Leylabadlo, Hamed Ebrahimzadeh;Kafil, Hossein Samadi;Yousefi, Mehdi;Aghazadeh, Mohammad;Asgharzadeh, Mohammad
Tuberculosis and Respiratory Diseases
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제79권3호
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pp.134-142
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2016
In recent years, in spite of medical advancement, tuberculosis (TB) remains a worldwide health problem. Although many laboratory methods have been developed to expedite the diagnosis of TB, delays in diagnosis remain a major problem in the clinical practice. Because of the slow growth rate of the causative agent Mycobacterium tuberculosis, isolation, identification, and drug susceptibility testing of this organism and other clinically important mycobacteria can take several weeks or longer. During the past several years, many methods have been developed for direct detection, species identification, and drug susceptibility testing of TB. A good understanding of the effectiveness and practical limitations of these methods is important to improve diagnosis. This review summarizes the currently-used advances in non-molecular and molecular diagnostics.
This study aimed to develop Lautropia mirabilis-specific quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) primers based on the sequence of DNA-directed RNA polymerase subunit beta gene. The PrimerSelect program was used in designing of the qPCR primers, RTLam-F4 and RTLam-R3. The specificity of the qPCR primers were performed by conventional PCR with 37 strains of 37 oral bacterial species, including L. mirabilis. The sensitivity of the primers was determined by qPCR with the serial dilution of purified genomic DNA of L. mirabilis KCOM 3484, ranged from 4 ng to 4 fg. The data showed that the qPCR primers could detect only L. mirabilis strains and as little as 40 fg of genome DNA of L. mirabilis KCOM 3484. These results indicate that this qPCR primer pair (RTLam-F4/RTLam-R3) may be useful for species-specific detection of L. mirabilis in epidemiological studies of oral bacterial infectious diseases such as periodontal disease.
Zoonoses are the diseases that are transmitted to human being from vertebrate animals either from livestock animals or from wildlife. Recently, zoonoses are increasingly common as a result of incremental human-animal contact. Propagative infections in wild animals and livestock are transmitted to human beings who are encountered with them. In general, wild animals can transmit infectious agents to livestock, and then livestock further transmit them to human being is a simple model of on how zoonotic diseases get transmitted to human being. This model emphasizes the importance of early detection of zoonoses by surveillance at its incipient stage. Cooperation between the respective ministries plays an important role in the identification of zoonoses and planning for the formulation of better preventive and control policy and strategy. We will be able to predict the occurrence of zoonotic diseases in human on the basis of disease trends in wildlife and livestock once when we obtain the surveillance data and data generated by respective ministries through sound cooperation and collaboration.
최근 COVID-19와 같은 신종 바이러스 감염증이 확산하여 심각한 공중 보건 문제를 제기하고 있다. 특히 이러한 질병은 고령자에게 치명적으로 작용하여, 생명을 위협하고 심각한 사회적, 경제적 손실을 초래하였다. 이에 많은 산업분야에서 사물 인터넷(IoT) 및 인공 지능(AI)을 응용한 원격진료, 헬스케어, 질병예방 등의 애플리케이션이 소개되어 질병 감지, 모니터링 및 검역 성능을 향상하고 있다. 하지만 기존기술은 갑작스러운 전염병의 출현에 신속하고 통합적으로 적용되지 않기 때문에, 사회 속에 감염병이 대규모 감염 및 전국적 확산되는 것을 차단하지 못하였다. 따라서 본 논문에서는 바이러스 질병 정보 수집기를 통해 지역적 한계가 있는 다양한 감염 정보를 수집하고, AI 브로커를 통해 AI 분석 및 심각도 매칭을 수행하여 감염의 확산을 예측하고자 한다. 최종에는 질병관리본부를 통해 고령자에게 위험경보 발령, 확산 차단 문자 발송 및 감염지역 대피정보를 신속하게 제공한다. 현실적인 고령자 지원시스템은 감염자 발생지역 정보와 고령자의 위치정보를 비교하여 증강현실 기반의 스마트폰 애플리케이션으로 직관적인 위험지역(감염지역) 회피기능을 제공하고 감염지역 방문이 확인되면 자동으로 방역관리 서비스를 제공한다. 향후 제안시스템은 위치기반의 사용자 밀집도를 파악함으로써 갑작스런 인파 집중으로 인한 압사 사고를 사전에 예방하는 방법으로도 활용 가능할 것이다.
