• Title/Summary/Keyword: Integration vector

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GIS위상구조자료로부터 교통망자료의 추출에 관한 연구 (Transportation Network Data Generation from the Topological Geographic Database)

  • 최기주
    • Spatial Information Research
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    • 제2권2호
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    • pp.147-163
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    • 1994
  • 본 고는 위상관계를 지니는 vector GIS데이터구조로 부터 교통계획이나 도로계획시 필요한 node-link중심의 교통망 자료를 획득하기 위한 절차 및 활용프로그램을 제시하는데 목적이 있다. 이를 위해 ARC/INFO GIS와 UTPS(Urban Transportation Planning System)계의 TRANPLAN이 구현을 위한 대표적 소프트웨어로서 선정되었고, 상호간 데이터의 교환을 위한 세가지으 위상변환(Topology Conversion)방법이 제시되었다. 첫번째 방법은 소프트웨어 개발자(ARC/INFO의 ESRI및 TRANPLAN Urban Analysis Group)들이 공동개발하여 별도의 소프트웨어 package로 구축한 프로그램에 대해서 변환절차의 개요 및 프로그램의 단계적 확대방안에 관해서 소개하였고, 둘째로 ARC/INDO에서 사용가능한 node attribute table(NAT)을 별도의 topology로 구축하여 acc attribute table(AAT)및 NAT에 있어서의 node체계를 상호 관련시켜서 node-link교통망 자료로 변환하는 알고리즘 AML(Arc Macro Language)로서 제시했으며, 끝으로 FOR-TRAN언어를 사용한 AAT에서의 node변환 알고리즘을 소개하였다. 이러한 GIS데이터의 위상변환의 필요성은 GIS를 교통부문에(특히 교통수요 예측)직접 이용함은 물론 더 나아가서는 양자사이으 효율적인 데이터의 교환이 그목적이라고 할 수 있다. 비록, 본고에서는 이들 세가지 방법 상호간의 구체적인 장단점에 관해서는 토의되지 못했지만 세방법중 어떠한 것이든 교통수요 예측모형을 위한 데이터의 변환과정에 역할을 할 수 있으며, 이들 시스템간의 효율적 통합은 교통계획과정에서의 생산성 향상에 기여할 것으로 보인다.

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수분ㆍ수정 시기를 이용한 Bialaphos 저항성 형질전환 담배의 개발 (Development of Bialaphos Resistant Transgenic Tabacco Plants by Pollination and Utilization of Fertilization Cycle)

  • 이효연;노일섭;김진호;유장렬;이종석;김학진
    • 식물조직배양학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.99-103
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    • 1994
  • 비선택성 제초제인 bialaphos는 고등식물에 있어서 glutamine 합성을 억제하여 식물체를 고사 시키는 능력을 갖고 있다. 본 연구에서 acetylteansferase에 의해 encoding된 bialaphos 저항성 유전자(bar gene)는 세균(Pseudomonas sryngae pv tabaci)의 genomic DNA로부터 cloning된 것을 사용하였다. 수분시킨 담배의 화계에 일정한 시간별로 bar 유전자를 처리한 결과 수분 후 30-40시간 사이의 처리구 에서 형질전환 식물체가 가장 많이 얻어 졌다. 그러한 형질전환 식물체의 kanamycin과 bialaphos 저항성 형질은 자식후대(T$_1$, T$_2$)에 있어서도 우성형질로 유전되었으나 wild type의 담배는 상기의 약제를 처리 하였을때 전부 고사하였다. 그리고, T$_1$세대의 형질전환 식물체로부터 전 염색체 DNA를 추출하여 Southern 분석한 결과 bar 유전자가 식물의 염색체상에 안정하게 존재하는 것을 확인하였다. 이상의 결과로부터 담배의 수분, 수정 시기에 외부유전자인 bar를 화주에 처리함으로써 bialaphos 저항성 식물을 만들어낼 수 있었다.

