzymes which were a protease, a lipase, a amylase and a cellulase when the strain was grown both at 3$0^{\circ}C$ and 55$^{\circ}C$. The Bacillus sp. PY123 had produced three enzymes which were a protease, a cellulase and a lipase at 3$0^{\circ}C$. The Bacillus sp. strain CM1 produced three enzymes which were a protease, a amylase, and a cellulase at 3$0^{\circ}C$. The bacteria were grown in media containing 6% NaCl at least and did not have antagonism each other. The four isolates treated much more food-wastes than referance strains did. In a flask without aeration, three reference strains treated 15.4% of food-wastes, while four isolates treated 23.7% of food-wastes. In a flask with aeration, food-wastes were treated 67.3% by four isolates, and 64.3% by three reference strains, but 53.9% without bacteria. However, food-wastes were treated about 78% in a 200$\ell$-reactor made by Siwon Co., while 65.8% in a 20$\ell$-reactor made by Sanyo Co.
Isolation and identification of anaerobic bacteria from blood cultures are still technically demanding procedures. Recently, with the use of gas liquid chromatography, the accuracy of identification is much improved. However, there has never been a satisfactory data analysis on anaerobic bacteremia in Korea. The authors evaluated both the clinical and the bacteriological data of 129 anaerobic bacteremias found at the Yonsei Medical Center during the period of 1973 to 1984. The most frequently isolated anaerobic bacteria were Bacteroides (52.7%), among which the major species was B. fragilis (38.7%). Incidence of anaerobic bacteremia by sex was 57% in male and 43% in female. Mortality was higg in groups below 1-year old and above 50-year old. The cause of death seemed closely correlated with the patient's age, general condition and the severity of the underlying disease. Various neoplasms were the most common (20%) underlying diseases predisposing the anaerobic bacteremia. Biliary tract was considered the most frequent route of infection in anaerobic bacteremia. The frequent clinical signs in anaerobic bacteremia were fever (65%), followed by liver function abnormality (29%), jaundice (20%) and hypotention(18%). When analysis of positive rate of blood culture was made on the patients from whom 4 cultures were done within 24 hours, it was found that 33% of the samples were positive. Isolation rate of anaerobic bacteria in thioglycollate medium was 83.8%, while it was 44% in Tryptic soy broth. Among the anaerobic bacteremia, 25.4% were polymicrobial infections with aerobic bacteria (92.5%), such as E. coli(33.3%). From these studies, it is concluded that B. fragilis is the most important causative organism in anaerobic bacteremia, with high fatality, particularly in those who have underlying diseases. The ports of entry are mainly biliary, gastrointestinal and female genital tract. Fever is the most frequent clinical sign. Single blood culture is not sufficient to detect all anaerobic bacteremia, therefore more cultures with optimal time interval are needed. The incidence of polymicrobial infection in anaerobic bacteremia is higher than that in overall bacteremia.
김치발효 중 Gram 양성세균 또는 유산균의 분리와 동정을 시도하였다. 종의 다양성은 분리배지와 온도에 영양을 받았고, 다양성은 온도가 낮아질수록 감소하는 경향이었다. MRS는 세균의 분리에 KM(김치재료로 만든 자연배지)은 종의 수를 파악 하는데 각각 적합하였다. 분리균의 동정은 Bergey's manual of Systematic Bacterio]ogy (1986)를 기초로 하여 작성한 이 분농생표(dichotomous Identification scheme)에 의하여 선행하였다. 각 온도(5, 15, $25^{\circ}C$)에서 동정된 Gram 양성세균은 Leuconostoc 5종, Streptococcus 4종, Pediococcus 3종, Bacillus 2종 그리고 Ltobacillms 18종이였다. 각 온도에서 출현 빈도가 높은 종은 $25^{\circ}C$에서 LactobaIlus ptantanmz, Streptococcµs faffinolactis, Leuconostoc maιnteroid, subsp mlsentιroides 이었고, $15^{\circ}C$에서 L. mesenteroides Lactobacillus fructosus, L. maen teroid,l.I subsp. mesent,roid, 이였고, $5^{\circ}C$ 에서 Leuconostoc sp.(65.2 빈도)에 의하여 이루어졌다. 그리고 각 온도에 따른 김치발효 중 지금까지 알려진 Pediococcus cerevisiae 와 Streptococcus faecalis는 분리되지 않았다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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