• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제30권8호
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• pp.1835-1838
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• 2009

Inhibition of human phenylethanolamine N-methyltransferase (hPNMT) has been proposed as a method for the treatment of several mental processes which related on adrenaline metabolism. We performed in silico screening to identify flavonoid inhibitors of hPNMT using automated docking method and selected 9 inhibitor candidates based on ligand score (LigScore) and binding free energy (${\Delta}G_{bind}$) estimation. Among 9 flavonoid candidates, 7 flavonoids belong to flavones while the rest of them belong to flavanone. All candidates have common chemical features; two hydrogen bond interactions with side chain of Lys75 and backbone carbonyl oxygen of Asn39, and two hydrophobic interactions. One hydrophobic site is formed by Val53, Leu262, and Met258 and the other is made up of Phe182, Ala186, Tyr222, and Val269. This study can be helpful to understand the structural features for inhibition of PNMT and showed flavonoids as promising inhibitor candidates for hPNMT.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제23권6호
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• pp.641-646
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• 1995

During the screening of inhibitors of melanin biosynthesis from microbial secondary metabolites, a fungal strain MR304 which was capable of producing high level of an inhibitor was selected. Based on taxonomic studies, this fungus could be classified as Trichoderma harzianum. The active compound (MR304-1) was purified from culture broth by Diaion HP-20 column chromatography, ethylacetate extraction, Sephadex LH-20 column chromatographv and HPLC. The inhibitor was identified as 3-(1,5-dihvdroxy-3-isocyanocyclopent-(E)-3-envl)prop-2-enoate by spectroscopic methods of UV, ESIMS, $^{1}$H-NMR, $^{13}$C-NMR, NOE, HMQC and HMBC. MR304-1 showed strong mushroom tyrosinase inhibitory activity with IC$_{50}$ value of 0.25 $\mu $g/ml. It inhibited melanin biosynthesis with 15 mm inhibition zone at 30 $\mu $g/paper disc in Streptomyces bikiniensis, a bacterium used as an indicator organism in this work. It also inhibited melanin biosynthesis in B16 melanoma cells with a niinimum inhibitory concentration of 0.05 $\mu $g/ml.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권11호
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• pp.1994-1998
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• 2017

FtsZ, a bacterial cell-division protein, is an attractive antibacterial target. In the screening for an inhibitor of Staphylococcus aureus FtsZ, madurahydroxylactone (1) and its related derivatives 2-5 were isolated from Nonomuraea sp. AN100570. Compound 1 inhibited S. aureus FtsZ with an $IC_{50}$ of $53.4{\mu}M$ and showed potent antibacterial activity against S. aureus and MRSA with an MIC of $1{\mu}g/ml$, whereas 2-5 were weak or inactive. Importantly, 1 induced cell elongation in the cell division phenotype assay, whereas 2-5 did not. It indicates that 1 exhibits its potent antibacterial activity via inhibition of FtsZ, and the hydroxyl group and hydroxylactone ring of 1 are critical for the activity. Thus, madurahydroxylactone is a new type of inhibitor of FtsZ.

• 미생물학회지
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• 제50권4호
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• pp.381-383
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• 2014

미생물 기원의 ${\alpha}$-glucosidase 저해제를 탐색하는 과정에서 토양에서 분리한 균주인 Bacillus sp. SKU31-1 배양액에서 강력한 저해제 compound K을 일련의 크로마토그래피 방법에 의해 분리 정제하였고 $^1H$ NMR, $^{13}C$ NMR, $^1H-^1H$ COSY spectra 분석과 문헌조사를 통해 5-amino-1-hydroxymethyl-1,2,3,4-cyclohexanetetrol로 동정되었다. Compound K의 ${\alpha}$-glucosidase 저해 활성은 $IC_{50}$값이 maltose 기질에서는 $1.9{\mu}M$이고, sucrose 기질 사용시 4.9 mM이었다. Lineweaver Burk plot에 의해 $K_i$값이 0.15 mM 로 강력한 경쟁적 저해제 임이 밝혀졌다.

• 한국균학회지
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• 제49권2호
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• pp.243-248
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• 2021

본 연구에서는 진균류 유래의 새로운 항치매성 BChE저해물질을 생산할 목적으로 대전광역시 하천에서 분리하여 선별한 비병원성 야생효모들의 무세포추출물들을 제조하여 이들의 BChE 저해활성 측정하였다. 비병원성 야생효모들 중 S. cerevisiae WJSL0113의 무세포추출물이 85.2%의 BChE 저해활성을 보여 최종 선발하였다. 선발 균주의 BChE 저해활성은 시판 주류용 S. cerevisiae과 식용 버섯들의 추출물보다 높은 저해활성을 보였고 선발 균주인 S. cerevisiae WJSL0113을 30℃에서 48시간 배양하였을 때 가장 높은 항치매성 BChE 저해활성을 보였다.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• 제29권
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• pp.37-42
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• 2011

본 연구에서는 효모에서 과 발현하는 Bax inhibior와 관련된 유전자를 동정하여 특성화 하였다. Yeast functional screening이라는 방법을 이용하여, 일반적은 환경에서 재배된 벼의 cDNA를 QX95001에 형질전 환하여 SD-galactose-Leu--Ura-배지에서 생성된 8개의 클론을 선발하였다. 그 중 AtBI-1과 같은 domain이 있는 D2-234를 포함하여 5개의 클론을 선발하였다. D2-243는 741bp의 염기서열과 247개의 아미노산으로 구성되었고 5 membrane-spanning 단편으로 되어 있음을 확인하였다. D2-234는 SD-galactose-$Leu^-$-$Ura^-$배지에서 세포성장이 왕성하였다. 본 실험에서 얻어진 결과는 벼 식물에서 나타나는 세포예정사와 관련된 단백질을 선발하는데 유용하게 이용될 것으로 생각된다.