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The EST Analysis and Transgene Expression System in Rice

  • Kim, Jukon;Nahm, Baek-Hie
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제1권1호
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    • pp.46-55
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    • 1999
  • The expressed sequence tags(ESTs) from immature seed of rice, Oryza sativa cv Milyang 23, were partially sequenced and analyzed by homology. As of 1998, the partial sequences of about 6,600 cDNA clones were analyzed from normal and normalized immature seed cDNA libraries. About 2,200 ESTs were putatively identified by BLASTX deduced amino acid sequence homology analysis. About 20% of them were putatively identified as storage proteins. Also the clones were highly homologous to genes involved particularly in starch biosynthesis, glycolysis, signal transduction and defenses. Compared to 35% of redundancy in the ESTs of normal cDNA library, that from the substracted library was 15%. The Korea Rice Genome Network is maintained to provide the updated information of sequences, their homologies and sequence alignments of ESTs. For the stable expression of transgene in rice, diverse vectors were developed for overexpression, targeting and gene dosage effect with transit peptides (Tp) and matrix attachment region (MAR) sequence from chicken lysozyme locus. The rice calli were transformed via Agrobacterium tumefaciens LBA4404(pSB1) with the triparental mating technique and selected by herbicide resistance. The green fluorescent protein(GFP) gene in expression vector under the control of rbcS promoter-Tp was overexpressed upto 10 % of the total soluble protein. In addition, the Tp-sGFP fusion protein was properly processed during translocation into chloroplast. The expression of sGFP in the presence of MAR sequences was analyzed with Northern and immunoblot analysis. All the lines in which sGFP transgene with MAR sequence, showed position independent and copy number-dependent expression, while the lines without MAR showed the varied level of expression with the integration site. Thus the MAR sequence significantly reduced the variation in transgene expression between independent transformants.

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Transgenic Expression of MsHsp23 Confers Enhanced Tolerance to Abiotic Stresses in Tall Fescue

  • Lee, Ki-Won;Choi, Gi-Jun;Kim, Ki-Yong;Ji, Hee-Jung;Park, Hyung-Soo;Kim, Yong-Goo;Lee, Byung-Hyun;Lee, Sang-Hoon
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제25권6호
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    • pp.818-823
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    • 2012
  • Tall fescue (Festuca arundinacea Schreb.) is an important cool season forage plant that is not well suited to extreme heat, salts, or heavy metals. To develop transgenic tall fescue plants with enhanced tolerance to abiotic stress, we introduced an alfalfa Hsp23 gene expression vector construct through Agrobacterium-mediated transformation. Integration and expression of the transgene were confirmed by polymerase chain reaction, northern blot, and western blot analyses. Under normal growth conditions, there was no significant difference in the growth of the transgenic plants and the non-transgenic controls. However, when exposed to various stresses such as salt or arsenic, transgenic plants showed a significantly lower accumulation of hydrogen peroxide and thiobarbituric acid reactive substances than control plants. The reduced accumulation of thiobarbituric acid reactive substances indicates that the transgenic plants possessed a more efficient reactive oxygen species-scavenging system. We speculate that the high levels of MsHsp23 proteins in the transgenic plants protect leaves from oxidative damage through chaperon and antioxidant activities. These results suggest that MsHsp23 confers abiotic stress tolerance in transgenic tall fescue and may be useful in developing stress tolerance in other crops.

Cooperation between Human DAF and CD59 in Protecting Cells from Human Complement-mediated Lysis

  • Xu, Li;Wu, Wenlan;Zhao, Zhouzhou;Shao, Huanjie;Liu, Wanhong;Liu, Hui;Li, Wenxin
    • BMB Reports
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    • 제39권6호
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    • pp.743-748
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    • 2006
  • The complement (C) regulatory proteins decay accelerating factor (DAF, CD55) and CD59 could protect host cells using different mechanisms from C-mediated damage at two distinct levels within the C pathway. Co-expression of DAF and CD59 would be an effective strategy to help overcome host C-induced xenograft hyperacute rejection. In this study, we made a construct of recombinant expression vector containing DAF and CD59 cDNA and the stable cell lines were obtained by G418 selection. Extraneous genes integration and co-expression were identified by PCR, RT-PCR and Western blot analysis. Human c-mediated cytolysis assays showed that NIH/3T3 cells transfected stably with pcDNA3-CD59, pcDNA3-DAF, and pcDNA3-CD59DAF-DP were protected from C-mediated damage and that synchronously expressed human CD59 and DAF provided the most excellent protection for host cells as compared with either human CD59 or DAF expressed alone. Therefore, the construct represents an effective and efficacy strategy to overcome C-mediated damage in cells and, ultimately, in animals.