배양장에서 생산된 양식생물은 자원조성에 필요한 종묘를 제공한다는 측면에서 매우 중요한 역할을 담당하고 있으며, 방류종묘의 질, 특히 개체의 건강도 는 방류이후 서식처에서 생존하고 자원조성 효과를 결정짓는데 매우 중요한 요소가 된다. 2010년도 방류 품종(해면품종 33종과 내수면품종 12품종)을 대상으로 수산동물전염병의 감염 여부를 검사하였다. 검사 품종 중에서 해면품종으로는 전복이 20.0%로 가장 많았으며, 그 다음 해삼(15.6%), 넙치(8.4%), 조피볼락(6.7%), 감성돔(6.3%), 꽃게(6.1%) 순으로 나타났다. 내수면품종 중에서는 붕어가 19.4%로 가장 많았으며, 그 다음으로 뱀장어(11.8%), 동자개(10.9%), 쏘가리(10.8%), 다슬기(8.4%), 메기(7.7%)의 순으로 나타났다. 총 45개 품종을 대상으로 1,120회의 검사가 의뢰되었으며, 검사 항목별로 2,105건의 검사를 실시한 결과 30건에서 koi herpesvirus (KHV), red sea bream iridovirus (RSIV), white spot syndrome virus (WSSV) 또는 viral haemorrhagic septicemia virus (VHSV)와 같은 병원체가 검출되어 불합격 처리되었다.
The aim of study was to investigate the correlation between the level of 17 antibiotic residues and 6 antibiotic resistances of Escherichia coli isolates in chicken meats. A total of 58 chicken meats were collected from retail grocery stores in five provinces in Korea. The total detection rate of antibiotic residues was 45% (26 out of 58). Ten out of 17 antibiotics were detected in chicken meats. None of the antibiotics exceeded the maximum residue level (MRLs) in chicken established by the Ministry of Food and Drug Safety (MFDS). The most detected antibiotics were amoxicillin (15.5%), followed by enrofloxacin (12.1%) and sulfamethoxazole (10.3%). In a total of 58 chicken meats, 51 E. coli strains were isolated. E. coli isolates showed the highest resistance to ampicillin (75%), followed by tetracycline (69%), ciprofloxacin (65%), trimethoprim/sulfamethoxazole (41%), ceftiofur (22%), and amoxicillin/clavulanic acid (12%). The results of study showed basic information on relationship between antibiotic residue and resistance for 6 compounds in 13 chicken samples. Further investigation on the antibiotic resistance patterns of various bacteria species is needed to improve food safety.
Tetanus is a specific infectious disease, which is often associated with catastrophic events such as earthquakes, traumas, and war wounds. The obligate anaerobe Clostridium tetani is the pathogen that causes tetanus. Once the infection of tetanus progresses to an advanced stage within the wounds of limbs, the rates of amputation and mortality increase manifold. Therefore, it is necessary to devise a rapid and sensitive point-of-care detection method for C. tetani so as to ensure an early diagnosis and clinical treatment of tetanus. In this study, we developed a detection method for C. tetani using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay, wherein the C. tetani tetanus toxin gene was used as the target gene. The method was highly specific and sensitive, with a detection limit of 10 colony forming units (CFU)/ml, and allowed quantitative analysis. While detecting C. tetani in clinical samples, it was found that the LAMP results completely agreed with those of the traditional API 20A anaerobic bacteria identification test. As compared with the traditional API test and PCR assay, LAMP detection of C. tetani is simple and rapid, and the results can be identified through naked-eye observation. Therefore, it is an ideal and rapid point-of-care testing method for tetanus.