• Biomolecules & Therapeutics
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• 제30권5호
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• pp.455-464
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• 2022

Efonidipine, a calcium channel blocker, is widely used for the treatment of hypertension and cardiovascular diseases. In our preliminary study using structure-based virtual screening, efonidipine was identified as a potential inhibitor of c-Jun N-terminal kinase 3 (JNK3). Although its antihypertensive effect is widely known, the role of efonidipine in the central nervous system has remained elusive. The present study investigated the effects of efonidipine on the inflammation and cell migration induced by lipopolysaccharide (LPS) using murine BV2 and human HMC3 microglial cell lines and elucidated signaling molecules mediating its effects. We found that the phosphorylations of JNK and its downstream molecule c-Jun in LPS-treated BV2 cells were declined by efonidipine, confirming the finding from virtual screening. In addition, efonidipine inhibited the LPS-induced production of pro-inflammatory factors, including interleukin-1β (IL-1β) and nitric oxide. Similarly, the IL-1β production in LPS-treated HMC3 cells was also inhibited by efonidipine. Efonidipine markedly impeded cell migration stimulated by LPS in both cells. Furthermore, it inhibited the phosphorylation of inhibitor kappa B, thereby suppressing nuclear translocation of nuclear factor-κB (NF-κB) in LPS-treated BV2 cells. Taken together, efonidipine exerts anti-inflammatory and anti-migratory effects in LPS-treated microglial cells through inhibition of the JNK/NF-κB pathway. These findings imply that efonidipine may be a potential candidate for drug repositioning, with beneficial impacts on brain disorders associated with neuroinflammation.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권9호
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• pp.2655-2659
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• 2014

Dual specificity protein phosphatase 4 (DUSP4) has been considered a promising target for the development of therapeutics for various human cancers. Here, we report the first example for a successful application of the structure-based virtual screening to identify the novel small-molecule DUSP4 inhibitors. As a consequence of the virtual screening with the modified scoring function to include an effective molecular solvation free energy term, five micromolar DUSP4 inhibitors are found with the associated $IC_{50}$ values ranging from 3.5 to $10.8{\mu}M$. Because these newly identified inhibitors were also screened for having desirable physicochemical properties as a drug candidate, they may serve as a starting point of the structure-activity relationship study to optimize the medical efficacy. Structural features relevant to the stabilization of the new inhibitors in the active site of DUSP4 are discussed in detail.

• 한국균학회지
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• 제13권4호
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• pp.203-212
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• 1985

전국 각지 토양으로 부터 채취한 토양균을 screening하여 ${\alpha}-amylase$를 저해하는 물질을 생성하는 균주인 Streptomyces DMC-72를 선발하였다. 이 균주가 생성하는 저해제를 acetone 침전 및 이온 교환 수지인 Amberlite IRC-50, Amberlite CG-50과 SP-Sephadex C-25를 이용하여 분리하였다. 이 물질은 ${\alpha}-amylase$ 뿐만아니라 다른 amylase와 기타 효소에 대해서도 억제작용을 나타내었다. 이 물질은 기질인 soluble starch의 가수분해에 대해서 non-competitive하게 저해작용을 보이주고 있으며 열 및 넓은 범위의 pH에서 안정한 물질이었다. 이 물질은 anthrone 시험과 IR spectrum에 의해서 oligosaccharide계 화합물임을 알 수 있었다.

• 미생물학회지
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• 제45권2호
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• pp.228-231
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• 2009

고추 역병을 야기하는 Phytophthora capsici 는 짧은 시간 내에 많은 면적에 피해를 주는 병으로 한번 발생하면 방제가 어려운 병으로 알려져 있다. 이러한 역병 곰팡이의 방제를 위하여 본 연구에서는 P. capsici의 염색체 복제 및 세포 골격 유지 등에 관여하는 단백질인 microtubule의 형성 저해를 유도하는 물질을 탐색하여 궁극적으로 고추역병 방제를 위한 연구를 진행하였다. 먼저 P. capsici alpha 및 beta tubulin을 E. coli BL21(DE3)에서 발현시켜 분리 정제하여 in vitro microtubule 형성을 확인하였다. P. capsici microtubule 형성 저해 metagenome clone 스크리닝을 위하여 경기도 수원의 여기산 토양에서 metagenome을 분리하여 library를 제작하여 Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) 방법을 이용하여 P. capsici microtubule 형성을 저해하는 화합물을 탐색하였다. In vitro 스크리닝에서 약 384개의 metagenome library에서 2종의 clone을 선택하여 고추작물에 직접 방제하여 역병균의 생장 억제를 확인하였다. 이는 차후 고추역병 방제제 개발에 있어 중요한 후보물질뿐만 아니라 metagenome library를 이용한 새로운 방법의 개발이라 사료 된다. 또한 in vitro 스크리닝에서 얻어진 2종의 metagenome clone의 염기서열을 분석하여 항역병 활성에 관련하는 DNA 서열을 확보하고 이를 응용하여 물질을 생산 할 경우, 현장에서 활용 할 수 있는 효과 큰 친환경 천연고추역병 방제제로서의 개발 가능성을 가진다는 점에서 본 연구결과는 매우 의미 있는 결과라 생각된다.