모멘텀 바이어스 인공위성의 2축 자세제어 시스템 설계 (Two Axis Attitude Control System Design of Momentum Biased Satellite)

  • 이승우;서현호
    • 한국항공우주학회지
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    • 제34권4호
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    • pp.40-46
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    • 2006
  • 위성기술의 비약적 발달에 따라서 설계 및 제작에 소용되는 비용은 저렴하지만 신뢰도가 높은 인공위성 자세제어 시스템 개발이 요구되고 있다. 본 연구는 이러한 요구를 만족시키기 위해 반작용휠에 의한 모멘텀 바이어스 벡터가 임의의 방향(태양 방향)을 지향하고 안정화되는 위성시스템을 제시하였다. 위성 시스템에서 고장 가능성이 가장 적은 자기장 센서, 저정밀 태양센서 및 자기토커를 센서와 구동기로 사용하였으며, 고전적 선형 제어방법에 의해 2축 제어하는 제어시스템 설계방법을 제시하였다. 제어기는 PD 형태의 간단한 제어기가 사용되었고, 선형화된 위성시스템에 대한 PD 제어기 설계방법이 적절한 가정과 함께 제시되었다. 제시된 제어기 설계방법에 의해 설계된 폐루프 시스템의 장기 안정성 검증을 위해서 비선형 시뮬레이션 방법을 사용하였다.

Begomoviruses and Their Emerging Threats in South Korea: A Review

  • Khan, Mohammad Sajid;Ji, Sang-He;Chun, Se-Chul
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제28권2호
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    • pp.123-136
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    • 2012
  • Diseases caused by begomoviruses (family Geminiviridae, genus Begomovirus) constitute a serious constraint to tropical and sub-tropical agro-ecosystems worldwide. In recent years, they have also introduced in temperate regions of the world where they have great impact and are posing a serious threat to a variety of greenhouse crops. Begomoviral diseases can in extreme cases reduce yields to zero leading to catastrophic losses in agriculture. They are still evolving and pose a serious threat to sustainable agriculture across the world, particularly in tropics and sub-tropics. Till recently, there have been no records on the occurrence of begomoviral disease in South Korea, however, the etiology of other plant viral diseases are known since last century. The first begomovirus infected sample was collected from sweet potato plant in 2003 and since then there has been gradual increase in the begomoviral epidemics specially in tomato and sweet potato crops. So far, 48 begomovirus sequences originating from various plant species have been submitted in public sequence data base from different parts of the country. The rapid emergence of begomoviral epidemics might be with some of the factors like evolution of new variants of the viruses, appearance of efficient vectors, changing cropping systems, introduction of susceptible plant varieties, increase in global trade in agricultural products, intercontinental transportation networks, and changes in global climatic conditions. Another concern might be the emergence of a begomovirus complex and satellite DNA molecules. Thorough understanding of the pathosystems is needed for the designing of effective managements. Efforts should also be made towards the integration of the resistant genes for the development of transgenic plants specially tomato and sweet potato as they have been found to be widely infected in South Korea. There should be efficient surveillance for emergence or incursions of other begomoviruses and biotypes of whitefly. This review discusses the general characteristics of begomoviruses, transmission by their vector B. tabaci with an especial emphasis on the occurrence and distribution of begomoviruses in South Korea, and control measures that must be addressed in order to develop more sustainable management strategies.