Toxoplasma gondii is a zoonotic parasite resulting in human infections and one of the infectious pathogens leading to uveitis and retinochoroiditis. The present study was performed to assess T. gondii infection in 20 ocular patients with chronic irregular recurrent uveitis (20 aqueous humor and 20 peripheral blood samples) using PCR. All samples were analyzed by nested PCR targeting a specific B1 gene of T. gondii. The PCR-positive rate was 25% (5/20), including 5% (1) in blood samples, 25% (5) in aqueous humor samples, and 5% (1) in both sample types. A molecular screening test for T. gondii infection in ocular patients with common clinical findings of an unclear retinal margin and an inflammatory membrane over the retina, as seen by fundus examination, may be helpful for early diagnosis and treatment.
꿀벌 6종 주요 감염성 질병을 동시 진단하기 위한 PCR-chip 기반 초고속 다중 PCR 진단법을 개발 하였다. 6종 주요 꿀벌 감염성 병원체들은, 세균성 질병인 미국부저병의 원인균, Paenibacillus larvae와 유럽부저병의 원인균인 Melissococcus plutonius, 또한 진균인 Ascosphaera apis(백묵병), Aspergillus flavus(석고병)와 Nosema apis, Nosema ceranae(노제마병)를 선발하였다. 개발된 PCR-chip 기반 초고속 다중 PCR은, 꿀벌 주요 병원체 6종에 대하여 각기 $10^3$ 분자이상이 존재할 경우 모두 성공적 증폭을 보였으며, 증폭여부의 확인에 걸린 시간(Ct-time)은 6종 중 4종은 9분 내외, 2종은 7분 내외이었으며, 총 40회전의 PCR은 11분 42초, 융점분석 1분 15초로 총 PCR분석에 소요된 시간은 12분 57초(40회전 및 융점분석)이었다. 표준 DNA 기질을 사용한 PCR-chip 기반 초고속 다중 PCR은 100%에 근접한 정확도를 보였으며, 꿀벌 genomic DNA를 사용한 실험에서 false-amplification은 발견되지 아니하였다. PCR-chip 기반 초고속 다중 PCR은 실험실 내 초고속 진단 뿐 아니라 양봉 현장에서도 신속하고 효율적인 병원체 검출법이 될 것으로 기대한다.
Kim, Min-Jeong;Quan, Fu-Shi;Kong, Hyun-Hee;Kim, Jong-Hyun;Moon, Eun-Kyung
Parasites, Hosts and Diseases
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제60권2호
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pp.143-147
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2022
Acanthamoeba keratitis (AK) is a rare ocular disease, but it is a painful and sight-threatening infectious disease. Early diagnosis and adequate treatment are necessary to prevent serious complications. While AK is frequently diagnosis via several PCR assays or Acanthamoeba-specific antibodies, a more specific and effective diagnostic method is required. This study described the production of a polyclonal peptide antibody against the periplasmic binding protein (PBP) of A. castellanii and investigated its diagnostic potential. Western blot analysis showed that the PBP antibody specifically reacted with the cell lysates of A. castellanii. However, the PBP antibody did not interact with human corneal epithelial (HCE) cells and the other 3 major causative agents of keratitis. Immunocytochemistry (ICC) results revealed the specific detection of A. castellanii trophozoites and cysts by PBP antibodies when A. castellanii were co-cultured with HCE cells. PBP antibody specificity was further confirmed by co-culture of A. castellanii trophozoites with F. solani, S. aureus, and P. aeruginosa via ICC. The PBP antibody specifically reacted with the trophozoites and cysts of A. polyphaga, A. hatchetti, A. culbertsoni, A. royreba, and A. healyi, thus demonstrated its genus-specific nature. These results showed that the PBP polyclonal peptide antibody of A. castellanii could specifically detect several species of Acanthamoeba, contributing to the development of an effective antibody-based AK diagnostics.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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