기계충버섯 형질전환체를 이용한 비스페놀 A의 분해와 에스토로겐 활성 제거 (Degradation of Bisphenol A and Removal of Its Estrogenic Activity by Two Laccase Transformants of Irpex lacteus)

  • 김윤정;송홍규;최형태
    • 미생물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.199-202
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    • 2008
  • 리그닌을 분해하는 백색부후균의 하나인 기계충버섯(Irpex lacteus)은 다양한 난분해성물질에 대한 분해능이 매우 높다. 그러나 이 균은 다양한 배양조건에서도 리그닌 분해효소의 하나인 laccase 활성이 매우 낮다. 난분해성 물질들에 대한 분해능을 향상시키기 위하여 laccase 활성을 증가시키고자 아교버섯의 laccase cDNA를 발현벡터로 구축하여 기계충버섯에 형질전환 방법으로 도입하였다. 항시 발현되는 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 유전자의 프로모터와 재조합된 laccase 유전자는 생성된 형질전환체에서 배양초기인 생장기에서 강하게 발현되었으며, 생성된 형질전환체가 내분비장애물질의 하나인 비스페놀 A (BPA) 분해능은 물론 에스트로겐 활성 제거에 있어서도 더 우수하였다.

Antisense gibberellin 3β-hydroxylase발현 형질전환벼 (Antisense GA 3β-Hydroxylase Gene Transferred to Rice Plants.)

  • 강용원;윤용휘;김길웅;이인중;신동현
    • 생명과학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.644-649
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    • 2004
  • GA 생합성에 결정적 역할을 하는 GA 3$\beta$-hydroxylase를 pIG121-Hm 벡터에 GUS유전자를 빼고 antisense로 클로닝하여 이를 동진벼에 도입한 결과 17개체의 절간신장이 억제된 형질전환한 식물체를 얻을 수 있었다. 일반 재배 동진벼를 대조군으로 하여 비교하였을때 antisense GA 3$\beta$-hydroxylase 유전자가 형질 도입된 식물체의 획득형질은 평균적으로 대조군에 비해 절간 신장의 억제가 확인되었다. 절간신장의 억제가 보인 개체의 엽육조직을 co취하여 Southen blot hybridization분석 결과 3개의 line에서 모두 single copy로 도입된 것으로 나타났다. 이로써$T_o$ 식물체 내에 antisense GA 3$\beta$-hydroxylase 유전자를 내포하고 있는 것으로 확인되었다. 이것은 antisense GA 3$\beta$-hydroxylase 유전자가 생체내에서 직접 또는 간접적으로 GA 3$\beta$-hydroxylase유전자의 발현에 관여한 것이라 사료되어진다.

Streptomyces avermitilis에서 olmA5 Gene의 Knock-out에 의한 Oligomycin 합성 억제 (Inhibition of Oligomycin Biosynthesis by olmA5 Gene Knock-out in Streptomyces avermitilis)

  • 강현우;유연우
    • KSBB Journal
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    • 제24권3호
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    • pp.279-286
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    • 2009
  • 방선균은 다양한 생리활성 물질을 이차대사산물로 생산하는 산업적으로 매우 유용한 미생물이다. 이에 따라 많은 연구진들이 방선균에 대한 분자생물학적 연구와 산업적 이용에 대한 연구들을 수행하고 있다. 방선균 중에서도 S. avermitilis는 강력한 구충효과가 있는 avermectin을 생산하지만, 또한 포유동물 세포의 미토콘드리아에서 산화적 인산화반응을 억제하는 oligomycin도 함께 생성된다. 따라서 S. avermitilis에서 oligomycin의 생성을 제거시키기 위하여 oligomycin synthetase gene을 disruption 시키기 위한 연구를 수행하였다. 이를 위하여 S. avermitilis로부터 cloning 한 oligomycin synthetase gene (olmA5)의 중앙부분에 apramycin resistance gene을 끼워 넣어 integration vector로 구축한 후에 S. avermitilis의 chromosomal DNA와의 homologous recombination에 의하여 olmA5 gene의 disruption을 유도하였다. Disruption mutants (olmA5::apra)는 PCR을 통해 olmA5 gene의 위치에 apramycin resistance gene이 존재하는 것으로 확인하였고, 또한 HPLC 분석을 통해 oligomycin 생합성이 완전히 제거된 것임을 확인하였다. 그러나 disruption mutant (olmA5::apra)를 이용하여 avermectin 만을 생산할 수 있었으나, avermectin의 생산량에는 거의 변화가 없었다. 이러한 mutants는 산업적으로 avermectin을 생산하기 위한 균주 개량의 훌륭한 source가 될 수 있을 것이다.